Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Lennox (2014)
Title Efficacy and tolerability of 3 nonnucleoside reverse transcriptase inhibitor-sparing antiretroviral regimens for treatment-naive volunteers infected with HIV-1: a randomized, controlled equivalence trial.
Citation Ann Intern Med
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 548
NumPts 293
Subtype B, CRF02_AG, A, C

 

  Page 1 of 6    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 548 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
PT1 -6D None None   I50IV, R83RK, K122E, Q174E, I178M, T200TA, Q207E, K223KR, V245E  
  646D TDF, FTC None   R83RK, K104KR, K122E, Q174E, I178M, T200TA, Q207E, V245E  
PT10 -5D None None     
  560D TDF, FTC None     
PT11 -6D None None   R83K, T200E, R211K, V245M  
PT12 -10D None None  E138A S68G, K102KQ, K122E, I135T, S162C, P176Q, V179I, G196E, V245K  
  1138D TDF, FTC None  E138A S68G, K122E, I135T, S162C, P176Q, V179I, G196E, V245K  
PT13 -12D None None   K49KR, D177E, I178M, T200A, V245VM  
  181D TDF, FTC None   K49R, K122KE, D177E, I178M, V179VI, T200A, V245M  
PT14 -7D None None   K122E, D177E, R211K L109LP 
  56D None None   K122E, D177E, R211K  
PT15 -6D None None   T39A, V60VI, D123E, I135T, S162C, G196E, R211K, V245M  
  135D TDF, FTC None M184V  T39A, V60I, D123E, I135T, S162C, G196E, R211K, V245M  
PT16 -6D None None   K49R, K122E, D123E, I135T, S162A, V245KM  
  141D TDF, FTC None D67DH  K49R, K122E, D123E, I135T, S162A, V245LM  
  461D TDF, FTC None   K49R, K122E, D123E, I135T, S162A, V245KM  
PT17 -12D None None   T39A, T69X, R83K, K122P, I135T, D177E, I178M, I202IV, Q207E, R211RK  
  506D TDF, FTC None T69D, T215I  R83K, K122P, I135T, D177E, I178M, D192N, Q207E, R211K  
PT18 -2D None None   K122KE, S162C, D177DE, I178M, G196E, T200TA, E248ED, A272P, K277R, K281KR, T286A, A288S, E297K, Q334Y  
  547D TDF, FTC None   K122KE, S162C, D177DE, I178M, G196E, T200TA, E248ED, A272P, K277R, K281KR, T286A, A288S, E297K, Q334Y  
PT19 -7D None None   V60I, K122E, D123DN, I135IT, K173L, Q174K, D177DE, V179VI, I202V, Q207K, R211S, F214FL, V245N  
PT2   None None   I135V, S162C, T200TA  
  465D TDF, FTC None K70KN, M184MV  K122E, I135V, S162C  
PT20 -9D None None   A98S, D121H, K122E, I135IR, I142T, T200A, R211RK  
  1189D TDF, FTC None   A98S, D121H, K122E, I135IR, I142T, T200A, R211RK P150PA 
PT21 -14D None None   K43KQ, K49KR, K64R, Q207D, R211K, V245M  
  415D TDF, FTC None   K43Q, K49KR, K64R, Q207D, R211K, V245K E44EQ 
PT22 -7D None None   R83K, A98AS, K122E, A158AS, E169D, G196E, T200TI, V245M  
  267D TDF, FTC None   R83K, A98AS, K122E, A158AS, E169D, G196E, T200TA, V245M  
PT23 -13D None None   D121Y, K122E, S162C, E169D, D177E, I178M, R211K, P243T  
  100D TDF, FTC None   D121Y, K122E, S162C, E169D, D177E, I178M, R211K, P243T  
PT24 -7D None None   K43KN, R83K, K122P, I195IL, R211K  
  475D TDF, FTC None M184V  K43N, R83K, K122P, G196E, E203K, R211K  
