Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Aulicino (2019)
Title Pre-treatment drug resistance and HIV-1 subtypes in infants from Argentina with and without exposure to antiretroviral drugs for prevention of mother-to-child transmission.
Citation J Antimicrob Chemother
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 115
NumPts 115
Subtype CRF12_BF, B, CRF38_BF, CRF17_BF, C, A, CRF29_BF, CRF28_BF, G

 

  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 115 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
L992GS L992GS None None   S3X, V21X, V35T, T39M, K102Q, E169G, Q207E K20KN, L34K, A62E, I63K, G93G*R 
LP103815 LP103815 None None   V60I, K102R, I135L, K166R, K173E, T200K  
LP105152 LP105152 None None M184V  S48T, K49R, V60I, K122E, I135M, T200A, E204D, Q207E  
LP106430 LP106430 None None M184V K103N, H221Y V90I, K101R, I135V, S162C, T200A, E204D  
LP110501 LP110501 None None   I178L, R211K  
LP111832 LP111832 None None   K49R, K122E, D123E, S162C, Q207G, R211K  
LP114348 LP114348 None None  K103N S48T, I135R, S162A, T200A, Q207E  
LP114460 LP114460 None None  V179D V60I, D123E, I135V, R211K, F214L  
LP116508 LP116508 None None   K64R, I135V, S191T, L210F  
LP116643 LP116643 None None   D123E, I135T, T165I, D177E, V189I, T200A, I202V, F214L  
LP116889 LP116889 None None   T39A, I47N, R83K, D123E, D177E, G196R, T200I  
LP117498 LP117498 None None  K101E, G190A D123E, S162C, L210S  
LP118230 LP118230 None None  K103N T39L, V60I, I135IV, T200M, Q207E  
LP118497 LP118497 None None  K103N E44D, V60I, V118I, D123E, I178V, G196E, R211Q, F214L  
LP123197 LP123197 None None   V60I, D123N, I135T, T200I  
LP124286_799 LP124286_799 None None M184MV  K49R, V60I, K122E, I142V, Q207K, R211A  
LP74462 LP74462 None None M184V  D123E, I135T, I142V, R211K  
LP83229 LP83229 None None   T39A, S105A, I135V, K173R, Q174K, Q207E  
LP84635 LP84635 None None   T39K, E40D, V60I, P140PT, I142V, Q207A T139TKN, S156SL 
LP85677 LP85677 None None   C38CS, K122E, Q151QKR, P176PQ, T200E, Q207K, R211T P150PHQ, G152GR, W153WL 
LP86672 LP86672 None None  V106I D123E, I142V, D177E  
LP87817 LP87817 None None   W88C, K122E, I135IT, I178L, Q207K, R211Q, F214L P140Q 
LP92074 LP92074 None None   V60I, I135V, Q197K P140PQ 
LP93574 LP93574 None None   T39A, V60I, R83K, D123E, I142V, G196E, Q197QK, T200I, R211RT  
LP94522 LP94522 None None     
LP97027 LP97027 None None   W88C, K122E, I135C, T200A, E204A, R211K, F214L  
M132SV M132SV None None   V35M, T39A, K64KR, K102R, K103KR, K104KR, I135V, K173KQ  
M244MBM M244MBM None None   T39A, D123E, I135T, P176S, D177E, Q197E, T200A, I202V, R211K, F214L  
M6141bisCHR M6141bisCHR None None   V35T, I135V, D177E, R211Q  
M793GEM M793GEM None None   V35T, T39R, E40D, K122E, D123N, P176Q, T200A, R211S  
M953QAL M953QAL None None   E6D, V35E, D177E, T200A, I202V, E204K, Q207E  
M976RLA M976RLA None None   A98S, D123E, T200V  
MU186828 MU186828 None None  E138A R83K, D123E, S162Y, I202V, F214L  
MU192275 MU192275 None None   V60I, I135V, I142V, I178L, L210F  
MU193619 MU193619 None None   S68G, I135V, S163T, T200I, R211K  
MU194732 MU194732 None None   S48T, V60I, T200A, Q207E, R211K  
MU195534 MU195534 None None M41L, L210W, T215D K103N S48T, V60I, K122E, I142V, S162C, R211K  
MU203563 MU203563 None None   D123E, I135L, T139A, D177E, T200A, Q207E  
MU209290 MU209290 None None   V60I, D123E, S162C, D177E, Q197K, Q207E  
MU221259 MU221259 None None   K49R, K122E, I135M, K173N, Q174K, G196E  
MU224344 MU224344 None None   I135M, S162A, K166R, I178M  
MU225908 MU225908 None None  V106I I135T, Q207E, R211K, F214L  
MU228508 MU228508 None None  K103N T39L, V60I, K102KR, K104KR, K122E, D123N, I135V, D177E  
MU230935 MU230935 None None   D123E, I135V, Q197K, T200S  
MU261670 MU261670 None None   T39N, I135V, S162C, R211RG  
MU263168 MU263168 None None  V106I K49R, V118I, D123E, I135T, S162C, Q207E, R211K, F214L  
MU263345 MU263345 None None   D123E, I135V, D177E, R211K  
MU267300 MU267300 None None   E53D, I135L, S162Y, K173E, T200A  
MU280501 MU280501 None None   V60I, K122E, D123S, I135T, E169D, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, E203D, Q207A, R211S  
