Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Parham (2011)
Title Short communication: high prevalence of drug resistance in HIV type 1-infected children born in Honduras and Belize 2001 to 2004.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 66
NumPts 66
Subtype B, C

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
09-MSF 09-MSF None None   V60I, I135T, S162A, Q174E, R199RK  
10MSF 10MSF None None  Y181YC K103R, I135T, T165I, Q174E, I202V, F214L, D250G  
112574 112574 None None  M230MI K43R, G51GR, K64R, R78RK, R83K, G93GR, D123E, Q145QH, S162Y, Q174A, D177E, E203EG W229W* 
15-MSF 15-MSF None None   K49R, S162C, T200A, Q207E  
1780996 1780996 None None   K49E, I142K, K166R, E169K, Q174E, I178V, I202V, F214L  
1877247 1877247 None None   K20R, K43KE, D86E, S162Y, K173Q, R211K, V245M  
2062 2062 None None   Q174E, Q207E, V245K  
2063 2063 None None  E138A I135T, Q174E, Q197K, I202V, V245I P97PL 
2201 2201 None None   I135T, S162C, Q174E, T200A, Q207E, V245A  
221183 221183 None None D67DN, K70R  K64R, T69TN, A98S, K122E, S162X, D177E, E194EK, E203EK  
24-MSF 24-MSF None None   V118VI, I135T, Q174E  
32MSF 32MSF None None   K103R, D123E, I135L, S162C, K173KE, Q174E, E204K, R211M, V245M  
34-MSF 34-MSF None None   K103R, K122E, D123T, Q174E, F214L, V245M, E248D  
36443 36443 None None   E6D, Q174E, R211K, V245I  
3680 3680 None None   V60I, S68G, K122P, I135R, I178L, Q197K, V245M Q145R, F214Y 
39-MSF 39-MSF None None   S162C, I195T, V245M, K249R  
5022 5022 None None   V35I, E40D, K103R, I135V, P140PT, Q174E, Q207S, R211K, F214L, V245T  
597307 597307 None None   I135V, Q174E, T200I, V245I  
597667 597667 None None   V35VI, D86E, I135T, I142V, S162A, S163T, D177E, I178M, V245L, E248D  
639991 639991 None None   K173E  
653557 653557 None None  K101E K103R, S162C, Q174E  
7021 7021 None None  V179D D86E, V90I, V118I, I135T, D177N, F214L, V245M  
B-109 B-109 None None   K11KR, V21I, K49R, V60I, K82KR, D123E, Q174L, D177E, I178M, G196E, I202V, Q207K, R211A  
B-113 B-113 None None   V35T, K102Q, S162C, T200L, E203D, H208Y, R211K  
B-139 B-139 None None   E28A, K122E, I142V, A158S, S162A, R211A I132IM 
B-190 B-190 None None   K20R, K104R, K122E, D123G, I135T, K166R, K173A, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, F214L, V245Q  
B-204 B-204 None None  F227FL D123E, I135T, D177E, I178M, F214L  
B-222 B-222 None None  V179VD V90I, D123E, I135T, Q174E, D177DE, I202V, V245K  
B-89 B-89 None None   D123E, D177E, I178M, V245E A158AV 
B-99 B-99 None None  E138A K20KR, V35MT, E36EG, T39E, V60I, K104R, D121Y, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, I178V, G196E, I202V, Q207K, R211A, F214L, V245Q, E248D  
B119 B119 None None  Y181C K13R, V21I, V60I, D123E, K173R, D177E, I178M, G196E, I202V, E204K, Q207EK, R211A, V245E  
B182 B182 None None  K101E, V106VA, E138K V35T, V60I, K122E, I135M, I142V  
