Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Derache (2015)
Title HIV drug resistance mutations in proviral DNA from a community treatment program.
Citation PLoS One
SelectedGene PR
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 119
NumPts 80
Subtype B


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Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 119 Clinical PR Isolates

PARC10010 PARC10010-DNA-BL PI    E35D, N37NS, R41K, I62V, L63P, A71T, V77VI, I93L  
  PARC10010-RNA-W24 PI    E35D, M36I, R41K, I62V, L63P, A71T, V77I, I93L  
  PARC10010-RNA-W96 PI    E35D, R41K, I62V, L63P, A71T, I93L  
PARC10011 PARC10011-DNA-BL PI    L10V, I13V, I15V  
PARC10014 PARC10014-DNA-BL PI  I84IV, L90LM L10LF, L24LF L19IV, F53FY, L63LP, I64IV, A71AV, I72V, V77VI  
  PARC10014-RNA-BL PI  M46I, I84V, L90M L10F, L24F, G73GS, T74TP L19V, F53Y, I62IV, L63P, A71V, I72V, V77I, I93L  
PARC10016 PARC10016-DNA-BL PI    L63LP  
PARC10017 PARC10017-DNA-BL PI    I15V, K20R, E35D, M36I, R41RK, K43KR, L63C  
  PARC10017-RNA-W24 PI    I15V, K20R, E35D, M36I, R41K, K43R, L63C  
  PARC10017-RNA-W48 PI    I15V, K20R, E35D, M36I, N37D, L63C  
PARC10018 PARC10018-DNA-BL PI    I64IV  
  PARC10018-RNA-W48 PI    E34EK, I64V  
PARC10019 PARC10019-DNA-BL PI    N37S, R41K, L63P, I64V  
PARC10020 PARC10020-RNA-BL PI    N37S, R41K, D60E, I62V, L63H, I64V, E65D, I72V, V77I  
  PARC10020-DNA-BL PI    N37S, R41K, D60E, I62V, L63H, I64V, E65D, I72IV, V77I  
  PARC10020-RNA-W24 PI    N37S, R41RK, D60DE, I62IV, L63LH, I64IV, E65ED, I72IV, V77VI  
  PARC10020-RNA-W48 PI  I50L, V82A  N37S, R41K, K45I, D60E, I62V, L63H, I64V, E65D, A71V, I72V, V77I, T91A  
  PARC10020-RNA-W72 PI  I50L, V82A L33F I13IV, G16GE, N37S, R41K, K45IV, D60E, I62V, L63H, I64V, E65ED, K70KE, A71V, I72V, V77I, T91A  
PARC10022 PARC10022-DNA-BL PI    L10I, I13V, L63T, A71T, I72T, V77I, I93L  
PARC10025 PARC10025-DNA-BL PI    I62IV, I93L  
PARC10028 PARC10028-RNA-BL PI    N37NS, L38LM, I62V, L63A, V77I, I93L  
PARC10029 PARC10029-DNA-BL PI    I62V, L63P, E65D  
PARC10030 PARC10030-DNA-BL PI    I15V, Q18L, E35D, N37D, A71T, I93L  
PARC10033 PARC10033-DNA-BL PI    T12P, G16E, L19LI, M36MI, R57RK, L63A, I64V, E65D, K70KR  
  PARC10033-RNA-W48 PI    T12P, G16E, L19I, R57K, L63A, I64V, E65D  
  PARC10033-RNA-W72 PI    T12P, I13IV, G16E, L19I, R57K, L63A, I64V, E65D  
PARC10036 PARC10036-RNA-BL PI    L10I, T12TS, E35D, M36I, L63P, I93L  
