Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Gonzales (2001)
Title HIV-1 reverse transcriptase and protease subtypes: Classification, amino acid mutation patterns, and prevalence in a northern California clinic-based population.
Citation J Infect Dis
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 2184
NumPts 2160
Subtype B, C, A, CRF01_AE, D

 

  Page 1 of 22    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 2184 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
CA1114 CA2500 AZT, 3TC, D4T NVP M184V K101KE, K103N, G190GA K20R, T200A, F214L  
CA1115 CA2515 D4T, AZT, 3TC None M41L, D67N, K70R, M184V, T215Y, K219E  R83RK, D123E, V245K  
CA1116 CA2516 AZT, 3TC, D4T None   R83K, V90I, G196E, R211K  
CA1118 CA2520 NRTI NNRTI M41L, D67N, K70R, M184V, L210W, T215Y, K219KQ  K20R, E44ED, T69P, K102R, K173N, H208Y, R211K, L228LH, A272S, T286A  
CA1119 CA2522 AZT, 3TC None   V60I, R83K, L193LF, R211K, V245E W153WL 
CA1120 CA2523 3TC, D4T None   M16MK, K22KN, R83K, K102KR, K104N, T131TP, P133L, N137I, K166R, D177DE K20K*, W24W*, A98AP, S105SP 
CA1121 CA2587 AZT, DDI, DDC, D4T, 3TC None M41L, D67N, T69D, M184V, T215Y  K20R, K122KE, I135T, I195L, R211K  
CA1122 CA2525 Unknown Unknown M184V, T215Y  K20R, K122E, I135V, S162C, D177E, I178M, Q207E, K277R  
CA1125 CA2533 AZT, DDC, DDI, 3TC, D4T None M41ML, D67N, T69D, K70R, T215FV, K219Q  T39X, V60I, A98AS, K101I, D123E, A158AS, S162X, D177N, G196E, L228LH, V245E  
CA1126 CA2534 AZT, DDI, 3TC, D4T NVP M41L, M184V, T215Y K103N K122KE, I135IT, I142V, E203D, Q207QE  
CA1128 CA2538 AZT, DDI, DDC, 3TC, D4T None M41L, D67N, K70R, M184V, L210W, T215Y, K219Q  E6D, T39A, E44D, K122E, I202V, R211K  
CA1129 CA2540 AZT, DDI, 3TC, D4T, Unknown Unknown  E138A R83K, G196E, R211RK  
CA1130 CA2542 AZT, D4T, 3TC None D67N, K70R, M184V, K219Q  K43KE, K122E, D123E, Q174K, D177E, I178M, Q207E, R211K, F214L  
CA1131 CA2578 AZT, 3TC, D4T, Unknown Unknown D67N, T215V, K219Q  K20KR, V35I, V60I, V118I, K122E, I135T, Q174N, Q207E, R211K, F214L, V245VE  
CA1132 CA2544 AZT, DDC, D4T, 3TC None M184V  I135T, I178L, R211N, F214L, V276I  
CA1133 CA2546 AZT, DDC, D4T, 3TC None M41L, M184V, L210W, T215Y  K43N, V60I, K104R, I142V, T165L, E169D, G196E, R211K, V245T, E248ED  
CA1136 CA2572 None None   R83K, K122E, V245VL  
CA1139 CA2585 AZT, DDC, 3TC, D4T, DDI None M41FL, M184V, L210W, T215Y  K13KN, K22KN, T39S, E44D, K64KR, V118I, K122E, I135T, I142X, R211K G18GA, W24W*C, E89ED 
