Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Tarasova (2021)
Title RHIVDB: A Freely Accessible Database of HIV Amino Acid Sequences and Clinical Data of Infected Patients.
Citation Front Genet
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 43
NumPts 43
Subtype A, A + CRF02_AG, CRF63_02A1, G, B

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
1081 1081 AZT, 3TC ETR A62V, K65R, M184V, K219E V179L, Y181C, P225H K11T, V35T, E36D, T39K, K49R, S68G, K122E, D123N, A158S, T165V, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245T, A272AP E248Y 
1098 1098 TDF, 3TC EFV L74I, M184V G190CS I5IV, E6D, K11A, V35M, T39Q, K101KQ, D121H, K122E, D123S, K173N, Q174K, N175Y, T200I, Q207A, R211K, E248D, A272AP L12W, K13P 
1101 1101 AZT, 3TC NVP M184V A98G, K103N K11T, V35T, E36D, T39N, D121H, K122E, D123S, I135L, S162A, K166T, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245T, E248D, A272AP  
1136 1136 ABC, 3TC None A62V, D67N, M184V, T215F  K11T, V35I, T39N, V90I, V118I, K122E, D123N, I135T, A158S, K173L, Q174K, D177E, I178V, V189I, G196E, Q207A, R211S, V245T, E248D, A272P  
1157 1157 TDF, 3TC NVP L74LI, M184MI V106I, G190S P19X, K20X, V35T, T39K, V60I, S68G, V90I, K122E, D123N, I135T, K173L, Q174K, I178IV, V179I, T200A, Q207A, R211K, V245E, E248D, A272AP  
1160 1160 AZT, 3TC EFV M41L, D67DN, M184V  K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, I135T, T139V, T165I, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245I, A272AP  
1259 1259 AZT, 3TC EFV M184V  K11T, K20R, V35T, E36D, T39R, K122E, D123S, I135T, S162C, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245K, E248D, A272P  
1263 1263 AZT, 3TC None D67N, K70R, M184V, K219Q  V8VI, V35T, T39K, K46Q, K64R, D121DA, K122E, D123DN, I135V, K173L, Q174K, D177E, I178L, Q207A, R211S, T215X, E248EK, A272AP  
1266 1266 3TC, DDI, TDF EFV A62V, L74V, M184V A98G, V108VI, Y181C, G190GS K11T, V35I, E36D, T39N, K101Q, V111VI, V118I, D123N, I135T, K166KR, K173I, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207A, R211S, E248D, A272AP  
1389 1389 AZT, 3TC None M184V  K11AS, K20KR, V35T, E36A, T39DN, E40ED, V60I, K122E, D123NS, I135T, K173L, Q174K, T200I, E203ED, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272AP  
1392 1392 AZT, 3TC, ABC EFV A62AV, M184MV  K11KT, V35IM, E36D, T39K, K82KR, K122E, D123S, A158AS, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, E248D, A272AP  
1406 1406 AZT, 3TC, D4T, TDF None A62V, M184V, T215F G190CS K11T, V35R, E36D, T39E, V75L, V90I, K122E, D123N, I135T, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245K, E248D, A272AP  
150 150 3TC, D4T None   V35T, T39K, K102Q, K104R, K122E, D123S, I135T, A158S, S162A, F171Y, Q174E, E194K, G196E, T200A, I202V, Q207A, R211S, E248D, A272P H198Q 
152 152 3TC None A62V, M184V  K11T, V35IT, E36D, T39K, K122E, D123N, I135IT, T139A, A158S, K173AS, Q174K, D177E, G196GE, T200TI, Q207A, R211S, E248D, A272AP  
1630 1630 TDF, 3TC, AZT ETR, NVP K65KR, M184MV K103KN, G190S K11T, K20KR, V35T, T39TM, K101KT, V118I, K122E, D123N, A158S, K173S, Q174K, T200A, I202V, Q207A, L210M, R211S, E248D, A272AP  
1638 1638 TDF, 3TC, AZT EFV, ETR A62V, M184V Y181C, H221Y V35R, T39E, K49R, K122E, D123N, I135T, A158S, K173S, Q174K, D177E, I178L, V179I, Q207A, R211S, V245VM, E248ED, A272AP  
168 168 AZT, 3TC None A62V, M184V E138EA K11T, V35I, T39TKN, V90I, K122E, D123NS, I135IT, T139TS, A158S, S162A, K173S, Q174K, T200TA, Q207A, R211RS, V245KM, E248D  
293 293 AZT, 3TC, DDI, ABC ETR D67DN, K70KR, L74V, M184V, T215TI, K219KE V179VFI, Y181CS K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S  
295 295 AZT, 3TC None M184V V106I V35T, V60I, A98S, K122E, D123S, I135T, T139TKM, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207K, R211S, V245Q, E248D, D250E  
540 540 AZT, 3TC None D67N, M184V  S48T, N57NH, T58TS, I63IL, K64KR, D123E, T139M, K154KR, S163SC, M164ML, R172RK, P176S, G196E, I202V, R211G, L228LF, N255NK N147NS 
