Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Little (2014)
Title Using HIV networks to inform real time prevention interventions.
Citation PLoS ONE
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 648
NumPts 648
Subtype B, C, CRF02_AG, CRF01_AE, G


  Page 1 of 7    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 648 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
SD_PIRC_10693 SD_PIRC_10693 None None   R83K, K122E, D123E, S162A, D177E, T200I, R211G, V245K, A272P, K277R, K281R, I293V  
SD_PIRC_11524 SD_PIRC_11524 None None   R83K, K122E, D123N, D177E, I178M, Q207R, V245E, A272P, V276I, T286A, I293V  
SD_PIRC_12805 SD_PIRC_12805 None None   V90I, I135T, S162A, D177N, T200E, R211K, V245I, G262GE, K277R, T286P, I293V, E297K  
SD_PIRC_12847 SD_PIRC_12847 None None   V35I, R83K, K104R, K122E, N147K, A158S, K166N, E169D, D186DN, D192DN, Q197E, I202V, E204EK, E233EK, V245E, D250DN M164MV, W229W*, W239W*, W252W*, W266W* 
SD_PIRC_1408 SD_PIRC_1408 None None   K20R, K122E, S162C, D177E, Q207K, R211K, E248D, D250N, A272S, T286A, I293V, E297A  
SD_PIRC_15859 SD_PIRC_15859 None None   K20R, R83RG, A98S, D123E, I135IT, S162A, D177E, V189A, T200A, Q207R, R211K, A272P, K277KR, P294T  
SD_PIRC_16384 SD_PIRC_16384 None None  K103N V60I, I135V, T200A, Q207E, V245M, K277R, P294Q R284RS 
SD_PIRC_16522 SD_PIRC_16522 None None   V35VI, D86E, D123DE, F171Y, G196E, I202V, R211K, V245D, A272P, T286A, V292VI, I293V, E297R  
SD_PIRC_1720 SD_PIRC_1720 None None   E53D, T69S, D121H, K122E, I135T, T200A, R211RK, V245K, K277R, I293V Y271YS 
SD_PIRC_18178 SD_PIRC_18178 None None  E138A K11KR, T39TI, R83K, K122KR, D123E, S162A, D177E, I180V, I195L, T200A, F214L, A272AS, V276VI, K281KR, R284K, T286TA, A288S, I293V  
SD_PIRC_18283 SD_PIRC_18283 None None   V35I, I135T, F214L, E248D  
SD_PIRC_18754 SD_PIRC_18754 None None D67N, T215S, K219E  A98S, K102Q, K104R, Q197H, T200G, R211K, V245E, K249R, A272P, K277R, I293V, E297G R284RS 
SD_PIRC_20716 SD_PIRC_20716 None None   V35VI, I135L, K154KR, S162C, T200A, V245Q, K277R, T286A, A288S, V292I, I293V  
SD_PIRC_21838 SD_PIRC_21838 None None   K104R, I135V, K173E, D177E, V245T, D250E, A272P, T286A, I293V  
SD_PIRC_2227 SD_PIRC_2227 None None   V35I, R83K, D123E, N175H, G196E, T200L, K277R, A288S, I293V, P294T, E297R  
SD_PIRC_24796 SD_PIRC_24796 None None   K20R, V60VI, D123E, S162C, R211RK, V245Q, A272P, K277R, T286P, I293V  
SD_PIRC_28018 SD_PIRC_28018 None None   V35M, K64R, D123E, S162A, D177E, I195L, T200A, R211K, F214L, K281R, R284K, T286A, E297K  
SD_PIRC_28951 SD_PIRC_28951 None None   S68G, K104KR, D123E, K166KR, K173E, G196GE, T200TA, E203D, R211EKQ, A288AT, E291ED, I293V, E297A  
SD_PIRC_29344 SD_PIRC_29344 None None   K66KR, R83K, D123E, I135T, S162A, T200I, R211K, F214L, A272P, E297A  
SD_PIRC_29485 SD_PIRC_29485 None None   K122E, E203D, Q207A, R211K, V245K, V276I, A288S, P294T  
SD_PIRC_29938 SD_PIRC_29938 None None   D123E, S162C, D177E, T286A, I293V, P294S  
SD_PIRC_3010 SD_PIRC_3010 None None   V35I, T39TA, S48T, R83RK, K102KR, E169D, D177DN, K238R, P243H, V245E, E248D, A272PS, K277KR, K281R, T286TA, I293V, E297K  
