Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Zolopa (1999)
Title HIV-1 genotypic resistance patterns predict response to saquinavir/ritonavir in patients in whom previous protease inhibitor therapy failed.
Citation Ann Intern Med
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 53
NumPts 46
Subtype B

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
CA1123 CA3193 AZT, 3TC None D67N, M184V, T215F, K219Q  T27TP, I31L, V35M, T39TP, K64KR, D121DY, K122E, E169D, D177E, I202V, R211K, K277R, T286TA, P294S  
CA1124 CA3170 AZT, DDI, 3TC, D4T None M41L, M184V, T215F  K20R, I142V, Q207E, R211K, V245K, A272P  
CA1127 CA3164 AZT, DDI, DDC, 3TC, D4T None D67N, K70R, M184V, T215F, K219Q  K20R, T69N, K102R, K122P, I135V, D177E, V179I, G196E, F214FL, V245T, A272P, Q278H  
CA1137 CA3126 AZT, DDC, D4T, DDI, 3TC None M41L, M184V, T215Y  T39A, R83K, V90I, S162Y, A272P, K277KR, Q278H  
  CA23914 AZT, DDC, D4T, DDI, 3TC, ABC EFV, DLV M41L, L74V, Y115F, T215Y K103N, Y181C T39A, V90I, K122E, S162A, I202IV, A272P, K277R, Q278H  
CA1138 CA2577 AZT, D4T, 3TC None K70R, M184V  E6K, K103R, K122E, I135L, Q197QL, Q207E, R211K D192DY 
CA1151 CA2615 AZT, DDC, D4T, 3TC None M41L, T215C  K43KN, V60I, G196GE, Q207X, R211X, V245K  
CA1159 CA2636 AZT, DDI, D4T NVP  V106VA, Y181YC V35L, E79ED, V179I, G196E, T200A, E203K, Q207E, E248D S268SR 
  CA24138 AZT, DDI, D4T NVP K70R, K219E Y181C K20R, V35L, T69N, E79D, K102M, V179I, G196E, T200A, E203K, Q207E, D218DE, L228R, E248D, A272P, T286A, P294PS, E297K  
CA1165 CA3104 AZT, DDC, D4T, 3TC NVP M41L, T69D, M184V, T215Y, K219R  K20R, V60I, V118I, K122E, I135M, G196E, F214L, L228H  
CA1167 CA2651 DDC, AZT, 3TC, D4T NVP M41L, D67G, T69D, K70R, V75M, F77L, M184V, T215Y K101E, G190A A98S, A158S  
CA1170 CA2657 AZT, DDI, 3TC, D4T, DDC None D67N, K70R, M184V, T215V, K219E  T69N, I135T, T200A, Q207E  
CA1173 CA3099 AZT, DDI, 3TC, D4T None D67N, K70R, M184V, K219Q  T27S, I31V, K64H, T69N, K122E, I195L, D218E, L228H, V245M, E248V, K249Q, A288T, I293V  
CA1251 CA3143 AZT, DDC, DDI, 3TC, D4T NVP D67N, K70R, M184V, T215F, K219E Y188L T69N, K122E, D237DE, V245R, A272P, K277R  
  CA23168 AZT, DDC, DDI, 3TC, D4T, ABC, Unknown NVP, Unknown M41L, D67N, K70R, L74I, M184V, T215F, K219E Y188L V35I, V60VI, T69N, V118I, K122E, V179I, H208Y, K223E, L228H, V245R, A272P, K277R, I293V  
  CA23170 AZT, DDC, DDI, 3TC, D4T, ABC, Unknown NVP, Unknown M41L, D67N, K70R, L74I, M184V, T215F, K219E Y188L V35I, V60I, T69N, V118I, K122E, V179I, H208Y, K223E, L228H, V245R, A272P, K277R, I293V L303P 
CA1254 CA3015 3TC, D4T None M41L, M184V, T215Y  S48T, K64KR, K122E, Q207E, H235HN, V245VG, A272P, K277R, T286A, P294S, E297R P226PQ 
