Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Hanke (2020)
Title A Recent Human Immunodeficiency Virus Outbreak Among People Who Inject Drugs in Munich, Germany, Is Associated With Consumption of Synthetic Cathinones.
Citation Open Forum Infect Dis
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 261
NumPts 261
Subtype C, B + C

 
  Page 1 of 3    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 261 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
12-01623 12-01623 None None   V35T, V60VI, K104KE, D121Y, K122E, I135R, S162C, K173A, D177E, T200A, Q207E, P243AT, V245K  
13-01544 13-01544 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, D121H, K122E, A158S, S162C, K173T, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
13-02407 13-02407 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
13-02617 13-02617 None None   K32KR, V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, I142IV, S162DY, K173T, Q174K, T200A, Q207E, V245N  
13-03525 13-03525 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248N  
13-04979 13-04979 None None   E6D, V35T, T39E, E40D, K49R, E53D, K122E, E169D, K173T, D177E, T200A, I202V, Q207E, V245Q, D250E  
13-05043 13-05043 None None   K32Q, V35T, E36A, T39E, K43R, K104R, K122E, D123N, I135K, K173A, D177E, Q197K, T200E, Q207A, R211K, V245Q  
13-05490 13-05490 None None   V35S, E36A, T39E, K122E, D123S, I135T, I159V, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
13-05905 13-05905 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K103KR, K122E, D123S, I135IT, K173A, Q174QK, D177G, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
13-05912 13-05912 None None   K20KR, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, I135T, S162C, K166R, K173A, T200A, Q207T, R211K, V245Q  
14-00307 14-00307 None None   V35T, T39K, S48T, A98AS, K122E, D123DN, K173A, Q174K, D177E, I202V, Q207G, R211K, V241I, V245Q  
14-00359 14-00359 None None   V35T, T39E, S48T, D123N, I135R, K166R, K173T, Q174E, T200A, Q207A, V245Q, E248V, D250E  
14-00835 14-00835 None None   V8I, K32E, V35K, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123DG, I135R, K173A, Q174QK, T200A, Q207E, V245Q  
14-00837 14-00837 None None   V35X, T39N, K43KE, K49KR, K122E, D123N, A158S, I159V, K173A, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K, P243T, V245N  
14-01478 14-01478 None None   E6D, K20R, V35T, E36A, T39D, S48E, V60I, K122E, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, E203D, Q207A, V245Q  
14-01708 14-01708 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K101R, K122P, I142K, K166R, K173I, D177E, V179I, D192N, T200A, Q207A, R211K, V245Q  
14-02511 14-02511 None None   V35T, T39E, S48T, E53D, K122E, S162A, K173A, Q207A, R211K, V245Q, D250E  
14-02560 14-02560 None None   T27S, V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173E, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214FL, V245Q  
14-02683 14-02683 None None  E138A K11KQ, V35T, E36A, T39DE, S48T, V60I, A98S, D121Y, K122E, D123G, K173E, D177E, T200A, Q207K, V245Q, K249KR  
14-03172 14-03172 None None   K20KR, V35T, T39K, S48T, V60I, K101KR, D121H, K122E, I135RT, S162C, K173T, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211RK, F214L, V245Q, D250E  
14-03461 14-03461 None None   V35T, E36A, T39D, K43KR, S48T, K122E, D123S, Q145I, T200A, Q207T, R211Q, V245Q, E248D  
14-03507 14-03507 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, K173E, D177E, I195L, G196K, Q197E, T200A, I202V, E204X, Q207X, R211K, V245Q, E248D, D250E  
14-03707 14-03707 None None   K32E, V35T, E36A, T39E, K43R, S48T, K122E, D123S, I135R, K173T, D177E, Q197K, T200E, Q207A, R211K, V245Q  
14-03848 14-03848 None None   V8I, V35T, T39K, S48T, K122E, D123DN, A158AS, K166R, K173A, D177E, G196K, T200A, I202IV, Q207E, R211K, V245Q  
14-03963 14-03963 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, K122E, D123S, A158S, K173AT, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