SD_PIRC_30625 SD_PIRC_30625 None None   V35I, I135L, S162C, T200A, V245Q, K277R, T286A, A288S, V292I, I293V  
SD_PIRC_30673 SD_PIRC_30673 None None   E6ED, K11KR, T39TA, P55PS, V60VI, K64KR, R83RK, D123E, I167IV, T200I, K277KR, T286TA, A288AS, I293IV, P294PH  
SD_PIRC_3097 SD_PIRC_3097 None None   V35I, D123E, D177E, T200E, Q207E, R211K, F214L, V245T, S251X, I293V, E297KR  
SD_PIRC_31015 SD_PIRC_31015 None None  E138A V35T, A98S, K122E, G196E, T200A, E248X, S251H, E291D, V292VI, P294T, E297A, A304E  
SD_PIRC_31774 SD_PIRC_31774 None None   I50V, I135T, D177E, I178M, R211K, A272P, K277KR, T286A, E297K  
SD_PIRC_31891 SD_PIRC_31891 None None  E138A A98S, K122E, D123G, I178M, V179I, D250E, S251D, A272P, P294S  
SD_PIRC_33127 SD_PIRC_33127 None None   I135IV, S162C, N175HY, I178IL, G196E, T200A, K201KT, V245VE, A272P, K277R, T286TA, I293V, A304AE  
SD_PIRC_33697 SD_PIRC_33697 None None   K20R, V60I, R83K, K122E, D123E, Q174H, D177N, G196E, R211K, V245E, E248D, T286A, E297K  
SD_PIRC_34468 SD_PIRC_34468 None None   R83RK, K104KR, K122KE, I135IV, S162SC, E169ED, P176PQ, V189VI, T200A, I202IV, R211K, A272PS, K277KR, Q278QE, E297AT R284RS 
SD_PIRC_35461 SD_PIRC_35461 None None  K238KN K13KR, V35L, R83K, K122E, D123G, G196E, R211K, I293V  
SD_PIRC_36796 SD_PIRC_36796 None None  K103N I5V, V60I, I135V, T200A, Q207E, V245M, K277R, P294Q R284RS 
SD_PIRC_41662 SD_PIRC_41662 None None   I135T, Q207A, R211K, V245K, E248D, D250E, A272P, K277KR, T286A, I293V, E297K  
SD_PIRC_42970 SD_PIRC_42970 None None T215D  K122KR, D123DE, I135L, I142IMT, S162C, R211K, I244V, V245T, K277R, T286A  
SD_PIRC_44023 SD_PIRC_44023 None None   V35I, I135R, S162C, T200I, R211K, V245L, D250E, S251V, A272G, T286P, A288S, I293V, E297K  
SD_PIRC_45175 SD_PIRC_45175 None None   K49R, I50V, R83K, T165I, E169D, K238R, P243H, V245E, E248D, A272S, K281R, T286A, I293V, E297K  
SD_PIRC_46144 SD_PIRC_46144 None None   V35IM, K102Q, I178IM, T200A, E204D, R211K, D250E, A272P, I293V, E297K  
SD_PIRC_46486 SD_PIRC_46486 None None   S105SL, I135T, K166KR, T200I, R211K, F214L, Y271YF, A272AT, K277KR, I293V, E297M  
SD_PIRC_46540 SD_PIRC_46540 None None   R83K, T165I, I202V, E248D, I257L, A272P, K277R, I293V  
SD_PIRC_46873 SD_PIRC_46873 None None  K103N, Y181C, H221Y E6D, V35M, T39A, S68T, T69S, K122E, I135L, A158S, V179I, E194D, T200A, R211K, V245M, A272P, K277R, R284K, T286A, I293V  
SD_PIRC_46912 SD_PIRC_46912 None None   E6D, K49R, R83K, V90I, S162D, K166R, R211K, K249N, A272P, V276VI, K277KR E248EG 
SD_PIRC_4726 SD_PIRC_4726 None None   A98S, I178M, E204Q, R211K, T286A, I293V, E297T  
SD_PIRC_48007 SD_PIRC_48007 None None  K103N V35I, R83K, V90I, S162G, V245E, T286A, V292I, I293V, E297K  
SD_PIRC_48754 SD_PIRC_48754 None None M41L  V60I, K122P, I135T, T165TI, E169D, K173R, D177E, V189VI, T200I, K223KR, A272P, K277R, I293IV  
SD_PIRC_49498 SD_PIRC_49498 None None  V108I I37IL, D123E, D177E, I178M, T200I, Q207H, R211K, T286A L26LS 
SD_PIRC_49804 SD_PIRC_49804 None None   E40EG, K122KE, I135M, T200I, R211K, V245E, A272P, K275Q, V276I, L283I, V292I, I293V A267S 
SD_PIRC_49813 SD_PIRC_49813 None None   K20R, S162C, K173Q, Q207E, R211K, V245VG, A272P, K277R, K281R, P294Q, A304E R284RS 
