Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Gonzalez-Domenech (2020)
Title High Prevalence of Sequences Included in Transmission Clusters Within Newly Diagnosed HIV-1 Patients in Southern Spain (2004-2015).
Citation Microb Drug Resist
SelectedGene PR
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 90
NumPts 90
Subtype B, CRF02_AG, F, CRF12_BF, C, CRF19_cpx, CRF06_cpx

 

Clinical PR Isolates


SubjectIsolatePIsWksPIMajorPIMinorCommonUnusual
1016 1016 None    K14R, E35D, R41K, L63P, I93L  
10974 10974 None    I64V  
10975 10975 None    N37S, L63PT, I64L, I72T, V77I  
109923 109923 None    T12A, I13V, I15V, L19T, K43R, L63P  
110387 110387 None    T12A, I13V, I15V, L19Q, N37S, L63P  
110619 110619 None    I13V, I15V, L19I, E35D, L63P, I72V  
1108 1108 None  L90M  T12I, E35D, I62V, L63P, I64V, H69CY  
1114 1114 None    E35ED, L63P  
1185 1185 None    I13V, E35D, M36IT, N37D, R57K, I62V, L63P, I64M, A71AV, I72M, V75VI, I93L  
119172 119172 None    T12A, I13V, I15V, L19T, K43R, L63P, F99FS  
119351 119351 None    T12A, I13V, I15V, L19I, E35D, L63P, I72V, Q92QR, F99L  
119446 119446 None    T12A, I13V, I15V, L19T, E35D, L63P  
119781 119781 None    I15V, L19T, L63LP  
12006 12006 None    T12P, I13V, L19V, L63H, I64V, I93L  
12055 12055 None    E35D, N37S, R41K, L63P  
12078 12078 None    I15IV, M36I, I62V, L63S  
12118 12118 None    T12P, L19S, N37C, L63P, Q92K  
12193 12193 None    T4TN, I15V, E35D, N37S, R57RK, I62V, L63PS, A71AV, I93L  
12194 12194 None    R57K, L63T, H69HY, A71T, I72IV, V77I I13RS 
12227 12227 None    L10I, I13V, L19LP, K20I, M36I, R41K, H69K, L89M K43K*R 
12248 12248 None    L19I, N37S, R41K, L63T, V77I, I93IL  
12255 12255 None    I13V, K14R, I15V, K20I, E35D, M36I, N37D, R41K, L63LH, I64IV, H69K, T74A, L89M, I93L  
12263 12263 None    I15V, G16E, E35ED, N37NS, L38LI, I62V, L63P, H69K, I93L  
12275 12275 None   L23LI I13V, N37S, L63P  
12725 12725 None    I13V, I15V, L19IT  
129215 129215 None    T12A, I15V, Q18QK, L19T, M36MI, N37NS, L63P, I64IM  
129318 129318 None    T12A, I15V, L19T, N37S, L63P  
129427 129427 None    I15K, G17GE, E35D, N37D, R41K, R57K, I62IV, L63R, I72V, V77I, I93L  
129429 129429 None    T12N, E35D, L63P, I72V, V77I, I93L  
129430 129430 None    E35D, N37T, L63P, I72T, V77I  
129431 129431 None    N37H, L63S, V77I  
129437 129437 None    N37C, L63T, I72T, V77I  
129483 129483 None    T12N, L19I, M36MI, N37NS, I64V  
129484 129484 None    I15V, E35D, N37S, R41K, L63H  
129502 129502 None    T12S, I13V, K14T, I15V, L19T, K20R, M36I, R41K, D60DE, Q61E, L63P, H69K, L89M, I93L  
129518 129518 None    T12N, N37H, R41K, K43R, L63P, K70R, V77I, I93L  
129522 129522 None    I13V, K14R, I15V, G16E, K20I, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M  
129525 129525 None    T12N, L19I, N37S, I64V  
129526 129526 None    L10I, Q18H, L19I, M36I, L63PS, I72T, I93L  
129535 129535 None    I13V, G16E, K20I, M36I, R41K, K43KR, H69K, L89M, I93L T74I 