B208 B208 None None  K103N V21I, V60I, D123E, K173R, Q174L, D177E, G196E, I202V, Q207K, R211A, P243H, D250E  
PCR-02 PCR-02 None None   K20R, V35L, K101Q, K103R, D121Y, K122E, I135K, Q174E, D177E, Q207R, V245M  
PCR-04 PCR-04 None None   K49R, D86N, I135T, T139A, S162C, Q174G, T200A, I202V, Q207K, I244K, V245K  
PCR-105 PCR-105 None None   I135V, Q174E  
PCR-107 PCR-107 None None   D86N, K101Q, K103R, K122E, D123S, I135K, Q174E, T200A, Q207E  
PCR-118 PCR-118 None None   K20R, L109I, Q174A, D177G, T200I, Q207E, V245K, E248N  
PCR-120 PCR-120 None None   V35I, R83K, K103R, K122E, D123T, Q174E, F214L, V245M, E248D  
PCR-14 PCR-14 None None   K173R, Q174EK, T200TA, V245IM  
PCR-15 PCR-15 None None   D86E, V118I, I135T, I178MV, R211K, F214L, V245M  
PCR-16 PCR-16 None None   K20R, V118I, D123E, I135T, Q174E, T200A, L210M, F214L, V245M L193A 
PCR-22 PCR-22 None None   V245M, E248D R199RG 
PCR-25 PCR-25 None None  M230MI S48A, G51GR, K122P, Q174E, I178L, D186DN, F214L F61FS, W88W* 
PCR-41 PCR-41 None None   D123E, S162C, D177E  
PCR-45 PCR-45 None None   D86N, K103R, I142T, Q174E, D177E, E194D, I202V, V245M  
PCR-46 PCR-46 None None   K32N, V60I, S68G, K122T, D123E, Q174EK, I178L, R211RK, V245I, E248D  
PCR-49 PCR-49 None None   D86E, T139A, I142T, S162C, I195T, R211K, V245M  
PCR-52 PCR-52 None None   V60I, K122Q, I142V, S162A, I195T, I202V, K238R, V245E  
PCR-55 PCR-55 None None   K20R, T39A, S68G, K103R, D123E, D177E, R211S, F214L, V245M  
PCR-58 PCR-58 None None A62V  V35I, D86E, K103R, D121H, K122E, S162N, Q174K, D177E, G196E, T200A, V245M, D250E V90L 
PCR-60 PCR-60 None None   K49R, A98S, D123E, Q174E, T200A, I202V, E204K, R211M, V245I  
PCR-74 PCR-74 None None  V108I V35I, D123E, Q174E, D177E, T253N  
PCR-77 PCR-77 None None   E6D, K101R, F171Y, K173E, T200A, I202V, F214L, V245M  
PCR-78 PCR-78 None None   K64R, D86E, D121DN, D123EK, R172RK, Q174A, D177E, I202V, S251I  
PCR-79 PCR-79 None None D67G  M16L, K20R, V75VL, S162C, Q174E, V189VI, V245I  
PCR-80 PCR-80 None None   D121H, K122E, D177E, I178M W88W* 
PCR-85 PCR-85 None None   S68G, K82KR, R211S, F214L, V245M  
PCR-90 PCR-90 None None   I135V, Q174E  
PCR-92 PCR-92 None None   K32N, V60I, S68G, T69N, D123E, I135R, Q174E, I178L, L210M, V245L  
PCR-93 PCR-93 None None   M16MI, M41MI, S48T, V90I, Q174E, R211K, D250E, S251C  
PCR-95 PCR-95 None None   E6D, K11T, G15GE, M41I, K49R, V60I, S68G, R72K, D86E, V90I, D123E, I135T, W153*, Q174E, E203K, Q207K, W229*, E233K  
PCR-99 PCR-99 None None  V108VI W88C, V245M, E248D  
PCR108 PCR108 None None   V35I, E42EK, E44EK, G45GE, E53EK, S68G, R72RK, K103KR, Q174K, D192DN, R211Q, F214L W71W*, V148VM 
PCR68 PCR68 None None M184I M230I E6K, M16I, M41I, G51R, W88*, G93R, G99R, I135V, Q174E, G190R, W229*  
PCR72 PCR72 None None  Y181C D123E, K126R, Q174E, D177E, I180IV, K238R, V245I