Positions with mixtures: Not Excluded
Numbers represent: Absolute numbers
Single occurences: Included
Total number of isolates shown beneath consensus
Legend:    Red >=5%    Blue 1-4.5%    Grey <1%

         10         20
P
545
Q
545
I
545
T
545
L
545
W
545
Q
545
R
545
P
545
L
545
V
545
T
545
I
545
K
545
I
545
G
545
G
545
Q
545
L
545
K
545




V2

A7
P6
S5





R1

Q1

L1

I147
F95
V55
R4
Y3

I54
L9
F1

P19
K12
S10
Q5
I5
E3
A3
N2
V2
R1

V205
M6
A4

R41
N3
T1
E1

V136

A35
E30
R1
N1
Q1

E6
D1

H18
R3
I2

I65
V23
T13
Q10
P7
S2
E2
M1

R100
T35
I35
M14
V11
Q2
E2

         30         40
E
545
A
545
L
545
L
545
D
545
T
545
G
545
A
545
D
545
D
545
T
545
V
545
L
545
E
545
E
545
M
545
N
545
L
545
P
545
G
545
D3
K1

V12

I16

I31
F7
M2

V1



E1





N20



I99
M3

F159
I32
V18
M3

Q38
D11
K4
A3
T2
R1
H1
N1

D191
G10
N8
K1
Q1
S1

I227
L23
V11
T2

D93
S64
E18
T17
H8
A4
C3
Q1
K1

W2

S17
Q7
T3

R1

         50         60
R
545
W
545
K
545
P
545
K
545
M
545
I
545
G
545
G
545
I
545
G
545
G
545
F
545
I
545
K
545
V
545
R
545
Q
545
Y
545
D
545
K146
E1
Q1



T53
R9
I3
Q3
A1

S1

R20
Q3
I2

I167
L60
V4
T1

V68
A1
M1

V13
M5
A3
E1

E1

V20
L18

A1



L34
Y3
I1
W1

V136
L57
M44
S4
T2
A2

R92
N7
T1



K120

E69
H1

F3
H1

E102
N4
Y1

         70         80
Q
545
I
545
L
545
I
545
E
545
I
545
C
545
G
545
H
545
K
545
A
545
I
545
G
545
T
545
V
545
L
545
V
545
G
545
P
545
T
545
E31
H6
N3
D2

V252
M2

P402
S14
A12
T11
Q10
H8
C8
R4
V2
I1

V100
L14
M8

D8

V12
F11
L3

F19
Y7
E4
S2
W1
L1
G1

E5
D1

Q34
Y22
R13
K9
N3

R19
T10
E9
V2
Q1

V190
T60
I29
F3
L2

T60
V59
L19
M9
E5
K4
R4
Q2
F1

S83
T16
C10
D5
A4
V2

S31
P25
A6
K2
E2
Q1

I4

V26

I182
L1
T1



S7
A5
N1
Q1
H1
D1



         90          
P
545
V
545
N
545
I
545
I
545
G
545
R
545
N
545
L
545
L
545
T
545
Q
545
I
545
G
545
C
545
T
545
L
545
N
545
F
545
 
 
H1

A120
T31
I22
C6
M5
L5
F3
S1

D5
S3
K1
H1

V135

V41
L1
M1



G1

D29
S8
G1

V49
M21
F9
I6
R3
T2
S1
A1

M221

S24
A4
N1

K23
R9
E1
H1

L197
M4
V1

D3

F10
L1
V1





S1

Y2
S1