546 546 AZT, 3TC EFV A62V  K11T, V35T, E36D, T39K, K49R, I50IV, V60VI, K64R, V90I, K122E, D123N, I135T, A158S, K173S, Q174K, D177E, V179VI, T200TA, Q207A, R211S, V245M, E248D  
548 548 AZT, 3TC EFV  K103N, P225PH V35T, E36D, E40D, V60I, K101KQ, D121Y, K122E, I135T, I142V, S162A, K173R, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211N, V245Q, E248D, A272P  
549 549 AZT, 3TC EFV A62V, M184V K101E, E138A, G190S K11T, V35I, E36D, T39N, K122E, D123N, A158S, K173S, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207A, E248D  
550 550 3TC, DDI, AZT NVP, EFV M184V K101E, V106I, G190S E6D, K11T, V35T, E36D, T39KN, K122E, D123N, K173LS, Q174K, D177E, V179VI, G196E, Q197QK, T200A, Q207A, R211S, E248D  
551 551 3TC, DDI, AZT EFV A62V K103KN K11T, V35I, E36D, T39E, K122E, D123N, A158S, S162C, E169G, K173AS, Q174K, D177E, I178L, Q207A, R211S, E248D  
561 561 AZT, 3TC, DDI None M41L, D67N, M184V, L210W, T215Y  K11T, V35T, E36D, T39Q, K43E, D121DH, K122E, D123S, I135V, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245T, E248D, A272AP  
563 563 AZT, 3TC NVP K70KR, M184V K101E, G190A K11T, V35T, T39L, K122E, D123S, Q174E, D177E, E204Q, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P  
564 564 3TC, D4T None M184V  K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, T200G, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272AP  
571 571 AZT, DDI None D67N, K70R, K219Q  I5V, K11T, V35T, T39N, E40D, D121H, K122E, D123S, E169EK, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245K, E248D, A272AP  
575 575 AZT, 3TC None M184V  S3T, P4PL, V10L, K11T, V35T, T39M, K122E, D123S, I135T, A158AS, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F214FL, V245M, E248D, A272P V8L 
65 65 AZT, 3TC ETR D67N, K70R, M184V, T215FI, K219E Y181C, H221HY K11T, V35T, E36D, T39K, T69TN, V90VI, K122E, D123S, A158S, S162CY, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, F214L, L228LH, V245M, E248D  
661 661 ABC, 3TC None A62V  K11T, V35IT, E36D, T39K, K49KR, V90I, K122E, D123N, A158S, S162A, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272AP  
664 664 AZT, 3TC EFV M41L, D67N, V75M, M184V, L210W, T215Y K101E, G190S K32E, V35T, T39DN, K43KE, E44EAD, V60I, V111I, V118VI, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, E203K, Q207D, H208Y, R211N, K223Q, V245M, E248D, A272AP  
676 676 AZT, 3TC None A62AV, M184V  K11T, V35T, E36ED, T39R, K122E, D123NS, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D Q145CW 
677 677 AZT, 3TC, ABC EFV A62V, K65KR, V75VI, M184V  K11T, V35I, V90I, K122E, D123N, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, V245M, E248D  
679 679 AZT, 3TC None M184V  I31IL, L34LF, V35T, T39L, V60I, K102KN, K122E, D123N, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200I, E203D, Q207A, R211S, V245T, E248D  
688 688 AZT, 3TC None M184V, L210LW, T215Y  K11T, V35R, S68SN, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, G196E, T200A, E203V, Q207A, R211S, E248D  
803 803 3TC, DDI, AZT, TDF EFV   V35T, T39MR, K122E, D123S, I135T, S162C, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245T, E248D, A272AP  
808 808 AZT, 3TC None A62V, M184V  K11T, V35I, E36D, T39K, K82R, K122E, D123S, I135T, A158S, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D  
810 810 AZT, DDI None M184V  K11T, V35T, E36D, T39N, V60I, D121H, K122E, D123S, I135V, K166R, K173I, Q174K, D177E, I180V, Q207A, R211S, V245M, A272P L12L* 
856 856 AZT, 3TC, TDF EFV  K101E, G190S, H221HY I5M, E6K, V35T, E36D, T39M, V60I, T69N, K122E, D123S, K173S, Q174K, D177E, G196EK, Q207A, R211S, V245Q, E248D, A272AP  
926 926 ABC, AZT, 3TC, TDF EFV  K103N P14K, V21I, V35T, E36D, T39S, K173T, Q174K, D177E, T200V, I202IV, Q207A, R211K, F214FL, V245Q, E248D  
965 965 AZT, DDI, 3TC, TDF None A62V, M184I  E6D, K11T, E28A, V35I, E36D, T39E, T69S, K122E, D123N, I135T, A158S, S162A, K173S, Q174K, D177E, Q207A, L210M, R211K, E248D, A272P