Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Lunar (2019)
Title Sequence ambiguity determined from routine pol sequencing is a reliable tool for real-time surveillance of HIV incidence trends.
Citation Infect Genet Evol
SelectedGene PR
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 353
NumPts 353
Subtype B, A, CRF02_AG, CRF01_AE, C, F, CRF43_02G, CRF56_cpx, D

 

  Page 1 of 4    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 353 Clinical PR Isolates


SubjectIsolatePIsWksPIMajorPIMinorCommonUnusual
11313-07 11313-07 None    L63P, I64V  
12747-10 12747-10 None    L10LIV, I13IV, K14R, E35D, M36I, N37D, R41K, D60DE, Q61QE, I62IV, E65ED, H69K, L89M, I93IL  
13343-09 13343-09 None    E35D, N37E, R57K, I93L  
13937-09 13937-09 None    E35D, M36I, R41K, H69K, L89M  
14748-07 14748-07 None    L10I, V11I, M36I, I62IV, L63P, I72IV  
14963-10 14963-10 None    T12S, E35D, R41RK, I62V, L63P, A71V, V77VI, I93L  
15020-09 15020-09 None    L10I, I13V, G16GE, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L  
18036-10 18036-10 None    L10V, K14R, I15V, E35D, Y59YH, I62V, L63P, I64IM, C67X  
18173-09 18173-09 None    M36I, L63P, I64V, C67Y  
19063-10 19063-10 None    L10LIV, E35ED, M36MI, N37NS, L38LM, R41K, I64V, V77VI  
19424-09 19424-09 None    L10I, T12I, I15V, E35D, M36I, N37D, R41RK, R57K, I62IV, L63S, K70KT, I93L  
19912-10 19912-10 None    I64V  
2140-10 2140-10 None    T12A, K14R, I15V, E35D, N37D, R57K, L63P, I93L  
3179-06 3179-06 None    K14R, I15V, E35D, N37E, R57K, L63A, I93L  
388-09 388-09 None    K14R, I15V, E35D, N37E, R57K, L63A, A71X, I93L  
5273-07 5273-07 None    N37D, D60E, L63P, A71V, I72T, V77I, P79S, I93L  
5558-07 5558-07 None    T12P, N37NS, L63P, I64V, C67Y  
5760-09 5760-09 None    L10IV, T12TS, I62V, L63T, I64L, I72T, T74S, V77I, I93IL  
5935-10 5935-10 None    I15IV, R41K, L63AV, I72V, V77I  
6113-06 6113-06 None    E35D, N37NS, R41RK, L63P, H69Q  
8151-08 8151-08 None    T12P, L19I, L63T, C67D, A71V, V77I, I93L  
819-06 819-06 None    E35D, I62V, L63P, A71T, V77I, I93L  
8916-07 8916-07 None    K14KR, E35D, I62IV, L63PS, A71T, V77I, I93L  
DB_SI10311-03 SI10311-03 None    E35D, N37NS, R57K, L63P, I64V, H69HY  
DB_SI10858-04 SI10858-04 None    T12S, E35D, I62V, L63S, A71V, I93L  
DB_SI11518-04 SI11518-04 None    L63P, I64V, C67Y  
DB_SI1305-01 SI1305-01 None    N37S, L63A, I72V  
DB_SI1761-01 SI1761-01 None    L10I, I13V, G16E, E35D, N37S, L63C, I64V, K70R  
DB_SI18-04 SI18-04 None    T12I, K14R, I15V, E35D, N37S, R57K, L63A  
DB_SI1994-00 SI1994-00 None    I15V, E35D, M36I, N37D, L63A  
DB_SI2063-00 SI2063-00 None    L63P, I72M, V77I  
DB_SI2113-03 SI2113-03 None      
DB_SI2338-00 SI2338-00 None    I15V, M36I, N37D, L63T  
DB_SI3076-00 SI3076-00 None    I13V, L63P, I64V  
DB_SI3099-01 SI3099-01 None    K14R, E35D, N37E, Q61E, L63P, I93L  
DB_SI3418-01 SI3418-01 None    T12S, E35D, I62V, L63P, A71T, V77I, I93L  
DB_SI3458-02 SI3458-02 None   T74P L10I, N37S, I62V, L63T, I72T, V77I  
DB_SI3493-03 SI3493-03 None    L10I, I13V, I15V, E35D, M36I, R41K, L63P, H69K, L89M, T91I  
DB_SI376-02 SI376-02 None    L10V, I13V, K14R, G16E, L19LP, K20I, E35D, M36I, R41K, I64IL, H69K, L89M  
DB_SI378-02 SI378-02 None    I13V, K14R, G16E, K20I, E35D, M36I, R41K, I64L, H69K, K70R, L89M  
DB_SI4037-02 SI4037-02 None    I13V, I15V, E35D, M36I, R41K, H69K, V77I, L89M, I93L  
DB_SI4314-03 SI4314-03 None    T12S, E35D, I62V, L63P, A71T, V77I, I93L  
DB_SI444-01 SI444-01 None    L10LI, K43KR, R57RK, I62V, L63P, A71V, V77I, I93L G94GD 