CA1256 CA3019 AZT, 3TC, D4T NVP A62V, M184V, T215F G190A I135T, A158S, D177E, R211K, I293V, E297A Y127YC 
CA1260 CA3028 AZT, DDC, DDI, Unknown, 3TC, D4T Unknown D67N, K70R, M184V, T215F, K219Q Y188L K13KN, V35M, T39A, K49R, K64HY, V118I, D123E, S162D, T165I, E169D, D177E, V179I, G196E, I202V, Q207H, R211K, F214L, D218E, L228H, A272P, T286A, E297K  
CA1263 CA3034 AZT, DDI, D4T, 3TC None T215CG  T39A, I142V, S162C, Q207E, V245VI, V292I, I293V E138EV 
CA1264 CA3037 AZT, 3TC None M184V  V35R, T69TS, R72RG, R83K, L100LF, I135V, Q207E, V245E, A272P, K277R, T286A, E297K L74LF, N81NY, Q85QP 
CA1268 CA3044 AZT, Unknown, 3TC, D4T Unknown M41L, D67N, T69D, L210W, T215Y  K20R, V35I, K122E, H208Y, R211K, V245E, K277R, I293V, E297K  
CA1270 CA3048 AZT, DDI, 3TC, D4T NVP M41L, D67DN, L210W, T215Y  W88S, K166I, R211K, K277R, T286A, E291D A299AG 
CA1271 CA3050 AZT, DDI, D4T, 3TC NVP M41L, D67N, M184V, L210W, T215Y, K219N G190A K20R, T39A, E44D, V118I, K122E, I135T, D177E, E203K, H208Y, R211D, L283I, R284K, I293V  
CA1279 CA3070 DDI, D4T None T215Y  E6D, K122E, T200I  
CA1284 CA3085 AZT, DDI, DDC, Unknown, D4T, 3TC Unknown M41L, D67DN, L210W, T215Y  E44D, V60VI, I135IT, Q207E, H208X, R211K  
CA1288 CA3161 D4T, AZT, 3TC, DDI NVP K70KR, M184V K103N, G190GA T27TS, K122E, D123N, I135IT, T200TS, Q207E, R211K, F214L, V245T, K277R, V292I, I293V, E297A  
CA1289 CA3210 AZT, D4T, 3TC None M184V, K219KIR  K20R, V35I, I135V, I142V, T165I, K201KI, K220KN, K238KR E53E* 
CA596 883-3 AZT, DDI, D4T, 3TC None M41L, D67N, M184V, L210W, T215Y V106I E40F, K43E, K104R, T107P, V118I, Q207E, H208Y, R211K, A272P, K277R  
  CA3145 AZT, DDI, D4T, 3TC None M41L, D67N, M184V, L210LW, T215Y  E40X, K43E, V118VI, I135IT, Q207QE, H208HY, R211K, V245VE, A272P, K277R  
CA605 CA3173 AZT, 3TC, D4T NVP M41L, D67N, T69D, K70R, V75M, M184V, L210W, T215F, K219Q K103N K20R, K43KE, V60I, D121HY, K122E, I135M, S162F, E169ED, D177E, G196E, H208Y, R211K, L228H, V245VE  
CA606 CA1142 AZT, DDI, D4T, 3TC None M41L, M184V, T215Y  K20R, A98S, K122E, A158S, Q197E, L228LH  
CA622 CA3188 AZT, DDC, DDI, 3TC, D4T None M41L, D67N, K70R, V75VA, L210W, T215Y, K219E  V35I, E44D, V118I, K122E, I202V, H208Y, R211K, L228H, I257L, I293V, E297K  
CA624 CA3097 DDI, 3TC, D4T, AZT None A62V, K70G, V75I, F77L, Y115F, F116Y, Q151M, M184V  S68G, T69KN, K166R, D177DE, I178IM, R211K, K277R, I293V  
  CA23587 DDI, 3TC, D4T, AZT, Unknown, ABC EFV, Unknown, NVP A62V, K70G, V75I, F77L, Y115F, F116Y, Q151M, M184V V108VI, Y181C, H221Y, K238KT S68G, T69K, K166R, D177E, Q207E, R211K, L228H, K277R, I293V  
CA626 CA3200 AZT, DDI, D4T, 3TC None D67G, K70G, F77L, F116Y, Q151M, M184V  I31IL, S68N, Q207E, F214L, T286A  
