Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Derache (2015)
Title HIV drug resistance mutations in proviral DNA from a community treatment program.
Citation PLoS One
SelectedGene PR
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 119
NumPts 80
Subtype B

 

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Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 119 Clinical PR Isolates


SubjectIsolatePIsWksPIMajorPIMinorCommonUnusual
PARC10010 PARC10010-DNA-BL PI    E35D, N37NS, R41K, I62V, L63P, A71T, V77VI, I93L  
  PARC10010-RNA-W24 PI    E35D, M36I, R41K, I62V, L63P, A71T, V77I, I93L  
  PARC10010-RNA-W96 PI    E35D, R41K, I62V, L63P, A71T, I93L  
PARC10011 PARC10011-DNA-BL PI    L10V, I13V, I15V  
PARC10014 PARC10014-DNA-BL PI  I84IV, L90LM L10LF, L24LF L19IV, F53FY, L63LP, I64IV, A71AV, I72V, V77VI  
  PARC10014-RNA-BL PI  M46I, I84V, L90M L10F, L24F, G73GS, T74TP L19V, F53Y, I62IV, L63P, A71V, I72V, V77I, I93L  
PARC10016 PARC10016-DNA-BL PI    L63LP  
PARC10017 PARC10017-DNA-BL PI    I15V, K20R, E35D, M36I, R41RK, K43KR, L63C  
  PARC10017-RNA-W24 PI    I15V, K20R, E35D, M36I, R41K, K43R, L63C  
  PARC10017-RNA-W48 PI    I15V, K20R, E35D, M36I, N37D, L63C  
PARC10018 PARC10018-DNA-BL PI    I64IV  
  PARC10018-RNA-W48 PI    E34EK, I64V  
PARC10019 PARC10019-DNA-BL PI    N37S, R41K, L63P, I64V  
PARC10020 PARC10020-RNA-BL PI    N37S, R41K, D60E, I62V, L63H, I64V, E65D, I72V, V77I  
  PARC10020-DNA-BL PI    N37S, R41K, D60E, I62V, L63H, I64V, E65D, I72IV, V77I  
  PARC10020-RNA-W24 PI    N37S, R41RK, D60DE, I62IV, L63LH, I64IV, E65ED, I72IV, V77VI  
  PARC10020-RNA-W48 PI  I50L, V82A  N37S, R41K, K45I, D60E, I62V, L63H, I64V, E65D, A71V, I72V, V77I, T91A  
  PARC10020-RNA-W72 PI  I50L, V82A L33F I13IV, G16GE, N37S, R41K, K45IV, D60E, I62V, L63H, I64V, E65ED, K70KE, A71V, I72V, V77I, T91A  
PARC10022 PARC10022-DNA-BL PI    L10I, I13V, L63T, A71T, I72T, V77I, I93L  
PARC10025 PARC10025-DNA-BL PI    I62IV, I93L  
PARC10028 PARC10028-RNA-BL PI    N37NS, L38LM, I62V, L63A, V77I, I93L  
PARC10029 PARC10029-DNA-BL PI    I62V, L63P, E65D  
PARC10030 PARC10030-DNA-BL PI    I15V, Q18L, E35D, N37D, A71T, I93L  
PARC10033 PARC10033-DNA-BL PI    T12P, G16E, L19LI, M36MI, R57RK, L63A, I64V, E65D, K70KR  
  PARC10033-RNA-W48 PI    T12P, G16E, L19I, R57K, L63A, I64V, E65D  
  PARC10033-RNA-W72 PI    T12P, I13IV, G16E, L19I, R57K, L63A, I64V, E65D  