14-04095 14-04095 None None   V35T, E36L, T39E, S48T, K122E, D123S, I135IT, A158S, K173A, Q174K, Q197E, T200E, E204D, Q207A, R211K, V245Q, K249Q  
14-04102 14-04102 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K173AT, Q174QH, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248N, D250E  
14-04161 14-04161 None None   I5IV, V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, V60I, D123E, K173A, I178L, T200A, Q207A, P243S, V245K, D250E  
14-04164 14-04164 None None   K20KR, V35IT, T39X, E40EA, K49KR, K122E, I135T, Q145C, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E  
14-04167 14-04167 None None  K103N V35T, T39E, A98S, K122E, D123S, K173T, D177E, T200A, K201T, I202V, E204K, Q207E, R211K, V245Q  
14-04171 14-04171 None None   V21I, V35T, E36A, T39E, E40D, V60I, K122KE, D123DN, I135V, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, K249Q, S251D  
14-04176 14-04176 None None   E6D, K20R, V35T, T39E, K104R, K122E, D123G, A158S, K166R, K173A, Q174K, D177E, I195IK, G196GE, I202V, Q207EG, R211K, V245Q, E248D  
14-04182 14-04182 None None  K103N V35T, E36M, T39E, A98S, K122E, D123S, I135T, S162C, K173AV, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
14-04220 14-04220 None None   V35IT, E36A, T39E, S48T, V60VI, K103R, D121Y, K122E, I135T, K173E, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
14-04439 14-04439 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, I135IR, A158AS, K173A, D177E, G196K, Q197QE, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, D250E  
14-04509 14-04509 None None   E6D, V35T, E36I, T39E, S48T, K122E, D123N, A158S, K166R, K173A, D177E, G196K, Q197E, Q207E, V245Q, E248D  
14-04525 14-04525 None None   P4S, K20KR, V35T, E36EA, T39E, S48T, E53D, V60VI, K64KR, T69TA, V118I, K122E, D123N, K173A, D177E, Q197K, T200E, I202V, Q207E, F214L, V245Q  
14-04526 14-04526 None None   V35T, T39X, S48T, V60VI, K102Q, D123DE, I142IM, K173X, Q174QK, D177E, I178IM, T200TA, Q207DE, R211RK, F214FL, V245LQ, E248ED  
14-04530 14-04530 None None   V8I, T27S, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123N, I135M, A158S, K166R, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q  
14-04631 14-04631 None None   V35I, E36EA, T39E, E40ED, S48T, K122E, D123NS, I135T, K173A, Q174K, D177E, Q197P, T200Q, I202V, Q207EG, R211K, F214L, V245T, D250E  
14-04731 14-04731 None None  V106I, Y188C I5IV, E6EK, K20KR, V35T, E36EA, T39X, E40ED, V60VI, K122E, D123DG, I142T, K173A, G196GE, T200A, Q207E, F214L, V245Q  
14-04750 14-04750 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123N, K173A, Q174N, D177E, T200A, Q207N, R211K, V245Q  
14-04758 14-04758 None None   V35T, T39TA, S48T, V60I, K102Q, K173A, Q174K, D177E, I178IM, T200A, Q207X, R211RK, V245Q, E248D  
14-04781 14-04781 None None   T27S, E28A, V35T, T39A, S48T, K122E, D123NS, I135T, A158S, F171Y, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, P243H, V245Q, D250DE  
14-04785 14-04785 None None K219KQ  V8VI, D17E, V35T, E36A, T39E, K122E, D123X, Y127YF, I135V, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q, K249Q  
14-04786 14-04786 None None   V21VI, V35T, E36A, T39E, E40D, V60I, D123DN, I135V, K173A, D177E, T200A, E204EKQ, Q207E, P243PS, V245Q, K249Q, S251DH P52PL 
14-04795 14-04795 None None  K103N K32R, V35T, E36Q, K49R, V60I, T139A, A158S, E169K, K173KE, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211K, V245Q  
14-04818 14-04818 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, K43N, I135M, K173A, Q174K, D177Q, G196Q, T200A, Q207D, R211K, V245E, E248D  
14-04820 14-04820 None None   V8I, K20R, V35T, E36A, T39E, K43KQ, K49KR, I135M, K173A, Q174QK, D177Q, G196Q, T200A, Q207E, R211K, V245E, E248D  
15-00032 15-00032 None None   V35T, E36A, T39E, K122E, I135T, S162C, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245K, D250E  
