Positions with mixtures: Not Excluded Numbers represent: Absolute numbers Single occurences: Included Total number of isolates shown beneath consensus Legend:    Red >=5%    Blue 1-4.5%    Grey <1%

10

20

P 522

I 522

S 522

P 522

I 522

E 522

T 522

V 522

P 522

V 522

K 522

L 522

K 522

P 522

G 522

M 522

D 522

G 522

P 522

K 522

S6 T1 R1

D25 K6 G2 N1

A2

I16

S3

R9 T3 N1

I1 V1

R4

L1

R73

30

40

V 522

K 522

Q 522

W 522

P 522

L 522

T 522

E 522

E 522

K 522

I 522

K 522

A 522

L 522

V 522

E 522

I 522

C 522

T 522

E 522

I3

R5

V1

S6

A4

D2

L3 V2 K1

E7 N4 R3 Q2 T2

I1

I82 T58 M15 L15 R6 A4 E4 K3

D7 A2 K2 T1

A37 M4 S3 E3 K2 L2

D8 K2 Q1

50

60

M 522

E 522

K 522

E 522

G 522

K 522

I 522

S 522

K 522

I 522

G 522

P 522

E 522

N 522

P 522

Y 522

N 522

T 522

P 522

V 522

L11 W1

K1 G1

R6 N2 E2 Q1

D2 K1

Q1

T10 E10

R23

V8

W1

K1

S1

I77

70

80

F 522

A 522

I 522

K 522

K 522

K 522

D 522

S 522

T 522

K 522

W 522

R 522

K 522

L 522

V 522

D 522

F 522

R 522

E 522

L 522

V3

R17

R12 N1

G4 N3

G20

S8 N6 P1

E3

V6 I3

L3 I2

90

100

N 522

K 522

R 522

T 522

Q 522

D 522

F 522

W 522

E 522

V 522

Q 522

L 522

G 522

I 522

P 522

H 522

P 522

A 522

G 522

L 522

R7

K85 G1

E6

C7 S2

I27

P1

S40

I8

110

120

K 522

K 522

K 522

K 522

S 522

V 522

T 522

V 522

L 522

D 522

V 522

G 522

D 522

A 522

Y 522

F 522

S 522

V 522

P 522

L 522

E14 Q8 R4

Q23 R11 E4

N70 R13 S2

R23 T2 N2

A4 T1

I12 M4 A1

I10

Y1

I2

S1

F2 H1 N1

I24

130

140

D 522

K 522

D 522

F 522

R 522

K 522

Y 522

T 522

A 522

F 522

T 522

I 522

P 522

S 522

I 522

N 522

N 522

E 522

T 522

P 522

Y19 H11 A2 C2 E1

E168 P25 T4 Q1 R1

E139 N21 S9 G2 A1 T1 K1

K1

L1 V1

L1

N2 R1

T76 V38 R20 L8 M4 K2

K1

A4 G3 K2

S3 A2 K2

Q1

150

160

G 522

I 522

R 522

Y 522

Q 522

Y 522

N 522

V 522

L 522

P 522

Q 522

G 522

W 522

K 522

G 522

S 522

P 522

A 522

I 522

F 522

V34 T27 M6 F1 A1 Q1 P1

K1

F2 C1

V2

H1

G2

F1

R1

H1 R1

E1

R1

E2

S12 T2 V1

M1

L1

170

180

Q 521

S 521

S 521

M 521

T 521

K 521

I 521

L 521

E 521

P 521

F 521

R 521

K 521

Q 521

N 521

P 521

D 521

I 521

V 521

I 521

C115 A33 Y14 N6 H4 R1

T6 C2

I34 A2 M1 K1 V1

R34 T3 I2

D52 K3 G2

S4

Y6

K4

E23 N11 S10 T7 Q6 R6 A5 M2 G1

K36 R21 E9 H8 N4 C2

H6

S4 T3

E142 N6 G6

M90 L51 V9 T1

I36 D21 E4 T2

V7 F1 L1

190

200

Y 521

Q 521

Y 521

M 521

D 521

D 521

L 521

Y 521

V 521

G 521

S 521

D 520

L 520

E 520

I 520

G 520

Q 520

H 520

R 520

T 520

C11 F1

V44 I12

N1

N1

M1

C3 H2 L1

I6

S10 A9 Q1 E1

N3

T8 L6

E92 R2 V2 D1

E14 K9 P8 L3

K1 G1

A139 I31 E11 R4 V4 S2 K2

210

220

K 520

I 520

E 520

E 520

L 520

R 520

Q 520

H 520

L 520

L 520

R 520

W 519

G 519

F 518

T 518

T 518

P 518

D 518

K 516

K 515

R7

V62

D8 Q1

K8 D5 Q4 A2 I1 G1 V1

E59 K11 A10 H9 D9 R9 N6 G6

W6 F4 S2 M2

K277 S20 Q13 T10 G9 A8 N1

G1

L91

D9 S6 E5 A4 L2

P1

N1 G1

E3 N1

I1

230

240

H 513

Q 512

K 512

E 509

P 508

P 508

F 508

L 506

W 506

M 506

G 505

Y 504

E 503

L 499

H 496

P 494

D 448

K 440

W 433

T 427

Y7

R1 I1

D4

H9 T1

L1

H4 F1 R1

R3

L3 K1

S1

H1

I2

T1

250

260

V 423

Q 420

P 415

I 411

V 404

L 402

P 400

E 397

K 393

D 389

S 389

W 387

T 386

V 381

N 364

D 358

I 357

Q 355

K 355

L 351

G1

T8 H5 S4 A2

V8

E68 M43 K35 Q30 T13 I5 A4 R2 L2

D44 K5 N4 Q3 V3 A1 G1

Q8

E49 S2 N2

N8 D7 C5 I3 T2

N2 S1

I1

E2

L5 V1

Q1

I3

270

280

V 350

G 349

K 349

L 349

N 347

W 346

A 346

S 346

Q 346

I 344

Y 344

A 343

G 342

I 339

K 334

V 334

K 334

Q 333

L 332

C 332

E3 R1

M1

T1

H1

F7

F4 H1 *1

P188 S20 Q2 G2 T1

V1

R11 Q2

I20 T5

R128

H12 N1 Y1 E1

I1

290

300

K 330

L 329

L 329

R 329

G 329

T 329

K 329

A 329

L 329

T 329

E 328

V 327

I 327

P 326

L 309

T 309

E 306

E 305

A 280

E 214

R41

I23

K4

A135 S1 P1 V1

Q1 R1

S40 G4 T3

P1

D22 V4 Q1

I42

V172

T17 A8 S8 Q4

M1

S4 A1

K76 A27 R17 T6 V4 Q3 D2

V1

D1 K1

310

320

L 171

E 61

L 15

A 14

E 13

N 6

R 6

E 6

I 6

L 6

K 6

E 5

P 5

V 5

H 5

G 5

V 5

Y 5

Y 5

D 5

R1

Q1

330

340

P 5

S 5

K 5

D 5

L 5

I 5

A 5

E 5

I 3

Q 2

K 2

Q 2

G 2

Q 2

G 2

Q 2

W 2

T 2

Y 2

Q 2

T1

E1

V1

350

360

I 2

Y 2

Q 2

E 2

P 2

F 2

K 2

N 2

L 2

K 2

T 2

G 2

K 2

Y 2

A 2

R 2

M 2

R 2

G 1

A 1

T1

H 1

T 1

N 1

D 1

V 1

K 1

Q 1

L 1