Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Albert (1994)
Title Analysis of a rape case by direct sequencing of the human immunodeficiency virus type 1 pol and gag genes.
Citation J Virol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 23
NumPts 22
Subtype B


Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
JA-1153 IVDA1153 None None   M16MK, K49R, R83K, D123E, I178M, G196E, R211RG L74F, N81Y 
JA-1423 HSM1423 None None   K20R, K32X, A33X, I135T, T139S, S162H  
JA-2213 IVDA2213 None None K70R  K49R, R83K, V111VL, T200A, E204K, Q207E D110DE, T131N 
JA-27 IVDA27 None None K70R  K49R, R83K, I142V, E204K, R211K, F214FL  
JA-3885 HSM3885 None None   V60I, D123E, Q161X, S162Y, D177EG F160FL, N175NK, I178DE, Y183NT 
JA-4029 HSM4029 None None   D123E, D177E, I178M, G196E, I202IV  
JA-408 IVDA408 None None   K49R, R83K, R211S Y183N 
JA-4771 HSM4771 None None   D123E, N137NI, D177E, I178M, G196E K20KI 
JA-4876 HSM4876 None None   D123E, A158AS, V179I, I202IV, L210M  
JA-4935 HSM4935 None None   V35I, T69TN, V118I, I135T, G196E, R211K, F214L  
JA-4982 HSM4982 None None   K122E, I135T, S162C T128P, P140Q 
JA-5012 HSM5012 None None   I135V, L149LP, S162C P140Q 
JA-5015 HSM5015 None None   A98S, K122R, D123E, I142V, W153*, K154R, D177E  
JA-5016 HAM5016 None None L210W  T39TA, E44D, S68G, I135IV, I159V, G196E, Q197QK, H208Y, R211K G99GV 
JA-5043 HSM5043 None None   K20KR, N54I, F124L, I135M  
JA-B137 IVDAB137 None None   K32KR, K49R, R83K, K166R, D177E, E204K  
JA-B183 IVDAB183 None None   V35I, R83K, D123E, R211K F130I 
JA-B197 IVDAB197 None None   D123E R83EK 
JA-B254 IVDAB254 None None K65KE  K49R, R83K, K103KE, E204K I94M 
JA-B304 IVDAB304 None None   K49R, R83K, G93R, D123E, D177E, G196E, Q207K, R211IS D218T 
JA-B85 IVDAB85 None None   K49R, R83K, E204K  
JA-F F-5W None None   K49R, I178IM, E204K, R211S D67R, S68C 
  F-18M-1 None None   K49R, I178IM, I202IV, E204K, R211IN