Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Yin (2020)
Title Molecular Epidemiology of HIV-1 in Jiangsu Province, Southeast China: Genotypes and HIV-1 Transmission Networks Among Newly Diagnosed Men Having Sex with Men in 2017.
Citation AIDS Res Hum Retroviruses
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 765
NumPts 765
Subtype CRF01_AE, B + C, B, CRF07_BC, A, CRF55_01B, CRF67_01B, CRF68_01B, C, CRF08_BC, B + CRF01_AE

 
  Page 1 of 8    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 765 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
cz10 cz10 None None  V179E E6D, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, I135R, R211K, F214L  
cz11 cz11 None None   E6D, V35T, V60I, S68G, K122E, D123S, I135T, R172K, K173X, Q174K, D177E, T200R, Q207N, R211S  
cz13 cz13 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R  
cz14 cz14 None None   E6D, E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, I47L, S48X, V60I, K122E, D123N, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, G196E, E203D, Q207A, R211S  
cz16 cz16 None None   V60I, K122E, I135T, T165I, E169D, G196E, R211M, F214L  
cz17 cz17 None None   P4S, E6D, V8I, K11T, V35T, T39K, K43E, V60I, S68G, V111I, D123S, I135T, T165A, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R  
cz18 cz18 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, L100X, D121Y, K122E, L168X  
cz23 cz23 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, P97X, D121H, K122E, I135T, D192X  
cz25 cz25 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43X, P95X, D123X, S162C, Q174K, D177E, V179I, Q207A, L210X, R211S, D237X, K238R  
cz33 cz33 None None   E6D, K11T, V21I, V35T, T39K, K43E, K49R, K122E, D123S, I135T, S162C, E169D, Q174R, D177E, Q207E, K238R  
cz35 cz35 None None M41L  E6D, K11T, I31X, V35T, T39K, K43E, V60I, K101R, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S  
cz36 cz36 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K102R, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200I, Q207A, R211S  
cz37 cz37 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K103R, D123X, Q174X, V179I, L193X, T200A, R211T, D237X D121M 
cz38 cz38 None None   E6D, V35T, I94X, K122E, D123S, T200I, R211K, F214L, K238R  
cz4 cz4 None None A62V  E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E  
cz40 cz40 None None   K22R, E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135L, K166R F87M 
cz42 cz42 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, T200A, Q207H  
cz43 cz43 None None   E6D, K22R, V35T, T39K, V118I, K122E, D123T, I135T, R211K, F214L  
cz44 cz44 None None  V179D E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, T200R  
cz45 cz45 None None   E6K, E28K, I31X, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, P176X, Q207H, R211K  
cz48 cz48 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K104X, D121H, K122E, T200A, L209X  
cz49 cz49 None None  A98G, V179E E6D, V8I, V35T, T39K, V60I, K122E, D123S, I135R, R211K, F214L  
cz52 cz52 None None   V35T, T39N, V60I, K101R, D121Y, K122E, T200I, R211G  
cz53 cz53 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43A, K122E, D123S, S162C, Q174N, D177E, V179I, E204K, Q207A, R211S  
cz58 cz58 None None   E6D, V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, T200I, R211K, F214L, K238R  
cz65 cz65 None None   E6D, W88X, K122E, D123S, I178L, T200I, R211K, F214L, K238R  
cz66 cz66 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V60I, K101R, I135V, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207X, R211S, D237X  
cz68 cz68 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, G196E, Q207A, R211S, K238R  
cz70 cz70 None None   E28K, K32E, V35I, E36A, T39D, S48T, V60I, K102R, S117X, V118X, D121Y, K122E, I135M  
cz71 cz71 None None   E6D, V35T, K122E, D123S, T200I, F214L, K238R  
cz73 cz73 None None   E6D, V35T, K122E, D123S, T200I, F214L, K238R  
cz75 cz75 None None   E6D, K64R, K122E, D123S, K166R, F171Y, T200I, K201R, R211K, F214L, K238R  
cz76 cz76 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, D123S, S162C, K173G, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
cz8 cz8 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V60I, K101R, K122E, D123N, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S  
cz9 cz9 None None   V8I, E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, I135V, K173E, Q207E  
ha11 ha11 None None   E6D, V35T, E36K, T39K, K43E, T69S, K101Q, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, E203D, Q207A, R211K  
ha15 ha15 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K102R, D121Y, K122E, K166R  
ha17 ha17 None None  V106I E6D, K20R, V35I, T39K, K122E, D123S, T200I, R211Q, F214L, K238R  
ha23 ha23 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, D177E, T200K, E203D, Q207A, R211S, K238R  
ha26 ha26 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, D177E, I178IM, V179I, Q207A, R211S, K238R  
ha28 ha28 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, T69S, K101Q, K122KE, D123N, S162Y, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, E203D, Q207A, R211K  
ha29 ha29 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135IV, T200A, R211K  
ha30 ha30 None None   K11R, V35T, E36A, T39E, S48T, E53D, V60I, D121H, K122E, I135T, T200I, I202V, Q207D, R211K  
ha31 ha31 None None   P9PT, E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, E169D  
ha36 ha36 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K49R, E53D, K122E, D123S, S162C, E169D, K173N, Q174K, D177E, I178L, Q207A, R211N, K238R  
ha37 ha37 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, T200A, R211K  
ha38 ha38 None None   K11R, E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, T200A, R211A  
ha39 ha39 None None   V8I, E28K, K32E, V35T, E36A, T39A, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, I142V  
