Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Si-Mohamed (2000)
Title Selection of drug-resistant variants in the female genital tract of human immunodeficiency virus type 1-infected women receiving antiretroviral therapy.
Citation J Infect Dis
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 43
NumPts 24
Subtype B, CRF02_AG, A, CRF11_cpx, K, D, A + J, C

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
AS_ABI AS_ABI None None   K122E, D123N, S162C, T165I, D177E, T200E, I202V, Q207E  
  AS_ABI1 None None   K103Q, K122E, D123N, S162C, T165I, D177K, T200E, I202V, Q207E  
AS_BER AS_BER None None   R83K, I178M, L187LF  
AS_BIA AS_BIA AZT None T215Y  K49R, V60I, D121Y, K122E, D123E, I142V, D177E, I178M, Q207E  
  AS_BIA1 AZT None K70R, T215S  K49R, V60I, D121Y, K122E, D123E, I142V, D177E, I178M, Q207E  
AS_BOC AS_BOC None None   R83K, I202V, R211K  
  AS_BOC1 None None   R83K, V90I, R211K  
AS_BON AS_BON AZT None T215S  K49R, R83K, I202V  
AS_BOR AS_BOR AZT None M41L, D67N, K70R, T215Y  K122P, I142T, D177E, G196E, Q207E, R211K  
  AS_BOR1 AZT None M41L, D67N, K70R, T215Y  K122Q, I142T, D177E, G196E, Q207E, R211K  
AS_CHA AS_CHA AZT None M41L, T215Y  D123E, D177E  
  AS_CHA1 AZT None M41L, T215Y  D123E, D177E  
AS_CHO AS_CHO 3TC, D4T None M41L, M184V, T215Y  K122E, I135T, G196E, E203D  
  AS_CHO1 3TC, D4T None M41L, M184V, T215Y  K122E, I135T, G196E, E203D  
AS_CRA AS_CRA None None   K122E, D123N, I135T, I142T, K166R  
  AS_CRA1 None None   K122E, D123N, I135T, I142T, K166R  
AS_DIA AS_DIA None None  E138A K122E, D123N, K173T, D177E, I178L, T200E, I202V, Q207E  
  AS_DIA1 None None   K122E, D123N, K173T, D177E, I178L, V179A, T200E, I202V, Q207K  
AS_FAN AS_FAN 3TC, D4T None M41L, D67N, M184V, T215Y  V60I, V118I, K122E, I135V, T139K, S162A, K166E, E169K, K173T, Q174A, D177E, I178M, T200A, E203K, Q207E, H208Y, R211K  
  AS_FAN1 3TC, D4T None M41L, D67N, M184V, T215Y  V60I, V118I, K122E, I135V, T139K, S162A, K166E, E169K, K173T, Q174A, D177E, I178M, T200A, E203K, Q207E, H208Y, R211K  
AS_FIA AS_FIA AZT, DDI None M41L, D67N, L210W, T215Y  E44D, I135T, S162C, V179G, R199*, T200A, F214V  
  AS_FIA1 AZT, DDI None M41L, D67N, L210W, T215Y  E44D, I135T, S162C, T200A  
AS_FOG AS_FOG None None   K122E, D123N, I135T, K173L, D177E, T200A, Q207E, R211K  
  AS_FOG1 None None   K122E, D123N, I135T, K173L, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K  
AS_GBA AS_GBA None None   K49R, I135V, S162A, E169K, K173T, D177E, I178M, V189I, T200A, Q207E  
AS_HER AS_HER AZT None   K49R, R83K, K122E, I135T, I142L  
AS_KNA AS_KNA None None   K122E, D123N, K173T, Q174K, D177E, I178L, T200E, I202V, Q207E, R211K  
  AS_KNA1 None None   K122E, D123N, K173T, Q174R, D177E, I178L, T200E, I202V, Q207E, R211K  
AS_LHE AS_LHE None None   I135V, S162A, K173T, Q174E, D177E, T200E, Q207N, R211K  
  AS_LHE1 None None   I50V, V60I, F87L, V90I, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207E Y56C 
AS_MEL AS_MEL 3TC, D4T None D67N, K70R, M184V, K219Q  D123E, K166R  
  AS_MEL1 3TC, D4T None D67N, K70R, M184V, K219Q  D123E, K166R  
AS_MWA AS_MWA AZT None   S48T, K49R, V60I, A98S, K122E, I135R, S162A, D177E, Q207E  
  AS_MWA1 AZT None M41L, T215Y A98G D123E, D177E  
AS_NZI AS_NZI DDC, AZT None   V60I, K102E, D121H, K122E, D123S, I142V, S162C, K173S, Q174K, D177E, I202V, Q207E, R211K I94K 
  AS_NZI1 DDC, AZT None   V60I, D121H, K122E, D123S, I142V, S162C, K173S, Q174K, D177E, Q207E, R211K  
AS_PET AS_PET AZT, Unknown, 3TC, DDI, ABC Unknown, EFV M41L, D67N, T69D, L74V, M184V, T215F L100I, K103N E53D, V60I, K70X, V90I, K102Q, K122E, D123E, S162Y, G196E, E203K, Q207E  
  AS_PET1 AZT, Unknown, 3TC, DDI, ABC Unknown, EFV M41L, D67N, T69D, L74V, M184V, T215F L100I, K103N E53D, V60I, V90I, K102Q, K122E, D123E, S162Y, G196E, E203K, Q207E, K219H  
AS_PIN AS_PIN AZT None D67N, K70R, T215F, K219Q  K122E, D123N, K173T, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200A, E203K, Q207A, R211K  
  AS_PIN1 AZT None D67N, K70R, K219Q  K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207K, R211Q  
AS_SOU AS_SOU None None   V90I, D121H, K122E, I142T, F171Y, D177E, I178M, Q207A, R211K  
  AS_SOU1 None None   I135V, S162A, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207N, R211K  
AS_VIR AS_VIR AZT None   K122E, D123N, I135V, S162C, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K