PT25 -14D None None   S68G, V90I, S162H, K166R, F171Y, K173Q, V179I, R211K, V245E H235HL 
  175D TDF, FTC None   S68G, V90I, S162H, F171Y, K173Q, D177DN, V179VI, R211K, V245E H235HL 
PT26 -9D None None   K122E, D123N, I142V, T200I, I202IV, V245I E42EV 
  840D TDF, FTC None   K122E, D123N, I142V, I195IV, T200I, I202IV, V245I H96HN 
PT27 -7D None None  K103S, V106I V35VIL, K101R, T107S, I135T, S162HY, Q174K, I178M, V179I, G196E, Q197K, R211K, A272P, K277R, Q278N, I293V, E297K, P313T, G333E, Q334H  
  917D TDF, FTC None  K103S, V106I V35VI, T39TA, K101R, T107S, I135T, S162Y, Q174K, I178M, V179I, G196E, Q197K, R211K, A272P, K277R, Q278N, I293V, E297K, P313T, G333E, Q334H  
PT28 -4D None None   T39A, S68G, K122P, I135V, K173Q, I178L  
  188D TDF, FTC None   T39A, S68G, K122P, I135V, K173Q, I178L  
PT29 0D None None  K103N A98S, K102Q, D123E, V179I, G196E, D250E, T286A, E297Q, V317A, Q334E  
PT3 -6D None None   T39TA, E40ED, I135L, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, P243T, V245Q  
  479D TDF, FTC None   K122KE, I135L, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, P243T, V245Q  
PT30 0D None None   D123E, K166R, V179I, V245KM  
  406D TDF, FTC None   D123E, K166R, V179I, V245K  
PT31 -8D None None   S48T, A98S, K122E, I135T, D177E, Q207E, R211K, V245M L209LR 
  382D TDF, FTC None   S48T, A98S, K122E, I135T, D177E, Q207DE, R211K, V245M  
PT32 -8D None None  K103KN T39E, S68G, K122E, I135T, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211RK, P243H, V245Q D186DY 
  145D TDF, FTC None   T39E, S68G, K122KE, I135T, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211RK, P243H, V245Q  
PT33 -5D None None   K103R, V118I, K122E, I135T, S162C, K173R, V179I, G196E, Q207H, R211K, F214L  
PT34 -14D None None   V60VI, R83RK, I135IV, S162SC, K166KR, E169ED, V245K  
  107D None None   V60VI, R83RK, S162SC, K166KR, E169ED, V245K  
PT35 -12D None None   T39A, R83K, T200TI, R211K  
PT36 0D None None  K103N, E138A R83K, K122P, S162C, K173E, Q174R, D177E, I178L, V179I, T200A, E204K, Q207E, R211K, F214L, V245E, A272P, T286A, E297K, L301I, V317A, G335D  
  7D TDF, FTC None  K103N, E138A R83K, K122P, S162C, K173E, Q174R, D177E, I178L, V179I, T200A, E204K, Q207E, R211K, F214L, V245E  
PT37 -13D None None   V75VL, I135M, T165TI, Q207E, R211RK  
  174D TDF, FTC None   V75VL, I135M, T165TI, Q207E, R211RK  
PT38 -26D None None   V35T, E40D, K49R, K122E, D123S, T165I, E169D, K173AS, Q174K, D177E, V179I, I195IL, T200A, I202IV, Q207A, R211S, V245Q, T286P, V292VI, I293V, P294T, E312D, G335D  
  1128D TDF, FTC None K70KR, M184V  K30KR, V35T, E40D, K49R, K122E, D123S, T165I, E169AD, K173A, Q174K, D177E, I178IL, V179I, T200A, Q207A, R211S, F214FL, V245Q, T286P, I293V, P294T, E312D, G335D  
PT39 -3D None None  E138A E40G, S48E, K49R, S162C, V179VI, G196E, E204Q  
  267D TDF, FTC None  E138A S48E, K49R, S162C, G196E, E204Q  
PT4 -7D None None     
  281D TDF, FTC None   D86E, D123E, D177E, D192N, T200A, R211M, F214L  
