Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Wu (2019)
Title Phylogenetic analysis highlights the role of older people in the transmission of HIV-1 in Fuyang, Anhui Province, China.
Citation BMC Infect Dis
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 362
NumPts 362
Subtype CRF07_BC, B, CRF01_AE, CRF08_BC, C, CRF55_01B, CRF67_01B, CRF68_01B, G, A, CRF62_BC

 

  Page 1 of 4    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 362 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
HETE.XZDfFY055 HETE.XZDfFY055 None None   P4Q, E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, D121H, K122E, D123S, I135M, S162C, Q174N, D177E, V189I, I202V, E203Q, Q207D, R211S, K238R, V245E  
HETE.XZDfFY059 HETE.XZDfFY059 None None M184V  V8I, T27S, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, T200A, E203ED, R211RK, V245H  
HETE.XZDfFY063 HETE.XZDfFY063 None None A62AV, V75I L100I, K103N E6D, V21VI, V35T, T39K, K43E, K102R, K122E, D123S, I135R, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
HETE.XZDfFY106 HETE.XZDfFY106 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K49KR, K122E, D123N, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
HETE.XZDfFY109 HETE.XZDfFY109 None None   V35T, E36A, T39D, E40D, S48T, V60I, T107S, K122E, V179I, V245Q  
HETE.XZDfFY117 HETE.XZDfFY117 None None   E6ED, T7TP, V35VI, I135V, S162C, Q174QH, T200E, R211K, V245E  
HETE.XZDfFY139 HETE.XZDfFY139 None None   K32N, K103KR, D121H, K122E, I135K, S162C, T200A, E204EK, Q207D, R211K, V245Q K11AV 
HETE.XZDfFY170 HETE.XZDfFY170 None None   V60I, I135V, S162C, Q174E, T200A, Q207H, R211K, V245E  
HETE.XZDfFY175 HETE.XZDfFY175 None None   K20KR, S162C, Q174H, T200A, R211G, E248D  
HETE.XZDfFY199 HETE.XZDfFY199 None None   D121H, I135V, S162C, R211K M230MV 
HETE.XZDfFY231 HETE.XZDfFY231 None None  K103N T39TA, K122KQ, S162C, V179VI, T200E, F214L, E248D  
HETE.XZDfFY235 HETE.XZDfFY235 None None T215A  I135L, S162C, T200A, E204EK, R211K  
HETE.XZDfFY268 HETE.XZDfFY268 None None   K20R, D123E, I135V, S162C, T200A, R211K  
HETE.XZDfFY304 HETE.XZDfFY304 None None   E6D, K20R, V35T, T39K, E40D, K43E, K122E, D123S, I159V, K173L, Q174K, D177EG, Q207A, R211S, I244V, V245K  
HETE.XZDfFY334 HETE.XZDfFY334 None None   I135V, S162C, T200A, R211K  
HETE.XZDfFY363 HETE.XZDfFY363 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D86E, D121Y, K122E, V245Q, K249Q  
HETE.XZDmFY013 HETE.XZDmFY013 None None   I135V, S162C, D177DE, I178M, T200A, R211K, V245E  
HETE.XZDmFY017 HETE.XZDmFY017 None None   I135L, S162C, T200A, R211K  
HETE.XZDmFY026 HETE.XZDmFY026 None None   D123E, I142V, S162C, E169D, G196E, T200A, K201KR, E204K, Q207K, R211S  
HETE.XZDmFY034 HETE.XZDmFY034 None None   E28K, V35KT, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q K32DE 
HETE.XZDmFY040 HETE.XZDmFY040 None None  V179D E28K, K32E, V35T, T39N, S48T, V60I, K122E, D123N, K166R, Q207E, V245Q, E248V, K249Q  
HETE.XZDmFY042 HETE.XZDmFY042 None None   E28R, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, T200I, V245Q, K249Q  
HETE.XZDmFY045 HETE.XZDmFY045 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, E169D, R211K, V245Q  
HETE.XZDmFY082 HETE.XZDmFY082 None None   I135V, S162C, Q174H, Q207E, R211K, V245K, K249KQ P170A 
HETE.XZDmFY102 HETE.XZDmFY102 None None   K22KR, E28K, K32E, V35T, E36A, T39DE, S48T, V60I, K101KR, D121Y, K122E, I135V, Q207E, V245Q, E248EV, K249Q  
