Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Guan (2020)
Title HIV-1 genetic diversity and transmitted drug resistance among newly diagnosed HIV-1 individuals in Jiangmen, China.
Citation J Med Virol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 188
NumPts 188
Subtype CRF01_AE, B + C, CRF07_BC, CRF55_01B, B, CRF08_BC, A, C

 
  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 188 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
EP003 EP003 None None   V35T, T39N, V60I, D121H, I135V, S162C, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K  
EP004 EP004 None None   E6P, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, A98S, K122E, S162A  
EP005 EP005 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, S68G, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S  
EP006 EP006 None None  E138G, V179E E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, R211K  
EP007 EP007 None None   K102Q, S162C  
EP010 EP010 None None   K102Q, S162C  
EP011 EP011 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, E53D, V60I, D121Y, K122E, I135V, S162N, Q207E, R211K  
EP012 EP012 None None K65E  E6D, V35I, T39K, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A  
EP014 EP014 None None   E6D, V35I, T39K, K43E, V111I, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S  
HS001 HS001 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S  
HS004 HS004 None None  V179E E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135R  
HS005 HS005 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, K122E, D123N, S162C, D177E, V179I, T200A, E204K, Q207V  
HS006 HS006 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123N, S162C, K173D, Q174K, D177E, I178M  
HS007 HS007 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K64R, K122E, D123S, S162C, Q174E, D177E, Q207A, R211S  
HS008 HS008 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K49R, E53D, K122E, D123N, S162C, K173R, Q174R, D177E, I178M, Q207A  
HS009 HS009 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43A, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, E203D, Q207A, R211S  
HS010 HS010 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, Q174N, D177E, Q207A  
jm03 jm03 None None  V179E V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, V111I, I132V, K166R, R172K, I178L, T200K, Q207E, R211K  
jm05 jm05 None None   K102Q, S162C  
jm06 jm06 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K49R, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S  
jm07 jm07 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E  
jm10 jm10 None None  V106I E6D, K11T, K20R, V35T, T39E, G45E, V60I, S68G, T69S, K102Q, K122E, D123N, T165I, K173I, Q174K, D177E, I178L  
jm109 jm109 None None   E6D, K11T, V35I, T39K, K43E, K122E, D123N, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S  
jm11 jm11 None None   K102Q, S162C S156L 
jm12 jm12 None None  G190E V35T, T39N, S48T, V60I, K122E, I135V, S162T, I167F, R172K, N175I, Q182H, M184L, E194Q, I195K, R199K R125M, I178K, I180F, Y188D 
jm48 jm48 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39N, S48T, V60I, K122E, D123N, I135T  
kp01 kp01 None None   E6D, V35T, T39R, K43E, V60I, K122E, D123N, I142V, K173R, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S  
kp02 kp02 None None   E6D, V35T, T39E, V60I, K122E, D123N, I142V, T165I, K173R, Q174E, D177E, I178M, E203D, Q207A  
kp04 kp04 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, I135V, K166R, Q197K, R211K  
kp05 kp05 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123N, I135T, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S  
pj03 pj03 None None   V8I, V35T, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, I135R, D177E, T200I  
pj04 pj04 None None   I5V, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, Q174N, D177E  
pj06 pj06 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123N, T139A, F171Y, K173T, Q174K, D177E, T200L, I202V, Q207A  
pj07 pj07 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, S162C, Q174E, D177E, I178M, I180L, T200A, E204K, Q207A, R211S  
pj08 pj08 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, E53D, V60I, K102R, I135V, S162C, I202V, Q207E  
pj09 pj09 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, K122E, K166R, I202V, R211K  
pj10 pj10 None None  V179D E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, K122E, D123S, I135T, S162C, D192N, T200A, Q207A, R211S  
pj100 pj100 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, T107S, D121Y, K122E, P170S  
pj101 pj101 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K101R, D121Y, K122E, S162C, E203K, R211S  
pj11 pj11 None None   E28K, K32E, V35T, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, T200S, Q207E, R211K  
pj12 pj12 None None   P4S, V8I, E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162C  
pj14 pj14 None None   E6D, V35T, T39R, K43E, V60I, K122E, D123S, I135T, I142V, K173S, Q174K, D177E, T200I, I202V, Q207A, R211S  
pj16 pj16 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A  
pj17 pj17 None None  V179D V35T, T39N, S48T, E53D, V60I, T107S, K122E, D123N, T200A, Q207E, R211K  
pj18 pj18 None None   P4Q, E6D, K11T, V35T, T39E, K102R, K104R, V118I, K122E, D123N, T165I, K173T, Q174R, D177E, T200I, Q207A, R211S  
pj19 pj19 None None   E6D, G99R, L100F, K103E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S  
pj22 pj22 None None   K11T, E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, T107S, D121Y, K122E, I135T  
