Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Venturi (1999)
Title Genotypic resistance to zidovudine as a predictor of failure of subsequent therapy with human immunodeficiency virus type-1 nucleoside reverse-transcriptase inhibitors.
Citation Eur J Clin Microbiol Infect Dis
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 78
NumPts 39
Subtype B, C

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
GV-1 Vent1B AZT None   K49R, R83K, D123E, D177E  
  Vent1W24 AZT, DDI None   R83K, D123E, D177E, R211K  
GV-10 Vent10B AZT None D67N, K70R, K219Q  K49R, A98S, K101R, D123E, I135T, D177E  
  Vent10W24 AZT, DDI None D67N, K70R, K219Q  K49R, A98S, K101R, D123E, I135T  
GV-11 Vent11B AZT None D67N, K70R, T215S, K219Q V106I T69N, D123E, I135IT, F214L G51A, Y144Y* 
  Vent11W24 AZT, DDI None D67N, K70R, T215S, K219Q V106I K43R, T69N, V118M, D123E, I135T, Y144*, F214L  
GV-12 Vent12B AZT None M41L, L210W, T215Y  K43E, I135T  
  Vent12W24 AZT, DDI None M41L, K65N, L210W, T215Y K103T K43E, V118I, I135T, R211RK  
GV-13 Vent13B AZT None D67DN, K70R, T215F, K219Q  T69N, K104N, V118I, K122E, I135T, A158S, S162D, G196GE, I202V, R211RK, F214L  
  Vent13W24 AZT, DDI None D67N, T69D, K70R, T215F, K219Q  V60I, K104N, V118I, K122E, I135T, S162D, G196E, I202V, F214L, E224D  
GV-14 Vent14B AZT None   E53EQ, R72K, K166R, I202V  
  Vent14W24 AZT, DDC None M184I  K103KR, D121N, D123E, W153*, G155R, K166R, G196R, I202V  
GV-15 Vent15B AZT None K70R  K122E, D123N, I135T, D177E, T200A, I202V, F214L  
  Vent15W24 AZT, DDC None K70R  K122E, D123N, I135T, D177E, T200A, I202V, F214L  
GV-16 Vent16B AZT None K70R  I50N, G51R, K64R, E89K, K102Q, K122E  
  Vent16W24 AZT, DDC None   E53D, K122E R143G 
GV-17 Vent17B AZT None K70R  K49R, R83K, R211K  
  Vent17W24 AZT, DDC None M41L, K70KR, T215Y  K49R, R211K  
GV-18 Vent18B AZT None D67DN, K70R  S48T, K122P, I135T, D177E, Q207E  
  Vent18W24 AZT, DDC None D67DN, K70R  K122P, I135T, S162C, D177E, Q207E, R211RK, T215X  
GV-19 Vent19B AZT None     
  Vent19W24 AZT, DDC None K70R  D123E, G196E, Q207E, F214L  
GV-2 Vent2B AZT None   V35I, R83K, K122KR, D123E, Q207X, R211RK  
  Vent2W24 AZT, DDI None F77L  V35I, R83K, D123E, Q207E, R211RK  
GV-20 Vent20B AZT None M41L, T215Y  T39A, K49R, V60I, R83K, L100*, D123DE, I135T, L149P, K166R I50G, F87S, V90A, V148A, F160S, H198Q, I202K, L209LQ 
  Vent20W24 AZT, DDC None M41L, T215Y  K49R, I50V, V60I, R83K, D123E, I135T, K166R  
GV-21 Vent21B AZT None K65N, T215Y K103T V35L, S48SL, R83K, D123E, D177E, T200A, K201KQ, Q207E K73N, E79EA, Y115L, I167L 
  Vent21W24 AZT, DDC None K70R, T215Y A98G V35L, R83K, D123E, Q174E, D177E, T200A, Q207E E79EV 
GV-22 Vent22B AZT None D67N, T69D, T215Y  V35T, T39E, S48T, D121H, K122E, D123S, A158S, S162T, K173T, D177E, T200A, Q207E  
  Vent22W24 AZT, DDC None D67N, T69D, K70R, T215DY  V35T, T39E, S48T, D121H, K122E, D123S, A158S, S162T, K173T, D177E, T200A, Q207E  
GV-23 Vent23B AZT None D67N, K70R, K219Q  D123E, D177E  
  Vent23W24 AZT, DDC None D67DN, K70R, K219KQ  D123E, D177E  
GV-24 Vent24B AZT None M41L, T215Y  K43T, K49R, K122E, K220N G155E 
  Vent24W24 AZT, DDC None M41L, T215Y  E44D, K49R, K122E, G196E, H221Q  
