Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Svicher (2006)
Title Involvement of novel human immunodeficiency virus type 1 reverse transcriptase mutations in the regulation of resistance to nucleoside inhibitors.
Citation J Virol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 564
NumPts 564
Subtype B, C, F, CRF12_BF

 

  Page 1 of 6    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 564 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
03420-1731A 03420-1731A RTI RTI M41L, M184V, T215Y  I135T, I142V, S162Y, I178L, V179I, T286A, I293V, E297K, V317A  
1514-760A 1514-760A RTI RTI   R83K, D123E, I135IV, T200IM, A272P, K281KR, T286A, P294T, I329L, Q334H, G335D  
1629-817A 1629-817A RTI RTI   K20KR, V35I, K122E, D123E, I135T, R211RK, F214FL, T286TA, E297A  
1796-203B 1796-203B RTI RTI   K20R, K49R, V60I, R83K, D123E, D177E, G196E, Q207R, R211H, I293V, Q334L  
2571-571C 2571-571C RTI RTI T215FY K103N, Y181C K11R, T39K, K43E, I142V, Q174K, Q207E, R211K, L228R, A288T, V292I, I293V, E297A, E300ED, K311R, L325LF, A327AV, G333E D86DH, I167IM 
2654-338D 2654-338D RTI RTI M41L, D67N, M184V, L210W, T215Y  K43N, V118I, R211K, A272P, K281R, R284K, T286A, E291D, E297R, K311R, Q334E  
2753-477B 2753-477B RTI RTI M41L, L74V, M184V, L210W, T215Y  K49R, V60I, K122E, I135T, E169EK, G196E, Q207E, R211K, A272P, K277R, I293V, E297R  
2991-1478A 2991-1478A RTI RTI T215Y K103N E28EK, R83K, V90VI, K101KQ, I135T, A158S, S162A, K166R, D177E, I178M, E194D, T200A, R211K, A272P, K311R, D324E, G333D  
2998-49E 2998-49E RTI RTI M41L, M184V, T215Y K103KN, V106VIM V35T, K122E, D123E, I135T, V179VI, G190X, A272P, P294T, E297R  
3014-113D 3014-113D RTI RTI M184MV K103N, Y188L, P225H K122E, I135V, S162C, V245K, K277R, Q278A, K311R, E312Q, Q334L  
3017-750C 3017-750C RTI RTI M41L, D67N, L74V, T215Y L100I, K103N V35R, T39A, K43E, V60I, V118I, K122E, D123G, I135T, D177E, E203D, E224D, A272P, K281R, T286A, E297A, V317VA, Q334D  
308-1783A 308-1783A RTI RTI D67N, K70R K103N, K238T, Y318F I135T, S162A, K277R, A288S, I293V, E297A  
3137-732D 3137-732D RTI RTI   V35I, K122E, K166KR, Q197P, P243S, V245K, A272S, K277R, T286A, I329V  
3139-637B 3139-637B RTI RTI A62V, V75I, F77L, Y115F, F116Y, Q151M, M184V K103S, V108I, G190A E6D, T58N, K64R, S68G, K70X, K101Q, D123E, I135T, S162D, K166Q, P170HL, D177E, T200IM, I244V, A272P, K277R, L283I, I293V, P294A  
3141-1232B 3141-1232B RTI RTI D67N, K70R, M184V, K219Q  T7TP, D123E, K166R, Q174QR, D177E, G196E, A272P, K277R, K281R, E297K, K311R  
3142-933B 3142-933B RTI RTI M184V K103N, M230ML K101KQ, I135IM, I178M, F214L, V245E, K277R, P294A, I329L  
3153-1604A 3153-1604A RTI RTI M41ML, D67DN, K70KR, M184V, K219KE  R83K, V90I, A98S, K104KQ, D123DG, E248D, A272S, I326V  
3159-380D 3159-380D RTI RTI M41L, D67N, L210W, T215Y, K219N K101E, E138A, Y181I, G190A T7A, K20KR, T27TS, E44D, V118I, K122E, D123N, E194Q, G196E, I202IV, E203K, H208Y, R211K, K223KE, V245I, E248D, A272P, I293V, E297K, S322T, Q334E  
