Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Chang (2020)
Title HIV-1 genetic diversity and recombinant forms among men who have sex with men at a sentinel surveillance site in Xi'an City, China.
Citation Infect Genet Evol
SelectedGene PR
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 79
NumPts 79
Subtype B + C, CRF01_AE, CRF07_BC, B, CRF55_01B, A

 

Clinical PR Isolates


SubjectIsolatePIsWksPIMajorPIMinorCommonUnusual
MSM20181080 MSM20181080 None    Q18E, E35D, R41K, D60E, L63P, I93L  
MSM20181308 MSM20181308 None    E35D, M36I, R41K, L63T, H69K, K70R, I72T, L89M  
MSM20181719 MSM20181719 None    K20R, E35D, M36I, N37ND, R41K, H69K, L89M, I93L  
MSM20181910 MSM20181910 None    G16E, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M  
MSM20181949 MSM20181949 None    K14R, G16A, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M P79L 
MSM20182073 MSM20182073 None    I13V, G16E, E35D, M36I, R41K, K45R, R57K, H69K, K70R, L89M  
MSM20182158 MSM20182158 None    I13V, G16E, E35D, M36I, R41K, K45R, R57K, H69K, L89M  
MSM20182315 MSM20182315 None    I15V, E35D, L63P, A71V, I72E, V77I, I93L  
MSM20182340 MSM20182340 None    L19V, E35D, R41K, D60E, L63P, V77I, I93L  
MSM20182378 MSM20182378 None    E35D, N37D, R41K, L63P, A71V, I93L  
MSM20182397 MSM20182397 None    L10I, I13V, E35D, M36I, R41K, H69K, V82I, L89M  
MSM20182407 MSM20182407 None    E35D, N37D, R41K, D60E, L63P, I64M, I93L  
MSM20182414 MSM20182414 None    I15V, E35D, R41K, D60E, Q61E, L63P, V82I, I93L  
MSM20182415 MSM20182415 None    T12V, N37S, R41K, I62V, L63A, V82I, I93L  
MSM20182453 MSM20182453 None    T12P, K14R, E35D, R41K, D60E, L63P, V77I, I93L  
MSM20182454 MSM20182454 None    L19V, E35D, R41K, D60E, Q61D, L63P, E65D, I72IV, V77I  
MSM20182455 MSM20182455 None    T12P, E35D, N37D, R41K, D60E, L63P, I93L  
MSM20182460 MSM20182460 None    T12A, E35D, R41K, D60E, L63P, I93L  
MSM20182544 MSM20182544 None    E35D, R41K, D60E, L63P  
MSM20182611 MSM20182611 None    E35D, N37D, R41K, D60E, L63P, I93L  
MSM20182708 MSM20182708 None    K14R, G16E, E35D, M36I, R41K, H69K, K70R, L89M  
MSM20182722 MSM20182722 None    I13V, L19V, E35D, R41K, D60E, L63P, A71V, I93L  
MSM20182747 MSM20182747 None    E35D, M36I, R41K, H69K, L89M  
MSM20182784 MSM20182784 None    L19V, R41K, K45R, D60E, Q61D, L63A, E65D, V77I, I93L  
MSM20182843 MSM20182843 None    E35D, M36I, R41K, H69K, I72V, L89M  
MSM20182861 MSM20182861 None    K14R, E35D, N37D, R41K, D60E, L63P, V77I  
MSM20182864 MSM20182864 None    T12A, E35D, N37D, R41K, D60E, L63P, A71T, I93L  
MSM20182868 MSM20182868 None    K20R, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M  
MSM20182874 MSM20182874 None    M36I, R41K, D60E, I62V, L63A, I72V  
MSM20182880 MSM20182880 None    I15V, L19I, E35D, R41K, D60E, L63P, I93L  
MSM20182906 MSM20182906 None    T12K, L19E, E35D, R41K, D60E, L63P, V77I, I93L  
MSM20182930 MSM20182930 None    E35D, R41K, L63P, I93L  
MSM20182946 MSM20182946 None    E35D, M36I, H69K, L89M, I93L  
MSM20182977 MSM20182977 None    L10I, K14R, E35D, R41K, D60E, L63P, I93L  
MSM20182980 MSM20182980 None    G16E, M36I, N37S, R41K, D60E, I62V, L63S, I72V, V77I, I93L  
MSM20182994 MSM20182994 None    L10M, E35D, R41K, D60E, Q61E, I62V, L63P, C67S, I93L  
MSM20182999 MSM20182999 None    E35D, R41K, D60E, I62V, L63P, V77I, I93L  
