Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Naugler (2002)
Title T69D/N pol mutation, human immunodeficiency virus type 1 RNA levels, and syncytium-inducing phenotype are associated with CD4 cell depletion during didanosine therapy.
Citation J Infect Dis
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 50
NumPts 25
Subtype B

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
WES-1 HIV1BL AZT None T215Y K103N, Y181C K32N, V35T, R83K, D123E, G196S  
  HIV1ES AZT, DDI None L74V K103N, Y181C A33V, V35T, T69N, R83K, D123E  
WES-10 HIV10BL AZT None K70R, V75I, T215S, K219Q  K64R, D123E, I142T, D177E, I178M, R211K, F214L  
  HIV10ES AZT, DDI None K70R, V75I, T215S, K219Q  K64R, D123E, I142T, D177E, I178M, Q207P, R211K, F214L  
WES-11 HIV11BL AZT None M41L, L210W, T215S V106I V35L, A62P, I202V, R211K V60G 
  HIV11ES AZT, DDI None M41L, L210W, T215S L100V, K103N, V106I V35L, A62P, I202V, R211K E42V, V60G 
WES-12 HIV12BL AZT None M41L, T215Y  K43N, D123E, I135V, I178L  
  HIV12ES AZT, DDI None M41L, T215Y  I135V, K166R K66N 
WES-13 HIV13BL AZT None M41L, T215Y  V35I, A98S, K122E  
  HIV13ES AZT, DDI None M41L, T215Y  V35I  
WES-14 HIV14BL AZT None M41L, L210W, T215Y  T39S, R83K, I135T, S162C  
  HIV14ES AZT, DDI None M41L, L210W, T215Y  T39S, T69N, I135T  
WES-15 HIV15BL AZT None M41L, D67N, K70R, V75I, L210W, T215Y  V35L, T39E, V60I, S162A, E169D, G196E, R211K, D218E, K219T  
  HIV15ES AZT, DDI None M41L, D67N, T69D, K70R, L210W, T215Y  T39A, V60I, W88C, L109I, D123E, K166R, D177E, I178L, G196E, T200A, R211K  
WES-16 HIV16BL AZT None D67N, L210W, T215Y  D123E, G196S, R211K K46L 
  HIV16ES AZT, DDI None D67N, L210W, T215Y  T69N, D123E, I142T, G196S, R211K K46L 
WES-17 HIV17BL AZT None M41L, L210W, T215Y  Q23P, V35I, T39P, R83K, D123E, G196S  
  HIV17ES AZT, DDI None M41L, L74V, L210W, T215Y  T39P, S68G, R83K, D123E, G196S, R211K  
WES-18 HIV18BL AZT None T215Y  R83K, T200A  
  HIV18ES AZT, DDI None T215Y  T69N, R83K, W88C, D123E, K166R, T200A  
WES-19 HIV19BL AZT None K70R, L210W, T215Y, K219Q  R83K  
  HIV19ES AZT, DDI None D67N, K70R, L210W, T215Y, K219Q  R83K, G196E  
WES-2 HIV2BL AZT None D67N, K70R, T215Y  V35I, T39A, D123E, R211K  
  HIV2ES AZT, DDI None K70R, L74V, T215Y  V35I, D123E, S162C, D177E, R211K  
WES-20 HIV20BL AZT None M41L, D67N, V75I, T215Y  V35I, K166R, T200A, R211K  
  HIV20ES AZT, DDI None M41L, D67N, T215Y  V35I, W88C, K166R, T200A, R211K  
WES-21 HIV21BL AZT None D67N, L210W, T215Y  D123E, I135V, G196E, E204K  
  HIV21ES AZT, DDI None D67N, T69D, L210W, T215Y  D123E, G196E  
WES-22 HIV22BL AZT None K70R, T215F  T69N, R83K, D177E, R211K  
  HIV22ES AZT, DDI None K70R, L74V, T215F  T69N, R83K, D177E  
WES-23 HIV23BL AZT None M41L, T215Y V106A K122E, F214L  
  HIV23ES AZT, DDI None M41L, L74V, L210W, T215Y  V35I, R83K, I135T, G196E, R211K  
WES-24 HIV24BL AZT None D67N, K70R, T215F, K219Q  V35M, R83K, K122P, K173Q, D177E, D192E, T200S P226Q 
  HIV24ES AZT, DDI None D67N, K70R, T215F, K219Q  V35M, R83K, K122P, K173Q, D177E, D192E, T200S P226Q 
WES-25 HIV25BL AZT None K70R, T215Y  K22N, R211K  
  HIV25ES AZT, DDI None D67N, K70R, T215Y, K219E  T69N, I135V, S162C, R211K  
WES-3 HIV3BL AZT None M41L, L210W, T215Y  V35I, R83K, I135T, G196E, R211K  
  HIV3ES AZT, DDI None M41L, L210W, T215Y  K32Q, V35I, A98S, K102Q, K104R  
WES-4 HIV4BL AZT None K70R, T215Y, K219Q  Q197P  
  HIV4ES AZT, DDI None D67N, K70R, T215Y, K219Q  Q197P  
WES-5 HIV5BL AZT None T215Y  V35I, R83K, R211K  
  HIV5ES AZT, DDI None T215Y  V35I, R83K, R211K  
WES-6 HIV6BL AZT None T215Y  V35I, T39S, R83K, K122E, D177E, G196E  
  HIV6ES AZT, DDI None L74V, T215Y  V35I, T39S, R83K, D121Y, K122E, A158S, D177E, G196E  
WES-7 HIV7BL AZT None D67N, T215Y, K219Q  K22N, V35L, D123E, I135M, S162C  
  HIV7ES AZT, DDI None D67N, T215Y, K219Q  V35L, I135M, S162C, G196E  
WES-8 HIV8BL AZT None K70R, T215Y, K219Q  K64R, D123E, D177E, R211K, F214L, L228R  
  HIV8ES AZT, DDI None K70R, T215Y, K219Q  D123E, D177E, R211K, F214L, L228R  
WES-9 HIV9BL AZT None M41L, T215Y  D123E, G196E  
  HIV9ES AZT, DDI None M41L, T215Y  D123E