Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Lu (2019)
Title Large transmission clusters of HIV-1 main genotypes among HIV-1 individuals before antiretroviral therapy in the Hebei province, China.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 138
NumPts 138
Subtype CRF01_AE

 

  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 138 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
8S0002 8S0002 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K103R, K122E, D123S, K166R, K173L, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
8S0003 8S0003 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, T39K, E40D, K49R, V111I, K122Q, D123S, I135T, K173M, Q174K, D177E, T200TI, Q207A, R211S, F214L, V245E  
8S0005 8S0005 None None   E6D, K11T, E28EK, V35T, T39K, E40EQ, K43E, V118I, K122E, D123S, T165TI, K173T, Q174K, T200E, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245D  
8S0006 8S0006 None None   E6D, K20R, V35T, E36A, T39E, K103R, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, V245E  
8S0007 8S0007 None None   E6D, K11S, V35T, T39K, E40Q, K43E, K103KR, D121H, K122E, D123S, I135IT, I142IT, K173T, Q174K, D177E, T200TI, Q207A, R211S, F214L, K238R, I244V, V245E, S251I  
8S0008 8S0008 None None   E6D, K11T, V35T, T39A, E40D, K64R, V118I, D121H, K122E, D123S, I135T, T165I, K173M, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, V245Q  
8S0009 8S0009 None None   E6D, V35T, T39KR, K43E, K49KR, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
8S0010 8S0010 None None L74I  E6D, K11S, V35T, T39K, E40Q, K43E, K103R, D121H, K122E, D123S, I135T, I142T, T165I, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, I244V, V245E  
8S0011 8S0011 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, D121DH, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, V245E K43G 
8S0013 8S0013 None None   E6D, K11T, K20R, V21VI, V35T, T39R, K43E, K122E, D123N, S162C, F171Y, R172K, Q174K, D177E, I178M, V179T, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
8S0014 8S0014 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K49R, S68SG, K122E, D123S, I135T, S162C, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, I244V, V245E, D256DE  
8S0015 8S0015 None None   E6D, K11T, V35T, K43R, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207A, K238R, V245E  
8S0016 8S0016 None None  V106M, G190A E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, L210M, R211S, K238R, V245E  
8S0017 8S0017 None None  V179VD E6D, K11T, V35T, T39K, K43A, K122E, D123S, I135T, K173IT, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, L228LI, V245K  
8S0018 8S0018 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, E36A, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, I202V, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
8S0019 8S0019 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, K43E, K102KR, K104R, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
8S0020 8S0020 None None   E6S, V35T, T39K, K43E, K103R, K104R, K122E, D123S, I135T, K173M, Q174K, D177E, V179I, T200V, Q207A, R211S, F214L, V245E  
8S0021 8S0021 None None   E6D, K11T, V35T, T39EK, K104R, D123S, K173I, Q174K, D177E, I202IV, Q207A, R211S, F214L, V245E  
8S0024 8S0024 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, I135RT, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200R, I202V, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
8S0025 8S0025 None None   E6D, K11R, V35T, T39K, E40Q, K43E, K122E, D123S, I135T, T165I, K173T, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
8S0026 8S0026 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K49R, K122E, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, I195L, Q207A, R211S, K238R, V245K  
8S0028 8S0028 None None   E6N, K11T, K32KI, V35T, T39K, K43E, K102KQ, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179X, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245K  
8S0030 8S0030 None None  V179D E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, K103R, V118I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, V245E, D250DN  
8S0031 8S0031 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K49R, D123S, I135T, S162C, D177E, I178M, Q207A, R211S, D237E, K238R, V245E  
8S0033 8S0033 None None  V179D E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, K102E, K103R, V118I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, V245E  
8S0036 8S0036 None None   K32KR, V35T, T39KR, K43E, K122E, D123S, S162C, K173G, Q174K, D177E, I178M, T200A, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245D  
8S0037 8S0037 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43A, K122E, D123S, S162C, Q174N, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
8S0039 8S0039 None None   E6D, V8VI, K11T, V35T, T39K, K43A, D121H, K122E, D123N, I135T, S162C, Q174N, D177E, I178IM, V179I, T200A, I202V, E204K, Q207A, R211S, K223R, K238R, V245E, S251N  
8S0040 8S0040 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, E40EK, K43E, V118I, K122E, D123G, I135T, K173T, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F214L, V245E, K249Q G231E 
8S0041 8S0041 None None   E6D, K11T, K20KR, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162SC, E169D, K173R, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238KR, V245E  