CA1140 CA2588 NRTI, AZT, 3TC, D4T None M41L, M184V, L210W, T215Y  K49R, V60I, D123DE, I135T, I178M, Q207E, R211K  
CA1141 CA2590 D4T, DDI, AZT, 3TC None M41L, D67N, T69D, V75A, L210W, T215Y  V35I, T39A, E40F, K43E, V118I, D177E, G196E, Q207K, H208Y, R211E  
CA1142 CA2592 Unknown Unknown M41L, M184V, T215Y K103N, V108I S162C  
CA1143 CA2599 AZT, 3TC NVP K70R, M184V K103N M16ML, V90VI, D123E, I135T, S162Y, R211Q  
CA1144 CA2601 AZT, DDI, DDC, 3TC, D4T None D67N, K70R, T215F, K219Q  V35M, T69N, V118I, K122E, I135T, I202V, F214L  
CA1145 CA2603 D4T, DDI, AZT, 3TC NVP M41L, D67N, V75M, M184MV, L210W, T215Y, K219Q K101P, K103N T39A, E40F, K43E, V60I, K122E, D123E, I135T, I178M, V179VI, G196E, E203K, Q207D, H208Y, R211K, L228H  
CA1146 CA2605 Unknown Unknown   K20R, R83K, K103R, I135T, S162C, T215X  
CA1147 CA2608 AZT, DDC, D4T, 3TC None M41L, K65KR, D67N, K70R, M184V, T215F, K219Q  V60I, T69N, D123E, I142V, K166R, D177E, G196GE, I202V, R211K  
CA1148 CA2609 AZT, DDI, 3TC, D4T None M41L, D67N, K70KR, V75M, M184MV, L210W, T215Y, K219N  K20R, E44D, V60I, D123E, I142V, S162Y, G196E, Q197K, H208F, R211K  
CA1150 CA2613 3TC, D4T, AZT None M184V  K20KR, R83K, I135V, S162A, T200TA, R211K  
CA1152 CA2618 AZT, DDI, 3TC, D4T None   K122E, Q197QP, Q207E, V245K  
CA1153 CA2623 Unknown Unknown M41L, M184V, T215Y  P4S, K166R, D177E, I178IM, Q207E, R211K, L228LP  
CA1154 CA2625 NRTI, AZT, 3TC None M41L, D67N, T69D, K70R, M184V, T215F, K219Q  D177E, G196E, Q197K, D218E, A272P K43HN 
CA1155 CA2627 NRTI None M41L, D67N, L210W, T215Y, K219N  V35I, K43Q, E44D, V118I, D121H, K122E, I135T, D177E, G196E, H208Y, R211K, V245K  
CA1156 CA2629 Unknown Unknown M41L, D67N, M184V, L210W, T215Y A98G, V108I, Y181C, H221Y V35I, K43Q, E44D, T69E, R83K, V118I, K122E, I178L, G196E, H208Y, R211K, L228Q, D250E, A272P  
CA1157 CA2632 AZT, DDC, DDI, D4T, 3TC None M41L, A62AV, D67N, T69D, M184V, L210W, T215Y, K219KR  K20R, V35I, K43E, E44A, V118I, K122E, I135T, H208HY, R211K, F214FL, L228H, A272P, K277R  
CA1158 CA2633 AZT, DDI, 3TC NVP M41L, M184V, L210W, T215Y E138A K43N, V75L, K122E, I142V, S162C, R172RG, V179VA, I180IV, T200TA, R211Q, L228R L168LF 
CA1159 CA3147 AZT, DDI, D4T None   V35L, E79D, V179I, G196E, T200TA, Q207E, E248D, A272P  
CA1160 CA2637 AZT, 3TC None M184V, T215Y K101E E28K, S68G, A98S, D123E, I135V, I142T, R211K  
CA1161 CA2640 AZT, DDC, DDI, D4T, 3TC DLV M41L, D67~, T69G, K70R, L74I, M184V, T215F, K219Q K103N E6D, K20R, T27TP, T39N, K43E, K102R, D123E, K166R, D177E, V179I, G196EK, T200I, Q207E, F214L, V245K, A272P, K277R  
