Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Oroz (2019)
Title Analysis of HIV-1 diversity, primary drug resistance and transmission networks in Croatia.
Citation Sci Rep
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 403
NumPts 403
Subtype B, A, C, CRF02_AG, CRF01_AE, CRF06_cpx

 
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Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 403 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
CRO1018 CRO1018 None None   K122E, I135R, I142V, S162A, R211K  
CRO1019 CRO1019 None None  K101E, E138K K11R, K20R, V118I, D123E, I135T, T165I, R211K, F214L  
CRO1030 CRO1030 None None   R83K, V90I, I135T, S162A  
CRO1039 CRO1039 None None   K102Q, D123E, I142IM, S162C, G196E, T200I  
CRO1042 CRO1042 None None   K122E, K166R, I178L, G196E, Q197L, I202V, Q207E  
CRO1043 CRO1043 None None  K101E, E138K K11R, K20R, V60VI, V118I, D123E, I135T, T139TA, T165I, R211K, F214L  
CRO1046 CRO1046 None None  K101E, E138K K11IT, K20R, V118I, D123E, I135T, T139A, I142T, T165I, R211K, F214L  
CRO1058 CRO1058 None None   V35I, R83K, V90I, S162A, G196E, R211K  
CRO1062 CRO1062 None None T215S  T39A, K49KR, D121H, K122E, I135R, I142V, S162A, D177E, T200I, R211K, F214L  
CRO1063 CRO1063 None None T215D L100I, K103N E44D, S68G, V90I, K101R, D123E, I135T, D177G, V179I, Q197P, T200A  
CRO1067 CRO1067 None None T215S  S68G, K122E, I135R, S162A, F214L  
CRO1068 CRO1068 None None  K101E, E138K K11R, V118I, D123E, I135T, T165I, R211K, F214L  
CRO1077 CRO1077 None None   V35M, R83K, I142V, Q207K, R211S  
CRO1080 CRO1080 None None T215S  V35T, K46Q, D86E, I142V, S162A, D177E  
CRO1088 CRO1088 None None   V35IM, I142V, I178L, R211K  
CRO1089 CRO1089 None None   K20R, K122E, D123E, S162C, Q174H, D177E, G196E, T200I, R211G  
CRO1090 CRO1090 None None   E6D, I135L, S162C  
CRO1100 CRO1100 None None   V8I, K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, I135V, S162A, K166R, E169A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207N, R211K, F214L  
CRO1102 CRO1102 None None   K20R, V60I, V118I, K122E, I135T, T165I, K166R, T200TIM, I202V, R211K, F214L  
CRO1107 CRO1107 None None   K20R, K32Q, V35I, V60I, D123E, I135R, I142IV, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, P243A  
CRO1113 CRO1113 None None  K101E, E138K V35I, V60I, V118I, D123E, I135T, T139A, I142T, T165I, R211K, F214L  
CRO1115 CRO1115 None None L210W, T215S  K43R, S68G, K122E, I135R, S162A, F214L  
CRO1118 CRO1118 None None   V60I, S68G, K101R, I135T, D177E, Q197E, T200A, Q207H, R211K  
CRO1122 CRO1122 None None T215D L100I, K103N V35I, E44D, S68G, V90I, K101R, K122E, D123E, I135T, D177G, V179I, T200E, I244IV  
CRO1127 CRO1127 None None   V60I, K122E, I142V, K166R, T200E, Q207T, R211K  
CRO1134 CRO1134 None None   V35VI, V60I, K122E, I135RT, I142V, Q197L, T200A, Q207P  
CRO1140 CRO1140 None None   V60I, K122E, D123N, I135T, I142T, K173S, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S  
CRO1148 CRO1148 None None   V35L, I135IV, T200R, R211K V241G 
