Positions with mixtures: Not Excluded
Numbers represent: Absolute numbers
Single occurences: Included
Total number of isolates shown beneath consensus
Legend:    Red >=5%    Blue 1-4.5%    Grey <1%

         10         20
P
262		 I
262		 S
262		 P
262		 I
262		 E
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263		 G
263		 P
263		 K
263
S1





 S10
H2

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 D26
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T3
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Q1
E1



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         30         40
V
263		 K
263		 Q
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263		 E
263		 E
263		 K
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263		 I
263		 C
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263		 E
263
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E8
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         50         60
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263		 E
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263		 E
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263		 K
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263
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         70         80
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263


 V2
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 I2
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 P1

 G2



         90         100
N
263		 K
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263		 T
263		 Q
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263		 Q
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263		 P
263		 A
263		 G
263		 L
263
I1



 K52
G1



 P1

 G1







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 S1





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         110         120
K
263		 K
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263		 V
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263		 L
263
Q7
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Q7

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S1

 R7

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M6
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 I3



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         130         140
D
263		 K
263		 D
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263		 N
263		 E
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263
Y8
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N2
C1

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Q7
P4
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 E77
S13
N11
A3









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 T66
V15
L7
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K3
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 A3
V1



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G
263		 I
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263		 Y
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263		 Q
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263		 W
263		 K
263		 G
263		 S
263		 P
263		 A
263		 I
263		 F
263


 V22
T6
M1
L1







 *1













 G1









 S9

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         170         180
Q
263		 S
263		 S
263		 M
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263		 I
263		 L
263		 E
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263		 K
263		 Q
263		 N
263		 P
263		 D
263		 I
263		 V
263		 I
263


 C56
A13
Y5
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F2
N1
G1

 T4



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 R17





 D21
K1



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 K1
I1

 R10
E9
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Q7
T5
I2
N1

 K18
E9
H7
N4
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A1

 H2
S1



 E72
N2
Q1

 M39
L21
V3

 I16
D7
E2
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T1
N1
L1

 L2
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         190         200
Y
263		 Q
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263		 D
263		 L
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263		 G
263		 S
263		 D
263		 L
263		 E
263		 I
263		 G
263		 Q
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263		 T
263
C4





 V21
I5







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H1

 I3

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M1
V1

 E39
D2
N1
R1

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 A65
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R3
V3
M2
K2

         210         220
K
263		 I
263		 E
263		 E
263		 L
263		 R
263		 Q
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263		 L
263		 R
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263		 F
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263		 T
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263		 K
263


 V26

 D5
K1

 D6
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F1
S1

 K135
Q10
S6
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T4
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 L31

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S1



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         230         240
H
263		 Q
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263		 P
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263		 L
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263		 M
263		 G
263		 Y
263		 E
263		 L
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263		 D
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263		 W
263		 T
263
Y1





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 H1



 L1

 H1
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L1

 L2
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 V1

 P1



 N1

 R3
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         250         260
V
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263		 I
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263		 N
263		 D
263		 I
263		 Q
263		 K
263		 L
263
I1



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 V12

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Q22
T16
K12
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N1



 S1

 D28
N7
Q3
A1
T1
K1

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N2

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N3
R1





 I3





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         270         280
V
263		 G
263		 K
263		 L
263		 N
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263		 S
263		 Q
263		 I
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263		 A
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263		 I
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263		 K
263		 Q
263		 L
263		 C
263
I1













 R1







 P135
S18
T4
G1
V1





 R3
Q2
S1

 I7
T1

 R103
Q1

 H9
E2





         290         300
K
263		 L
263		 L
263		 R
263		 G
263		 T
263		 K
263		 A
263		 L
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263		 I
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263		 L
263		 T
263		 E
262		 E
262		 A
262		 E
262
R39



 I18

 K8



 A92
V2
P1

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 I32

 V146

 Q7
T6
S5
A4



 S2

 K56
A21
R17
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         310         320
L
261		 E
261		 L
261		 A
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259		 N
259		 R
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259		 I
258		 L
258		 K
258		 E
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258		 V
258		 H
258		 G
258		 V
258		 Y
258		 Y
258		 D
258
M4





 E3

 K1



 K1



 L2
V2

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K3
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N1
D1

 Q2
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I1
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         330         340
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258		 Q
258		 G
258		 Q
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258		 Y
258		 Q
258
S3

 T27
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*1
L1



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S2

 I2

 V29
M3
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 V3

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 L29
V21



 N1

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D1

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L18
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Y8
N5
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A2
K2
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P1

 D29
S5
N3
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 S12

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F1

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         350         360
I
258		 Y
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258		 M
258		 R
258		 G
258		 A
258
V3

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 D3
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 Q8
A2
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H1

 R2

 I3
T1



 R2





 N1



 S1

 K56
T1

 T68
V12
K6
A5
S3
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I2
N1

 K26

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T7

 T24
V2
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I1

         370         380
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258		 T
258		 N
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258		 T
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255


 I1

 T1



 I10

 R42

 L1



 A12
S7
V5

 D4
Q3

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 A1

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 T55
S22
V10

 L20
M11
I8
V6
R3
Q1
P1



 C13
G11
A3

 V1

         390         400
V
255		 I
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255		 G
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255		 P
255		 K
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254		 K
254		 L
254		 P
252		 I
250		 Q
247		 K
244		 E
240		 T
236		 W
232		 E
228		 A
137
I10

 V1





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 I22
V4
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N1



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 R158

 V1



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L2
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W
79		 W
79		 T
79		 E
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79		 W
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79		 W
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79		 E
79		 W
79		 E
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79		 P
79




 M10
S2
I2

 D12









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P
79		 L
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79		 K
79		 L
79		 W
79		 Y
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79		 E
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79		 G
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79		 F
79
L2



















 Q2
T2

 D14





 I18
A12
M4
L4
E2

 E2

 V4





 Y4

         450         460
Y
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79		 D
79		 G
79		 A
79		 A
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79		 E
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79		 G
79		 K
79		 A
79		 G
79		 Y
79		 V
79		 T
79		 D
79










 S4

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 K4

 D1

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R
79		 G
79		 R
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79		 K
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79		 V
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79		 T
79		 N
79		 Q
79		 K
79		 T
79		 E
79		 L
79		 Q
79
K21



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 I17

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T3
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I1

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A
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79		 H
79		 L
79		 A
79		 L
79		 Q
79		 D
79		 S
79		 G
79		 L
79		 E
79		 V
79		 N
79		 I
79		 V
79		 T
79		 D
79		 S
79		 Q
79
S1
T1

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N8
L5
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 E4
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 S31
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Y
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79		 L
79		 G
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79		 I
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79		 Q
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79		 D
79		 K
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79		 E
79		 S
79		 E
79		 L
79		 V
79		 S
79		 Q
79


 V2

 I5







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 S1

 I2





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Q2



 D3
V1



 D3
A2

 I14
V4



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         530         540
I
79		 I
79		 E
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79		 I
79		 K
79		 K
79		 E
79		 K
79		 V
79		 Y
79		 L
79		 A
79		 W
79		 V
79		 P
79		 A
79		 H
79		 K
79






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 N12
Q2
G2



 K1

 R5

 I7





 S8
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         550         560
G
79		 I
79		 G
79		 G
79		 N
79		 E
79		 Q
79		 V
79		 D
79		 K
79		 L
79		 V
79		 S
79		 A
79		 G
79		 I
79		 R
79		 K
79		 V
79		 L
79
V1











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