PT40 -5D None None   K122E, S162C, T165I, D177E, T200X, I202V, R211K, V245VM  
  183D TDF, FTC None   K122E, S162C, T165I, D177E, T200TA, I202V, R211K, V245VM  
PT41 -8D None None   S68G, K122Q, K166R, D177E  
  392D TDF, FTC None   S68G, K122Q, K166R, D177E  
PT42 -8D None None   K43R, V60I, D123E, I135T, D177E, I178M, R211RK  
  339D TDF, FTC None   V60I, K122KE, D123EQ, I135IT, D177E, I178M, R211RK  
PT43 -6D None None   Q174S  
  794D TDF, FTC None   Q174S  
PT44 -5D None None   V60I, S68G, K122KE, I135T, R211K  
PT45 -8D None None   D121H, K122E, S162C, K173Q, D177E, I178LM, R211G, V245S  
  140D TDF, FTC None M184V  D121H, K122E, S162C, K173Q, D177E, I178LM, R211G, V245S  
PT46 -8D None None   A98S, K104RT, K122E, D123A, K166R, R211K, V245M  
  246D TDF, FTC None M184V  A98S, K104RT, K122E, D123A, K166R, R211K, V245M  
PT47 -14D None None   K122E, I178M, T200A, Q207E  
  554D TDF, FTC None   K122E, I178M, T200A, Q207E  
PT48 -12D None None   K49R, R83K, K122E, I135T, E169D, G196E, R211K, V245K  
  183D TDF, FTC None   K49R, R83K, K122E, I135T, E169D, G196E, R211K, V245K  
PT49 -2D None None   T39M, I135IT, I202V, Q207E, V245K  
  114D TDF, FTC None   T39M, I135IT, I202V, Q207E, V245K  
PT5 0D None None   V60VI, K122KE, D123E, I142V, T165TI, D177A, G196E, T200I, I202IV, V245E, A272P, K277R, T286P, T296S, E297K  
PT50 -21D None None   I50V, D123DE, I135T, Q145V, S162C, D177E, F214L  
PT51 -6D None None   K122E, D123N, I135T, S162C, I178V, T200E, K201I, E204Q  
  183D TDF, FTC None   K122E, D123N, I135T, S162C, I178V, T200E, K201I, E204Q  
PT52 -6D None None  E138A V35I, S48T, K122E, T200I, V245T, E248V, I293V, I329V  
  924D TDF, FTC None  E138A V35I, S48T, K122E, D123G, T200I, V245T, E248V, I293V, I329V  
PT53 0D None None   V35I, R83K, K122KR, D123E, I135V, S162C, D177E, I178M, R211K, V245E, E248D, I293V, E297K, V317A, Q334E  
  56D TDF, FTC None   V35I, R83K, K122KR, D123E, I135V, S162C, D177E, I178M, R211K, V245E, E248D, I293V, E297K, V317A, Q334E  
PT6 -2D None None  K103N S48T, I50V, V60VI, K122KE, Q174E, T200A, Q207E, V245K  
  151D TDF, FTC None M184I K103N K43N, K122E, D123N, K173N, Q174K, T200A, Q207E, R211K, V245K  
  278D TDF, FTC, AZT None M184MIV K103N K43N, K122E, D123DN, K173N, Q174K, T200A, Q207E, R211K, V245K  
PT7 -3D None None   S48T, D121H, K122E, I135M, S162X, E169D, D177E  
  1389D TDF, FTC None   G45R, S48T, D121H, K122E, I135IMT, S162C, E169D, D177E  
PT8 0D None None   S48T, V60I, K122P, I142V, Q174N, I178M, Q207R, R211K, V276I, K281R, I293V, K311R, G333D, Q334N  
  1346D TDF, FTC, ABC, 3TC None   S48T, V60I, K122P, I142V, Q174N, I178M, Q207R, R211K, K277R, K281R, I293V, K311R, G333D, Q334N  
PT9 0D None None   E6D, V35I, S48T, A98S, I135V, D177E, Q207E, R211K, V245M, E248Q, D250E, K277R, I293V, P294T, K311R  
  1139D TDF, FTC None   E6D, V35I, S48T, A98S, I135V, D177E, Q207E, R211K, V245M, E248Q, D250E, K277R, I293V, P294T, K311R