PARC10036 PARC10036-RNA-BL PI    L10I, T12TS, E35D, M36I, L63P, I93L  
  PARC10036-DNA-BL PI    L10I, T12S, E35D, M36I, L63P, I93L  
PARC10040 PARC10040-DNA-BL PI    I15V, I62V, L63P  
PARC10041 PARC10041-DNA-BL PI  I54V, V82IT T74P L10I, K20R, E35D, M36I, N37E, R57K, I62V, L63T, I66L, A71V, I72T, I93L  
  PARC10041-RNA-BL PI  I54V, V82IT T74P L10I, K20R, E35D, M36I, N37E, R57K, I62V, L63T, I66L, A71V, I72T, I93L  
PARC10042 PARC10042-DNA-BL PI    I13V, K14R, I15V, L19I, D60E, L63A  
PARC10043 PARC10043-DNA-BL PI    I13V, K14R, R41K, I62V, L63P, K70R, A71T  
PARC10044 PARC10044-DNA-BL PI    N37S, L63AT, V77I  
PARC10045 PARC10045-DNA-BL PI    L10I, I62V, L63P, I93F  
PARC10047 PARC10047-RNA-BL PI    T12P, L19V, I62V, L63P, C67H, V77I, I93L  
  PARC10047-DNA-BL PI    T12P, L19V, I62V, L63P, C67H, V77I, I93L  
PARC10049 PARC10049-DNA-BL PI    T12P, L19IM, K20R, L33V, L63P, I64V, C67HY, V82I  
PARC10050 PARC10050-DNA-BL PI    N37D, L89I, I93L  
PARC10051 PARC10051-DNA-BL PI    I15V, E35D, N37D, I62V, L63P, V77I, I93L  
  PARC10051-RNA-BL PI    I15V, E35D, N37D, I62V, L63P, V77I, I93L  
PARC10052 PARC10052-DNA-BL PI    P39PS, A71AT, V77VI, P79PA  
PARC10056 PARC10056-DNA-BL PI    L63P, K70R, V77I  
  PARC10056-RNA-BL PI    L63P, K70R, V77I  
PARC10059 PARC10059-DNA-BL PI    M36I, R41K, L63P, K70R, V77I  
  PARC10059-RNA-W48 PI    M36I, R41K, L63P, H69Y, A71T, V77I  
  PARC10059-RNA-W72 PI    M36I, R41K, L63P, K70R, V77I, I93L  
PARC10060 PARC10060-DNA-BL PI    T12A, I13V, L63P  
PARC10061 PARC10061-RNA-BL PI    N37C, R41K, K43R, I62IV, L63P, V77I, I93L  
  PARC10061-DNA-BL PI    N37C, R41K, K43R, I62IV, L63P, V77I, I93L  
PARC10062 PARC10062-DNA-BL PI    I15IV, N37CS, L63LP  
PARC10063 PARC10063-DNA-BL PI    L10I, Q61H, I64V, I93L  
PARC10064 PARC10064-DNA-BL PI    I13V, L63H, I64V, E65D, V77I  
  PARC10064-RNA-BL PI    I13IV, K14KR, N37NS, L63LH, I64IV, E65ED, V77VI  
PARC10065 PARC10065-DNA-BL PI    T12S, I15V, E35D, N37S, L63P  
PARC10068 PARC10068-DNA-BL PI    I15V L24V 
PARC10069 PARC10069-DNA-BL PI    R41K, I62V, L63T, H69Q, A71T, I72E, V77I, I93L  
  PARC10069-RNA-W24 PI    L19V, R41K, I62V, L63T, A71T, I72E, V77I, I93L  
PARC10070 PARC10070-DNA-BL PI    N37C, R41K, I62V, L63A, A71V, V77I, I93L T96I 
PARC10071 PARC10071-DNA-BL PI  D30N N88D L63P, V77I  
PARC10072 PARC10072-DNA-BL PI    K14R, I64V  
PARC10073 PARC10073-DNA-BL PI    E35D, M36I, R41K, L63P, A71V, I93L  
PARC10075 PARC10075-DNA-BL PI    E35D, N37T, R57K, Q61E, L63P, I64V, I93L  
