Positions with mixtures: Not Excluded
Numbers represent: Absolute numbers
Single occurences: Included
Total number of isolates shown beneath consensus
Legend:    Red >=5%    Blue 1-4.5%    Grey <1%

         10         20
P
178
Q
180
I
180
T
1209
L
1220
W
1246
Q
1252
R
1255
P
1258
L
1262
V
1262
T
1262
I
1262
K
1262
I
1262
G
1262
G
1262
Q
1262
L
1262
K
1262


H1



A1
P1

F2
T1
P1
V1

L15
R12
S2
G2
C1

K3
H2
R2
N1
E1

Q3
P1
*1

T2
S1
R1

I105
V28
F5
R2
M1
T1
P1

I3
A2

S57
A57
P25
N13
I11
E10
K9
V4
R3
Q2
D1

V225
T1
M1
K1

R145
S2
M1
T1

V207
L1

E47
A3
W3
R1

E7
D6
A1
W1
V1

H11
L10
I3
E3
R1
K1

I96
V26
Q21
T16
M2

R40
T10
I5
M4

         30         40
E
1262
A
1262
L
1262
L
1262
D
1262
T
1262
G
1262
A
1262
D
1262
D
1262
T
1262
V
1262
L
1262
E
1262
E
1262
M
1262
N
1262
L
1262
P
1262
G
1262
D1
V1



I2
V1

I2
*1

N4

A1





V4
E1

N36

S1

A1
I1

V31
I10
F4

G2

D358
N2

I241
L15
V8
T5
N1

S218
D156
T27
E19
C19
A12
K10
H7
I3
Y2
P1
Q1

F6
M2
W1
I1

S37
Q13
T2
A1
L1



         50         60
R
1262
W
1262
K
1262
P
1262
K
1262
M
1262
I
1262
G
1262
G
1262
I
1262
G
1262
G
1262
F
1262
I
1262
K
1262
V
1262
R
1262
Q
1262
Y
1262
D
1262
K367
N3
S1

Y3
S1

R22
N4
Q1
T1

A1

R24
I1

I17
L10
T2
R1
V1







N1
L1
V1



A1



L5
V3

R2



K160
N1

E2
H1
K1

F3

E113

         70         80
Q
1262
I
1262
L
1262
I
1262
E
1262
I
1262
C
1262
G
1262
H
1262
K
1262
A
1262
I
1262
G
1262
T
1262
V
1262
L
1262
V
1262
G
1262
P
1262
T
1262
E38
H8
N6
*4
K3
D2

V314

P727
S79
A56
T48
H29
Q20
C19
V12
R7
N2
I1

V209
L66
M26

D50
*1

M1
V1

S11
Y11
D2
W1

E3

Q56
K37
Y32
N2
R2

R68
I4
E4
T3
N1

T66
V54

V97
T55
M9
E8
L3
Q1
K1

S4
V1

S3
P3
K3

I2
L1

I1

I414



A2
D2
S1
L1



         90          
P
1262
V
1262
N
1262
I
1262
I
1262
G
1262
R
1262
N
1262
L
1262
L
1262
T
1262
Q
1262
I
1262
G
1262
C
1262
T
1262
L
1262
N
1262
F
1257
 
 


I33
A2

D4
K1

V9

V7
M1

E1

T1
I1
G1

S10
D9

M38
I2

M19
F1
P1
V1

V4
P1

K17
H2
R2
E2

L365
F1
M1
V1



Y1

A1
S1

*3

I6
K1

L27
S1