Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Fabeni (2020)
Title Evaluation of HIV Transmission Clusters among Natives and Foreigners Living in Italy.
Citation Viruses
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 726
NumPts 726
Subtype B, C, CRF02_AG, F, A, CRF01_AE, CRF12_BF, CRF20_BG, B + F, B + G, CRF24_BG, A + B, CRF09_cpx

 
  Page 1 of 8    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 726 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
13929 13929 None None  E138A V35I, R83K, A98S, D123E, I135T, K166R, G196E, I202V, F214L, D250E  
14077 14077 None None  E138A V35I, R83K, A98S, D123E, I135T, T139I, K166R, G196E, I202V, F214L, D250E  
14585 14585 None None   K32R, A98S, D123E, S162C, I195T  
14696 14696 None None   V35E, A98S, K102Q, D123E, I135R, D177N, G196E  
15505 15505 None None   A98S, I135L, S162C, D177E, T200A, R211K, L228H, D250E  
15519 15519 None None   V35E, A98S, K102Q, D123E, I135R, D177N, G196E  
15574 15574 None None   K32R, A98S, D123E, S162C  
15642 15642 None None   S48T, K49R, V60I, K122E, I135V, S163T, T165I, T200A  
15844 15844 None None   S48T, K49R, V60I, S117P, I135V, S163T, T165I, T200A Y115N 
15978 15978 None None L210W, T215D L100I, K103N V60I, V90I, A98S, K122E, I135V, T139K, I142V, Q197E  
16069 16069 None None   K20R, Q174H, E204Q, Q207E, R211K, F214L, V245E, E248D, K249R  
16242 16242 None None L210W, T215D L100I, K103N V60I, V90I, A98S, D121H, K122E, T139K, I142V, Q197E  
16310 16310 None None  V179D V60I, D123E, I135M  
16312 16312 None None   I135L, G196E, S251T  
16316 16316 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
16322 16322 None None   K49R, K104R, K122E, I135T, S162C, E169D, T200A, Q207A, V245M  
16335 16335 None None   D177E, R211K  
16355 16355 None None   V35I, I135T, T200A, I202V, R211A  
16362 16362 None None   K32R, V35R, K49R, V60I, D123E, I135S, D177E  
16366 16366 None None   R83K, E203D, R211K, T240A, V245Q  
16374 16374 None None   A98S, K122E, Q207E, R211Q, V245N  
16406 16406 None None   V245M  
16408 16408 None None  E138A R83K, K101R, K122E, D123G, K166R, V179I, G196E  
16409 16409 None None  E138A R83K, K101R, K122E, D123S, K166R, V179I, G196E  
16410 16410 None None   K49R, R83K, I135T, D177E, G196E  
16432 16432 None None K65E, D67N, K219Q  P55A, V118I, K122R, D123E, S134C, I135T, T139R, Y144F, R211K, F214L, V245E  
16437 16437 None None   K49R, R83K, I135T, D177E, G196E  
16450 16450 None None  V179D V60I, D123E, I135M  
16455 16455 None None   K32T, V35I, K49R, D123E, I135K, T200A, I202V, R211G, F214L, V245N, D250E  
16458 16458 None None   V60I, Q207E, R211K, E248Q, D250E  
16460 16460 None None   V35I, K43R, K122E, D123N, K173N, Q174K, I178M, T200A, V245E  
16473 16473 None None   K122E, Q207E, V245E  
16480 16480 None None   A98S, I142M, G196E, Q197H, T200A, K201R, Q207A, R211K, V245E  
16498 16498 None None  A98G, G190A K20R, V35M, D123E, I135L, T165I, R172K, Q174H, V179I, E203D, R211K  
16500 16500 None None   K64R, T69S, K122P, I135T, S162C, D177E, I178M, R211K  
16570 16570 None None   K49R, R83K, D123E, I135T, G155R, D177E, G196E, L210F, R211K  
16571 16571 None None   K49R, R83K, D123E, I135T, D177E, G196E, R211K, V245E  
16578 16578 None None   V60I, V118I, R211Q, F214L, V245I, E248D  
16591 16591 None None   D123E, I135T, D177E, R211K, V245M, E248D  
16592 16592 None None   K101R, K122E, Q207E, V245E  
16626 16626 None None   K20R, V60I, K102R, S162C, Q207E, R211K, E248Q, D250E  
16628 16628 None None  Y181C I178L, Q207E, R211K  
16629 16629 None None   R211K  
16630 16630 None None   S162C, Q207N, R211K, V245M  
16683 16683 None None   A98S, D123E, I135T, D177E, R211K, V245I, E248D  
16698 16698 None None   A98S, Q174R  
16708 16708 None None   D123E, I135T, D177E, R211S  
16709 16709 None None   K20R, V35I, K49R, V60I, R83K, I135T, E169D, R211K  
16723 16723 None None   K49R, K122E, D123E, I135T, E169D, Q207E, R211K, F214L  
16727 16727 None None D67N, K219Q  I50V, P55A, V60I, T69N, V118I, D123E, S134C, I135T, T139R, Y144F, R211K, F214L, V245E  