  PARC10075-RNA-W48 PI    L19V, E35D, N37T, R57RK, Q61E, I62IV, L63P, I64V, I93L  
PARC10077 PARC10077-DNA-BL PI    R57K, L63P, V77I, I93L  
PARC10079 PARC10079-DNA-BL PI    E35D, L63P, I72T  
PARC10082 PARC10082-DNA-BL PI    E35ED, N37T, R41K, L63P, K70R, I93L  
  PARC10082-RNA-W48 PI    N37T, R41K, L63P, K70R, I93L  
PARC10085 PARC10085-DNA-BL PI    L19T, K43R  
  PARC10085-RNA-BL PI    L19T, K43R  
PARC10086 PARC10086-DNA-BL PI    V11A, E35D, N37E, L63P, H69R, A71V, V77I, I93L  
PARC10087 PARC10087-DNA-BL PI    I13V, L63P  
PARC10088 PARC10088-DNA-BL PI    E35D, N37E, L63P, A71T, V77I, I93L  
PARC10090 PARC10090-DNA-BL PI    I15V, N37S, Q61E, I62V, L63P, I72V, V77I, I93L  
  PARC10090-RNA-W48 PI    K14KR, I15V, N37S, Q61E, I62V, L63P, I72V, V77I, I93L  
PARC10091 PARC10091-DNA-BL PI    I13V, N37P, P39S, L63P, V77I  
PARC10092 PARC10092-DNA-BL PI    L63P, I64L  
PARC20007 PARC20007-DNA-BL PI    G16GE, G48GE, L63LF, V77IL, I93L  
PARC20012 PARC20012-RNA-BL PI  D30N, M46L N88D I13V, L63P, I64V, A71V, I72M, V77I  
  PARC20012-DNA-BL PI  D30N, M46L N88D I13V, L63P, I64V, A71V, I72M, V77I  
PARC20013 PARC20013-DNA-BL PI    L10I, M36I, I62V, L63ST, I93L  
  PARC20013-RNA-BL PI    L10I, M36I, I62V, L63ST, I93L  
PARC20014 PARC20014-DNA-BL PI    I15IV, L19X, E35ED, L63LP  
  PARC20014-RNA-W48 PI    L19E, L63P  
PARC20016 PARC20016-DNA-BL PI    I13V, L19I, L33V, R41RK, I62V, L63P, E65D  
PARC20017 PARC20017-DNA-BL PI    K14R, G16GE, R41K, I62V, L63A, T74A, V77I  
PARC20020 PARC20020-RNA-BL PI    L19I, N37S, R41K, L63T, E65D, I72T, V77I  
  PARC20020-DNA-BL PI    L19I, N37S, R41K, L63T, E65D, I72T, V77I  
PARC20021 PARC20021-DNA-BL PI    I13V, L19V, I62V, L63A  
PARC20023 PARC20023-DNA-BL PI    K14R, I15V, L19T, M36I, H69Q R41RG 
PARC30001 PARC30001-RNA-BL PI    E35D, N37S, L63A  
  PARC30001-DNA-BL PI    E35D, N37S, L63V  
PARC30002 PARC30002-DNA-BL PI    E35D, L63PS, I72V  
PARC30007 PARC30007-RNA-BL PI    N37S, L38LV, I62V, L63A, I64L, A71V, V77I, I93L  
  PARC30007-DNA-BL PI    M36MV, N37NS, L38LV, R41RK, R57RK, I62V, L63A, I64L, A71V, V77I, I93L  
PARC30009 PARC30009-DNA-BL PI    K14N, L63P  
PARC30010 PARC30010-DNA-BL PI    L19V, M36I, L63P, Q92E  
PARC30012 PARC30012-DNA-BL PI  I54V, I84V, L90M K20T L10I, I13V, Q18H, L19I, I64V, I66F, K70R, A71V, I72L, V77I, L89M  
PARC30013 PARC30013-RNA-BL PI    E35D, N37S, I64V  
  PARC30013-DNA-BL PI    L10P, E35D, N37S, I64V