Positions with mixtures: Not Excluded
Numbers represent: Absolute numbers
Single occurences: Included
Total number of isolates shown beneath consensus
Legend:    Red >=5%    Blue 1-4.5%    Grey <1%

         10         20
P
129		 I
129		 S
129		 P
129		 I
129		 E
129		 T
129		 V
129		 P
129		 V
129		 K
129		 L
129		 K
129		 P
129		 G
129		 M
129		 D
129		 G
129		 P
129		 K
129










 D1



 I1





 R1



 N1



 R2





 A1



 R21

         30         40
V
129		 K
129		 Q
129		 W
129		 P
129		 L
129		 T
129		 E
129		 E
129		 K
129		 I
129		 K
129		 A
129		 L
129		 V
129		 E
129		 I
129		 C
129		 T
129		 E
129
I1

 R1









 S1

 K2

 G1





 N1
Q1
R1
E1





 I12
T6
M4
L2
R1
E1







 A13
S2
N1

 F1

         50         60
M
129		 E
129		 K
129		 E
129		 G
129		 K
129		 I
129		 S
129		 K
129		 I
129		 G
129		 P
129		 E
129		 N
129		 P
129		 Y
129		 N
129		 T
129		 P
129		 V
129
L52

 K1

 Q8
E6
N2
H1
R1

 D11
A1





 N1

 T3
E1

 R26
Q1
E1

 V7





 D1









 S1



 I20

         70         80
F
129		 A
129		 I
129		 K
129		 K
129		 K
129		 D
129		 S
129		 T
129		 K
129		 W
129		 R
129		 K
129		 L
129		 V
129		 D
129		 F
129		 R
129		 E
129		 L
129


 V9



 R3
Y1
M1

 R2
Q1
E1



 N46

 G7
N1

 N8
D6
S3
I2
E2

 R25







 V6
I2
F1

 I3
M2



 L1



 D1

 F1

         90         100
N
130		 K
130		 R
130		 T
130		 Q
130		 D
130		 F
130		 W
130		 E
130		 V
130		 Q
130		 L
130		 G
130		 I
130		 P
130		 H
130		 P
130		 A
130		 G
130		 L
130


 R1

 K28









 C3



 I7





 R1









 S12
G2





         110         120
K
130		 K
130		 K
130		 K
130		 S
130		 V
130		 T
130		 V
130		 L
130		 D
130		 V
130		 G
130		 D
130		 A
130		 Y
130		 F
130		 S
130		 V
130		 P
130		 L
130
E4
Q3
R1

 Q4

 N28
R2

 R3



 I2
A1
M1



 I2
A1















 Y3



 I23

 A1



         130         140
D
130		 K
130		 D
130		 F
130		 R
130		 K
130		 Y
130		 T
130		 A
130		 F
130		 T
130		 I
130		 P
130		 S
130		 I
130		 N
130		 N
130		 E
130		 T
130		 P
130
Y3
H1

 E52

 E26
N6
G1
S1

 L2
S1

 G1





 I2













 T49
V10
L6
M5
R1
K1

 S1



 A2
D1

 R1
K1



         150         160
G
130		 I
130		 R
130		 Y
130		 Q
130		 Y
130		 N
130		 V
130		 L
130		 P
130		 Q
130		 G
130		 W
130		 K
130		 G
130		 S
130		 P
130		 A
130		 I
130		 F
130


 V12
T7
K2
M1

 K1





 N1









 M3













 S4
T1





         170         180
Q
130		 S
130		 S
130		 M
130		 T
130		 K
130		 I
130		 L
130		 E
130		 P
130		 F
130		 R
130		 K
130		 Q
130		 N
130		 P
130		 D
130		 I
130		 V
130		 I
130


 C15
D5
N4
Y4
G1
H1

 T1



 I2
A1

 R12





 D8
K2



 Y1

 K1

 E4
R1

 H4
K2
E2
N1
R1

 Y2
H1
S1

 S1

 E20
N2
G2

 L9
M5
V2

 I3

 M1

         190         200
Y
130		 Q
130		 Y
130		 M
130		 D
130		 D
130		 L
130		 Y
130		 V
130		 G
130		 S
130		 D
130		 L
130		 E
130		 I
130		 G
130		 Q
130		 H
130		 R
130		 T
130
C21





 V75







 L3

 I1

 A9
S2







 Q1

 L2
T1
M1

 E22
K1

 K2
E2
P1
R1
L1



 K1
T1

 A21
I5
E3
V1
K1

         210         220
K
130		 I
130		 E
130		 E
130		 L
130		 R
130		 Q
130		 H
130		 L
130		 L
130		 R
130		 W
130		 G
130		 F
130		 T
130		 T
130		 P
130		 D
130		 K
130		 K
130


 V15

 K5
D5
G3
V1

 D4
K2





 E18
A2
K2
N1
R1

 Y11



 W34
F1

 K61
S5
E2
A1
D1
N1
G1
Q1





 L21

 Y53
F15
V3
C3
I1
D1





 E4

 Q22
R3
N2
E2



         230         240
H
130		 Q
130		 K
130		 E
130		 P
130		 P
130		 F
129		 L
129		 W
129		 M
129		 G
129		 Y
129		 E
129		 L
126		 H
126		 P
126		 D
125		 K
125		 W
125		 T
125
Y3
C1



 Q3
E2

 D1





 L2

 H11
R3
Q1











 P2



 L1

 H1



 L1



         250         260
V
122		 Q
122		 P
122		 I
119		 V
119		 L
119		 P
94		 E
94		 K
94		 D
89		 S
9		 W
9		 T
8		 V
3		 N
3		 D
3		 I
1		 Q
1		 K
1		 L
1


 H1

 S1



 E7
M3
T2
I1
K1
L1





 D2



 E4