Positions with mixtures: Not Excluded
Numbers represent: Absolute numbers
Single occurences: Included
Total number of isolates shown beneath consensus
Legend:    Red >=5%    Blue 1-4.5%    Grey <1%

         10         20
P
765		 I
767		 S
768		 P
770		 I
770		 E
770		 T
770		 V
770		 P
770		 V
770		 K
770		 L
770		 K
770		 P
770		 G
770		 M
770		 D
770		 G
770		 P
770		 K
770
L1



 R2

 S23
T2
K1



 D51
K20
A2
*1

 P3
L1
A1

 I16
A1
G1

 S2

 A3

 T13
R8
E4
Q3
N3
S2
A1



 R3
E1

 S1
T1
A1
L1

 *1
V1
R1

 V4
R1
T1
L1

 G3
H1

 D1

 S1

 R91
E1
*1
N1

         30         40
V
770		 K
770		 Q
770		 W
770		 P
770		 L
770		 T
770		 E
770		 E
770		 K
770		 I
770		 K
770		 A
770		 L
770		 V
770		 E
770		 I
770		 C
770		 T
770		 E
770
I13
A1
D1

 R8
I2
N2

 L1

 R1
C1

 L1



 S31
A2
P1

 A18
K4
G2

 G3
D1
Q1

 R2
E1
Q1
N1

 L7
R6
V3

 R8
E8
Q6
I5
N1
T1

 E1

 I2
S1
F1

 T445
I44
M19
K14
L9
A4
E1
S1

 A274
D11
K2

 L1

 W1

 E280
D100
K37
A32
N15
M3
S1
I1
R1

 D27
K2
A2
Q2

         50         60
M
770		 E
770		 K
770		 E
770		 G
770		 K
770		 I
770		 S
770		 K
770		 I
770		 G
770		 P
770		 E
770		 N
770		 P
770		 Y
770		 N
770		 T
770		 P
770		 V
770
L5
V1

 G1
Y1

 E26
R12
N3
Q3

 D3
G1



 Q4
E1



 T382
E4
P1

 R46

 V8
T1



 S1

 D31







 T3
D1

 P2

 S1

 I263

         70         80
F
770		 A
770		 I
770		 K
770		 K
770		 K
770		 D
770		 S
770		 T
770		 K
770		 W
770		 R
770		 K
770		 L
770		 V
770		 D
770		 F
770		 R
770		 E
770		 L
770


 V3



 R18

 R13
N2
M1



 N14
G3

 G20
R1

 S10
A4
N3
I2

 R6
N1
Q1



 G3

 R1

 V5
I1

 L3
I1
M1







 D1

 P1

         90         100
N
770		 K
770		 R
770		 T
770		 Q
770		 D
770		 F
770		 W
770		 E
770		 V
770		 Q
770		 L
770		 G
770		 I
770		 P
770		 H
770		 P
770		 A
770		 G
770		 L
770
I1

 R5

 K21

 I1



 E10



 C6
S4
G1

 G1
D1

 I17



 I1

 E1





 P1



 S43
G5



 I7
V1

         110         120
K
770		 K
770		 K
770		 K
770		 S
770		 V
770		 T
770		 V
770		 L
770		 D
770		 V
770		 G
770		 D
770		 A
770		 Y
770		 F
770		 S
770		 V
770		 P
770		 L
770
E13
Q12
R5

 Q41
R30
M2
T1

 N130
R17
S2
T2

 R23
N1
E1

 A8
L1

 M25
I11
A1

 S1

 I14



 N1

 I6
G1



 G1



 N1
S1
F1

 Y1
S1



 I18

 S1



         130         140
D
770		 K
770		 D
770		 F
770		 R
770		 K
770		 Y
770		 T
770		 A
770		 F
770		 T
770		 I
770		 P
770		 S
770		 I
770		 N
770		 N
770		 E
770		 T
770		 P
770
Y59
H48
E3
A2
N2
C1

 E540
P18
Q9
A2
R1

 E99
S97
N88
G72
A1

 S1

 G1
T1

 R1





 G1





 V1





 T134
V56
R44
M11
L8
K5

 T1

 H1

 A38
K2
G2
D2

 A10
K1



         150         160
G
770		 I
770		 R
770		 Y
770		 Q
770		 Y
770		 N
770		 V
770		 L
770		 P
770		 Q
770		 G
770		 W
770		 K
770		 G
770		 S
770		 P
770		 A
770		 I
770		 F
770
E1

 V64
T11
M5
K3
L1

 K1

 S1

 E5
H2
V1
C1



 H1













 E1



 L3



 S35
P1

 V10

 S1

         170         180
Q
770		 S
770		 S
770		 M
770		 T
770		 K
770		 I
770		 L
770		 E
770		 P
770		 F
770		 R
770		 K
770		 Q
770		 N
770		 P
770		 D
770		 I
770		 V
770		 I
770
R1
*1