SD_PIRC_50692 SD_PIRC_50692 None None   R83K, K122Q, D177E, V245K, E248D, A272P, K281R, P294PS  
SD_PIRC_51742 SD_PIRC_51742 None None   V35M, R83K, S162C, T200A, K249KR  
SD_PIRC_51793 SD_PIRC_51793 None None   K122E, D123E, I135T, S162C, D177E, E248D, A272P, K277R  
SD_PIRC_55444 SD_PIRC_55444 None None M41L, T215D  V60I, R83K, K122E, T200A, I202V, Q207H, V245E, A272P, I293V  
SD_PIRC_5554 SD_PIRC_5554 None None   A98S, D123E, I135T, S162A, D177E, V189A, T200A, Q207R, R211K, A272P, K277R, P294T  
SD_PIRC_56635 SD_PIRC_56635 None None   L34LI, R83K, D121H, K122E, K166R, T200A, I202V, L210X, R211K, A272P, I293V  
SD_PIRC_56851 SD_PIRC_56851 None None   E6DN, V35I, S48T, A98S, I135V, T200I, Q207K, R211K, V245M, D250E, V292I, I293V Y115YH 
SD_PIRC_58726 SD_PIRC_58726 None None   K32R, Q174H, I202V, Q207E, R211K, V245K, K249Q, A272P, G273GR, K277KR, I293V, E297T R284RS 
SD_PIRC_58744 SD_PIRC_58744 None None   V35VI, R83K, K103R, K122E, D123X, I178M, T200TA, R211RK, V245E, L283LI, I293V  
SD_PIRC_59653 SD_PIRC_59653 None None   E6D, K82R, R83K, S162C, Q174R, I178L, T200A, V245Q, T286A, V292I  
SD_PIRC_60748 SD_PIRC_60748 None None   D123E, T139TAS, I142AT, S162C, R211K, A272P, K277R, T286A, I293V, E297R, L301I  
SD_PIRC_60988 SD_PIRC_60988 None None   E6D, V8VI, E53ED, K102KR, K122PT, K166KR, F171FY, D177E, T200I, R211K, F214L, V241VI, V245VI, A272P, L283I, A288AT, I293V, P294PH  
SD_PIRC_63427 SD_PIRC_63427 None None  K103N R83K, S162H, E169D, Q207R, R211E, D250E, A272P, I293V  
SD_PIRC_65677 SD_PIRC_65677 None None  E138A D123E, S162C, Q207S, R211K, I293V, P294T W24WL 
SD_PIRC_67129 SD_PIRC_67129 None None M41L, V75I, T215FL, K219E Y188L V35M, T39A, E40A, E79D, R83K, K102KQ, V118I, D121H, K122E, T139TA, T165TI, D177E, F214L, V245K, L283I, R284K, I293V  
SD_PIRC_68308 SD_PIRC_68308 None None  E138A V35VIL, T39TA, A98S, K122E, D123DG, Q174H, V179I, T200TA, Q207E, R211RK, D250E, S251D, A272P, P294PT  
SD_PIRC_70180 SD_PIRC_70180 None None T215C  K20R, S68G, K103R, D123E, I142M, D177E, R211K, F214L, V245E, K249R, A272P, K277T, T286A, P294PS, E297K I293IT 
SD_PIRC_70234 SD_PIRC_70234 None None   V35I, I135L, S162C, T200A, V245Q, K277R, T286A, A288S, V292I, I293V  
SD_PIRC_71344 SD_PIRC_71344 None None   D121H, K122E, I135IT, I178L, I202IV, Q207QE, F214L, T286A, A288S  
SD_PIRC_74056 SD_PIRC_74056 None None  M230MI V35I, K122R, D123E, I135L, S162C, D177E, T200A, W212WR, V245Q, A272P, G273GR, V276VI, K277KR, T286A, A288S, V292I, I293V  
SD_PIRC_74776 SD_PIRC_74776 None None   K122E, D123N, E194D, T200A, K238R, I293V  
SD_PIRC_7591 SD_PIRC_7591 None None M41L V179E V21I, K32R, V35T, E36ED, T39L, V60I, E79D, I135V, K173KT, D177E, T200A, R211S, V245Q, D250E, S251D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A  
SD_PIRC_76360 SD_PIRC_76360 None None   E40EG, V60I, R83K, V90I, D123E, S162Y, D177E, V179I, T200A, W212WR, K223KR, A272P, I293V D86DG 
SD_PIRC_77326 SD_PIRC_77326 None None  K103N R83K, S162H, E169D, Q207R, R211E, D250E, Y271YH, A272P, V276VI  
SD_PIRC_78298 SD_PIRC_78298 None None   V35T, E36EA, T39E, A158S, K173AT, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, S251G, A272P, K277KR, T286A, E291D, V292I, I293V, P294AT  