HETE.XZDmFY105 HETE.XZDmFY105 None None   V60I, K102KR, I135L, S162C, T200A, R211K  
HETE.XZDmFY126 HETE.XZDmFY126 None None   V35T, E36EA, T39D, S48T, E53D, V60I, I135IV, S162SC, Q174QR, I178IL, Q207E, R211RK, V245Q  
HETE.XZDmFY128 HETE.XZDmFY128 None None   V21VI, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K102R, D121Y, K122E, I178M, V179I, Q197R, R211Q, V245Q, D250E  
HETE.XZDmFY133 HETE.XZDmFY133 None None  V179E E6D, K11T, V35T, T39N, K101R, K122KE, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, Q207G, R211S, K238R, V245E  
HETE.XZDmFY168 HETE.XZDmFY168 None None   E28K, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q K32D 
HETE.XZDmFY174 HETE.XZDmFY174 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, T200I, Q207EK, R211K, V245Q, E248V, K249Q  
HETE.XZDmFY177 HETE.XZDmFY177 None None   V35VI, I135IV, I178IL, T200E, I202IV, L210LS, R211Q, F214L, D250DN  
HETE.XZDmFY179 HETE.XZDmFY179 None None  V106VI, E138EA K11KT, I135V, S162C, T200A, R211K  
HETE.XZDmFY192 HETE.XZDmFY192 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121HY, K122E, I135M, T165I, D177E, V245Q  
HETE.XZDmFY204 HETE.XZDmFY204 None None   K20R, S162C, Q174H, T200A, R211G, E248D  
HETE.XZDmFY210 HETE.XZDmFY210 None None   I135V, S162C, T200V, R211K  
HETE.XZDmFY217 HETE.XZDmFY217 None None  V108I K102Q, D123E, S162C, P176PS, T200A, Q207E  
HETE.XZDmFY224 HETE.XZDmFY224 None None   E6D, E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, T200TA, Q207E, V245Q, E248V, K249Q  
HETE.XZDmFY254 HETE.XZDmFY254 None None T215A  D123X, I135L, S162C, D177E, T200V, R211K  
HETE.XZDmFY270 HETE.XZDmFY270 None None   I135IV, I142IV, S162C, Q174H, T200TA, R211RG, E248D  
HETE.XZDmFY277 HETE.XZDmFY277 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K102R, D121Y, K122E, I178M, V179I, Q197R, R211Q, V245Q, E248K, D250E  
HETE.XZDmFY279 HETE.XZDmFY279 None None   K20KR, D123E, I135V, S162C, T200AE, E204EG, R211K  
HETE.XZDmFY280 HETE.XZDmFY280 None None   I135T, S162C, Q174H, T200A, R211G, E248D  
HETE.XZDmFY285 HETE.XZDmFY285 None None   K20R, S162C, Q174H, T200A, R211G, E248D  
HETE.XZDmFY300 HETE.XZDmFY300 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173KR, Q174E, D177E, V179I, T200TA, I202V, E204K, Q207A, R211S, K238KR, V245E  
HETE.XZDmFY312 HETE.XZDmFY312 None None   V35K, T39D, S48T, V60I, D123E, D177E, T200A, R211K, V245Q  
HETE.XZDmFY322 HETE.XZDmFY322 None None  K103N, K238RT E6D, K11T, V35IT, T39KR, K43E, D121H, K122E, D123S, S162C, R172RK, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245E  
HETE.XZDmFY361 HETE.XZDmFY361 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D86DE, D121Y, K122E, V245Q, K249Q  
HETE.XZDmFY382 HETE.XZDmFY382 None None   E6D, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, I135X, S162C, K173R, Q174E, D177E, I178M, T200A, E203D, E204K, Q207A, R211S, K238R, V245E  
HETE.XZDmFY396 HETE.XZDmFY396 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173R, Q174N, D177E, T200A, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245Q  
HETE.XZDmFY413 HETE.XZDmFY413 None None   E6D, K11T, K32I, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179VI, T200TA, E204Q, Q207A, R211S, K238R, V245Q  
MSM.XZDmFY015 MSM.XZDmFY015 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I142V, R211K, V245Q, E248V, K249Q  