129540 129540 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, L63H, I64M, H69K, L89M  
129556 129556 None    T12N, L19I, E35D, N37S, R41K, K43R, L63P, V77VI, I93L  
129656 129656 None    I13V, I15V, L19I, N37T  
129861 129861 None    I15V, L19T, M36MI  
129990 129990 None    E35D, N37S, R41K, L63LP  
129991 129991 None    I15V, N37NS, L63S, V77I  
129992 129992 None    K14KR, L19LI, E35D, M36I, N37DE, R41K, L63P, H69Q, I93L  
138035 138035 None    E35D, L63P, I72T, V77I  
138047 138047 None    G17E, R41RK, I62IV, I64V  
138060 138060 None    M36I, R41K, I93L  
138062 138062 None    N37E, R41RK, I93L  
138095 138095 None    E35ED, N37NS, L63P, V77I, I93L  
138098 138098 None    L5LI, T12N, L19I, N37S, I64V  
138114 138114 None    K14R, E35D, N37E, R57K, I62V, L63P, V77I  
138132 138132 None    L63P, V77I, I93L  
138146 138146 None    M36I, R41K, L89LI, I93L  
138154 138154 None    K14KR, E35D, N37S, R41K, L63LF, I64V  
138162 138162 None    P39AS, R41K, I62V, L63P, V77I, I93L  
138174 138174 None    L10I, I15L, L19T, K20R, L63P, C67H, V77I, I93L  
138175 138175 None    T12N, L19I, N37S, L63CS, I64IV  
138185 138185 None    L5LI, L10V, T12N, L19I, N37S, I64V  
138193 138193 None    K14R, I15V, E35D, M36I, R41K, R57K, Q61N, L63S, E65D, L89M  
138195 138195 None    I13V, I15V, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M  
138210 138210 None    L19LI, L33V, N37S, P39A, R57K, D60E, I62V, L63P, H69Y, I72V  
138242 138242 None    L10LI, E35D, L63P, I72T, V77I  
138274 138274 None    L10V, K14KR, L19LI, L33V, M36I, R41K, D60E, I62V, L63P, I64V, H69Y, I72E  
138280 138280 None    E35D, P39S, R41K, I62V, L63P, A71V, V77I, I93L  
138468 138468 None    T12A, I15V, L19T, M36I, N37S, R41K, L63P, K70R, T74A  
138764 138764 None    V11VI, T12A, I13V, I15V, L19T, K43KR, L63P  
138931 138931 None    T12D, I15V, L19T, E35D, L63P  
138957 138957 None    T12A, I13V, L19T, K20MR, K43R, L63P, H69HY  
2032 2032 None    I13V, K14R, I15V, R41K, I64V  
2143 2143 None    N37A, I62IV, L63P, I72IT, V77VI  
2194 2194 None    L33LV, L63P, V77VI  
2305 2305 None    E35D, N37D, L63P, A71T, V77I, I93L  
2403 2403 None    W6L, I13V, E35D, R57RK, L63P, I64V, V77I  
2415 2415 None    N37S, R41K, R57RK, L63A, V77I  
382 382 None    I15V, R41K, I62IV, L63X, I64IV  
387 387 None    R41K, I62V, E65D L63SY 
417 417 None    L10V, I15V, E35D, M36I, R41K, R57K, Q61N, H69Y, I72T, I93IL  
41912 41912 None    T12A, I13V, I15V, L19T, L63P  
456 456 None    I13V, K20R, L33I, N37A, R41K, L63P, I64V  
488 488 None    T12A, K14R, I15V, G16E, K20M, E35D, M36I, R57K, Q61N, L63PS, I72T, L89M  
538 538 None    K14R, I15V, R41K  
547 547 None    K14KR, I15IV, E35D, M36I, N37E, L63P, I72V  
558 558 None    I15IV, N37NS, R41K, L63P, A71AT, V77I, I93L  
611 611 None   L10FV I15IV, N37K, L63LP  
619 619 None    E35D, L63P, I72IV, I93IL  
818 818 None    L33V, K43KR, Q61E, L63P, V82I, L89M  
853 853 None    I62V, L63P, I85V  

Database

Resources

Team