MU287355 MU287355 None None M41L, K70N, L74I, V75T, M184V, T215Y Y181C, G190A, H221Y E44D, S68G, K122E, D123E, V179I, G196K, L210F  
MU299710 MU299710 None None   T39L, V60I, T139K, D177N, V179I, I202V, Q207E, F214L  
MU300305 MU300305 None None   T39M, S48T, D123E, Q207N, H208Y, R211K  
MU310101 MU310101 None None   S68G, K122E, P176Q, I178L, V179I, T200A  
MU310160 MU310160 None None   R83K, V118I, D123E, T139K, R143RK, Q207E, F214L, E224G  
MU318132 MU318132 None None T215I K103N I135T, T200A, Q207N, F214L  
MU324986 MU324986 None None   K122P, D123E, I178V, Q197P, T200E, Q207R, R211K  
MU337475 MU337475 None None   D123E, I135T, K173E, I178M, G196E, Q197K, T200S  
MU347582 MU347582 None None   K173Q, I178L, T200A, E204Q, Q207E, F214L  
MU349932 MU349932 None None  K103N K49R, V60I, K122E, T200A, Q207N  
MU350483 MU350483 None None   D123E, R211K  
MU357016 MU357016 None None  Y181YC D123E, I135T, S162C, D177E, G196E, T200I  
MU362506 MU362506 None None   D123E, I135T, A158T, I178M, G196E, Q207E, R211K  
MU382176 MU382176 None None   E40D, V60I, K122E, I135L, Q174K, G196E, Q207K, R211A  
MU_SAAN MU_SAAN None None   K122E, I135T, I142T, T200M, K201I, I202V  
N36HAP N36HAP None None   D123E, I135R, I178M, G196A, Q207N, R211K  
N636GLL N636GLL None None   V8I, V35T, T39L, W88C, I142V, R211G, F214L  
N653LM N653LM None None   V35T, K49R, R211Q  
N654AMD N654AMD None None   V35T, T39L, D123E, I135V, Q197P, T200E, L210F  
N693ARA N693ARA None None   V35T, T39R, E40D, S162Y, T200S, E204D  
N698RLJ N698RLJ None None A62V  V35T, T39A, V90I, D121A, K122E, D123DN, I135V, S162C, T200A, R211K  
N741RAL N741RAL None None M184I V106I, Y181C I135V, S162C, F214L  
O14PRA O14PRA None None   V8I, V35S, V60I, A98S, K122E, Q207R, R211K  
O196AD O196AD None None   K32E, V35L, D123E, I135R, K173E  
O319TTL O319TTL None None   V35T, V60I, K122E, I135L, I142V, H198P R206T 
O525FEJ O525FEJ None None   K32R, R211K  
O532AC O532AC None None   V35I, V60I, E79X, I135L  
O541AMM O541AMM None None   K20R, K49R, A98S, E169D, F214L  
O672SP O672SP None None   V35I, V60I, K104R, I135V, I142T  
P260DRD P260DRD None None  K103N E6K, F87L, K122E, I135M, I202V, L210F, R211K  
P470GMR P470GMR None None  V106I, E138A V60I, I135T, T165I, I195T, G196E, Q197K, T200A, I202V  
P529FM P529FM None None   K122E, I135T, I195T, Q197K, T200Q, I202V, Q207T, R211K  
P536AG P536AG None None   E6D, V35I, K49R, V60I, R83K, D123E, I135K, T139Q, S162A, E169D, I178M, E194EK, T200E, Q207E  
R268RU R268RU None None   V35T, T39L, K101Q, D123E, I135K, K166R  
R8LUM_ R8LUM_ None None T215N K103S, Y188L K49R, E53D, K101Q, K122E, D123N, I135K, S162A, E169D, I202V  
R983OBM R983OBM None None  K103N V35T, V60I, K122E, D123E, I135V, I142V, I178M  
S483PMA S483PMA None None   V35T, E53D, V60I, I135L, Q174QK, I180V, T200A  
T281DE T281DE None None M184V K103N, V106I, G190A K101R, T200A, L210F  
T805GST T805GST None None   V35T, T39M, V60I, I135V, K173E, T200A  
U129GM U129GM None None  G190A V35I, I142V, D177N, I180V, T200A, R211K  
U134SS U134SS None None   E6D, K11R, I135T, K173Q, T200I, I202V  
U308EP U308EP None None  K103N V35T, T39M, E40D, S68G, K102N, D123E, I135T, I178L, I195IK, I202V, E204D, Q207K, R211S  
U393BC U393BC None None   V35T, T39M, V60I, D121H, K122Q, I135T, I142V, S162Y, T200A, E203D  
U864ABF U864ABF None None   K20R, V35T, T39A, V60I, K104R, K122E, D123S, I135L, K166R, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207S, R211K  
U877PEC U877PEC None None   V35T, T39S, S68G, D123E, D177N, I178M, G196E, R211G  
V099SG V099SG None None  K103KN, V106I K20KR, I135V, K173N, R211Q, F214L  
V263PG V263PG None None   V35T, K122E, I135V, I142V, K166R, R211K  
V304BV V304BV None None   V35T, E36A, T39E, K43R, S48T, V60I, K102KR, K122E, D123G, I142V, A158S, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K  
V349AU V349AU None None   V35T, V60I, K104R, K122E, D123S, I135T, E169D, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A  
V783ME V783ME None None   K11R, V35I, V118I, K122E, I135C, I142L, T200I, E204A, R211K, F214L  
X546PG X546PG None None M184V  K13R, V35T, K122E, I135V, I142V, K166R, R211K