8S0043 8S0043 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122A, D123N, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178V, T200A, Q207A, R211T, K238R, V245E  
8S0045 8S0045 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, I135T, I142V, S162C, K173N, Q174K, D177E, T200TI, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
8S0046 8S0046 None None   E6D, K11KT, K20R, V35T, T39R, K43E, K49KR, K122E, D123S, I135M, S162C, R172K, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E Y127YD, I132IM 
8S0047 8S0047 None None   E6D, K32KI, V35T, T39KR, K43E, K103R, K122E, D123S, S162SC, K173N, Q174K, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
8S0048 8S0048 None None   E6DN, K11KT, K20R, V35T, E36A, T39E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, V245E  
8S0049 8S0049 None None   P4PH, E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K49R, K122E, D123N, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
8S0051 8S0051 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K49R, K122E, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
8S0052 8S0052 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, Q174K, D177E, V179I, Q207A, L210M, R211S, V245E, S251N  
8S0055 8S0055 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S105A, V118I, K122E, D123S, I135T, K173R, Q174E, D177E, T200R, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
8S0056 8S0056 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S105A, V118I, K122E, D123S, I135T, K173R, Q174K, D177E, T200R, Q207A, R211S, F214L, K238KR, V245E  
8S0058 8S0058 None None   E6D, V35T, T39TK, V60I, K102KR, K122E, D123S, I135T, I142V, K173T, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211RS, F214L, K238R, V245E  
8S0059 8S0059 None None   E6D, K11S, V35T, T39KR, K43E, K102R, K122E, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, G196E, E203D, Q207A, R211S, K238R  
8S0062 8S0062 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, K43A, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
8S0065 8S0065 None None   K122E, D123N, I135IT, S162C, K173R, Q174K, D177E, E194ED, T200TI, E204EK, Q207A, R211S, K238R  
8S0066 8S0066 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200IR, I202IV, Q207AD, R211S, F214L, K238R, V245D  
8S0067 8S0067 None None   K122E, D123N, S162C, E169D, K173R, Q174K, D177E, I202V, Q207A, R211S, K238R  
8S0068 8S0068 None None   E6D, V35T, T39K, K104R, K122E, D123S, T165I, K173T, Q174K, N175H, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
8S0069 8S0069 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, K173R, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, D250DE  
8S0071 8S0071 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, E40EA, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
8S0072 8S0072 None None   V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, K173S, Q174K, T200A, E203D, E204D, Q207A, R211T, K238R, V245A  
8S0073 8S0073 None None   E6S, V35T, E36D, T39K, K43E, T69S, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, I202V, Q207A, R211S, F214L, V245E  
8S0074 8S0074 None None   E6N, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
8S0075 8S0075 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, I135R, S162C, K173S, Q174K, D177E, I178M, T200TA, I202V, Q207A, R211S, V245E  
8S0076 8S0076 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, D121H, K122E, D123S, I135T, S162C, Q174N, D177E, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
8S0080 8S0080 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, E40A, K43E, K103R, K122E, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174K, I178M, V179I, Q207AT, R211S, F214FL, K238R, V245E  
8S0081 8S0081 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K49R, K122E, D123S, I135T, S162C, D177E, I178M, G196E, Q197K, Q207A, R211S, K238R, V245E  
8S0082 8S0082 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, K103R, V118I, K122E, D123S, I135T, K173T, Q174K, D177E, T200M, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
8S0083 8S0083 None None   P4H, E6D, V35T, T39A, E40D, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F214L, V245E  
8S0084 8S0084 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
8S0086 8S0086 None None   E6S, V35T, T39K, E40A, K43E, K103R, K104R, K122E, D123S, I135IT, K173E, Q174K, D177E, V179I, T200V, Q207A, R211S, F214L, V245E, S251SG  
8S0087 8S0087 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, T39N, V111VI, K122Q, D123N, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
8S0089 8S0089 None None  V106I E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200X, I202V, Q207A, R211S, K238KR, V245E, E248D  
8S0090 8S0090 None None   E6D, V35T, T39A, K122E, D123N, I135T, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245E  
8S0091 8S0091 None None  V179VD E6D, K11T, V21VI, V35T, T39K, E40EQ, K43E, D123N, S162C, Q174K, D177E, T200TA, E203D, Q207A, R211ST, K238KR, V245E  
8S0092 8S0092 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, Q207A, R211S, V245Q, E248V, K249Q  
8S0094 8S0094 None None   E6ED, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123N, S162C, K173R, Q174K, D177E, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