3163-480B 3163-480B RTI RTI K65R, Y115F, M184V, K219Q  V60I, S68G, K103R, K122KE, I135L, F214FL, L228LH, Q278QH, A288S, K311KR, V317VA, I326V, I329IL  
3165-328E 3165-328E RTI RTI M41L, D67N, T69D, L210W, T215Y, K219R V179VL, Y188L K43Q, E44D, V60I, V75VL, V90VI, K102Q, V106L, V118I, K122E, Q174K, N175Y, G196E, T200M, E203A, Q207E, R211K, D218E, D237DN, A272P, K281R, L283LI, T286A, A288S, E297K, S322T  
3166-1612A 3166-1612A RTI RTI D67N, K70R, K219Q  V60I, A98S, K101Q, D123E, I135V, S162N, D177DG, I178M, A272P, K277R, I293V, E297K, V317A, S322A, I329V  
3170-690C 3170-690C RTI RTI M41L, L74V, M184V, L210W, T215Y E138EA, G190A K20R, K49R, V118VI, D123E, I142X, R172RK, D177E, I178L, V179VI, G196E, E204N, A272P, K277R, T286TA, I293IV, E297K  
3172-357D 3172-357D RTI RTI M41L, D67N, L74V, M184V, L210W, T215Y K103N, Y181C K20R, V35M, T39A, K43E, T69E, K122P, I135T, S162C, I178L, R211K, A272P, K277KR, T286A, I293V, P294T, G333E  
3173-978B 3173-978B RTI RTI   V35X, T39TA, E40ED, G196E, Q197H, T200TA, Q207E, R211K, F214FL, V245E, E248ED, A272P, E297EA, K311R, Q334L  
3175-1014B 3175-1014B RTI RTI D67N, K70R, T215I, K219Q K101E, G190A E6EK, K32KQ, V35L, K122E, I135T, I142T, Q207E, F214L, D250DE, A272S, T286A, I293V, H315HQ, V317A, D320X, S322AT, Q334S E28E*K, L289LQ, L303LR, Y319Y* 
3176-1615A 3176-1615A RTI RTI D67N, K70R, L74LV, M184V, T215F, K219Q G190S V10I, K20R, V35I, V60I, T69N, K104N, V118I, D123E, I135T, I202V, R211K, F214L, A272P, T286A, E291D, E297Q, S322T  
3179-604C 3179-604C RTI RTI   V60VI, K122E, D123E, I142V, R211E, A272P, K281R, T286A, P294T, E297K, A304E, K311KR, D320E, S322SL, I329V, G335D  
3180-664B 3180-664B RTI RTI M184MV E138G K20R, K32N, V35VI, K49R, V60VI, R83K, V90I, K102Q, D123DE, I135T, T200A, R211K, A272P, K281KR, T286P, P294A, E297K, V317VA, G335D  
3184-608D 3184-608D RTI RTI M41L, L74V, M184V, L210W, T215Y K101E, Y181C, G190A E28EK, T39A, E44D, V118I, D123E, D177E, Q197K, T200TA, R211K, L228H, Q242H, V245K, I257L, A272P, I293V, E297K, S322T, Q334E  
3187-611B 3187-611B RTI RTI M41L, M184V, L210W, T215Y, K219R K103NS, Y181C K20R, K43KN, E44D, A98S, V118I, K122E, I135T, V179VI, R211K, D218E, L228R, A272P, T286A, K287KR, E291D, R307K, I329L  
3190-437C 3190-437C RTI RTI D67N, K70R, K219Q K103N K20KR, V60I, A98S, K101R, D123E, I135T, R172RK, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245E, A272P, T286A, E297K, L310I, S322T, Q334QL  
3195-152B 3195-152B RTI RTI M41L, T215Y K101E, E138A, G190A K20R, V35M, T69S, R83RK, A98S, D123E, A272P, I293V, P294T, E297Q, G335GD  
3198-1151B 3198-1151B RTI RTI M41L, D67N, V75M, L210W, T215Y K103KN K20R, V35I, E44D, K102KQ, V118I, K122E, D123E, I135T, T139I, E169K, K173E, D177N, I178IL, G196E, Q207E, H208Y, R211K, V245E, A272P, K281KR, I293V, E297K, Q334N  
3209-856D 3209-856D RTI RTI T215F Y181DV D123E, I142IT, V245E, V261I, A272P, K277R, K281R, I293V, P294A, E297K  
3210-1627A 3210-1627A RTI RTI M41L, D67N, T69D, L74V, M184V, L210W, T215Y K101E, E138Q, Y181C, G190S V35I, E44D, V118I, D123E, S162D, V189I, Q207E, H208Y, R211K, A272P, K277R, T286A, E297R, V317A  
