Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Makwaga (2020)
Title Prevalence of human immunodeficiency virus-1 drug-resistant mutations among adults on first- and second-line antiretroviral therapy in a resource-limited health facility in Busia County, Kenya.
Citation Pan Afr Med J
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 50
NumPts 50
Subtype A, D, C, B

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
001K 001K NRTI, AZT, 3TC NNRTI D67N, M184V, T215F, K219E G190A K20R, V35T, V60I, T69N, K122E, D123N, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211N  
02k 02k AZT, 3TC NVP  K103N V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D123E, I135T, I142T, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
03k 03k NRTI, TDF, 3TC NNRTI A62V, K65R A98G, K101E, Y181C, G190A V35T, K46Q, V60I, S68G, K103R, D121H, K122E, I135T, I142V, K173Q, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211K, F214L, L228R  
04k 04k AZT, 3TC NVP M184V  K49R, V60I, K122A, D123N, I135T, D177E, V189I, I195L, T200M, Q207E  
05k 05k TDF, 3TC None K70E, M184I K101E, Y181C E28A, V35T, V60I, V90I, D121Y, K122E, K166R, D177E, I178M, V179I, T200M, Q207E, R211K, L228R  
06k 06k NRTI, AZT, 3TC NNRTI L74I, M184V A98G, K103N, P225H P4Q, V35T, V60I, K122E, D123S, I135L, I142V, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207A, L210S, R211S  
07k 07k NRTI, AZT, 3TC NNRTI K65R A98G, K101E, Y181C, G190A V35T, K46Q, V60I, S68G, K103R, D121H, K122E, I135T, I142V, K173Q, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211K, F214L, L228R  
08k 08k AZT, 3TC EFV L74V, Y115F, M184V K103N, V179E, Y181C E6K, K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, T69N, K122E, I135V, T139A, K173A, Q174K, T200A, I202V, Q207E  
09k 09k TDF, 3TC EFV  K103N P4T, E6D, V21I, V35M, T39A, V60I, K122E, D123G, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
10k 10k AZT, 3TC NVP M184V K103N V35T, E40D, K49R, V60I, D121H, K122E, D123E, I135T, S162C, T200I, Q207E, R211K  
11k 11k AZT, 3TC NVP  K103S K11T, K20R, V35T, V60I, K102R, D121H, K122E, K173S, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211K  
12k 12k NRTI, AZT, 3TC NNRTI D67N, K70E, M184V K101E, E138A, G190S E6K, K20R, E28A, V35T, T39A, K43R, V60I, K122E, I135T, Q174R, D177E, I178V, T200A, Q207E, R211K, F214L  
13k 13k AZT, 3TC EFV  K103N V35T, T39L, V60I, K122V, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
14k 14k TDF, 3TC EFV   E6D, V35T, T39L, S48T, V60I, K122E, D123N, I135T, S162H, K173S, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S  
15k 15k TDF, 3TC EFV D67N, T69D, K70T  M16T, K20R, V21I, V35T, T39A, V60I, K122E, D123N, S163T, K173S, D177E, T200A, Q207A  
16k 16k NRTI, TDF, 3TC NNRTI K70E K103N, P225H E6K, V35T, V60I, K122E, D123N, I135M, K166Q, K173L, Q174K, D177E, I178M, T200V, Q207D, R211K  
17k 17k NRTI, TDF, 3TC NNRTI M184V K103N, E138A, G190A K20R, V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211S, F214L  
18k 18k AZT, 3TC NVP M184V Y181C, H221Y V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K49R, K122E, D123G, S162N, K173N, I178M, T200A, Q207E  
19k 19k TDF, 3TC EFV K65R, M184V K103N, M230L K20R, V21I, V35T, T39K, K102Q, K122E, D123S, T165I, K173T, Q174K, D177E, I178V, V179I, I202V, Q207A, R211S  
20k 20k AZT, 3TC EFV  K101E, V179D, G190A E6K, K20R, V35T, V60I, K122E, D177E, I178M, Q207E, R211K  
21k 21k TDF, 3TC EFV K65R, Y115F K103N, V179F, Y181C, H221Y K22R, V35T, T39L, V60I, D121Y, K122E, D177E, I178M, T200V, Q207E, R211K  
22k 22k AZT, 3TC NVP  Y181C, H221Y E6Q, V21I, V35T, T39G, V60I, V90I, K122E, I135T, S162A, T165I, K173T, Q174N, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
