Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Shafer (1995)
Title Drug resistance and heterogeneous long-term virologic responses of human immunodeficiency virus type 1 - infected subjects to zidovudine and didanosine combination therapy.
Citation J Infect Dis
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 48
NumPts 31
Subtype B

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
143GW353 143G353W0 None None   T27X, Q174X, V245M  
143H144 143H144W0 None None  V179D R83K, K122KR, D123E, I135T  
143H179 143H179W0 None None   S162C, E169D, Q174X, T200AP, Q207E  
143U206 143206_W0 None None   T27X, E29X, V35I, R83K, K101Q, D123E, I135T, S162C, Q174X, R211K K126KE 
CA478 CA867 None None   V35I, D123E, A158S, V245E  
  CA899 AZT, DDI None F77L, F116Y, Q151M  V35I, R83K, A158S, R211K, V245E  
JIDP10 JIDP10W104 AZT, DDI None M41L, D67N, K70R, T215Y  R83X, K104N, D123E, K166R, D177E, W239C, V241A  
JIDP13 JIDP13W0 None None   Q197E, K220X, V241X K223KN 
  JIDP13W104 AZT, DDI None D67N, K70R, K219Q  V90I, K104KR, G196E, V241X, V245K  
JIDP14 JIDP14W0 None None   H208X, R211K, W239C  
  JIDP14W104 AZT, DDI None K70R  R211K, W239C  
JIDP16 JIDP16W0 None None   R83K, S162C, R211K, K220X, V241A, V245M  
  JIDP16W104 AZT, DDI None L210W, T215Y  R83K, K102Q, K103R, S162Y, Q207X, R211K, V241A, V245M  
JIDP17 JIDP17W0 None None   I135V, I142V, T165I, R211T, W239C  
  JIDP17W104 AZT, DDI None M41L, L210W, T215Y  V60VIL, I135V, I142V, T165TI, R211K, K223KQ, L228R, W239C  
JIDP18 JIDP18W88 AZT, DDI None M41L, T215Y  K49R, R83K, D123E, K166R, D177S, T200A  
JIDP19 JIDP19W0 None None   A62AP, R83K, K104KN, K122E, T131TP, I135T, S162C, T200A, E204D, R211K, E233ED, V241A, P243PS T84TP 
  JIDP19W104 AZT, DDI None M41L, D67N, K70R, L210W, T215Y, K219EQ  K104KN, S117SP, K122E, T131TP, I135T, I142V, S162C, T200A, E203K, E204D, R211K, L228H, W239C, V241X  
JIDP2 JIDP2W0 None None   T27X, R72K, I135T, S162N, T200A, V245K  
  JIDP2W104 AZT, DDI None   K49R, I135T, S162N, T200A, K223Q, V241X, V245K  
JIDP20 JIDP20W104 AZT, DDI None M41L, D67N, T69D, L210W, T215Y  E44D, V60I, V118I, K122E, A158S, G196E, V241X, V245T  
JIDP21 JIDP21W104 AZT, DDI None M41L, L210W, T215Y  V60X, R83K, L100F, S162C, Q207E, R211K, L228R D110DA 
JIDP22 JIDP22W104 AZT, DDI None M41L, D67N, L210W, T215Y A98G, V108I E44D, V60I, R83K, V118I, R211K, V245E  
JIDP24 JIDP24W0 None None   E89X, K104KN, I178M, R211K  
  JIDP24W104 AZT, DDI None M41L, D67N, T215Y  T107X, A158S, I178M, R211K, W239C  
JIDP25 JIDP25W0 None None   E28X, S48T, K122E, I142T, R211K, V245VM  
  JIDP25W104 AZT, DDI None V75I, F77L, Y115F, F116Y, Q151M, K219E  V35E, E36K, I37IM, S48T, S68G, K122E, I142T, R211K  
JIDP26 JIDP26W0 None None   A98S, I135V, Q174HN, G196E, Q207KN, R211G, F214L, V241X, V245M  
  JIDP26W88 AZT, DDI None A62V, V75I, F77L, F116Y, Q151M, K219E  T39A, S68G, A98S, I135V, R172K, Q174H, R211G, F214L, V245M  
JIDP27 JIDP27W104 AZT, DDI None  E138A E28X, R83K, K122E, M164MI, K166KR, G196E, W239C, V241X  
JIDP28 JIDP28W0 None None   D123E, T131TP, D177E, F227X, V241X, V245M  
  JIDP28W104 AZT, DDI None   K104X, T107X, D110X, T131TP, D177E, V241X, V245M  
JIDP29 JIDP29W104 AZT, DDI None   I135V, S162Y, Q174H, R211S, V241X, V245T  
JIDP3 JIDP3W0 None None   E44D, R83K, I135V, S162C  
  JIDP3W72 AZT, DDI None K70R  Q145X, Q151X, S162C, R211K  
JIDP31 JIDP31W104 AZT, DDI None   R83K, M164MI, Q174X, D177E, G196E, T200X, R211G, Q222X  
JIDP34 JIDP34W0 None None   K104KN, R206X, Q207X, H208X, R211K, F214L, V245M  
  JIDP34W104 AZT, DDI None M41L, T215Y  Q207DE, R211K, F214L, V245M G99GV 
JIDP35 JIDP35W0 None None   S162C, G196E, T200TA, Q207QH, R211K  
  JIDP35W104 AZT, DDI None M41L, D67N, K70R, L210W, T215Y, K219Q  K43Q, V60I, V75L, S162Y, D177E, G196E, Q207E, H208Y, R211K, D218E, W239C  
JIDP37 JIDP37W104 AZT, DDI None M41L, L210W, T215Y  S48T, D123N, S162A, M164MI, D177E, W239C, V241X  
JIDP4 JIDP4W0 None None   I142V K126KE 
  JIDP4W104 AZT, DDI None   K104R, T131TP, I142V, Q174X, V245M  
JIDP7 JIDP7W0 None None   V35I, C38X, K122E, T131TP, I135T, R211K, K219X, K220X, V241X  
  JIDP7W104 AZT, DDI None D67N, K70R, T215F, K219Q  V35I, K101Q, K104KN, K122E, I135V, R211K  
JIDP8 JIDP8W0 None None   T165I, Q174R, G196E, Q207X, R211K, F214L, W239C H208HQ 
  JIDP8W104 AZT, DDI None D67N, K70R, K219Q  T165I, Q174R, G196E, E203K, Q207DE, R211K, F214L, L228R, W239C  
JIDP9 JIDP9W104 AZT, DDI None M41L, L210W, T215Y A98G R83K, T165I, Q207D, R211K, W239C, V241X  

Database

Resources

Team