pj23 pj23 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E  
pj25 pj25 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I  
pj26 pj26 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, S48T, V60I, D121H, K122E  
pj27 pj27 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173M, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S  
pj28 pj28 None None   K11Q, E28K, K32E, V35T, E36A, T39N, E40K, E44K, S48T, E53K, V60I, D121Y, K122E, K166R G152E 
pj29 pj29 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, V60I, S68G, A98S, K122E, D123N, I135R, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S  
pj30 pj30 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, V60I, D121H, K122E S48I 
pj31 pj31 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, I135T, Q174E, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L  
pj34 pj34 None None  V179E E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135R, R211K, F214L  
pj35 pj35 None None  V179E E6D, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, I135R, I202V, R211K, F214L  
pj36 pj36 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, T69S, K102R, T200I, Q207E, R211K  
pj37 pj37 None None   K20R, V35T, T39N, S48T, V60I, K122E, D123E, K166R, T200I  
pj38 pj38 None None   K20R, V35T, T39N, S48T, V60I, K122E, D123E, K166R, T200I  
pj40 pj40 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S  
pj41 pj41 None None   E6D, V35T, T39R, K43E, V60I, K122E, D123S, I135T, I142V, K173S, Q174K, D177E, T200I, I202V, Q207A, R211S  
pj42 pj42 None None  E138G, V179E E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135R, R211K, F214L  
pj44 pj44 None None  V179E E6D, V35T, T39K, K43E, V111I, K122E, D123N, I135R, I178M, R211K, F214L  
pj45 pj45 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, K122E, D123E, D192E, Q197L S191C 
pj46 pj46 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174R, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S  
pj47 pj47 None None  V179E E6D, K32N, V35T, T39K, K122E, D123S, I135R, D177N, I202V  
pj49 pj49 None None  V179E E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, I135R, I202V, R211K, F214L  
pj54 pj54 None None   V8I, V35T, T39N, S48T, V60I, D121H, K122E, I135R, I202V  
pj55 pj55 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, T69N, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S  
pj57 pj57 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, E194D, T200I, Q207A, R211S  
pj58 pj58 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K64R, K122E, D123S, S162C, D177E, E204K, Q207A, R211S  
pj59 pj59 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S  
pj64 pj64 None None  V179E E6D, K32I, V35T, T39K, K122E, D123S, I135R, D177N, I202V, R211K, F214L  
pj65 pj65 None None   E6D, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
pj66 pj66 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K49R, K122E, D123S, S162C, Q174R, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S  
pj67 pj67 None None   E6D, K11T, V21I, V35T, T39K, V60I, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207K, R211S  
pj68 pj68 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, E53D, V60I, I135V, S162C, Q174G, T200A, Q207E, R211K  
pj69 pj69 None None   E28K, K32E, V35T, T39N, S48T, V60I, D76N, D121Y, K122E, I135T, S162C, R211G, F214L  
pj71 pj71 None None  V179E E6D, V35T, T39K, K43E, K102Q, V118I, K122E, D123S, I135R, S163C, R211K, F214L  
pj72 pj72 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, K173R, Q174D, D177E, Q207A, R211K  
pj73 pj73 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123N, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L  
pj75 pj75 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S  
pj77 pj77 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135V, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S  
pj80 pj80 None None   K122E, D123S, I135V, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S  
pj83 pj83 None None  V179E E6D, V35T, T39K, K43E, V60I, V118I, K122E, D123S, I135R, T200I, I202V  
pj84 pj84 None None   V35T, T39N, S48T, V60I, K122E  
pj87 pj87 None None   M16V, V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, K64R, T69S, V90I, I135V, S162C, I195L, Q207E, R211K  
pj88 pj88 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, E203D, Q207A  
pj89 pj89 None None   K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178V, V179I, T200I, Q207A, R211S  
pj91 pj91 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, D123E  
pj92 pj92 None None   E6D, K11T, V35T, K49R, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S Q85R 
pj93 pj93 None None   K11Q, K20R, E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, K166R, K173Q, D177E, Q197K, Q207E  
pj94 pj94 None None   E6D, V8I, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K166R, K173I, Q174K, Q207A, R211S  
pj95 pj95 None None   E6D, P9S, K11T, V35T, T39K, K43E, K101Q, K122E, D123N, S162C, K166R, K173R, Q174N, D177E, V179I, T200I, Q207D, R211S  
pj97 pj97 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, I135T, S162C, D177E, I178L, T200A  
pj98 pj98 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, Q174N, D177E, Q207A, R211S  
pj99 pj99 None None   E6D, V35T, T39E, T107S, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S  
TS005 TS005 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, D177E  
TS012 TS012 None None   E6D, V8I, V35T, T39N, V60I, D121H, K122E, T200A  

Database

Resources

Team