23k 23k NRTI, AZT, 3TC NNRTI M184V Y181I E6Q, V21I, T27S, V35T, T39G, V60I, V90I, T107S, K122E, S162A, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, F214L  
24k 24k TDF, 3TC EFV  K101E V35T, E36A, T39E, E40D, K122P, A158S, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
25k 25k AZT, 3TC EFV M184V K103N, V108I, M230L E28A, V35T, V60I, T69N, V90I, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211Q, F214L  
26k 26k AZT, 3TC EFV K65R, Y115F, M184V V106I, Y188L P4H, V35T, T39A, S48T, E53D, V60I, S68N, V118I, K122E, D123S, K126Q, I135T, S162Y, F171Y, K173L, Q174K, T200A, Q207D, R211K, F214L, L228I  
27k 27k AZT, 3TC NVP  G190A K11T, K20R, V35T, T39E, V60I, K122E, D123N, K173S, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211K  
28k 28k NRTI, AZT, 3TC NNRTI M184V K101H, G190A, P225H E6A, V21I, V35T, V60I, D121Y, K122E, D177E, I178M, T200E, Q207G, R211K, F214L, K238R  
29k 29k NRTI, AZT, 3TC NNRTI  K103N V35T, T39L, V60I, K122V, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, E203D, Q207T, R211S  
30k 30k NRTI, TDF, 3TC NNRTI M41L, M184V, T215Y  V35T, K49R, V60I, K122E, I135T, D177G, V179I, Q197K, T200E, Q207E, R211K  
31k 31k TDF, 3TC EFV   V35T, S48T, V60I, D121H, K122E, D123E, I135T, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S  
32k 32k NRTI, AZT, 3TC NNRTI M184V, T215F K103N, E138A E6D, K20R, V35T, T39L, V60I, S68G, A98S, K101Q, K122E, D123N, I135L, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, F214L  
33k 33k NRTI, AZT, 3TC NNRTI K65R, Y115F K103N, V179F, Y181C, H221Y K22R, V35T, T39L, V60I, D121Y, K122E, D177E, I178M, T200V, Q207E, R211K  
34k 34k AZT, 3TC EFV L74V, Y115F, M184V K103N, G190A V35T, T39L, V60I, D121Y, K122E, D123E, I135T, K173L, Q174K, D177E, I180V, Q207A, R211S, D237E  
35K 35K TDF, 3TC EFV   I5V, V35T, V60I, D121Y, K122E, I135M, S162H, K173S, Q174K, D177E, V179I, G196E, T200A, Q207A, R211H  
36K 36K AZT, 3TC EFV   V35T, T39M, V60I, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
37K 37K AZT, 3TC NVP   K11T, V35T, K122E, D123G, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
38K 38K AZT, 3TC EFV   P4H, V35T, T39K, K43E, D121H, K122E, D123S, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
39K 39K AZT, 3TC NVP   K11T, K20R, V21I, K122E, D123S, K173S, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S  
40K 40K TDF, 3TC EFV   V21I, V35T, S48T, V60I, K122E, D123S, E169D, K173A, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207A, R211S  
41K 41K AZT, 3TC NVP   K11T, K20R, V21I, V35T, T39S, K122I, D123N, K173A, Q174K, D177E, I178V, V179I, I202V, Q207A, R211S  
42K 42K AZT, 3TC NVP   V35T, T39I, V60I, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
43K 43K TDF, 3TC None   V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D123T, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207V, R211K  
44K 44K TDF, 3TC None   E6D, V35T, V60I, S68SG, K122E, I135T, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, I202V, Q207K, R211S  
45K 45K NRTI, AZT, 3TC NNRTI   E6D, V35T, T39L, S48T, V60I, K122E, D123N, I135T, S162H, K173S, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S  
46K 46K NRTI, AZT, 3TC NNRTI   M16MK, V21I, V35T, V60I, K122E, D123S, E169D, K173A, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207A, R211S  
47K 47K AZT, 3TC NVP Q151QL  K11T, K20R, V21I, V35T, T39S, S117P, K122I, D123N, E169ED, K173S, Q174K, D177E, I178V, V179I, I202V, Q207A, R211S, Y232YD I167IN 
48K 48K TDF, 3TC None   V35T, V60I, T69S, V118I, K122E, D123S, I135T, I142V, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, F214L  
49K 49K AZT, 3TC NVP   K20R, T27S, V35T, K122E, D123G, I135T, K173A, Q174K, D177E, V179I, Q207D, R211K  
50K 50K NRTI, AZT, 3TC NNRTI   E6A, V35T, E40D, K122V, D123S, K173A, Q174N, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S