15-00325 15-00325 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123S, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207K, R211M, V245Q  
15-00805 15-00805 None None   K11R, E28K, K32E, V35K, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, K166R, T200V, V245Q, E248V, K249Q  
15-01268 15-01268 None None  E138A V35T, E36A, T39E, S48T, D121DHY, K122E, S162C, K173A, Q174K, T200A, Q207E, R211RK, F214L, V245Q, E248D  
15-01402 15-01402 None None   V35T, T39D, E40A, S48T, E53D, D121H, K122E, D123E, I135R, S162Y, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207N, R211K, V245Q  
15-01501 15-01501 None None  K103N V8I, V35T, T39E, K43R, S48T, K122E, D123S, A158S, S162C, K173A, T200A, Q207K, R211K, V245Q, E248D, D250E  
15-01909 15-01909 None None   I31IV, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, K173A, Q174K, D177DE, T200E, E204A, Q207E, R211K, V245Q, E248EK, D250DE  
15-01994 15-01994 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, I135T, K166R, K173E, Q207A, R211K, V245Q, D250N  
15-02082 15-02082 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, P170PS, K173AT, D177E, V179A, T200A, Q207EG, R211K, V245Q, S251N  
15-02102 15-02102 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, D123E, T139A, T165I, F171Y, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
15-02153 15-02153 None None D67DE  V35T, T39E, S48T, K122E, D123N, K173A, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207R, R211K, V245Q  
15-02159 15-02159 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K103R, D121Y, K122E, I135T, T165I, K173E, Q174R, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K, F214L, V245Q, E248EK  
15-02226 15-02226 None None   P14PQ, V35T, T39EG, K49R, A98S, K122E, D123N, I142V, K173AT, D177E, I178M, T200AE, E204K, Q207E, R211K, P243T, V245Q  
15-02549 15-02549 None None   T27S, E28A, V35T, T39A, S48T, K122E, D123S, I135IT, A158AS, F171Y, K173A, Q174K, D177E, Q182QH, T200A, I202IV, Q207E, R211RK, F214L, P243HQ, V245Q, D250DE  
15-02628 15-02628 None None   E6X, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, E248N, D250DE  
15-02653 15-02653 None None   K20R, V35IMT, E36A, T39DE, S48T, V60I, K122E, D123S, A158AS, I159V, D177DE, G196K, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E  
15-02662 15-02662 None None   K20R, V35I, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, A158S, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, P243PS, V245Q, D250DE  
15-02695 15-02695 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, K173I, Q174K, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
15-02704 15-02704 None None  V179VD V35T, E36A, T39K, K43E, S48ST, V60I, K122P, T165TI, E169D, K173A, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207E, R211K, F214FL, V245Q  
15-03006 15-03006 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, K173IL, Q174K, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
15-03229 15-03229 None None   E6K, K11T, V35T, E36A, T39D, S48T, K103R, V118I, K122E, D123S, T165I, K173A, D177E, T200A, Q207R, R211K, F214L, V245Q  
15-03456 15-03456 None None   V35T, T39E, E40G, S48T, E53D, K122E, S162T, K173A, Q207A, R211K, V245Q, D250E  
15-03940 15-03940 None None   V35T, T39EK, S48T, E53D, K122E, S162A, K173A, Q207A, R211K, V245Q, D250E  
15-04282 15-04282 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60VI, D121H, K122E, D123E, I135R, S162Y, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207N, R211K, V245Q  
15-04336 15-04336 None None   V35T, E36A, T39E, K122E, D123G, I142V, K166R, K173A, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207E, V245Q, E248D, D250E  
15-04398 15-04398 None None   V35T, T39E, A158S, K173A, Q174R, T200E, Q207E, R211K, V245Q  
15-04426 15-04426 None None   V35T, T39K, K122E, A158S, I159V, K173A, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K, P243T, V245N  