CRO1152 CRO1152 None None   V35T, T39E, V60I, K122E, I135T, I142IV, K173A, D177E, I178M, T200A, E204K, R211K  
CRO1156 CRO1156 None None   A98S, K122E, I135T, S162C, T200A  
CRO1162 CRO1162 None None   K122P, I135IT, I142T, E169D, D177E, T200I, R211K  
CRO1163 CRO1163 None None   V35I, K64R, K122KE, I135IT, I195IM  
CRO1166 CRO1166 None None   K122P, E169D, D177E, I178M, T200I, R211K, I244K  
CRO1167 CRO1167 None None   K20R, V60I, K122E, I135T, K173R, Q174K, D177E, I202V, Q207E, F214L  
CRO1174 CRO1174 None None   S162C, I178M, Q197L, T200A, E204K, R211G  
CRO1189 CRO1189 None None   V35I, E44D, V60VI, R83K, I178L, R211T  
CRO1194 CRO1194 None None T215S  K122E, D123N, I135R, I142V, S162A, R211K, F214L, I244K  
CRO1195 CRO1195 None None   V35L, I135V, D177E, T200I, R211K  
CRO1208 CRO1208 None None   K32N, V35I, I135R, I142V, E169D, I178L, Q197L, F214L  
CRO1212 CRO1212 None None   K32Q, V35I, I135R, I142V, I178L, Q197P, R211K  
CRO1222 CRO1222 None None   V35I, V60I, S68G, K101R, K122Q, I135T, T139TA, D177E, Q197E, T200A, Q207H, R211K  
CRO1239 CRO1239 None None   K20R, V35T, T39M, V60I, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, I178L, Q207A, R211S  
CRO1241 CRO1241 None None   V60I, K122E, D123N, I135IT, I142IT, K173S, I178M, V179I, Q207A, R211S  
CRO1242 CRO1242 None None  K101E, E138K K11R, K20R, V60I, V118I, D123E, I135T, T165I, T200TI, R211K, F214L  
CRO1255 CRO1255 None None   K20R, K49R, V60I, R78RK, E79EK, I135R, G196E, R211K, I244V  
CRO1257 CRO1257 None None   D123E, I135R, D177E, I202V, R211K  
CRO1263 CRO1263 None None   K20R, V60I, K122E, I135T, Q174R, D177E, I202V, Q207K, F214L  
CRO1275 CRO1275 None None   V21I, V35T, E36A, T39E, V60I, K104R, K122E, D123G, I135T, T165I, K173T, Q174K, D177E, T200K, Q207A  
CRO1279 CRO1279 None None   V60I, S68G, K101R, K122Q, I135T, I142L, K166KR, D177E, Q197E, Q207H, R211K, K238Q  
CRO1292 CRO1292 None None K65E  K32N, D121E, K122E, I135R, I178L, Q197L, I202V  
CRO1294 CRO1294 None None   K122E, I135K, I178L, Q197L  
CRO1295 CRO1295 None None   V60I, R83K, I135T, I178L, R211K  
CRO1297 CRO1297 None None   K20R, V60I, T69A, V118I, K122E, D123E, I135T, Q174R, D177E, I202V, Q207E, R211K, F214L V241G 
CRO1306 CRO1306 None None  E138A V35A, K102M, K122E, I135T, S162C, E169D, K173S, I202V, Q207H, D237N N81H 
CRO1314 CRO1314 None None   V35T, I135R, I142V, I178L, F214L Q197M 
CRO1315 CRO1315 None None   I178L, Q197L  
CRO1318 CRO1318 None None   T27S, V35T, T39E, E40D, S48T, K122E, D123N, K173A, G196K, T200A, Q207E, R211K  
CRO1320 CRO1320 None None   V60I, K64R, I135L, D177E, R211K  
CRO1321 CRO1321 None None   E6D, D123E, I135R, I142T, Q174K, Q197P, I202V, F214L  
CRO1327 CRO1327 None None   V60I, I135R, E169D, I178L, R211Q  
CRO1336 CRO1336 None None   K20R, V60I, I135T, Q174R, D177E, V189I, I202V, Q207E, F214L  
CRO1339 CRO1339 None None   S68G, K122P, I135RT, D177E, G196E, T200A, Q207H, R211K  
CRO1346 CRO1346 None None   R83K, S162A, I178L, R211K  
