Positions with mixtures: Not Excluded
Numbers represent: Absolute numbers
Single occurences: Included
Total number of isolates shown beneath consensus
Legend:    Red >=5%    Blue 1-4.5%    Grey <1%

         10         20
P
146		 Q
146		 I
146		 T
146		 L
146		 W
146		 Q
147		 R
147		 P
147		 L
152		 V
152		 T
153		 I
153		 K
153		 I
153		 G
155		 G
156		 Q
156		 L
156		 K
156




 N3
S1

 A1



 L4
C1

 L1
E1

 *2
L1

 S2

 I14
V3
P1
Q1

 F2

 P3
S3
N2
A2
I2
K1

 V20
K1
L1

 R13
N1
*1
E1

 V15

 A2
E2



 H2
L2

 I6
Q3
V2
T1

 R3

         30         40
E
156		 A
156		 L
156		 L
156		 D
156		 T
156		 G
156		 A
156		 D
156		 D
156		 T
156		 V
156		 L
156		 E
156		 E
156		 M
156		 N
156		 L
156		 P
156		 G
156






 F4



 P2







 V1

 P1



 V6
F1
I1



 D46

 I23
V1
L1

 S30
D18
T6
E3
A2
H1
I1

 F1

 S1



         50         60
R
156		 W
156		 K
156		 P
156		 K
156		 M
156		 I
156		 G
156		 G
156		 I
156		 G
156		 G
156		 F
156		 I
156		 K
156		 V
156		 R
156		 Q
156		 Y
156		 D
156
K38

 L1

 N3
R2



 R2



 L1



 R1



 W1





 F1

 N1



 K12



 F1

 E4

         70         80
Q
156		 I
156		 L
156		 I
156		 E
156		 I
156		 C
156		 G
156		 H
156		 K
156		 A
156		 I
156		 G
156		 T
156		 V
156		 L
156		 V
156		 G
156		 P
156		 T
156
E2
H1

 V40
T1

 P89
S7
T4
C3
Q3
H2
A2
I1
V1

 V21
L4
M1

 D2
K1

 N1

 S3
F1
Y1

 *1
E1

 Y6
Q5
S1
K1

 R5
E2
T1

 T9
V3

 V10
T3
M2
E1







 F1

 I46







         90          
P
156		 V
156		 N
156		 I
156		 I
156		 G
156		 R
156		 N
156		 L
156		 L
156		 T
156		 Q
156		 I
156		 G
156		 C
156		 T
156		 L
156		 N
156		 F
155		  
 


 I2
F1

















 V1

 K3

 L41