Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Milazzo (1999)
Title Evidence of stavudine-related phenotypic resistance among zidovudine-pretreated HIV-1-infected subjects receiving a therapeutic regimen of stavudine plus lamivudine.
Citation JAIDS
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 40
NumPts 20
Subtype B

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
Mil-AR MilazzoAR0 AZT, 3TC None K70KR, M184MV  R83RK, I135T, I142M, Q207H, R211K  
  MilazzoAR1 AZT, 3TC None K70KR, M184MV  D123DE, I135T, I142M, Q207H, R211K  
Mil-BO MilazzoBO0 AZT None M41L, L210W, T215Y  V35I, K43E, R72RG, R83K, T200I, H208Y, R211K, L228R  
  MilazzoBO1 AZT, 3TC None M41L, M184V, L210W, T215Y  M16ML, V35IT, K43KE, E44D, R83K, D123E, T200TI, R211K, L228R  
Mil-BT MilazzoBT0 AZT None K65KE  E29EG, K49R, K64R, K102KR, I178ILM, V179VI, G196GE N54NK, F77FV, P133PH 
  MilazzoBT1 AZT, 3TC None M184MV  K49R, K64KR, D123EG, Q174QH, I178L, V179I, G196E P157PS 
Mil-CH MilazzoCH0 AZT None M41L, T215Y  T39TA, S162A, Q207E  
  MilazzoCH1 AZT, 3TC None M41L, M184V, T215F, K219Q  K20R, E28ED, I135T, S162DHN, V179VI, F214L  
Mil-CO MilazzoCO0 AZT None D67N, T69D, K70R, T215F, K219Q  V90I, K103R, D123E, I135T, S162N, V179I, Q207X, F214L  
  MilazzoCO1 AZT, 3TC None D67N, T69D, K70R, M184V, T215F, K219Q  V90I, D123E, I135T, Q161H, S162H, V179I, Q207E, F214L  
Mil-DR MilazzoDR0 AZT None D67DN, K70KR, K219KQ  D123E, I135T, R211K, F214L  
  MilazzoDR1 AZT, 3TC None D67DN, K70KR, K219KQ  D123E, I135T, R211K, F214L, T215X  
Mil-FO MIlazzoFO0 AZT None   R83K, V90I, S117T, R211K  
  MilazzoFO1 AZT, 3TC None   R83K, V90I, S117T, K122E, D123E, R211K  
Mil-FR MilazzoFR0 AZT None M41L, L210LW, T215Y  V60I, R83K, D123E, T200TS, R211K, L228LH T128TS 
  MilazzoFR1 AZT, 3TC None M41L, M184V, T215Y  E28EG, V60I, Q207E, R211K  
Mil-LI MilazzoLI0 AZT None M41L, L210W, T215Y Y181S E6D, K22KN, V35I, K43E, R83K, K102Q, V118I, D123E, S162Y, Q207E, R211K, L228H  
  MilazzoLI1 AZT, 3TC None M41L, L210W, T215Y  E6D, G45R, G51R, R83K, K102Q, V118I, D123E, G141R, S162Y, G190R, Q207E, R211K, L228H  
Mil-LU MilazzoLU0 AZT None   K102Q, D123E, I135T, S162C, D177E  
  MilazzoLU1 AZT, 3TC None   K102Q, D123E, I135T, S162C, D177E  
Mil-MA MilazzoMA0 AZT None K70KR  V35IT, I50V, R83K, D123E, K166R, K173KT, I178L, G196E  
  MilazzoMA1 AZT, 3TC None   V35IMT, S48ST, R83K, D123E, K166R, D177E, I178L, G196E  
Mil-MI MilazzoMI0 AZT None  M230MI K11KT, K49R, R83K, G141GR, Q197QH, Q207K  
  MilazzoMI1 AZT, 3TC None   V35I, K49R, R83K, K126R, Q197H F116I 
Mil-MT MilazzoMT0 AZT None K65KN, D67N, K70R, T215Y, K219Q  K104KN, D123E, I135T, D218E G213D 
  MilazzoMT1 AZT, 3TC None D67N, K70R, M184V  K64KR, D123E, I135T, F214L D218A 
Mil-SA MilazzoSA0 AZT None K65E, K70R, T215Y, K219Q E138A K20R, K32N, E42EG, E44G, G45GR, R83G, D123E, I135T, G196GE, E204D, F214L R78G 
  MilazzoSA1 AZT, 3TC None M41ML, D67N, K70R, M184V, K219Q E138A K20R, K32N, T107TS, D123E, I135T, E203D, E204ED, F214L S68SC 
Mil-TA MilazzoTA0 AZT None   R72RG, R83K, D123E, A158S, E169ED, K173KR, T200TA  
  MilazzoTA1 AZT, 3TC None   R83K, D123E, A158S, T165TI, E169D, D177DG, T200TA, R211RK K30KN 
Mil-TE MilazzoTE0 AZT None D67DN, K70R, M184MV, T215TA, K219Q  T69TN, D123E, D177E, I178ILM, G196GE, R211NS, F214L  
  MilazzoTE1 AZT, 3TC None D67DN, K70KR, T215TI, K219Q  D123E, D177E, G196E, R211S, F214L  
Mil-TO MilazzoTO0 AZT None M41L, T215Y  T39A, D123E, I135M, S162C, Q207E P226PL, G231GS 
  MilazzoTO1 AZT, 3TC None M41ML, M184V, T215Y  T39A, D123E, I135M, S162C, D177E, I178M, T200R, Q207E P226PL, G231GS 
Mil-TS MilazzoTS0 AZT None M41L, L210W, T215Y  V10L, T39A, K43N, D121N, K122E, D123E, T200A, R211K Q145QR, Y146YC 
  MilazzoTS1 AZT, 3TC None M41L, M184V, L210W, T215Y  V10L, A33AG, T39A, K43N, D121N, K122E, D123E, T200AV, R211K  
Mil-TU MilazzoTU0 AZT None M41L, T215Y  E28EK, E29ED, R83K, T107P, D121N, F214L K49*GR, R78RIT, Q85HL 
  MilazzoTU1 AZT, 3TC None M41L, M184V, T215Y  K49R, N54I, R83RK L80LF, Q85QR, E89EA, H96HR 
Mil-ZG MilazzoZG0 AZT None D67N, K70R, T215F, K219Q  T7P, A98S, I178M, T200A, I202V T128TS 
  MilazzoZG1 AZT, 3TC None D67N, K70R, T215F, K219Q  T7P, A98S, I178M, M184L, T200A, I202V T128TS