CA1162 CA2641 3TC, D4T None M184V  R83K, V245E  
CA1163 CA2643 NRTI NNRTI D67N, L210W, T215Y  E44D, A98S, I142V, S162Y, E203K, Q207D, R211K, E248D, Q278H, I293V  
CA1164 CA2645 Unknown Unknown M184V  D123E, K166R, D177E, V245E, K277R, Q278QH, T286A  
CA1166 CA2649 AZT, DDC, D4T, 3TC None K65R, K70R, V75I, F77L, Y115F, F116Y, Q151M, K219KE  E6D, V35IM, S68G, K122E, I135T, T200I, I202V, V245M, A272P, K275KR, E297D T216TI 
CA1167 CA3119 DDC, AZT, 3TC, D4T NVP M184V K103N, G190GA K20R, S162C, E203D, R211K Y146YC 
CA1168 CA2653 3TC, D4T None M184V  D123E, K166R, D177E, V189VI, R211K, V245M, A272AG, I293V  
CA1171 CA3178 AZT, 3TC NVP M184V K103N E6D, R83K, K102Q, K122E, S162A, I178L, Q207E, R211K, A272P, K277R, I293V  
CA1172 CA2661 AZT, DDI, DDC, 3TC, D4T None M41L, M184V, T215Y  V35T  
CA1174 CA2668 AZT, DDC, 3TC, D4T None M184V  R83K, K122P, S162C, D177E, A272P, K277R  
CA1175 CA2670 AZT, 3TC None M184V  V35X, D121HY, K122E, S162C, E169ED, F171FY, D177E, R211K, A272P, K277KR, K281R, I293IV, E297K  
CA1176 CA2672 Unknown Unknown M41L, A62V, L74V, M184V, L210W, T215Y  K43N, V118I, K122E, D123E, I135T, S162C, T200R, R211N, A272P, Q278H  
CA1177 CA2673 Unknown Unknown M41L, L74V, M184V, L210W, T215Y  I31L, V35M, E44D, A98S, V118I, K122E, I178M, R211N, E248D, I293IV, E297A  
CA1178 CA2675 Unknown Unknown M41L, M184V, L210LW, T215Y  T39A, V60I, K122E, I135T, I142V, S162H, A272P, A288ST  
CA1179 CA2677 Unknown Unknown M184V  R83K, S162C, I178L, V245E, A272P, I293V  
CA1253 CA3012 AZT, 3TC NVP M184V K101E, K103KN, G190A R83K, K122P, D177E, T200A, E204EG, A272P K220KI 
CA1255 CA3017 Unknown Unknown M41L, T215Y  V35I, T39TA, R83K, A98S, K122P, I135T, I178M, Q207E, K219KT, K220KR, T286A, I293V R199RS 
CA1257 CA3022 AZT, DDC, 3TC, D4T NVP M41L, D67N, M184V, L210W, T215Y, K219N K103N, V106VA K43Q, V118I, K122E, D123E, I135T, G196E, T200A, D250E, L283I, R284K  
CA1259 CA3026 AZT, DDC, D4T, 3TC None M41L, D67N, M184V, L210W, T215Y, K219N  E44D, V118I, K122E, D123E, D177E, I178M, H208Y, R211K, E248D, A272P, K277KR, T286A, E297K A299AG 
CA1261 CA3030 None None   R83K, K122KE, I142IM, T165I, K173KE, Q174K, I178IM, I202V, Q207E, R211RK, A272P  
CA1265 CA3039 DDI, 3TC None M184V H221Y E6D, K20KR, I135T, S162C, T200I, V245K, A272T, K277R  
CA1266 CA3041 NRTI, AZT, 3TC, DDI, D4T NVP M41L, D67N, M184V, L210W, T215Y, K219KN K101KE, K103N, K238T K43KQ, V60VI, K122P, I135T, I142IV, D177E, I178IM, G196E, Q207E, A272P, K277R  