3256-720D 3256-720D RTI RTI M41L, M184V, T215Y  K49KR, D123E, T200A, R211K, V245VI, V292I, I293V, K311R, D324G  
3262-531C 3262-531C RTI RTI D67N, K70R, M184V, K219Q K103N, V108I, K238T D123E, Q207E, R211K, F214L, V245E, A272P, K277R, K281R, I293V, P294A, E297R, K311R  
3267-707C 3267-707C RTI RTI D67N, T69D, K70R, M184V, T215V, K219Q K103N, Y318F K20R, A98S, K122E, D123EK, I135L, G196E, T200A, I202V, E224EG, D237DE, A272P, K281R, T286A, A288S, E297K  
3268-1062C 3268-1062C RTI RTI D67N, K70R, M184MV, K219Q G190S P4S, K122E, D123A, V179I, T200A, Q207E, R211RKT, A272P, K281R, E297K, K311KR  
3269-1078C 3269-1078C RTI RTI M41L, L74V, L210W, T215Y V108I, Y181C, H221Y V35M, K43N, E44ED, R83K, V118I, K122E, A158S, I293V  
3274-1661A 3274-1661A RTI RTI M184V, K219Q K101P, K103S E6D, T7I, V60I, K122P, D123E, S162Y, P176Q, D192N, T200A, Q207E, F214L, D218E, P243S, V245T, I293V, E297A  
3280-463B 3280-463B RTI RTI M184V K103KN E6D, A98S, K101R, D123E, I142V, G196E, T200I, T253X, A272P, K281R, R284K, T286A, A288S, I293V, P294PT, E297R  
3286-1668A 3286-1668A RTI RTI   D123E, K166KR, K173E, Q197QK, T200TI, A272P, K277R, K281KR, T286TA, P294T, E297Q, G335D  
3289-522D 3289-522D RTI RTI   E53D, D123E, S162Y, R211K, F214L, A272P, R284K, T286A, A288S, I293V, E297R  
3290-1669A 3290-1669A RTI RTI M184V K103N V35I, S48E, V60VI, R83K, D123E, I135T, T139QR, A272P, K277R, T286A, E297K  
3292-511B 3292-511B RTI RTI M184V  K20KR, R83K, K122P, D177E, I178L, A272P, K275R, T286A, Q334L  
3305-161E 3305-161E RTI RTI M41L, D67N, T69D, K70R, V75M, M184V, T215Y L100I, K103N E44D, V60I, K122E, D123N, I135T, Q207D, V245E, A272P, L283I, A288G, I293V, D324E  
3307-164B 3307-164B RTI RTI M41L, D67N, L74LI, M184V, L210W, T215Y  K20R, K43Q, E44D, V118I, D123E, V179VI, G196GR, H208HY, R211K, V245K, A272P, K281R, E297K, G333E, Q334H  
3317-1681A 3317-1681A RTI RTI M184V A98G, K103N, E138A R83K, K101KQ, D123E, I135L, V179IT, T200A, A272P, K281R, I293V, E297R  
3326-652B 3326-652B RTI RTI   V35I, V60I, R83K, D123E, Q197E, T200TA, A272P, K281R, E291ED, V292VI, I293V  
3332-795B 3332-795B RTI RTI   K20R, K49R, K122E, I142T, Y144F, E169D, K173Q, A272P, I293V, P294AS, E297A  
3337-155E 3337-155E RTI RTI A62AV, M184V, T215F A98G K122E, I135T, I142IV, R211K, A272P, K281R, I293IV, E297K  
3341-563D 3341-563D RTI RTI D67N, T69D, K70R, M184V, K219Q  V35T, V60I, K122E, D123E, I135T, G196E, F214L, A272P, K281R, E297K L295L_L 
3343-1693A 3343-1693A RTI RTI  K103N, G190A V35M, D86DE, K102KR, I135IM, R211K, V245E, A272P, K281R, E297K, I329V, G335C  
3354-252D 3354-252D RTI RTI M184V E138A E28EA, V35VA, D123E, S162C, G196E, Q197K, P243S, E248D, A272P, K277R, I293V, P294A, E297R  
3373-493E 3373-493E RTI RTI M184MV K103KN, G190GA K49KR, V60I, R83K, V90VI, K122E, D177E, T200I, Q207E, R211K, A272P, K281R, E297K, P313S, Q334E  
3381-1708A 3381-1708A RTI RTI M184V  K20R, V21I, R211K, A272P, K277R, T286TA, P294Q, I326K, Q334L  
3387-1311B 3387-1311B RTI RTI M41L, L74V, M184V, T215S Y181C, H221Y K11KR, V35E, T39A, D121Y, K122KE, D123DE, I135R, D177E, G196E, A272P, K277R, V292VI, I293V, P294PS, E297R  