DB_SI4688-03 SI4688-03 None    T12P, K14R, E35D, N37D, L63P, I93L, L97LI  
DB_SI4715-01 SI4715-01 None    E35ED, K45R, R57RK, Q61E, L63P, I64V, I93L  
DB_SI4736-03 SI4736-03 None    T12S, E35D, I62V, L63P, A71T, V77I, I93L  
DB_SI4993-02 SI4993-02 None    T12P, K14R, L63P, C67S, K70KR  
DB_SI5191-04 SI5191-04 None    I13V, K14R, K20R, M36I, N37S, R57K, I64V, K70R  
DB_SI5301-03 SI5301-03 None    I13V, Q18H, L19LV, E35D, L63P  
DB_SI5335-02 SI5335-02 None    I13V, L63P  
DB_SI5336-02 SI5336-02 None   T74TP L10I, N37NS, I62V, L63PT, I72IT, V77VI  
DB_SI548-03 SI548-03 None    R41RK  
DB_SI6145-02 SI6145-02 None    I3V, I13V, L63PT, I64M, H69K  
DB_SI6198-03 SI6198-03 None    I13IV, N37S, K43E, L63P  
DB_SI6422-02 SI6422-02 None    T12S, E35D, I62V, L63P, A71T, V77I, I93L  
DB_SI6423-02 SI6423-02 None    E35ED, N37CS, I62V, L63P, I72M, V77I  
DB_SI6424-02 SI6424-02 None    N37A, I62V, L63P, I72M, V77I  
DB_SI6439-02 SI6439-02 None    T12S, E35D, I62V, L63P, A71T, V77I, I93L  
DB_SI6515-04 SI6515-04 None    L19S, P39T, L63P, I72M, V77I, I85V  
DB_SI6663-03 SI6663-03 None    T12TS, E35ED, M36MI, I62V, L63P, I93L  
DB_SI6826-01 SI6826-01 None    T12S, E35D, I62V, L63P, A71V, I93L  
DB_SI7136-03 SI7136-03 None    N37S I93T 
DB_SI7655-04 SI7655-04 None    T12S, E35D, I62V, L63P, A71AV, V77VI, I93L  
DB_SI7918-02 SI7918-02 None    E35ED, N37D, L63P, I72IM, V77I, I93L  
DB_SI8213-02 SI8213-02 None    T12S, E35D, I62V, L63P, A71V, I93L  
DB_SI8421-02 SI8421-02 None    L10V, I13V, I15V, G16E, K20R, E35D, M36I, P39Q, R41K, K45R, R57K, L63T, E65D, L89M  
DB_SI8427-04 SI8427-04 None    L10I, I13V, K14R, K20IM, M36T, R41K, L63P, C67F, H69K, L89I, F99L  
DB_SI879-00 SI879-00 None    E35D, K45KR, R57K, I64L, H69HY  
DB_SI900-02 SI900-02 None    E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L  
DB_SI9180-04 SI9180-04 None    I13IV, K14R, I15IV  
pt1009 7162702707 None    L10I, I62V, L63AT  
pt1045 6957369518 None    T12P, E35D, I62V, L63P, A71T, V77I, I93L  
pt1074 6769579978 None    K14R, I15V, E35D, N37E, R57K, L63A, I93L  
pt1142 6315700286 None    L63P, V77I, I93L  
pt1237 5784172435 None    K14R, V77VI  
pt1293 5439372363 None    R41K, L63P, I72M, V77I, I85V  
pt1303 5383101971 None    R41K, I93L  
pt1315 5314345068 None    L10I, V11I, L63P, I93L  
pt1347 5133450941 None    I62IV, I93L  
pt1450 4558440144 None    L10I, V77I, F99L  
pt1471 4464641873 None    T12TS, E35D, I62V, L63P, A71T, V77I, I93L  
pt1530 4093797321 None    L63V  
pt1591 3824337138 None    K14R, I15V, E35D, N37E, R57K, L63A, I93L  
pt1618 3640057927 None    E35D, N37E, R57K, I93L  
pt1706 3127279339 None    N37S, R41K, R57K, L63P, H69Q  
pt1814 2443409798 None    R41K  
pt1857 2115109319 None    L63P, V77I, I93L  
pt1867 2063487117 None    T12P, E35D, I62V, L63P, A71T, V77I, I93L  
pt2021 1214439289 None    L63V  
pt2090 774899151 None    K14R, I15V, E35D, N37E, R57K, L63A, I93L  
pt552 9629311501 None    L10I, V11I, L63P, I93L  
pt572 9526613047 None    T12A, K14R, I15V, R41K, L63P, C67Y, I93L  
pt582 9488643021 None    R41K, I93L  
pt613 9329543392 None    I15IV, M36L, N37D, I62V, L63P, I93L  
pt614 9317917952 None    L10I, V11I, L63P, I93L  
pt669 9013581209 None    I13V, N37S, I62V, I64V  
pt741 8694470308 None    T12N, K14R, R41RK, I64V  
pt967 7430279324 None    T12S, E35D, I62V, L63P, I64V, A71T, V77I, I93L  
pt985 7354679039 None    N37S, R41K, L63A, E65D  
pt991 7324703900 None    I15IV, E35ED, K43KR, I62V, L63P, I93IL