CA1267 CA3042 NRTI, 3TC, D4T, ADV None M41L, D67N, M184V, T215Y  K20R, V60I, K101Q, K104N, I135T, S162C, T200A  
CA1272 CA3056 AZT, DDC, 3TC None D67N, K70R, M184V, T215TI, K219Q  T39TA, K64N, T69TN, V90I, K104KR, I135V, S162Y, K173KR, E224D, L228H, V245M, E248S, D250DE, A272P  
CA1273 CA3057 AZT, DDC, D4T, DDI None D67N, K70R, K219Q  T39A, K64Y, K104N, T200A, I202V, R211K, F214L, L228H, V292VI, I293V, E297A  
CA1274 CA3060 AZT, DDC, 3TC, DDI, D4T DLV D67N, K70GR, T215F, K219Q K103N K102Q, K122E, I135V, D177DE, G196E, I202IV, E248D, A272G  
CA1276 CA3064 DDI, DDC, AZT, 3TC None   K20KR, D123E, I135IT, I178IM, G196E, T200A  
CA1277 CA3066 AZT, D4T, DDI, DDC, 3TC None D67N, K70R, M184V, K219Q  V60I, K103R, K104N, S162A, T200A, Q207E, F214L, A272P, K277R, A288S  
CA1278 CA3068 Unknown Unknown M41L, D67N, L74I, L210W, T215Y, K219E K103KN, Y181C E44D, V118I, K122KE, D123E, E169D, D177G, T200A, Q207E, H208HY, R211K, A272P, K277R  
CA1280 CA3072 AZT, 3TC None M184V  V60VI, K64KR, I135R, V189I, V245E, R284K, T286A, P294T, A304G  
CA1281 CA3079 AZT, Unknown, 3TC, DDC Unknown, NVP  K103N E6D, S48ST, K49KR, I50IV, K122E, Q145QH, K166KR, E169ED, E203D, Q207E, A272P, K277R, L283I  
CA1282 CA3081 Unknown Unknown D67N, T69D, K70R, M184V, T215Y, K219Q K101P, Y181YC T27S, R83K, K122E, I135T, S162Y, E203D, R211K, D218E, T286A, A288S, I293V, E297A  
CA1283 CA3083 AZT, DDI, 3TC, D4T None   K102Q, K122E, R211K, V245M, A272P, K277R, T286A  
CA1284 CA3085 AZT, DDI, DDC, Unknown, D4T, 3TC Unknown M41L, D67DN, L210W, T215Y  E44D, V60VI, I135IT, Q207E, H208X, R211K  
CA1285 CA3088 AZT, DDI, DDC, 3TC, D4T NVP M184MV  I202IL, Q207E, R211RK, T215X, K219KT, K220KR, L228LP, E248ED, A272P R199RS, K201KN, D218DV 
CA1286 CA3157 AZT, NRTI, 3TC None K70R  T69S, I135IV, K166R, D177E, R211K, K277R, I293V  
CA1287 CA3159 AZT, 3TC NVP M184V K103N, E138Q D123E, I135L, I142T, Q174E, L228LP, D250S S156SL, L234LR 
CA1290 CA3214 DDC, AZT, D4T, 3TC, DDI NVP M41L, D67N, K70R, L74I, M184V, T215F, K219Q K103N K122E, I178M, T200A, Q207E, D218E, K223KR, D250A, A272P, E297A R172RS 
CA1291 CA3216 Unknown Unknown M41L, T215Y  V35R, R211K, V245E, A288V, I293V  
CA1292 CA3218 NRTI, AZT, 3TC, D4T NVP   K49R, R83K, K173Q, Q174QH, R199RT, T200TP, K201KI, R211K, K220KE, V245VE, A272P, E297A D218DV 
CA14170 CA3032 D4T, AZT, 3TC, DDI None M184V  I31IL, I135T, V292I, I293V  
CA4172 CA1191 DDC, AZT, 3TC, D4T, DDI, Unknown Unknown M41L, D67N, M184I, L210W, T215Y, K219R  V35I, K43E, K122E, I202V, R211K, D218E, D250E, S251D  