  PARC10036-DNA-BL PI    L10I, T12S, E35D, M36I, L63P, I93L  
PARC10040 PARC10040-DNA-BL PI    I15V, I62V, L63P  
PARC10041 PARC10041-DNA-BL PI  I54V, V82IT T74P L10I, K20R, E35D, M36I, N37E, R57K, I62V, L63T, I66L, A71V, I72T, I93L  
  PARC10041-RNA-BL PI  I54V, V82IT T74P L10I, K20R, E35D, M36I, N37E, R57K, I62V, L63T, I66L, A71V, I72T, I93L  
PARC10042 PARC10042-DNA-BL PI    I13V, K14R, I15V, L19I, D60E, L63A  
PARC10043 PARC10043-DNA-BL PI    I13V, K14R, R41K, I62V, L63P, K70R, A71T  
PARC10044 PARC10044-DNA-BL PI    N37S, L63AT, V77I  
PARC10045 PARC10045-DNA-BL PI    L10I, I62V, L63P, I93F  
PARC10047 PARC10047-RNA-BL PI    T12P, L19V, I62V, L63P, C67H, V77I, I93L  
  PARC10047-DNA-BL PI    T12P, L19V, I62V, L63P, C67H, V77I, I93L  
PARC10049 PARC10049-DNA-BL PI    T12P, L19IM, K20R, L33V, L63P, I64V, C67HY, V82I  
PARC10050 PARC10050-DNA-BL PI    N37D, L89I, I93L  
PARC10051 PARC10051-DNA-BL PI    I15V, E35D, N37D, I62V, L63P, V77I, I93L  
  PARC10051-RNA-BL PI    I15V, E35D, N37D, I62V, L63P, V77I, I93L  
PARC10052 PARC10052-DNA-BL PI    P39PS, A71AT, V77VI, P79PA  
PARC10056 PARC10056-DNA-BL PI    L63P, K70R, V77I  
  PARC10056-RNA-BL PI    L63P, K70R, V77I  
PARC10059 PARC10059-DNA-BL PI    M36I, R41K, L63P, K70R, V77I  
  PARC10059-RNA-W48 PI    M36I, R41K, L63P, H69Y, A71T, V77I  
  PARC10059-RNA-W72 PI    M36I, R41K, L63P, K70R, V77I, I93L  
PARC10060 PARC10060-DNA-BL PI    T12A, I13V, L63P  
PARC10061 PARC10061-RNA-BL PI    N37C, R41K, K43R, I62IV, L63P, V77I, I93L  
  PARC10061-DNA-BL PI    N37C, R41K, K43R, I62IV, L63P, V77I, I93L  
PARC10062 PARC10062-DNA-BL PI    I15IV, N37CS, L63LP  
PARC10063 PARC10063-DNA-BL PI    L10I, Q61H, I64V, I93L  
PARC10064 PARC10064-DNA-BL PI    I13V, L63H, I64V, E65D, V77I  
  PARC10064-RNA-BL PI    I13IV, K14KR, N37NS, L63LH, I64IV, E65ED, V77VI  
PARC10065 PARC10065-DNA-BL PI    T12S, I15V, E35D, N37S, L63P  
PARC10068 PARC10068-DNA-BL PI    I15V L24V 
PARC10069 PARC10069-DNA-BL PI    R41K, I62V, L63T, H69Q, A71T, I72E, V77I, I93L  
  PARC10069-RNA-W24 PI    L19V, R41K, I62V, L63T, A71T, I72E, V77I, I93L  
PARC10070 PARC10070-DNA-BL PI    N37C, R41K, I62V, L63A, A71V, V77I, I93L T96I 
PARC10071 PARC10071-DNA-BL PI  D30N N88D L63P, V77I  
PARC10072 PARC10072-DNA-BL PI    K14R, I64V  
PARC10073 PARC10073-DNA-BL PI    E35D, M36I, R41K, L63P, A71V, I93L  
PARC10075 PARC10075-DNA-BL PI    E35D, N37T, R57K, Q61E, L63P, I64V, I93L  