3397-1717A 3397-1717A RTI RTI M184V  I31L, A98S, D123E, T139TA, I142IT, R211K, T215X, A272P, K281R, I293V, E297Q F160L 
3406-1722A 3406-1722A RTI RTI D67DN, K70R  K20R, V60VI, T69S, A98S, G196E, T200TA, Q207QE, R211RK, A272P, K281R, T286TA, E297K, L310LI, K311KR  
3407-1188B 3407-1188B RTI RTI   I5IM, E6D, Q23QP, V35I, R83K, I135T, I178L, T200A, Q278N, L283I, I293V, P294T, I329L, Q334H  
3409-1723A 3409-1723A RTI RTI K70KR, M184V K103NS, G190GA T39TA, D123E, I135T, I142IT, D177E, I178IM, G196E, F214L, A272P, K277KR, K281R, T286TA, E297K L295P 
3411-1725A 3411-1725A RTI RTI M184V K103N, P225H K20KR, R83RK, I135L, G196E, T200A, I293V, E297K, L301I  
3412-1726A 3412-1726A RTI RTI M184V  A98S, D123E, A272P, R284K, P294S, E297R, I329V, G335S  
3418-1459B 3418-1459B RTI RTI M41L, D67N, T69D, M184V, L210W, T215Y  K20R, V35I, K43Q, V118I, K122E, I135T, I178M, V179I, L228H, D237N, V245E, A272P, K281R, I293V, E297R, L301I  
3419-1730A 3419-1730A RTI RTI D67N, M184V, T215Y K101E, G190A R83K, D123E, K275R, Q278H, T286A, A288AT  
3432-56B 3432-56B RTI RTI  K101EQ, K238KT K49R, V60VI, K122E, I135K, E169ED, G196GE, T200TA, R211RK, A272P, T286A, V292I, I293IV, E297EK, D324E  
3433-514B 3433-514B RTI RTI D67N, K70R, M184V, T215F, K219Q G190A, K238T V35T, T69N, K102Q, D123E, I135T, K166R, D177E, G196E, E203K, R211K, A272P, E297K  
3439-140F 3439-140F RTI RTI M41L, D67N, L74V, M184V, L210W, T215Y, K219N K103KN, Y181C, K238T K43E, E44A, V118I, D121Y, K122E, I135T, S162C, Q174K, D177E, G196E, I202IV, A272P, K277R, V292I, I293V, E297A, Q334D  
3447-1743A 3447-1743A RTI RTI M41L, D67N, L210W, T215Y, K219KR  V35T, T39TA, K43KEQ, V60I, V118I, K122E, D123E, I135T, G196E, Q197K, R211RK, A272P, T286A, V292I, I293IV, E297K, D324E  
3464-1754A 3464-1754A RTI RTI M184V  N57NK, A158S, V189I, R211Q, A272P, T286A, V317A, G333E, Q334N, G335S  
3474-1763A 3474-1763A RTI RTI K65KR, M184V K103KN, G190GA K101X, K122E, D123E, I135IT, S162C, Q207QE, V245E, A272P, K277R, K281KR, I293V, E297R  
3484-1770A 3484-1770A RTI RTI D67N, K70R, M184V, K219KE K103N, P225H, K238T V35M, T39A, K101KQ, D123E, I135T, I142T, A272P, V292I, I293V, E297KQ  
3497-513C 3497-513C RTI RTI   K102KQ, K122E, S162C, D177DE, I178M, V245E, A272P, K277R, I293V, E297EK, S322T  
3512-1779A 3512-1779A RTI RTI D67G, K70R, M184V, K219Q  V60I, S68G, K102Q, K173KE, D218E, A272P, K281R, E297R, E312G  
3514-1780A 3514-1780A RTI RTI  G190GE K49R, V60I, R83K, K122KR, I178L, V189I, G262GE, K275KQ, K277KR, Q278QH, I293V, E297A L282LF 
3537-146G 3537-146G RTI RTI D67N, K70R, M184V, T215F, K219KE L100LI, K103N, G190GA K32R, V35T, S48E, V60I, V90VI, K101KR, D123E, I135IV, T139QR, S162SC, A272P, K277R, T286A, P294T, E297K  
3544-1209D 3544-1209D RTI RTI M41L, L74V, M184V, L210W, T215Y V108VI, E138A, F227FL K20R, K43KE, K64KR, R83K, V118I, K122E, I178IM, V179VI, G196E, T200TA, E203K, Q207E, H208Y, R211K, K223E, L228R, A272P, E297R, I329L, G333D  