MSM20183039 MSM20183039 None    T12A, R41K, D60E, Q61D, L63P, V77I, I93L  
MSM20183042 MSM20183042 None    L19V, E35D, R41K, D60E, I62V, L63P, I93L  
MSM20183061 MSM20183061 None    K20R, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L  
MSM20183070 MSM20183070 None    R41K, D60E, L63P, C67Y, A71V, I93L  
MSM20183079 MSM20183079 None    T12A, I15V, E35D, N37D, R41K, D60E, L63P, A71V, V77I, I93L  
MSM20183091 MSM20183091 None    E35D, M36I, N37D, R41K, H69K, K70R, L89M, I93L  
MSM20183104 MSM20183104 None    L19F, E35D, R41K, D60E, L63P, V77I, I93L  
MSM20183123 MSM20183123 None    E35D, R41K, D60E, I62V, L63P, I93L  
MSM20183149 MSM20183149 None    E35D, M36I, R41K, D60E, Q61E, L63P, H69Y, A71V, V77I, I93L  
MSM20183186 MSM20183186 None    G16E, K20R, E35D, M36I, L63S, H69K, K70R  
MSM20183245 MSM20183245 None    E35D, R41K, D60E, L63P, I93L  
MSM20183289 MSM20183289 None    I13V, K14R, G16E, E35D, M36I, R41K, H69K, K70R, L89M  
MSM20183302 MSM20183302 None    G16E, E35D, M36I, N37S, R41K, L63P, H69K, L89M, I93L  
MSM20183312 MSM20183312 None    T12A, R41K, D60E, L63P, V77I, I93L  
MSM20183356 MSM20183356 None    E35D, M36I, R41K, L63T, H69K, K70R, I72T, L89M  
MSM20183357 MSM20183357 None    L10V, E35D, M36I, R41K, L63T, H69K, I72T, L89M  
MSM20183388 MSM20183388 None    Q18E, K20R, E35D, M36I, R41K, I62V, L63P, H69K, K70R, L89M, I93L  
MSM20183408 MSM20183408 None    E35D, R41K, K45R, D60E, L63P, V77I, I93L  
MSM20183409 MSM20183409 None    E35D, M36I, R41K, K45R, R57K, D60E, I62V, L63P, I93L  
MSM20183422 MSM20183422 None    E35D, P39S, R41K, D60E, L63P, A71V, I72T, V77I, I93L  
MSM20183470 MSM20183470 None    I13V, E35D, M36I, R41K, H69K, K70R, L89M  
MSM20183490 MSM20183490 None    E35D, M36I, R41K, K45R, R57K, D60E, I62V, L63P, I93L  
MSM20183534 MSM20183534 None    T12S, I15V, L19M, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M, I93L  
MSM20183609 MSM20183609 None    E35D, R41K, L63P, A71T, V77I, I93L  
MSM20183630 MSM20183630 None    I13V, I15V, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M  
MSM20183637 MSM20183637 None    E35D, R41K, D60E, Q61E, I62V, L63P, I93L  
MSM20183642 MSM20183642 None    E35D, R41K, L63A, A71V, I93L  
MSM20183646 MSM20183646 None    R41K, D60E, Q61D, L63P, I93L  
MSM20183664 MSM20183664 None    K14R, I15V, P39A, R41K, L63A, I93L  
MSM20183726 MSM20183726 None    E35D, M36I, R41K, L63T, H69K, I72T, T74S, L89M  
MSM20183734 MSM20183734 None    I15V, K20R, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L  
MSM20183738 MSM20183738 None    G16E, E35D, M36I, R41K, H69K, K70R, L89M  
MSM20183765 MSM20183765 None    K14R, I15V, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L  
MSM20183786 MSM20183786 None    K20R, E35D, M36I, R41K, L63P, H69K, L89M, I93L  
MSM20183845 MSM20183845 None    E35D, N37D, R41K, D60E, L63P, V77I, I93L  
MSM20183853 MSM20183853 None    I13V, G16E, E35N, M36I, R41K, R57K, L63S, H69K, L89M, Q92K  
MSM20183902 MSM20183902 None    T12A, K14R, I15V, E35D, N37D, R41K, D60E, L63P, I93L  
MSM20183928 MSM20183928 None    E35D, N37D, R41K, D60E, L63P, V77I, V82I, I93L  
MSM20183929 MSM20183929 None    E35D, R41K, L63S, A71V, V77I, I93L  
MSM20183940 MSM20183940 None    I15V, E35D, R41K, K43R, D60E, L63P, I93L  
MSM20183977 MSM20183977 None    L19V, D60E, I62V, L63S, I72V, V77I, I93L  
MSM201891 MSM201891 None    L10V, G16E, E35D, M36I, R41K, L63T, H69K, I72T, L89M