Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Jia (2019)
Title Two-year cross-sectional studies reveal that single, young MSMs in Shenzhen, China are at high risk for HIV infection.
Citation Virol J
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 409
NumPts 409
Subtype CRF07_BC, CRF01_AE, CRF55_01B, B, CRF08_BC, A, CRF67_01B, CRF68_01B, D

 
  Page 1 of 5    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 409 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
14001 14001 None None  V106I E28K, K32E, V35T, E36A, T39DN, S48T, V60I, D121Y, K122E, I244V, V245Q, E248V, K249Q, A272P  
14002 14002 None None  V179VDE E6D, V35T, T39K, K43E, V60VI, V111I, K122E, D123S, I135IR, T200TI, R211RK, F214FL, I244V, V245Q, E248V, K249Q, A272P D218DH 
14003 14003 None None  K101E, E138A T69S, F87FL, A98S, K102R, K104R, D123E, I135T, G196K, T200I, I202V, R211K  
14004 14004 None None  V179E E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, R211H, V245K  
14005 14005 None None  V179E E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135R, R211K, F214L, V245AD  
14007 14007 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, K49KR, V60I, D121H, K122E, I135T, V245Q, E248V, K249Q, A272P  
14008 14008 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39N, S48T, V60I, D121Y, K122E, R211G, V245Q, E248V, K249Q, A272P  
14009 14009 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q, A272P  
14010 14010 None None   T7A, K11Q, E28K, K32E, V35T, E36A, T39N, S48T, V60I, D121Y, K122E, T200I, V245Q, E248V, K249Q, I257L, A272P  
14011 14011 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, K101I, D121Y, K122E, V179VI, V245K, A272P  
14012 14012 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, K43KE, V111I, K122E, D123NS, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S, V245E  
14013 14013 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K102KR, D121Y, K122E, T200TI, V245Q, E248EV, K249Q, A272P  
14014 14014 None None  V106I E28K, K32E, V35T, E36A, T39DN, S48T, V60I, D121Y, K122E, I244V, V245Q, E248V, K249Q, A272P  
14015 14015 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39A, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q, A272P  
14016 14016 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, V245Q, E248V, K249Q, A272P  
14017 14017 None None   T107S, K122E, D123S, S162C, K173V, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S, V245E, A272P  
14018 14018 None None  E138G E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, V245Q, E248V, K249Q, A272P  
14019 14019 None None  V106I E6D, T107S, I135V, S162C, F171Y, K173N, Q174K, T200E, Q207E, A272P  
14020 14020 None None   V8I, K11R, V35I, R83K, K102Q, K104R, N175H, I178M, Q197K, T200E, Q207E, V245E E248Y 
14021 14021 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, S48T, V60I, D121Y, K122E, Q207K, R211G, V245Q, E248V, K249Q, A272P  
14022 14022 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173S, Q174K, D177E, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E, K249R  
14023 14023 None None   V21VI, E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K101KQ, K102KR, T200I, V245Q, E248V, K249Q, A272P  
14024 14024 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39A, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, I142V, V189I, V245Q, E248V, K249Q, A272P  
14025 14025 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I142V, T200I, Q207R, V245Q, E248V, K249Q, A272P  
14026 14026 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, S48T, V60I, D121Y, K122E, Q207K, R211G, V245Q, E248V, K249Q, A272P  
14027 14027 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39A, S48T, V60I, D121Y, K122E, K173T, V245Q, E248V, K249Q, A272P  
14029 14029 None None   V35T, T39E, S48T, K49KR, E53D, V60I, D123E, I135R, S162C, T200A, Q207A, R211K, V245Q, A272P  
14030 14030 None None   E6K, V8I, E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121DN, K122E, V245Q, K249Q, A272P  
14031 14031 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, S48T, V60I, D121H, K122E, I132IL, S134GR, P150PS, V245Q, E248V, K249Q, A272P T39DNY, T128TN, Y146CS, L149LI, Q151QP 
14032 14032 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, S48T, V60I, D121H, K122E, V245Q, E248V, K249Q, A272P T39NY 
14033 14033 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, V245Q, A272P  
14034 14034 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200V, Q207A, R211S, K238R, V245E  
14035 14035 None None   P4S, E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S, V245E  
14037 14037 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, T69N, K122E, D123S, S162C, Q174R, D177E, I178M, I195L, G196E, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
14038 14038 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, Q207E, V245Q, E248I, K249Q, A272P  
14039 14039 None None   P4S, E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S, V245E  
14040 14040 None None  K238N I5V, V118I, I135M, T165I, T200A, F214L  
14041 14041 None None   E6D, K11T, E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, Q174QK, D177DE, I178IV, I202IV, Q207X, V245E, K249KQ, A272P  
14042 14042 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, S162C, Q174R, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
14043 14043 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, T69S, I135V, S162C, I178L, E194A, G196E, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
14044 14044 None None  V179E E6D, V35T, T39K, K43E, V60I, V118I, K122E, D123S, I135R, T200TI, I202V, R211RK, F214L  
14045 14045 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123NS, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P  
14046 14046 None None   E6D, V35T, T39R, V118I, K122E, D123N, I135T, K166R, P176S, T200I, R211K, F214L, K238R, V245E, A272P  
14047 14047 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, D123E, P176S, T200TA, R211K, V245Q, E248V, K249Q, A272P  
14048 14048 None None   E6D, V35I, I50V, V60I, K102M, T107S, D123E, I142V, S162C, Q207E, L210F, R211K, A272P  
14049 14049 None None  V179E E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135R, I202V, R211K, F214L, V245A, A272P  
14050 14050 None None   E6D, V35T, T39K, K43Q, K122E, D123S, I135T, S162C, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
14051 14051 None None   E6ED, E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, D123DE, Q207AP, R211S, V245Q H96HP 
