Positions with mixtures: Not Excluded
Numbers represent: Absolute numbers
Single occurences: Included
Total number of isolates shown beneath consensus
Legend:    Red >=5%    Blue 1-4.5%    Grey <1%

         10         20
P
79
I
79
S
79
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79
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79
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80
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80
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80
K
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P1

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         30         40
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81
K
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81
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81
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81
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82
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82
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H1

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A12

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         50         60
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82
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L33

Q1

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T3

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         70         80
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82
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82
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         130         140
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82
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82
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82
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82


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T1

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82
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82
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82
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82
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82
I
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H3
R3

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         190         200
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M
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82
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82
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82
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82
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82
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*1



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82
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K34
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         230         240
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P
82
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82
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82
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82
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82
Y2



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         250         260
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Q
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P
82
I
82
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82
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82
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82
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82
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82
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82
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82
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81
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81
I
81
Q
81
K
81
L
80
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K2
T1
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         270         280
V
80
G
77
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76
L
76
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75
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74
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72
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69
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68
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66
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66
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65
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63
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61
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56


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55
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55
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54
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51
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49
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49
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48
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46
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44
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44
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44
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43
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41
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40
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39
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I1



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N1
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V24
L1

Q2
T2





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A4
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*1

         310          
L
37
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31
L
19
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5
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2
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2
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2
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2
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2
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2
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1
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
V1

D5
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