  PARC10075-RNA-W48 PI    L19V, E35D, N37T, R57RK, Q61E, I62IV, L63P, I64V, I93L  
PARC10077 PARC10077-DNA-BL PI    R57K, L63P, V77I, I93L  
PARC10079 PARC10079-DNA-BL PI    E35D, L63P, I72T  
PARC10082 PARC10082-DNA-BL PI    E35ED, N37T, R41K, L63P, K70R, I93L  
  PARC10082-RNA-W48 PI    N37T, R41K, L63P, K70R, I93L  
PARC10085 PARC10085-DNA-BL PI    L19T, K43R  
  PARC10085-RNA-BL PI    L19T, K43R  
PARC10086 PARC10086-DNA-BL PI    V11A, E35D, N37E, L63P, H69R, A71V, V77I, I93L  
PARC10087 PARC10087-DNA-BL PI    I13V, L63P  
PARC10088 PARC10088-DNA-BL PI    E35D, N37E, L63P, A71T, V77I, I93L  
PARC10090 PARC10090-DNA-BL PI    I15V, N37S, Q61E, I62V, L63P, I72V, V77I, I93L  
  PARC10090-RNA-W48 PI    K14KR, I15V, N37S, Q61E, I62V, L63P, I72V, V77I, I93L  
PARC10091 PARC10091-DNA-BL PI    I13V, N37P, P39S, L63P, V77I  
PARC10092 PARC10092-DNA-BL PI    L63P, I64L  
PARC20007 PARC20007-DNA-BL PI    G16GE, G48GE, L63LF, V77IL, I93L  
PARC20012 PARC20012-RNA-BL PI  D30N, M46L N88D I13V, L63P, I64V, A71V, I72M, V77I  
  PARC20012-DNA-BL PI  D30N, M46L N88D I13V, L63P, I64V, A71V, I72M, V77I  
PARC20013 PARC20013-DNA-BL PI    L10I, M36I, I62V, L63ST, I93L  
  PARC20013-RNA-BL PI    L10I, M36I, I62V, L63ST, I93L  
PARC20014 PARC20014-DNA-BL PI    I15IV, L19X, E35ED, L63LP  
  PARC20014-RNA-W48 PI    L19E, L63P  
PARC20016 PARC20016-DNA-BL PI    I13V, L19I, L33V, R41RK, I62V, L63P, E65D  
PARC20017 PARC20017-DNA-BL PI    K14R, G16GE, R41K, I62V, L63A, T74A, V77I  
PARC20020 PARC20020-RNA-BL PI    L19I, N37S, R41K, L63T, E65D, I72T, V77I  
  PARC20020-DNA-BL PI    L19I, N37S, R41K, L63T, E65D, I72T, V77I  
PARC20021 PARC20021-DNA-BL PI    I13V, L19V, I62V, L63A  
PARC20023 PARC20023-DNA-BL PI    K14R, I15V, L19T, M36I, H69Q R41RG 
PARC30001 PARC30001-RNA-BL PI    E35D, N37S, L63A  
  PARC30001-DNA-BL PI    E35D, N37S, L63V  
PARC30002 PARC30002-DNA-BL PI    E35D, L63PS, I72V  
PARC30007 PARC30007-RNA-BL PI    N37S, L38LV, I62V, L63A, I64L, A71V, V77I, I93L  
  PARC30007-DNA-BL PI    M36MV, N37NS, L38LV, R41RK, R57RK, I62V, L63A, I64L, A71V, V77I, I93L  
PARC30009 PARC30009-DNA-BL PI    K14N, L63P  
PARC30010 PARC30010-DNA-BL PI    L19V, M36I, L63P, Q92E  
PARC30012 PARC30012-DNA-BL PI  I54V, I84V, L90M K20T L10I, I13V, Q18H, L19I, I64V, I66F, K70R, A71V, I72L, V77I, L89M  
PARC30013 PARC30013-RNA-BL PI    E35D, N37S, I64V  
  PARC30013-DNA-BL PI    L10P, E35D, N37S, I64V