CRO1347 CRO1347 None None   T39A, S68G, D123E, I135L, S162C, R211K, F214FL  
CRO1350 CRO1350 None None   V60I, R83K, S162N, I178L, R211K  
CRO1355 CRO1355 None None   V60I, R83K, I178L, R211K  
CRO1356 CRO1356 None None   T39A, S68G, D123E, I135L, S162C, R211K, F214L  
CRO1357 CRO1357 None None   V60I, R83K, S162N, I178L, R211K  
CRO1360 CRO1360 None None  G190A V35T, E36D, V60I, D121H, K122E, Q174K, R211Q  
CRO1365 CRO1365 None None   V35IT, E36ED, T39K, K43E, V60I, K102Q, K122E, D123S, K173R, Q174K, I178M, V179I, T200I, Q207H, R211S, F214C, K238R, W239C  
CRO1367 CRO1367 None None   V60I, R83K, I178L, R211T, K238R  
CRO1368 CRO1368 None None   K32N, V35I, K102Q, K122E, I135R, I195L  
CRO1369 CRO1369 None None   V35I, K102Q, K122E, I135R, K166R, I195L  
CRO1375 CRO1375 None None   K20R, V60I, K122E, Q174R, D177E, V179I, V189I, I202V, Q207E, F214L  
CRO1378 CRO1378 None None T215E L100I, K103N V35I, E44D, S68G, V90I, A98S, D123E, D177G, V179I, Q197P, T200A  
CRO1379 CRO1379 None None   E6D, V60I, S68G, K102Q, K122Q, I142V, T165I, T200E, Q207N, R211K  
CRO1383 CRO1383 None None   V35I, V60I, I135M, R172K, I178L, R211T, Q242H  
CRO1385 CRO1385 None None   V35I, K64R, I135T, D177E, I178L, Q197L, R211K  
CRO1389 CRO1389 None None   V35A, K49R, R211K  
CRO1390 CRO1390 None None  K101E, E138K K11KR, K20R, V118I, D123E, I135T, T139A, T165I, R211K, F214L  
CRO1391 CRO1391 None None   T27S, V35I, I142V, E194K, I195L, G196E, R199K, R211K  
CRO1394 CRO1394 None None  K103N E6A, K20R, V35M, E36T, T39E, S48T, K122E, D123N, S162C, K173A, D177E, T200A, E203D, Q207E  
CRO1396 CRO1396 None None   V35I, R83K, D123E, I135T, S162A, D177E, I202V, R211K  
CRO1400 CRO1400 None None   V35I, S68G, I135R, I178L  
CRO1403 CRO1403 None None   V35I, R72K, K122E, D123E, I135T, I178L, T200V, Q207D, R211K, F214L  
CRO1405 CRO1405 None None   V60I, R83K, I178L, R211T  
CRO1409 CRO1409 None None  E138A K122KE, S162C, T200IV, R211K  
CRO1410 CRO1410 None None   V60I, R83K, I178L, R211T, K238R  
CRO1412 CRO1412 None None   V35I, V60I, K101Q, I135R, I142V, I178L, Q197L, Q207E  
CRO1414 CRO1414 None None   K11T, V35T, T39G, V60I, S68G, D121H, K122E, D123N, I135T, I142M, K173S, Q174N, D177G, V189I, Q207A, R211S, F214L  
CRO1415 CRO1415 None None   E6D, D123E  
CRO1422 CRO1422 None None   K43E, V60I, I63V, D123E, I135T, K166R, I178L, R211K  
CRO1423 CRO1423 None None   V60I, S68G, K122Q, I135T, K166R, V189I, Q197E, T200A, Q207H, R211K, F214L  
CRO1424 CRO1424 None None   K122P, I142T, E169D, D177E, T200I, R211K  
CRO1427 CRO1427 None None   R83K, D123E, I178L, Q197K, Q207K  
CRO1428 CRO1428 None None T215S  S68G, K122E, I135R, S162A, R211K  
CRO1430 CRO1430 None None   V60I, V118I, I135T, T139R, E169D, Q174E, I178M, T200A, R211K  
CRO1437 CRO1437 None None   R83K, V90I, D123E, S162A, R211K  
CRO1443 CRO1443 None None   D123E, S162C, D177E, I202L, Q207H, R211K, D218N  
CRO1445 CRO1445 None None   K20R, V60I, K122E, I135T, T165I, Q174K, D177E, I202V, Q207E, R211K, F214L  

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