CA628 CA1197 AZT, DDC, D4T, 3TC None M41L, M184V, L210W, T215Y  K20R, V35I, K43KN, A272P, K277R, I293V, E297K  
CA629 CA3205 DDI, AZT, 3TC, D4T None M41L, D67N, T69D, K70R, M184V, T215F, K219Q  V35I, K122E, I180V, H208Y, D218E, L228H, A272P, K277T, I293V  
CA630 CA3149 AZT, DDC, 3TC, D4T None D67N, K70R, M184V, K219Q  K102R, T215X, I293V, E297K  
CA632 CA3135 AZT, DDC, DDI, D4T, 3TC None M41L, D67N, T69D, M184V, L210W, T215Y  T39A, K43A, E44D, V118I, K122E, I142V, Q207E, R211K K126KE 
CA634 CA3138 AZT, DDI, D4T, DDC, 3TC None M41L, D67N, T69D, M184V, L210W, T215Y  K43E, E44A, W88C, V118I, I135V, I142V, K166KR, D177E, I178M, G196E, T200TA, E203D, H208Y, R211DN  
CA635 CA3141 AZT, DDC, 3TC, D4T, DDI None D67N, K70R, M184MV, T215F, K219Q A98G K64KR, D123E, I135T, Q207K, F214L, T286A, K287R  
CA637 CA3090 AZT, DDI, 3TC, D4T None M41L, M184MV, T215Y  K20R, K122E, I135T, T200A, R211RK, A272P, I293V, P294L  
CA641 CA3114 AZT, DDI, 3TC, D4T None M41L, D67DN, T69AD, M184V, L210W, T215Y  K20KR, V35M, T39S, K43E, E44D, V111VI, V118I, K122E, T200A, E203K, Q207D, H208Y, R211K, K223E, L228HR, A272P, K277R  
CA642 CA3186 AZT, DDI, 3TC, D4T NVP M41L, D67N, T69D, K70R, M184V, T215F, K219Q V106VA, G190GA K43KE, S48SP, K122KE, D123E, S162A, D177E, V179I, G196GE, R211Q, D218E, A272P, K277R A33AP, I37IT 
CA790 CA3166 AZT, DDC, 3TC, D4T None M41ML, D67N, K70R, M184V, T215Y, K219Q  V35IT, T39TA, I135T, V179VI, D218E, E248D, I293V, E297A  
CA792 CA3153 AZT, 3TC, D4T DLV M41ML, M184V, T215Y Y188L K13KN, A98S, K122E, T165I, T200A, R211T, A272P, K277R  
CA794 CA3180 AZT, DDI, DDC, D4T, 3TC NVP M41L, A62AV, D67N, V75IT, L210W, T215Y, K219KN Y181CS K20R, V21I, V35I, K43Q, E79D, R83K, K122E, Q151X, L187LF, G196E, Q197K, D218E, A272P, K277R N137NT 
  CA24577 AZT, DDI, DDC, D4T, 3TC, ABC NVP, EFV M41L, A62V, K65R, D67N, V75I, F116Y, Q151M, L210W, T215Y Y181I K20R, V21I, V35I, K43Q, S68N, E79D, R83K, K122E, G196E, Q197K, F214L, K223Q, A272P, K277R  
CA796 CA3124 AZT, DDI, 3TC, D4T, DDC NVP M41L, D67N, T69D, K70R, V75M, M184V, T215F, K219W K103N, Y181C K20KR, V35T, V60I, K122E, I135T, V179VI, H208Y, D218E, L228H, V245E, E248Q  
CA799 CA1443 AZT, DDI, 3TC, DDC, D4T NVP M41L, D67E, M184V, L210W, T215Y A98G, Y181C V35IM, E44D, S68G, K122E, I135T, D177E, V179I, G196E, E203K, Q207E, D250E, A272P, V276I  
CA801 CA3094 AZT, 3TC, D4T None M41L, D67N, K70R, M184V, L210W, T215Y, K219KE  V35I, V118VI, D123E, I135T, S162Y, Q207E, R211K, E224ED, T286A  
PCC-44 PCC44-5140 AZT, 3TC, D4T, DDI NVP M41L, D67N, T215Y K101E, G190A K11R, D123E, I132IV, V179I, T200I, R211K, K249Q  

Database

Resources

Team