16739 16739 None None   I135V, D177E, R211K  
16752 16752 None None   K49R, K104R, K122E, I135T, S162C, E169D, Q207E, V245M  
16784 16784 None None   K32R, S68G, D121H, K122E, I135T, S162C, D177E, G196E, T200I, R211G, V245E  
16786 16786 None None   V60I, I135T, T200I, F214L  
16819 16819 None None  K103N V35T, E36A, T39E, K173T, T200A, E204K, Q207E, V245Q  
16839 16839 None None   D123E, R211K, F214L  
16840 16840 None None   K64R, S68G, D123E, I135T, D177E, R211Q, V245I, E248D  
16854 16854 None None   V60I, I135T, T200I, F214L  
16874 16874 None None   V60I, I135T, T200I, F214L  
16885 16885 None None   R83K, D123E, D177E, R211K, V245I, E248D  
16894 16894 None None   V35T, T39A, A98S, K122E, D123H, I178M, T200A, R211K, V245M  
16918 16918 None None   K20R, T39A, A98S, D123E, F171Y, K173R, Q174K, T200A, I202V, Q207E, R211K, F214L  
16932 16932 None None   D123E, I135T, D177E, R211K, V245I, E248D  
16933 16933 None None   R83K, R211K, V245Q  
16943 16943 None None   S68G, A98S, I135V, I142M, Q145E, Q197H, T200A, K201R, Q207A, R211K, P243T, V245E  
16949 16949 None None   K49R, K122A, D123E, I135T, E169D, Q207E, R211K, F214L L120S 
16958 16958 None None   K20R, V35T, E40D, I50V, V60I, V118I, D121H, K122E, P176S, I178L, T200A, F214L, V245M  
16959 16959 None None   D121H, K122E, D177E, T200A  
16960 16960 None None  E138A K20R, V35I, K49R, V60I, R83K, I135T, T165I, E169D, R211K  
16961 16961 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, S162N, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
16977 16977 None None   S162C, I178L, Q207E, R211K  
16981 16981 None None   V35M, T39A, R83K, I135T, R211K  
17006 17006 None None   R83K, V245E  
17058 17058 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, D121Y, K122E, I159V, K173E, T200A, Q207K, R211Q, E233K, V245Q, E248N  
17090 17090 None None   V35T, T39A, I135V, S162A, E169Q, K173T, Q174N, D177E, V189I, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
17104 17104 None None   I135R, I202V, F214L  
17121 17121 None None   A98S, I135L, S162C, D177G, T200A, R211K, L228H, D250E  
17123 17123 None None   K49R, K104R, I135L, S162C, K173A, Q174R, I178M, V189I, T200A, Q207A, R211K, V245Q  
17141 17141 None None   V35M, R83K, K166R, R211K  
17142 17142 None None   V35M, R83K, D86E, I135T, K166R, R211K  
17149 17149 None None  V106I A98S, K122E, I135T, S162C, Q207E, R211K, F214L  
17187 17187 None None  E138A S68G, K104R, D123E, I135T, V179C, G196E, T200A, Q207N, R211K, V245L  
17188 17188 None None  E138K V35T, T39A, A98S, K122E, D123H, I178M, T200A, R211K, V245M  
17202 17202 None None   I135T, K173R, D177G, R211K, V245M  
17207 17207 None None   V35I, I135V, Q197H, Q207E, R211K  
17221 17221 None None   R83K, D123N, I135V, E203D, R211K, V245Q  
17235 17235 None None  E138A K11E, D121H, K122E, D123S, I135V, S162C, V179I  
17236 17236 None None   E28K, E29K, K49R, K122E, D123E, E169D, Q207E, R211K, F214L  
17249 17249 None None  E138A K20R, K49R, I50V, V60I, R83K, A98S, D123E  
17254 17254 None None   V60I, R83K, D121Y, K122E, L210M, R211K  
17261 17261 None None   D123E, I135T, I142T, D177E, R211K, V245I, E248D  
17263 17263 None None   P9S, V35T, T39A, I135V, I142V, S162A, E169Q, K173T, Q174N, D177E, V189I, T200A, Q207D, R211Q, F214L, V245Q  
17283 17283 None None  E138A S68G, K104R, K122E, D123E, V179C, G196E, T200A, Q207N, R211K, V245L  
17284 17284 None None  K103N, E138A, K238T K20R, V35T, E40D, V60I, K101Q, K122E, D123S, I135T, I178L, F214L, V245T  
17286 17286 None None   V35I, T200A, I202V, R211A D177Y 
17293 17293 None None   V35T, T39S, I135V, S162A, E169Q, K173T, Q174N, D177E, V189I, T200A, Q207E, R211Q, F214L, V245Q  
17339 17339 None None   V35T, T39A, I135V, I142V, S162A, E169Q, K173T, Q174N, D177E, V189I, T200A, Q207E, F214L, V245Q  
17343 17343 None None   I50V, S68G, I135T, K173R, Q174K, T200A, R211S  
17357 17357 None None  V179D V60I, D123E, D177E, G196E, R211Q, F214L, V245M  
9948 9948 None None  V179D V35L, T39A, P55A, V118I, K122E, S134C, I135T, T139R, R211K, F214L, V245E, D250E  

Database

Resources

Team