CA596 CA1119 AZT, DDI, D4T, 3TC None M41L, D67N, M184V, L210LW, T215Y  L26LF, K43EQ, V118VI, I135T, R211K  
CA597 CA1121 AZT, 3TC None   D121H, K122E, D123E, S162C, L210F, R211Q  
CA598 CA1123 D4T, DDI, AZT, 3TC DLV, NVP M41L, D67N, T69D, M184V, L210W, T215Y, K219KN A98G, K103N, Y181C E6D, T39A, K43EQ, E44D, V118VI, K122E, I142T, K166R, G196E, Q197QK, I202V, R211K  
CA599 CA1125 AZT, 3TC, DDC, D4T None D67N, K70R, T215F, K219Q  K32N, T39A, A98AS, D121Y, K122E, I135K, K173Q, I178L, V245Q  
CA602 CA1132 AZT, 3TC, DDI, D4T None D67N, K70R, M184V, K219Q  K11R, I135IT, T200A, Q207R, R211E, D218E  
CA620 CA1181 AZT, DDC, DDI, 3TC None M41L, D67N, M184V, L210W, T215Y, K219N  E44D, V60I, V118I, K122E, I135V, G196E, E203K, Q207E, R211K  
CA624 CA1189 DDI, 3TC, D4T, AZT None A62V, K70G, V75I, F77L, Y115F, F116Y, Q151M, M184EV  S68G, T69N, K166KR, D177DE, I178M V148VE, Y183Y* 
CA631 CA1203 AZT, DDC, D4T, DDI, 3TC None M41L, D67N, V75M, M184V, L210W, T215Y, K219N  E6D, V35VI, T39A, E44D, V118I, K173T, E203K, Q207D, H208Y, R211K  
CA633 CA1207 AZT, DDI, NRTI, D4T, 3TC NVP M184V K103N, M230ML K122E, T165I, V245E, K277R, Q278QH  
CA636 CA1213 AZT, D4T, DDI None M41L, T215Y  K20R, S134SR, V245K, K277R, K281R, T286A, I293V, E297K  
CA639 CA1219 AZT, DDC, DDI, 3TC, D4T None M41L, M184V, L210W, T215Y  D121Y, K122E, I135V, S162C, T200A, R211K  
CA640 CA1221 AZT, 3TC, D4T, DDI NVP M41L, L74LV, T215Y V106VA, Y181YC P4PS, D123E, I135T, I142T, D177E, V179I, G196E, K275Q, T286A, A288G, I293V, P294T, E297X  
CA643 CA1227 AZT, D4T, 3TC, DDI None   K122E, K201R  
CA644 CA1229 AZT, 3TC, D4T, DDI NVP M41L, L210W, T215Y Y181YC, G190GA K49R, V60I, K104N, D121Y, K122E, R211K, V245R  
CA789 CA1423 AZT, DDC, 3TC, D4T None A62V, V75T, M184V  I37L, K122E, D123N, P133X, D177DE, I178IM, T200TA, E204ED, Q207DN, R211K S268SR, I270IM 
CA791 CA1427 NRTI, AZT, 3TC, D4T NVP M41L, D67N, T69D, M184V, L210W, T215Y Y181C V35M, E44D, V111I, K122E, I135T, V179VI, G196E, Q197K, E203D, Q207E, H208Y, R211K  
CA797 CA1439 NRTI, AZT, 3TC None M184V  K82R, R83K, D123E, S162C, E169ED, G196E, R211RG, D250E  
CA798 CA1441 NRTI, DDC, AZT, 3TC None M41L, M184V, L210LW, T215Y  V21I, K122E, D177E, T200A, R211K  
CA800 CA1445 None None   S68R, K122E, V245VM, A272P, K277R  
CA802 CA1449 RTI, AZT, DDI, 3TC, D4T RTI  Y181C E6D, I135T, T200I, Q207E  
CA803 CA1451 AZT, 3TC, D4T None M184V  R83K, S162C, Q174QR, I178L, Q197QH, T200TA, Q207E, R211K, A272P, K277R