Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Cornelissen (2000)
Title Spread of distinct human immunodeficiency virus type 1 AG recombinant lineages in Africa.
Citation J Gen Virol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 20
NumPts 20
Subtype CRF02_AG, G, CRF06_cpx, A

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
MC90GH01 MC90GH01 None None   V35T, E36D, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, E203Q, Q207E, R211G, F214L, V245Q, T286A  
MC91ZR02 MC91ZR02 None None   V35T, V60I, K122E, D123S, I135R, K173T, Q174K, D177E, V189I, G196E, T200A, Q207E, F214L, V245Q, E248N, D250E, D256X, A272P  
MC93GH05 MC93GH05 None None   V35T, E36D, V60I, V90I, I135V, S162A, K173T, Q174E, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207E, P243T, V245Q, K277R, T286A  
MC93GH07 MC93GH07 None None   V35T, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, V245Q, D250E, S251I, T286A, A288T  
MC94GH08 MC94GH08 None None   V35T, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, V245Q, P247A, E248D, V276I, T286A  
MC94GH09 MC94GH09 None None   V35T, E36D, K122A, I135V, S162A, E169Q, K173T, Q174K, D177E, V189I, T200A, Q207E, V245X, E248D, K277R, T286A  
MC94GH10 MC94GH10 None None   V35T, T39A, E40D, K49R, I135V, S162A, E169K, K173A, Q174E, D177E, T200A, I202V, Q207E, V245Q, A272P, T286A K46KN 
MC94LB11 MC94LB11 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, K104R, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, I178M, V189I, T200A, Q207E, V245Q, E248D, D250E, A272P, V276I, T286A  
MC94LB12 MC94LB12 None None   V35T, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, P243T, V245Q, T286A  
MC94RW13 MC94RW13 None None   E6Q, K11T, V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173S, D177E, Q207A, R211S, V245Q, D250N, K281R, T286P  
MC95GH14 MC95GH14 None None   V35M, T39A, A98S, K122Q, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q, T286A  
MC96CM25 MC96CM25 None None   V35T, E36D, K122E, D123N, I135V, I142V, S162A, K173T, Q174R, D177E, T200A, Q207E, V245Q, L283X  
MC96GH16 MC96GH16 None None   V35T, E36D, T39A, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q, E248D, T286A  
MC97AN20 MC97AN20 None None   V21I, V35T, V60I, K102Q, K122E, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207D, R211K, V245Q, E248D, D250E, S251N, A272S, L283I  
MC97CM21 MC97CM21 None None   V35T, E36D, T39S, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207E, L210LMV, R211K, V245Q, T286A  
MC97GH17 MC97GH17 None None   V35T, I135V, T139K, S162A, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, P243T, V245Q, T286A  
MC97GH19 MC97GH19 None None M184V  V35T, E40D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, K277R, T286A, A288T F130Y, Q151P 
MC97GH22 MC97GH22 RTI RTI M41L, D67N, T69D, M184I, L210W, T215Y  V35T, T39Q, E44D, V60I, A98S, K122P, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272S, K277R, L283I, T286A  
MC97GH23 MC97GH23 None None   V35T, E36D, K49R, V60I, L109LIV, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207D, R211K, V245Q, T286A  
MC97GH24 MC97GH24 None None   V35T, K122E, I135V, S162A, T165I, K173T, Q174E, D177E, I178M, T200A, L205LF, Q207E, V245Q, A272P, T286A L187LIV 

Database

Resources

Team