Positions with mixtures: Not Excluded
Numbers represent: Absolute numbers
Single occurences: Included
Total number of isolates shown beneath consensus
Legend:    Red >=5%    Blue 1-4.5%    Grey <1%

         10         20
P
461		 Q
462		 I
463		 T
463		 L
463		 W
463		 Q
463		 R
463		 P
463		 L
463		 V
463		 T
463		 I
463		 K
463		 I
463		 G
463		 G
463		 Q
463		 L
463		 K
463




 N2

 S1





 R1





 V28
I20
M3

 I3

 S227
A16
I3
P2
N1

 V111

 R69
I4
T2
N1
E1

 V350

 E57
A10

 D4
E1

 H1
L1
E1

 I222
V44
T28
Q3
S1
M1
K1

 R104
M2
I2

         30         40
E
463		 A
463		 L
463		 L
463		 D
463		 T
463		 G
463		 A
463		 D
463		 D
463		 T
463		 V
463		 L
463		 E
463		 E
463		 M
463		 N
463		 L
463		 P
463		 G
463
Q1
K1

 V2





 E1

 I3



 V2





 A1
P1



 F2
V1

 K2

 D180

 I415
L8

 D48
S31
K14
T6
E5
A2
H1
C1

 V2
M1

 Q5
S4
T3
A1



         50         60
R
463		 W
463		 K
463		 P
463		 K
463		 M
463		 I
463		 G
463		 G
463		 I
463		 G
463		 G
463		 F
463		 I
463		 K
463		 V
463		 R
463		 Q
463		 Y
463		 D
463
K428
N5
D1
E1



 R17
T3

 S6
L1

 R55
Q1



















 N1



 K90

 E2
*1

 F1

 E77
S1
K1

         70         80
Q
463		 I
463		 L
463		 I
463		 E
463		 I
463		 C
463		 G
463		 H
463		 K
463		 A
463		 I
463		 G
463		 T
463		 V
463		 L
463		 V
463		 G
463		 P
463		 T
463
E39
H9
N3
D2

 V46

 P115
V40
T32
S22
A11
Q9
I3
H2
F1
C1
R1
G1

 V14
L13
M8
T1

 D12
K1



 Y6
S2
F1
W1
E1

 E1

 K428
Y5
Q3
R1

 R42
E3
Q2

 T7
V4

 V18
M10
T4
R1
L1
E1



 S53
A9

 I1



 I48



 S1
L1



         90          
P
463		 V
463		 N
463		 I
463		 I
463		 G
463		 R
463		 N
463		 L
463		 L
463		 T
463		 Q
463		 I
463		 G
463		 C
463		 T
463		 L
463		 N
463		 F
463		  
 
S1

 I38
A1





 V2
M1



 K1



 M359
I7

 M3
W2

 V3
I1

 R1

 L350
M2

 C1







 S1