GV-25 Vent25B AZT None M41L, T215Y  A98S, K102R, R211EK  
  Vent25W24 AZT, DDC None M41L, T215Y  A98S, K102R, R211E  
GV-26 Vent26B AZT None M41L, L210W, T215Y F227L E44D, K122E, D123E  
  Vent26W24 AZT, DDC None M41L, T215Y  E44D, V118I, K122E, I135T  
GV-27 Vent27B AZT None M41L, L210W, T215Y  V35I, K43KN, D123E, I135T, R211K  
  Vent27W24 AZT, DDC None     
GV-28 Vent28B AZT None   F214L, E224K  
  Vent28W24 AZT, 3TC None   K30R, T39P, K43R, D123E, F214L H221P 
GV-29 Vent29B AZT None   R83K, D123E, R211K  
  Vent29W24 AZT, 3TC None   R83K, D123E, E169D, R211K L210A 
GV-3 Vent3B AZT None   R83K, K122KE, D123E, I135T, G196E, T200A  
  Vent3W24 AZT, DDI None K70R, T215S  R83K, D123E, I135T, Y144*, G196E  
GV-30 Vent30B AZT None T215D A98G, K103KT R83K, K122E, D123E, D177E, I178M, T200A, R211K I167IL 
  Vent30W24 AZT, 3TC None M41L, D67N, M184V, L210W, T215Y  K122E, D123E, D177E, I178M, T200A, R211K  
GV-31 Vent31B AZT None K70R  D123E, R211K, E224N, P225L  
  Vent31W24 AZT, 3TC None K70R  D123E, R211K G51A, E79A 
GV-32 Vent32B AZT None K70R  V35I, S48E, T69N, D123E, I135T, I142V, F214L  
  Vent32W24 AZT, 3TC None K70R  S48E, T69N, D123E, I135T, I142V, F214L  
GV-33 Vent33B AZT None K70R  K122E, D123E, S162C, E169D, T200A, F214L  
  Vent33W24 AZT, 3TC None K70KR, M184MV  K122E, D123E, S162C, E169D, T200A, F214L  
GV-34 Vent34B AZT None K70R  V35M, T39S, R83K, D123E, D177E, G196E  
  Vent34W24 AZT, 3TC None K70KR, M184MV  V35M, T39S, R83K, K104E, D123E, D177E, G196E  
GV-35 Vent35B AZT None K70R  K122P, D123E, D177E, Q182H, F214L Y183G 
  Vent35W24 AZT, 3TC None K70R, M184MV  K122KQ, D123E, D177E, F214L  
GV-36 Vent36B AZT None M41L, T215FY  D123E, R211K  
  Vent36W24 AZT, 3TC None M41L, M184V, T215Y  D123E, R211K  
GV-37 Vent37B AZT None M41ML, K70R  V35T, T39X, T200A, E203D, R211K, T215X L149LV 
  Vent37W24 AZT, 3TC None M41ML, K70R, M184MV, T215Y  V35T, T39S, D123E, D177DE, T200A, E203D, R211K E42Q 
GV-38 Vent38B AZT None D67DN, K70R, T215Y  V35L, R83K, D123E, D177E, G196GE, T200A, Q207E  
  Vent38W24 AZT, 3TC None D67DN, K70R, T215Y  V35L, R83K, D123E, D177E, G196GE, T200A, Q207E  
GV-39 Vent39B AZT None D67N, K70R, K219Q  K49R, A98S, K101R, D123E, I135T, S162X, D177E, T215X  
  Vent39W24 AZT, 3TC None D67N, K70R, M184MV, T215F, K219Q  K49R, A98S, K101R, D123E, I135T, S162SG, D177E  
GV-4 Vent4B AZT None K70R  V35T, T69S, D123E, D177N, G196E, F214L  
  Vent4W24 AZT, DDI None K70R  V35T, T69S, D123E, D177N, G196E, F214L  
GV-5 Vent5B AZT None K70R  V35I, V60I, R83K, D123E, I135T  
  Vent5W24 AZT, DDI None K70R  V35I, V60I, T69S, R83K, D123E, I135T  
GV-6 Vent6B AZT None K70R  K122E, D123E, T200A  
  Vent6W24 AZT, DDI None M41L, T215Y  K103X, K122E, D123E, T200A E79A, V90A, Y115YS 
GV-7 Vent7B AZT None D67N, K70R  K49R, R83K, E169D  
  Vent7W24 AZT, DDI None K70R  K49R, R83K, D123E, E169ED  
GV-8 Vent8B AZT None K70R V179D D123E, I135T, R211K, F214L  
  Vent8W24 AZT, DDI None K70R, T215F, K219Q V179D S68SG, K82KR, V118VI, R211K, F214L  
GV-9 Vent9B AZT None D67N, K70R, K219Q  V60I, D123E, I135V, L228LH  
  Vent9W24 AZT, DDI None K70R, K219Q  V60I, T69N, D123E, F214L  

Database

Resources

Team