8S0095 8S0095 None None   I5V, E6D, K11T, K32I, V35T, T39R, W88C, K102Q, K122E, D123S, K126KR, I142V, S162Y, P170PS, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
8S0096 8S0096 None None   E6D, K11X, K20KR, V35X, T39X, K43E, K49KR, K122E, D123S, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
8S0097 8S0097 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K101R, K102R, D121H, K122E, D123S, S162C, Q174K, D177E, I180V, T200A, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E, D256DE  
8S0098 8S0098 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, K173R, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
8S0099 8S0099 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, K173R, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245D  
8S0100 8S0100 None None   I5V, E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q197E, Q207A, R211S, V245K, K249Q  
8S0101 8S0101 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43A, K122E, D123S, S162C, Q174K, D177E, V179T, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E, S251N  
8S0103 8S0103 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K101Q, K122E, D123S, I135R, S162W, D177E, Q207S, R211S, V245K  
8S0104 8S0104 None None M184V K103N E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, I135IL, I142V, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200TI, Q207A, R211S, K238S, V245E  
8S0106 8S0106 None None   E6S, V35T, T39K, E40A, K43E, V60VI, K103R, K104KR, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200V, I202V, Q207A, R211S, F214L  
8S0107 8S0107 None None  V179D V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, D177E, T200A, E203D, Q207A, R211S, V245E  
8S0108 8S0108 None None   E6A, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, I135R, S162C, K173N, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K223R, K238R, V245E  
8S0109 8S0109 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K49R, K122E, D123GS, S162C, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
8S0110 8S0110 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K101KQ, K104R, K122E, D123S, A158AS, S162SG, K173IT, Q174K, D177E, V179X, Q207A, R211S, F214FL, V245E  
8S0112 8S0112 None None   E6D, K11T, K32I, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200R, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245D  
8S0113 8S0113 None None   E6D, V35A, T39A, E40D, K102R, K122E, D123S, S162C, D177E, I178L, V179I, T200A, Q207A, R211S  
8S0115 8S0115 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, D121H, K122E, D123S, I135RT, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245EK  
8S0117 8S0117 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, K122E, D123S, I135V, S162C, K173S, Q174K, D177E, I178M, Q207A, L210M, R211S, K238R, V245E  
8S0118 8S0118 None None  V179D V21I, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, T200A, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E, D250N  
8S0120 8S0120 None None   E6D, K11T, K22R, V35T, E36A, T39D, W88S, K122E, D123S, I135T, S163T, K173I, Q174K, D177E, I178L, T200I, Q207A, R211S, F214L, V245E  
8S0121 8S0121 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173A, Q174K, D177E, I178IM, V179VI, Q207A, R211S, K238R, V245E  
8S0123 8S0123 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, T39K, K43X, K64R, K122E, D123S, I135T, K173RT, Q174K, D177E, T200I, I202V, Q207A, R211S, F214L, I244V, V245E  
8S0124 8S0124 None None  P225H E6D, K11T, D17E, V35T, T39E, V118I, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200R, Q207D, R211S, F214L, K238R, V245D  
8S0125 8S0125 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, S162C, Q174R, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245D  
8S0126 8S0126 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K102KQ, K122E, D123N, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, I180IV, T200A, I202V, Q207AT, R211S, K238R, V245A  
8S0128 8S0128 None None   E6D, V35T, T39KR, K43E, S105A, K122E, D123NS, I135IR, S162Y, K173R, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
8S0130 8S0130 None None   E6D, V35T, E36G, T39E, K122E, D123S, I135T, K166R, K173I, Q174K, D177E, T200K, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245D  
8S0132 8S0132 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K64R, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178IV, Q207A, R211S, F214L, V245E  
8S0133 8S0133 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123N, S162C, D177E, I178M, T200A, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245K  
8S0134 8S0134 None None   E6D, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
8S0135 8S0135 None None   E6D, K11T, V35T, E36D, T39K, K43E, V118I, K122E, D123NS, I135T, T165I, K173AT, Q174K, D177E, T200R, Q207A, R211S, F214L, V245E  
8S0136 8S0136 None None  V179D E6D, K11T, K32KR, V35T, E36D, T39K, K43E, V111I, S162C, Q174R, D177E, I178M, Q207A, L210M, R211S, K238R, V245E  
8S0137 8S0137 None None  V179D E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, K102KE, K103R, V118I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211NS, F214L, V245E  
8S0138 8S0138 None None   E6N, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, K173R, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, K249Q