MSM.XZDmFY018 MSM.XZDmFY018 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K49KR, V118I, K122E, D123S, I135T, K173KMT, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, E248D  
MSM.XZDmFY022 MSM.XZDmFY022 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, V189I, I195L, G196E, T200A, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245K  
MSM.XZDmFY035 MSM.XZDmFY035 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123N, S162C, K173S, Q174K, D177E, V179I, I202V, E203K, Q207A, R211S, I244V, V245K, K249Q  
MSM.XZDmFY058 MSM.XZDmFY058 None None   E6D, K11KT, E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, V60I, D121Y, K122E, S162SC, K173T, Q174K, D177E, I178L, R211RM, V245Q, K249Q  
MSM.XZDmFY064 MSM.XZDmFY064 None None A62V, V75I L100I, K103N E6D, V21I, V35T, T39K, K43E, K102R, K122E, D123S, I135R, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
MSM.XZDmFY090 MSM.XZDmFY090 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, G196E, T200A, R211A, V245Q, K249Q  
MSM.XZDmFY100 MSM.XZDmFY100 None None   I5V, E6D, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
MSM.XZDmFY123 MSM.XZDmFY123 None None   V35T, T39N, E40D, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, T139V  
MSM.XZDmFY125 MSM.XZDmFY125 None None   E6D, V35M, T39E, K64R, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200R, Q207A, R211S, V245E, K249R  
MSM.XZDmFY146 MSM.XZDmFY146 None None   E6K, V8I, E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, Q197K, T200A, Q207K, V245Q, K249Q  
MSM.XZDmFY154 MSM.XZDmFY154 None None   E28K, K32E, V35K, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, T200I  
MSM.XZDmFY164 MSM.XZDmFY164 None None   I5V, E6D, V35T, T39KR, K43E, V60I, K122E, D123S, I135IV, S162C, F171Y, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207AT, R211S, K238R, V245E  
MSM.XZDmFY171 MSM.XZDmFY171 None None   E6D, V35T, T39TA, V118I, K122E, D123N, I135IT, T200V, R211K, F214L, K238R, V245E  
MSM.XZDmFY180 MSM.XZDmFY180 None None   E6D, V35T, T39K, K43KE, V60VI, V118VI, K122E, D123NS, S162C, K173RT, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
MSM.XZDmFY198 MSM.XZDmFY198 None None   I135V, S162SC, T200TA, E204ED, R211KQ, E224ED, E248N  
MSM.XZDmFY207 MSM.XZDmFY207 None None   K11KT, E28EK, V35T, E36EA, T39EK, V60I, K122E, D123N, I135IT, S162N, M164MI, T165X, K173KR, Q174X, D177DE, V179VI, T200TA, Q207X, K238KR, V245EQ, E248EV, K249KQ  
MSM.XZDmFY228 MSM.XZDmFY228 None None   E6D, K11KT, V35T, T39K, K43E, T69TN, K122E, D123N, S162C, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207NS, R211S, K238R, V245E  
MSM.XZDmFY232 MSM.XZDmFY232 None None   E6D, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, D177E, I178M, V179I, V189I, Q207A, L210LF, R211S, K238R, V245E, K249R  
MSM.XZDmFY243 MSM.XZDmFY243 None None   I135M, S162H, T200A  
MSM.XZDmFY249 MSM.XZDmFY249 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, Q197K, R211RK, V245Q, K249Q  
MSM.XZDmFY263 MSM.XZDmFY263 None None  K103N K49KR, I135T, E169D, Q174E, T200A, E204K, R211X  
MSM.XZDmFY271 MSM.XZDmFY271 None None   V8I, E28K, K32E, V35T, E36A, T39DE, S48T, V60I, D121H, K122E, T200V, V245Q, E248V, K249Q F87M 
MSM.XZDmFY297 MSM.XZDmFY297 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, I202V, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E, K249R  
