Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Diouara (2014)
Title Antiretroviral treatment outcome in HIV-1-infected patients routinely followed up in capital cities and remote areas of Senegal, Mali and Guinea-Conakry.
Citation J Int AIDS Soc
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 73
NumPts 73
Subtype CRF02_AG, CRF06_cpx, B, C, D, F, A, CRF09_cpx

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
GUIN_003 GUIN_003 RTI RTI   V35T, E36D, K101Q, K122E, D123T, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, F214L  
GUIN_006 GUIN_006 RTI RTI   K32R, V35T, E36D, T39Q, A158AS, S162A, K173T, Q174K, D177DE, T200A, Q207E, V245E  
GUIN_009 GUIN_009 RTI RTI D67N, K70R, M184V, K219Q K103N V35T, T39A, E40D, K49R, V60I, I94L, D121Y, K122E, D123E, I135T, S162N, T165L, T200A, Q207E, R211K, F214L, V241I, V245K  
GUIN_021 GUIN_021 RTI RTI M41L, D67N, K70R, M184V, T215Y K103N, V106M V35T, E40D, V60I, K122E, D123N, T165L, K173R, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
GUIN_031 GUIN_031 RTI RTI T69G, M184V, T215F, K219E K103N, Y188H V35T, K49R, V60I, D67X, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, L228H  
GUIN_032 GUIN_032 RTI RTI   V35T, E36D, T39A, S68G, K102KR, K122E, A158S, S162A, K173S, Q174K, D177E, V179I, G196E, E203AG, Q207A, R211K  
GUIN_033 GUIN_033 RTI RTI   V35T, E36D, V60I, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207E, V245Q, E248N, D250E  
GUIN_048 GUIN_048 RTI RTI M184V, T215Y K103N, V108I K20R, V35T, E36D, T39M, I135M, S162A, K173T, Q174K, D177E, Q207E, R211K, V245K  
GUIN_050 GUIN_050 RTI RTI  K103KN, G190GA K20R, V35T, T39A, E40D, V60I, K101KN, D123N, I135V, S162Y, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, F227FY  
GUIN_053 GUIN_053 RTI RTI K70R, M184V, K219Q V108I, Y181C K32T, V35K, K49R, V60I, T69N, D123E, I135T, S162A, K173T, Q174K, D177E, E203K, Q207E, R211K, F214L, L228R, V245K, D250T  
GUIN_076 GUIN_076 RTI RTI D67H, K70R, M184V, K219E V106I, Y188L V35T, T39A, V60I, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174R, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207E, R211K, F214L  
GUIN_077 GUIN_077 RTI RTI  K103T, G190GA K20R, V35T, T39N, V60I, D123N, I142V, K173T, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
GUIN_080 GUIN_080 RTI RTI M184V, T215TS V106A, E138K K13N, K20R, V35T, E36D, T39E, K49R, V60I, K122E, D123N, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, E203K, Q207E, R211K, D218E  
GUIN_095 GUIN_095 RTI RTI M184V K103N K20R, V35T, K122E, I135V, S162A, K166R, K173T, Q174S, D177E, T200A, Q207G, R211K  
GUIN_099 GUIN_099 RTI RTI   K20R, V35T, E40D, K49KR, V60I, S162A, K173T, Q174K, D177DE, I195IL, T200A, Q207E, P243T, V245Q  
GUIN_102 GUIN_102 RTI RTI M41L, M184V, T215Y V108I, Y181C, H221Y V35T, V60I, V90I, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200V, Q207G, R211K, L228R, P243T, V245Q  
GUIN_113 GUIN_113 RTI RTI M41L, D67G, T69AD, K70R, V75M, M184V, T215Y K101KE, K103N I31L, K32KR, V35T, T39A, A98S, I135T, S162A, K166KR, Q174E, D177E, D186N, I195T, G196GR, T200A, Q207EK V60VIM, G93E 
GUIN_123 GUIN_123 RTI RTI M184V, T215F K101P V35K, K49R, V60I, S68G, D121H, S162A, T165L, K173T, Q174K, D177E, I178L, V179I, T200A, Q207E, V245Q, E248N  
GUIN_125 GUIN_125 RTI RTI K70KR  V35T, V60I, S68G, V90I, D123E, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
GUIN_132 GUIN_132 RTI RTI   V35T, K122E, D123E, I142IV, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200I, Q207D, V245Q W71WG 