15-04427 15-04427 None None   V8I, T27S, V35T, E36A, T39E, S48T, D121Y, K122E, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
15-04438 15-04438 None None   K20R, E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, A158S, S162A, K173S, G196K, T200E, Q207E, R211K, V245Q, E248D  
15-04467 15-04467 None None   T27S, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121H, K122E, I135R, S162C, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211Q, V245Q  
15-04474 15-04474 None None   K20KR, V35IMT, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, A158S, K173A, D177E, G196R, T200A, Q207E, V245Q, E248N  
15-04475 15-04475 None None   T27S, K32KE, V35T, E36A, T39DE, E40ED, S48T, V60I, K122E, D123S, I135R, K173A, D177E, Q197QK, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D  
15-04476 15-04476 None None   V35T, E36A, T39E, K104KR, K122E, D123G, A158S, K166KR, K173A, Q174QK, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
15-04511 15-04511 None None  K103N, E138A E6K, V35T, T39E, E40D, S48T, V118I, K122E, T165I, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
15-04641 15-04641 None None   V35T, E36A, T39E, K122E, D123G, I142V, K166R, K173A, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207E, V245Q, E248D, D250E  
15-04693 15-04693 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, V245Q, E248D  
15-04695 15-04695 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, D121HY, K122E, I135V, K166KR, K173A, Q174K, D177E, G196M, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q, D250E  
15-04719 15-04719 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, D121H, K122E, D123E, I135R, S162Y, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207N, R211K, V245Q  
16-00108 16-00108 None None  Y181C K20R, V35I, T39E, E40D, K43R, K122E, D123E, I135R, A158S, K173A, Q174K, D177E, I178V, T200A, I202V, Q207E, R211K, F214L, V245Q, E248D  
16-00184 16-00184 None None   V35T, E36EA, T39X, V60VI, K122E, D123DG, I135IR, K173AE, Q174X, D177E, V179VI, T200TA, E204ED, Q207ADE, R211K, V245X, D250E  
16-00194 16-00194 None None   V21VI, V35T, E36A, T39E, A98S, K122E, D123S, A158S, K173A, Q174K, T200A, Q207E, R211RK, V245Q  
16-00199 16-00199 None None   V8I, V35T, E36A, T39DE, K43R, S48T, D121H, K122E, I135T, I142IV, S162SC, K173A, Q174K, D177E, T200A, E203D, Q207E, R211K, V245Q  
16-00257 16-00257 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K101R, K122E, D123N, I135IV, K173IV, D177G, D192N, T200A, Q207A, R211K, V245Q  
16-00318 16-00318 None None   K22R, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D123N, I135M, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E  
16-00323 16-00323 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K101R, K122PQ, I135IV, T139A, K166R, K173I, D177E, D192N, T200A, I202V, Q207A, R211K, V245Q  
16-00327 16-00327 None None D67N, K70R, M184V, T215F, K219Q Y181C, H221Y, K238T K20R, V35M, T39E, E40D, K43R, V60I, T69N, K122E, I135R, A158S, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207E, R211K, F214L, V245Q, E248D  
16-00368 16-00368 None None   K32KR, V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, V90I, K122E, D123G, K166R, K173I, Q174KR, D177DN, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D  
16-00375 16-00375 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, D121H, K122E, A158S, S162C, K173T, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
16-00433 16-00433 None None   V35T, T39E, K43KR, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174K, D177E, G196Q, T200A, I202V, Q207E, F214L, V245Q T58TA 
16-00437 16-00437 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, K43KR, V60VI, A98S, K122E, D123S, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245KQ  
16-00464 16-00464 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, D121H, K122E, K166R, K173A, Q174K, D177E, G196M, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q, D250E  

Database

Resources

Team