MSM.XZDmFY305 MSM.XZDmFY305 None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
MSM.XZDmFY309 MSM.XZDmFY309 None None   P4H, E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K103R, V111I, K122E, D123S, S162H, Q174KR, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, E248T  
MSM.XZDmFY311 MSM.XZDmFY311 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121HY, K122E, I135T, S162C, D177N, V245Q, E248V, K249Q  
MSM.XZDmFY316 MSM.XZDmFY316 None None   E6D, K11KRT, V35T, T39KR, K43E, K64KR, K122E, D123S, S162Y, F171FY, K173X, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, E203ED, Q207AD, R211S, K238R, V245E  
MSM.XZDmFY328 MSM.XZDmFY328 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, R211K, V245Q, E248V, K249Q  
MSM.XZDmFY336 MSM.XZDmFY336 None None   E6D, K11T, E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, V60I, D121Y, K122E, K173T, Q174K, D177E, R211A, V245Q, E248V, K249Q  
MSM.XZDmFY340 MSM.XZDmFY340 None None   E6D, E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, K166R, T200I, Q207A, R211S, V245Q, E248EV, K249Q  
MSM.XZDmFY350 MSM.XZDmFY350 None None   K22KR, E28K, K32E, V35K, E36A, T39D, S48T, V60I, D76DN, K104KR, D121Y, K122KE, I202V, R211K, V245Q, E248V, K249Q  
MSM.XZDmFY351 MSM.XZDmFY351 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39DE, S48T, V60I, K104R, D121Y, K122E, Q197K, R211EG, V245Q, E248V  
MSM.XZDmFY354 MSM.XZDmFY354 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, K43E, K64KR, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178IM, T200V, Q207A, R211S, K238R, V245E  
MSM.XZDmFY355 MSM.XZDmFY355 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, Q207T, R211A, V245Q, E248V, K249Q  
MSM.XZDmFY365 MSM.XZDmFY365 None None   E28K, K32E, V35K, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q  
MSM.XZDmFY370 MSM.XZDmFY370 None None   E6D, E28K, K32E, V35T, E36A, T39N, V60I, K122E, V245Q, E248V, K249Q  
MSM.XZDmFY375 MSM.XZDmFY375 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E, E248N  
MSM.XZDmFY384 MSM.XZDmFY384 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K102R, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207D, R211K, K238R, V245E, D250E  
MSM.XZDmFY401 MSM.XZDmFY401 None None   K20R, E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, T200A, R211A, V245Q, E248V, K249Q  
MSM.XZDmFY418 MSM.XZDmFY418 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I142V, R211K, V245Q, E248V, K249Q  
XZDFY084 XZDFY084 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, R211Q, V245Q, E248V, K249Q  
XZDFY119 XZDFY119 None None   V35T, E36A, T39D, V60I, K101R, D121Y, K122E, I135R, I142V, T165I, K173AEV, Q174K, D177E, I178L, T200A, K201R, Q207E  
XZDFY127 XZDFY127 None None L210W V106I V8I, G45GE, K104R, V118I, K122E, I135T, E169D, V189VI, I202V, R211K, F214L  
XZDFY237 XZDFY237 None None   V35T, T39R, V60I, K64R, K122E, D123X, I135T, K173T, Q174NS, T200A, Q207A, V245K, E248D, D250E  
XZDFY259 XZDFY259 None None   D123E, I135T, S162C, D177E, R211K  
XZDFY291 XZDFY291 None None  K103N V60I, I135L, S162C, T200A, R211K  
XZDFY341 XZDFY341 None None   V21VI, V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, D123E, S162C, I178L, T200TA, Q207E, R211K, V245Q  
XZDFY364 XZDFY364 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, T165I, F214L, V245Q, E248V, K249Q