3564-1802A 3564-1802A RTI RTI  K103KN, E138A D123E, I135T, I142IT, S162C, Q207E, R211K, F214L, A272P, K281R, R284RK, T286A, I293IV, P294PT, E297R I257IM 
3585-1817A 3585-1817A RTI RTI  K103N, P225H, K238T K101R, D177DEG, I178IL, Q207N, R211K, A272P, K277R, L283I, I293V, E297A  
3586-1818A 3586-1818A RTI RTI M184MV  V35VL, K49R, A98S, K102Q, T107S, D123E, Y127YF, S162C, E169D, D177E, T200A, R211K, V245Q, A272P, T286TA, E297Q, I326IM  
3587-1819A 3587-1819A RTI RTI   I50V, R83K, D123E, I135T, A272P, K277R, E297K, G335D  
3597-265D 3597-265D RTI RTI D67N, T69DN, K70R, L74V, T215F, K219Q L100I, K103N E28A, E40D, K43N, K122E, K173KR, R211K, D218E, A272P, K277R, A288AT, I293V, G333E, Q334N, G335S  
3601-738C 3601-738C RTI RTI D67N, K70R, M184V, K219Q  T69X, F214L, T286A, Q334C, G335S  
3603-1256C 3603-1256C RTI RTI M41L, M184V  V35T, D123E, K166R, T200TA, R211K, A272P, K277R, K281R, T286A, I293V, E297R, Q334H  
3605-1832A 3605-1832A RTI RTI M41L, D67N, K70R, M184V, L210W, T215Y, K219E E138A V8VG, V35M, E36ED, I50F, R83K, D121DN, S134SR, I135V, Y146YS, S162C, E169EK, K173Q, R211K, E248D, A272P, K277R, S322SL, I329V, Q334E H96HL 
3618-428D 3618-428D RTI RTI   K101KR, K122E, I135T, D250DE, A272P, K277R, E297A  
3623-313C 3623-313C RTI RTI D67N, T69D, M184V, T215Y  V35L, S105SL, D123E, D177E, V179I, G196E, V245K, A272P, I293V, P294A, E297K, K311R K20IR, G262GEV 
3634-330A 3634-330A RTI RTI T215Y Y181C V35M, K49R, R83K, I135L, K166R, K173Q, P176Q, I178M, T200E, E204K, Q207E, R211K, A272P, I293V, E297AV E42EA 
3644-351A 3644-351A RTI RTI  K103N V35I, T39A, D123E, I135T, E194K, G196E, F214L, K249Q, A272P, V292I, E297Q, D324A L149LV 
3648--1854B 3648--1854B RTI RTI K65R, K219R K103N, G190A V35M, T39A, S68K, K102N, K122E, I135T, I178M, V179I, T200A, R211S, F214L, A272P, V292I, V317A, Q334L K70H 
3649-364E 3649-364E RTI RTI A62V, Q151M K103N, E138K, Y181C P4PS, S68G, T69K, D123E, S162N, R211K, F214L, A272P, K281R, L283I, T286A, I293V, E297Q, K311R K70W 
3675-1870A 3675-1870A RTI RTI M184V G190E K20R, V35I, R83RK, D123E, I180V, T200A, Q207E, R211K, A272P, K277R, K281R, I293V, E297R, L301I, G333E, Q334H  
3681-612D 3681-612D RTI RTI M41L, D67DN, L74LV, M184V, L210W, T215Y, K219R A98G, V108I, Y181C, G190A I31IL, V35M, K43Q, E44D, K101Q, V118I, K122E, I135IV, I178IM, G196E, E203K, H208FY, R211K, K223T, L228H, Q242H, V245M, K277R, Q278E, L283I, E297R, D324E, Q334E  
3711-1034B 3711-1034B RTI RTI M184V Y181C V60I, R83K, D123E, I135T, T165A, T200A, R211K, V245E, A272P, K281R, E297K  
3727-1410C 3727-1410C RTI RTI M184V Y188L I135T, K166R, V245E, K277R, T286A, E297D, V317VA  
3755-2367A 3755-2367A RTI RTI D67DN, K70KR, M184MV, K219KQ  V35VI, T69TN, V118VI, K122E, I135T, G196E, T200TA, F214L, T215X, I274IV, E297K, H315HY, S322A  
4348-1790A 4348-1790A RTI RTI   V35M, K49KR, I50V, R83K, D123E, S162X, E169D, F171Y, D177E, G196E, A272P, K277R, R284K, T286A, P294S, E297R  
521-52a 521-52a RTI RTI  V106VI E6ED, V8VI, V60I, D123E, K166R, D177E, R211K, A272P, T286P, I293V, E297R  
711-253a 711-253a RTI RTI   I135T, T139M, S162C, K277R, V292I, I293V, E297EA