Positions with mixtures: Not Excluded
Numbers represent: Absolute numbers
Single occurences: Included
Total number of isolates shown beneath consensus
Legend:    Red >=5%    Blue 1-4.5%    Grey <1%

         10         20
P
129		 Q
129		 I
129		 T
548		 L
548		 W
548		 Q
548		 R
548		 P
548		 L
548		 V
548		 T
548		 I
548		 K
548		 I
548		 G
548		 G
548		 Q
548		 L
548		 K
548






 A1



 G1
C1

 E2
H1



 T1

 I38
V27
P1

 I2
A2

 S30
A25
I15
P10
N8
Q4
K4
V2

 V122
Q1
A1

 R76
I2

 V102
L1

 E34
A4
R1

 E7
D3

 L6
E4
H3
P1

 I53
Q14
V7
T6
P4
S3
E2
A1

 I12
M8
R7
V1
T1

         30         40
E
548		 A
548		 L
548		 L
548		 D
548		 T
548		 G
548		 A
548		 D
548		 D
548		 T
548		 V
548		 L
548		 E
548		 E
548		 M
548		 N
548		 L
548		 P
548		 G
548
K1







 N1





 T1









 V24
F4
I3

 G2

 D146
K1
G1

 I120
L8
V2

 S75
D65
E9
T7
A6
H5
C5
K4
Y3
M1

 V2

 S20
Q10
T4
A2



         50         60
R
548		 W
548		 K
548		 P
548		 K
548		 M
548		 I
548		 G
548		 G
548		 I
548		 G
548		 G
548		 F
548		 I
548		 K
548		 V
548		 R
548		 Q
548		 Y
548		 D
548
K217

 *1

 R16



 R23















 L1



 R2



 K102





 E72
A1

         70         80
Q
548		 I
548		 L
548		 I
548		 E
548		 I
548		 C
548		 G
548		 H
548		 K
548		 A
548		 I
548		 G
548		 T
548		 V
548		 L
548		 V
548		 G
548		 P
548		 T
548
E12
N3

 V146
M2

 P243
A57
T46
Q38
S23
H11
C5
V5
D4
E3
I2
R2
N1

 V112
L33
M11

 D42
K1



 S12
D6
Y5
W2



 Q34
K24
Y19
R2

 R58
E6
T3
I2
N2

 T43
V29

 T58
V56
M5
L5
E2
R2



 A1

 I4



 I200



 S3



         90          
P
548		 V
548		 N
548		 I
548		 I
548		 G
548		 R
548		 N
548		 L
548		 L
548		 T
548		 Q
548		 I
548		 G
548		 C
548		 T
548		 L
547		 N
547		 F
546		  
 


 I13

 D1





 E1



 Y1

 M29
I2



 A1
V1

 K4

 L155





 S1



 K1

 L6