ha40 ha40 None None   I5V, E6D, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, G196R, T200I, E203D, Q207A, R211S, K238R  
ha41 ha41 None None   E6D, K20R, V35T, T39R, K43E, V60I, K122E, D123S, K173R, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, K238R, I244V  
ha42 ha42 None None   V35T, T39M, S48T, V60I, K102R, D121H, K122E, I135T, S162C, Q207E  
ha43 ha43 None None   E6D, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, E169D, K173R, Q174K, D177E, I178M, I195L, G196E, Q207A, L210M, R211S, K238R  
ha44 ha44 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, S162C, Q174E, D177E, I178M, V179I, E204K, Q207A, R211S, K238R  
ha49 ha49 None None   E6D, K122E, D123S, I135T, K166R, T200I, R211Q, F214L, K238R  
ha5 ha5 None None   P4S, E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, E169D, K173R, Q174R, D177E, I178M, T200TI, Q207A, R211S, K238R  
ha51 ha51 None None  V179E E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, P176T, T200A, I202V, R211K  
ha52 ha52 None None   K11T, E28K, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, Q174S, D177E, V179I, Q207A, R211S  
ha53 ha53 None None   E6D, K11T, K32R, V35T, T39K, E40A, K43E, K122E, D123S, I135T, K173M, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, I244V  
ha57 ha57 None None   V8I, E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, I142V  
ha6 ha6 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K49R, V60I, K122E, D123S, I135T, T139A, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, G196E, E203D, Q207N, R211S, K238R  
ha8 ha8 None None   E6D, K11A, K20R, V35T, T39K, K43E, D121Y, K122E, I135T, I178LM, V179I  
lyg1 lyg1 None None   E6D, V60I, D123E, I135T, V179I, Q207K, R211K, F214L  
lyg12 lyg12 None None   K11T, V35T, T39K, K43E, D123N, S162C, F171Y, Q174R, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R  
lyg15 lyg15 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T  
lyg17 lyg17 None None   P4H, E6D, K11T, V35T, T39N, V118I, D123S, I135T, K173A, Q174K, D177E, T200I, Q207D, R211S, F214L  
lyg19 lyg19 None None   E6D, V35T, T39K, V118I, K122A, K173E, T200V, R211Q, F214L  
lyg2 lyg2 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, E169D, Q174K, D177E, I178M, I195L, G196E, Q207A, L210M, R211S, K238R  
lyg20 lyg20 None None   E6D, V8I, V35T, T39K, V60I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, V189I, T200I, Q207A, R211S  
lyg21 lyg21 None None   E53D, D121Y, K122E, S162Y, R211K  
lyg26 lyg26 None None  V179D K11T, V35T, T39K, K43E, K102R, K104R, D121H, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174R, D177E, Q207A, R211S  
lyg28 lyg28 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V75L, D121H, K122E, D123S, I135T, S162C, Q174E, D177E, E203D, E204K, Q207A, R211S, K238R  
lyg31 lyg31 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, K166R, T200A  
lyg35 lyg35 None None  Y181C E6D, K11T, V35K, T39D, K49R, K122E, D123S, I135T, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200K, Q207A, R211S, K238R  
lyg36 lyg36 None None   E6D, E28K, K32E, V35T, K122E, D123S, S162C, K173N, Q174K, D177E, I178M, T200E, Q207A, R211S, K238R  
lyg38 lyg38 None None   E6D, V35T, K122E, D123S, I135T, T200I, R211RK, F214L, K238R  
lyg41 lyg41 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43A, K122E, D123S, I135T, S162C, K173N, Q174K, Q207A, R211S, K238R  
lyg43 lyg43 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43A, D123N, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R  
lyg48 lyg48 None None   E6D, V35T, K122E, D123S, K166R, R211K, F214L, K238R  
lyg55 lyg55 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K101R, D121Y, K122E, I135T, Q207G  
lyg56 lyg56 None None  K103S, V106I E6D, K11T, V35T, T39K, E40Q, K43E, K122E, D123S, I135T, F214L, I244V  
lyg57 lyg57 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, S162C, K173R, Q174R, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R  
lyg58 lyg58 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K102R, K122E  
lyg59 lyg59 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E  
lyg64 lyg64 None None   E28K, K32E, V35K, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, I178M, V179I  
lyg65 lyg65 None None   E6D, K11T, V35T, D121H, K122E, D123G, S162C, D177E, T200I, E203D, Q207A, R211S, T216X, D237N, K238R Q174I 
lyg67 lyg67 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, A158S, S162C, E169D  
lyg68 lyg68 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R  
lyg69 lyg69 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162H, K173L, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R K73I 
lyg7 lyg7 None None   I135R, S162C, E169D, Q174E  
lyg70 lyg70 None None   E6N, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, I142V, S162Y, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R  
lyg73 lyg73 None None   I5V, E6D, V35T, E36D, T39R, K43E, K49R, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R  
lyg74 lyg74 None None   D123E, I135V, E169X, Q174E, T200A, Q207L  
lyg77 lyg77 None None   E6D, V35T, T39K, K43A, K122E, D123S, I135R, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R  
lyg8 lyg8 None None   E28Q, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123E, I135R, Q207K  
lyg87 lyg87 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R  
lyg9 lyg9 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, Q207E  
nj3 nj3 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S48T, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174E, D177E, E204K, Q207A, R211S, K238R  
nj4 nj4 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V60I, V118I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L  
nj7 nj7 None None   E28K, K32E, V35T, T39N, S48T, V60I, D121H, K122E, D177E, R211K  
nj8 nj8 None None   E6D, K11T, E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, D177E, I178M  

Database

Resources

Team