SD_PIRC_78445 SD_PIRC_78445 None None   D121Y, K122E, S162C, D177E, R211K R284RS 
SD_PIRC_78919 SD_PIRC_78919 None None   K11R, R83K, K104R, Q174K, T200I, I202V, R211K, V245E, R284K, T286A  
SD_PIRC_79216 SD_PIRC_79216 None None   V35T, E36A, T39E, K122E, D123G, A158S, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, S251G, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
SD_PIRC_80230 SD_PIRC_80230 None None   K20R, V35I, K43KR, K103R, K122E, I135T, T139I, F171Y, G196E, T200I, F214L, V245M, E248D, D250E, A272P, I293V, E297T, A304AV  
SD_PIRC_81439 SD_PIRC_81439 None None   K122E, I135T, S162C, G196E, T200I, A272P, K277R, I293V, E297K  
SD_PIRC_83761 SD_PIRC_83761 None None   K20R, V35X, I135IV, S162SC, K173KR, D177DE, G196GE, Q207QK, R211X, V245K, A272PS, Q278H, T286A, A288S, E297T  
SD_PIRC_85312 SD_PIRC_85312 None None   G196E, T200I, I202V, V245I, S251C, V276I, I293V  
SD_PIRC_85384 SD_PIRC_85384 None None   E6D, A98S, D123E, R211K, R284K, T286A, T296S, E297K  
SD_PIRC_89368 SD_PIRC_89368 None None  K103N R83K, D123E, T200A, I202V, Q207K, R211K, V245I, E248D, A272P, K277R, E291D  
SD_PIRC_89935 SD_PIRC_89935 None None  K103N K20R, V35I, V118I, I135T, N137S, T165I, Q207N, R211K, F214L, K277R, T286A, I293V  
SD_PIRC_90025 SD_PIRC_90025 None None   K64R, K103R, K122E, D123G, I135T, K166Q, V189I, F214L, V245M, A272P, K277R  
SD_PIRC_92578 SD_PIRC_92578 None None M41L, D67N, T69D, L74LV, M184V, L210W, T215Y A98G, K103N T39E, V60I, K101KQ, K122E, D123N, I142V, T200A, R211K, V245M, D250E, A272P, K275KR, T286A, E297K  
SD_PIRC_9295 SD_PIRC_9295 None None   V35I, R83K, K122P, I135T, I178M, Q207QR, R211RS, K277R, V292VI, I293V  
SD_PIRC_9343 SD_PIRC_9343 None None   K20R, S162A, V189VA, I202V, A272P, V292I, I293V  
SD_PIRC_94129 SD_PIRC_94129 None None   K32R, I202V, Q207E, R211K, V245K, K249Q, A272P, T286A, I293V, E297T  
SD_PIRC_95056 SD_PIRC_95056 None None   V35I, R83K, K122E, D123N, D177E, D192N, T200A, R211K, A272P, T286A, I293V, E297A  
SD_PIRC_95218 SD_PIRC_95218 None None   R83K, S162C, S163T, Q207E, K277R, E291D, E297A  
SD_PIRC_95497 SD_PIRC_95497 None None   K11KR, D123E, D177DE, I178ILM, R211K, A272P, E291D  
SD_PIRC_95899 SD_PIRC_95899 None None M41L, D67N, T215Y K101P, K103N K20R, T39A, V60I, I202V, R211K, A272P, A288S  
SD_PIRC_96130 SD_PIRC_96130 None None T215D  R83K, K122KE, I135L, E169D, I195L, G196E, T200A, I202V, R211K, K277R, R284K, T286A, E297K  
SD_PIRC_96259 SD_PIRC_96259 None None   I135V, S162C, R211K  
SD_PIRC_9775 SD_PIRC_9775 None None   V60VI, I135V, I159V, D177E, R211K, I244V, V245VI, D250E, A272P, K277R, I293V, E297A  
SD_PIRC_9802 SD_PIRC_9802 None None   K122E, I135IRT, Q207E, R211K, F214L, T286A, I293V  
SD_PIRC_98056 SD_PIRC_98056 None None   A98S, K101Q, K104R, S162C, K173R, Q174K, Q207E, R211K, V245E, A272P, V276VI, K277R, A288S, I293V  
SD_PIRC_9934 SD_PIRC_9934 None None  E138A K20R, A98S, D123E, I135T, S162C, V245T, K277R, T286A, I293V, P294S  
SD_PIRC_99742 SD_PIRC_99742 None None   V35I, S48T, K49R, I50V, R83K, T165I, E169D, K238R, P243H, V245E, E248D, A272S, K281R, T286A, I293V, E297K  
SD_PIRC_99859 SD_PIRC_99859 None None   V60I, R83K, K173KQ, Q197QE, T200TA, R211RK, A272AV, T286TA, I293IV