 C115
A81
Y17
H6
D6
N4
F3
T2
G1

 T5
G1
N1



 I53
K1
L1

 R79
T2
I2
E1
Q1

 L1



 D39
K8
A4
Q2
S1
G1

 S3
T1
L1

 Y5

 K5
T1
M1

 A256
T110
I25
E14
Q11
R10
N5
V4
S3
L3
M2

 K229
R36
H10
N7
E5
A3
L3
S1

 H8
Y5
T1
S1

 S7
T1

 E433
G9
N4
Q4

 M89
L86
V19
T1

 I43
D16
E2

 V1

         190         200
Y
770		 Q
770		 Y
770		 M
770		 D
770		 D
770		 L
770		 Y
770		 V
770		 G
770		 S
770		 D
770		 L
770		 E
770		 I
770		 G
770		 Q
770		 H
770		 R
770		 T
770
C8

 P1

 F1
C1

 V119
I6
L1







 L6
H5
C4

 I9

 A18
S4
Q1
C1



 N4



 G3
V2
N1
Q1
D1

 T8
L6
V1
M1

 E88
M7
K5
T5
V4
R2

 K18
E11
P5
H4
L3
D1



 I1

 A471
I43
E36
S3
L3
V2
K2
Q1

         210         220
K
770		 I
770		 E
770		 E
770		 L
770		 R
770		 Q
770		 H
770		 L
770		 L
770		 R
770		 W
770		 G
770		 F
770		 T
770		 T
770		 P
770		 D
770		 K
770		 K
770
R3
I2
M1

 V78
M1

 D10
K5
Q2
G2

 K20
D15
Q5
M2





 E362
A65
K22
D22
G12
N10
H6
R4
P1
L1
S1

 Y6



 F4
W2
M2
S2
Q1

 K476
S35
Q14
G13
E2
M2
A1





 L111

 A4
S2
I2
F2
Y2
D1
L1







 E6
Q1

 R1

         230         240
H
770		 Q
770		 K
770		 E
770		 P
770		 P
770		 F
770		 L
770		 W
770		 M
770		 G
770		 Y
770		 E
770		 L
770		 H
770		 P
770		 D
770		 K
770		 W
770		 T
770
Y8
L1



 R1

 D1

 H13



 L3

 R6
H3
Q1

 *1

 L6
V1







 P2





 E2
G1

 R31
T5
N3
S1



 K1

         250         260
V
770		 Q
770		 P
770		 I
770		 V
770		 L
770		 P
770		 E
770		 K
770		 D
770		 S
770		 W
770		 T
770		 V
770		 N
770		 D
770		 I
770		 Q
770		 K
770		 L
770
I3

 L1

 T15
S7
A2
R1
H1

 V14

 Q375
E67
M60
K35
T20
L13
H4
A3
I3
N3
S1

 V1

 T1

 D76
N22
Q2
K2
T1
V1

 Q9
R2
N1

 E127
N1
S1

 N11
C10
D7
A3
I1
R1
T1









 E3

 L14
V2







         270         280
V
770		 G
770		 K
770		 L
770		 N
770		 W
770		 A
770		 S
770		 Q
770		 I
770		 Y
770		 A
770		 G
770		 I
770		 K
770		 V
770		 K
770		 Q
770		 L
770		 C
770


 E1











 C1



 V2

 H3
F1

 P535
S28
T7
R3
Q2
G2
H1

 R1

 V26
L1

 R37
Q24

 I30
T7

 R355
T6

 H29
N21
K1
Y1
E1

 M8
I7



         290         300
K
770		 L
770		 L
770		 R
770		 G
770		 T
770		 K
770		 A
770		 L
770		 T
770		 E
770		 V
770		 I
770		 P
770		 L
770		 T
770		 E
770		 E
770		 A
770		 E
770
R91
N1

 V2
F1
S1

 I44

 K19

 R1

 A382
V3

 R5

 S39
T3
V1



 S3

 D442
A3

 I448

 V636

 T62
S16
Q12
A12
V1

 M5

 S12

 A57
K54
Q13
R11
D11
T9
V3
P2
G2
I2
H1

 D7



 Q6
K3

         310         320
L
770		 E
770		 L
770		 A
770		 E
770		 N
770		 R
770		 E
770		 I
770		 L
770		 K
770		 E
770		 P
770		 V
770		 H
770		 G
770		 V
770		 Y
770		 Y
770		 D
770
F5
I1



 W1

 E8

 V1

 S1

 K6



 L5

 I7

 R81
S3
E2
N1

 T37
Q8
N4
K2
D2
A1
G1

 T13
Q4

 I9
E1
M1

 Y10
P1



 A99
T4
G3
M1
S1



 H1

 E3
G1

         330          
P
769		 S
768		 K
768		 D
768		 L
768		 I
767		 A
767		 E
767		 I
767		 Q
767		 K
767		 Q
767		 G
765		 Q
764		 G
756		  
 		  
 		  
 		  
 		  
 
S6
T1

 T26
A20
L5

 R4

 E71
Y2
N1
A1
G1

 F2
I1

 V77
T7
L4
M1

 V4

 D10

 L77
V69

 L2
K1

 N7

 L2
H1
P1

 E49
D8

 H169
N91
D54
L40
E20
Y19
C7
G4
S4
R2
V1
M1
A1
T1
K1

 D404
S16
N5
E2
C2
A1