GUIN_142 GUIN_142 RTI RTI   V35T, E36D, T39K, D121H, K122E, D123S, I135V, S162A, K173T, Q174R, D177E, Q197K, T200E, Q207G, R211E  
GUIN_177 GUIN_177 RTI RTI D67N, K70R, M184V, L210W, T215Y, K219E K103N, Y181C, G190A, H221Y I2V, K20R, V21I, V35T, T39A, E44D, K49R, K101R, K122E, I135V, S162T, E169D, P170L, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, I202V, E203K, Q207E, R211K, L228H, V245H  
GUIN_198 GUIN_198 RTI RTI   K20R, V35T, E36D, K103KE, D123E, I135V, S162A, T165I, K173T, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207G, R211K  
GUIN_204 GUIN_204 RTI RTI  V179E E28EK, K32E, V35T, V60I, S68G, T69N, D123N, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, E224K, V245Q  
GUIN_207 GUIN_207 RTI RTI L74I, Y115F, M184V, K219KE K103N, V108I, V179E, P225H E28EK, K32E, V35T, T39K, V60I, S68G, T69N, V90I, L109I, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174R, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
GUIN_209 GUIN_209 RTI RTI  Y181C V35T, E36D, V90VI, D123N, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, V179I, G196E, T200A, Q207E  
GUIN_213 GUIN_213 RTI RTI   V35T, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174K, Q197L, T200A, Q207E, V245Q  
GUIN_214 GUIN_214 RTI RTI   M16T, K20R, V35T, T39Q, I135V, S162A, K173A, Q174K, N175Y, D177E, L193F, T200E, Q207E, R211Q  
ML_10BCS ML_10BCS RTI RTI K219N Y181C V35T, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207E, R211K  
ML_12BCS ML_12BCS RTI RTI M184MV V108VI, Y181YC, G190GE, H221HY V35T, E40D, K49R, V60I, P119PS, D121H, K122E, I135T, K173N, Q174QK, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E  
ML_1509UK ML_1509UK RTI RTI M41L, M184V, T215Y K103N T27S, V35T, T39L, V60VI, K102KR, A158AS, S162A, Q174K, D177E, I178IM, T200TA, Q207K, R211E  
ML_15BCS ML_15BCS RTI RTI T69S_SS, M184I, T215F Y181C V35T, E36D, K49R, K64KR, D123E, I135M, T165L, E169D, K173T, Q174K, D177E, I178L, G196E, T200A, Q207E, R211K  
ML_16BCH ML_16BCH RTI RTI M184V K103N E28EK, V35T, K49R, V60I, K101Q, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, V245E, D250E, S251H  
ML_17BCS ML_17BCS RTI RTI D67N K101E, V106M K32R, V35T, T39KR, K122E, D123S, F130L, I135T, K166R, K173A, Q174R, D177E, V189VA, G196M, T200A, I202V, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
ML_18SIK ML_18SIK RTI RTI M184MI K103KN, Y181YC V35T, T39A, I135T, T165X, K173I, Q174K, T200A, Q207E, R211K, F214L W71WR 
ML_2208UK ML_2208UK RTI RTI D67DN, K70KR, M184MV, T215TI, K219KE K103KN, V106VI, V108VI V21I, K32R, V35T, T39A, V60VI, F77FS, K102Q, K122E, D123DE, I135X, S162C, Q174R, D177E, I178V, G196E, T200A, I202IV, Q207E, R211K N175V 
ML_22BCS ML_22BCS RTI RTI M184MV G190GA V35T, T39M, E40D, K49R, V60VI, D121CY, K122E, T139TR, E169ED, D177E, T200AE, I202V, Q207E, R211K, F214L  
ML_23BCS ML_23BCS RTI RTI   K32KR, V35T, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K, L228LF, V245Q  
ML_24BU5 ML_24BU5 RTI RTI K70R, M184V V106A, F227L V35T, T39M, V60I, V90I, D123E, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207E, R211K, F214FL, V245KT  
ML_26BCS ML_26BCS RTI RTI  V179E E28EK, K32E, V35T, V60I, S68G, T69N, D123N, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, E224K, V245Q  
ML_27BCS ML_27BCS RTI RTI   V35T, K46Q, V90I, K122KE, R125RK, S162A, K173I, Q174E, D177E, Q197K, T200A, Q207A, R211K  
ML_28BCS ML_28BCS RTI RTI M184V, T215F K103KN, Y181C V21I, V35T, T39A, K49R, I135T, I142V, T165L, E169D, K173A, Q174K, T200A, Q207E, R211RK  