14052 14052 None None   E6D, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, I135T, S162W, K173S, Q174K, D177E, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245K, A272P  
14053 14053 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39N, S48T, V60I, V245Q, E248V, K249Q, A272P R211RGW 
14054 14054 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S134SN, Q207H, V245Q, E248V, K249Q, A272P  
14056 14056 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D177E, T200A, V245Q, K249Q, A272P R143RT, N147ND, E248LV, G262G*, A267AG 
14057 14057 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, T69N, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I202V, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272AST  
14058 14058 None None  V179E E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, R211H, V245EK  
14059 14059 None None   E6D, V35I, I135L, S162C, N175H, G196E, A272P  
14060 14060 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, S162C, Q174R, D177E, I178M, V179I, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
14061 14061 None None  V179E E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, I135R, R211K, F214L, V245A  
14062 14062 None None   K11N, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, I202V, Q207A, L210S, R211S, V245E  
14063 14063 None None  V179E E6D, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, I135R, R211K, F214L, V245A  
14064 14064 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174KR, D177E, I178M, V179I, Q207T, L210F, R211S, K238R, V245E  
14065 14065 None None  V108I E6D, K11A, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, T200A, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
14066 14066 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, V60I, D121Y, K122E, Q197K, Q207E, R211K, V245Q, E248AS, K249Q, A272P  
14067 14067 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, T200A, V245Q, E248V, K249Q, A272P  
14068 14068 None None   E28R, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, I195M, V245Q, E248A, K249Q, A272P  
14070 14070 None None   V35I, I135L, S162C, E169D, T200A, R211K  
14071 14071 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D177A, R211K, V245Q, E248V, K249Q, A272P  
14072 14072 None None   T27A, D121Y, K122E, S162C, A272P  
14073 14073 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
14074 14074 None None  V179E E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135R, Q174R, I202V, E203D, R211Q, F214L, V245A P4PR, M16MR, P19PST 
14075 14075 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, E53D, V60I, T69S, K103KR, S162C, I202V, Q207E, R211K, V245H, A272P  
14076 14076 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K103R, K122E, D123N, I135T, S162C, F171Y, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, V245E, D250E, A272P  
14078 14078 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, D121H, K122E, I135K, I142V, T200I, V245Q, A272P  
14079 14079 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, D192N, T200A, V245Q, E248V, K249Q, A272P  
14080 14080 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, Q174R, I178M, T200I, V245Q, E248I, K249Q, A272P  
14081 14081 None None   T27S, V35T, E36Q, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I142ILV, V245Q, A272P  
14084 14084 None None   K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, M184MT, T200I, Q207A, R211S, I244V, V245E  
14085 14085 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, K173KR, V245Q, E248V, K249Q, S251N, A272P  
14089 14089 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K101KQ, K103KR, D121Y, K122E, K173R, Q197K, V245Q, E248V, K249Q, A272P  
14090 14090 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, D123DG, I135S, V245Q, E248V, K249Q, A272P  
14091 14091 None None  E138EG, V179E E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, I135R, K166R, T200I, I202V, R211K, F214L, V245AE, A272P  
14092 14092 None None   K11T, E28K, K32E, V35T, E36A, T39A, S48T, V60I, I135V, T200I, V245Q, K249Q, A272P  
14093 14093 None None   I5IV, E6D, K11KT, E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, D123E, S162C, E203D, V245Q, E248V, K249Q, A272P  
14094 14094 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, R211G, V245Q, E248V, K249Q, A272P  
14095 14095 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q, A272P  
14096 14096 None None   E6D, V35T, T39Q, D121DH, D123E, S162C, R172K, K173I, Q174KR, D177E, I178L, V179I, T200A, Q207S, R211S, K238KR, V245E, A272P  
14097 14097 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S105A, K122E, D123S, S162C, Q174KN, D177E, I178M, V179I, T200TA, Q207A, R211S, K238R, V245E  
14098 14098 None None   S68G, T69N, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
14099 14099 None None   E6D, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, Q174N, Q207A, R211S, K238R, V245E, I274V  
14100 14100 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39DE, S48T, V60I, K102R, D121DY, K122E, V245Q, K249Q, A272P  
14101 14101 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, T200I, V245Q, E248V, K249Q, A272P  
14102 14102 None None   S134C, I135V, E169D, Q174E, P176S, T200A, Q207K  
14103 14103 None None  V179E E6D, V8A, V35T, T39K, K43E, V111I, K122E, D123S, I135R, R211K, F214L, V245A, A272G  
14105 14105 None None   V8I, K11R, R83K, V90I, K101I, S162Y, I178M, T200I, R211K, V245E, A272P  
14106 14106 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, K43E, K64R, K122E, D123S, I135V, R172K, K173M, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, F214L, V245E  
14108 14108 None None   E6D, K11T, V35T, T39D, S68G, K103R, K122E, D123S, I135IT, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200I, Q207AT, R211S, V245E  
14109 14109 None None  V179E E6D, V35T, T39K, E40Q, K43E, D121H, K122E, D123S, I135R, I202V, R211K, F214L, V245A  
14110 14110 None None   E28K, K32E, V35T, T39N, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, R211K, V241VA, V245Q, E248V, K249Q, A272P I180IT 
14111 14111 None None   M16T, E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121HY, K122E, I135T, V179A, V245Q, E248V, K249Q, A272P  
14112 14112 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, I135R, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207T, R211S, K238R, V245E  
14113 14113 None None   V118I, D123E, I135T, K166R, F214L, V245M, I257L, V261I  

Database

Resources

Team