ML_29BCS ML_29BCS RTI RTI M184MV  V35T, E36D, T39A, V90I, K122E, I135V, I142IT, S162A, F171Y, K173T, Q174K, D177E, I178V, T200A, I202IV, Q207E, R211K, F214L  
SN_10023HALD SN_10023HALD RTI RTI  Y188L, P225H V35T, E36D, V60I, K122E, D123N, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
SN_3793HALD SN_3793HALD RTI RTI D67N K101E, V106M K32R, V35T, T39D, N57ND, K122E, D123S, T131TP, S134SG, I135T, K166R, K173A, Q174R, G196M, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q, E248D, D250G N175NK 
SN_3848HALD SN_3848HALD RTI RTI  K103N, L234I T7P, V35T, E36D, T39L, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174N, D177E, G196R, T200A, Q207E, R211K, E233X  
SN_4011HALD SN_4011HALD RTI RTI M184V, T215Y K103N, Y181C V21I, I31IM, V35T, E42D, K122E, D123E, I135V, S162T, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207E, E224D, L228R, P243T, V245M K30KQ, K32HN 
SN_4094HALD SN_4094HALD RTI RTI D67N K101E, V106M P9T, E29EK, K32R, V35T, T39R, K122E, D123S, I135T, K166R, K173A, Q174R, D177E, S191SF, G196M, T200A, I202V, Q207E, R211K, P225S, W229X, V241X, V245Q, E248D, D250E  
SN_4274HALD SN_4274HALD RTI RTI M184V K103N E28K, V35T, E36D, V60I, K82R, K102R, D121Y, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K  
SN_4670HALD SN_4670HALD RTI RTI M184V K101E, G190A V35T, T39A, E40D, K49R, K122A, D123S, S162A, E169D, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, L210M, F214L  
SN_4748HALD SN_4748HALD RTI RTI   E28EK, K32KE, V35T, E36D, V60I, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200E, Q207E, R211K, V245E  
SN_4834HALD SN_4834HALD RTI RTI D67N, K70R, M184V, K219Q K101H, V106A, E138Q V35T, T39M, V60I, K122E, I135T, S162A, K173T, Q174K, T200A, I202V, Q207E, F214L  
SN_5558HALD SN_5558HALD RTI RTI   V35T, E36D, V60VI, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207K, R211EK, V245Q, E248D  
SN_5698HALD SN_5698HALD RTI RTI D67DN, K70R, M184V, T215TI, K219KQ A98AG, Y188L V35T, T39L, K64KR, T69TN, D121DN, K122E, D123DN, T131TP, S162A, R172RK, K173I, Q174K, D177E, I178IM, T200A, Q207E, F214FL, K238KR, V245Q, E248D W71WG, E89EG, V111VG 
SN_5702HALD SN_5702HALD RTI RTI   K20R, V35T, K43KR, K101R, K122AE, D123NS, S162A, E169T, Q174E, D177E, V189I, T200E, I202V, Q207K, R211K, F214L, V245Q, K249X  
SN_5703HALD SN_5703HALD RTI RTI   V35I, R83K, D110N, I135V, S162A, K173T, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207N, R211K, V245Q C38CF 
SN_5745HALD SN_5745HALD RTI RTI   V35T, T39A, K122E, I142V, S162A, K173A, Q174K, D177E, V189I, S191SF, T200A, Q207E, R211K, F214L, P243T, I244V, V245Q  
SN_5792HALD SN_5792HALD RTI RTI M41L, V75I, M184V, L210W, T215Y K103N K22R, V35T, E36D, E44D, W88C, K122E, D123N, I132L, I135V, T139TI, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178L, G196GE, T200A, E203EK, Q207E, R211K  
SN_5828HALD SN_5828HALD RTI RTI K70R, M184V, T215I, K219KE V108VI, Y181C K20R, V35T, E40D, K49R, V60I, D67X, T69N, K122P, I135T, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178V, T200A, Q207E, V245Q, E248D V179Q 
SN_6204HALD SN_6204HALD RTI RTI M184V, T215Y K103N V35T, E36D, T39I, K49R, V60I, S68G, K122E, I135V, S162T, K173T, Q174K, N175Y, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, P226PS, T240A, V241VL D237D_L 
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SN_9796HALD SN_9796HALD RTI RTI   E28A, V35T, E36D, K122P, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
SN_SL84 SN_SL84 RTI RTI T69D, K70R, M184V L100I, K103N V35I, K102R, K122E, Q174R, D177E, I178F, V179I, T200A, E203K, Q207E, R211K, L228R