Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Hernandez-Sanchez (2018)
Title Prevalence of Drug Resistance Mutations in Protease, Reverse Transcriptase, and Integrase Genes of North Central Mexico HIV Isolates.
Citation ARHR
SelectedGene PR
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 51
NumPts 51
Subtype B, CRF02_AG

 

Clinical PR Isolates


SubjectIsolatePIsWksPIMajorPIMinorCommonUnusual
MX-HIV-0422 MX-HIV-0422 None    I13V, K43*, G48R, I62V, L63P, A71T, V77I  
MX-HIV-050 MX-HIV-050 None    T12A, E35D, N37H, R41K, K43R, I62V, L63P, V77I  
MX-HIV-057 MX-HIV-057 None    L10I, I13V, M36I, N37D, L63P, K70R, I93L  
MX-HIV-066 MX-HIV-066 None    T12P, E35D, M36I, N37D, R57K, L63P, C67Y, A71T, I72V, I93L  
MX-HIV-071 MX-HIV-071 None  L90M  I13V, R41K, I62V, L63S, I64M, A71V, I72T, I93L  
MX-HIV-086 MX-HIV-086 None    I13V, I62V, L63P, A71T, V77I  
MX-HIV-110 MX-HIV-110 None    L10V, R41K, K45R, Q61L, I62L, L63P, I93L  
MX-HIV-125 MX-HIV-125 None    T12P, K14R, G16E, E35D, R57K, L63P, I64V, I72V, V77I, I93L  
MX-HIV-160 MX-HIV-160 None    I15V, R41K, L63A, I72V, V77I, V82I  
MX-HIV-172 MX-HIV-172 None    T12I, R41K, I62V  
MX-HIV-207 MX-HIV-207 None    T12E, E35D, R57K, L63P, H69Y, I72V, V77I, I93L  
MX-HIV-210 MX-HIV-210 None    L10I, I13V, K20R, L33V, N37D, R41K, K45R, R57K, L63Q, I64V, I93L  
MX-HIV-230 MX-HIV-230 None   G73S I15V, G17R, E35D, M36I, N37E, G40E, W42*, G48R, I62V, L63P, I64L, G78R, V82I, I93L G16K, G27E, G49R, G51R, G52S, G68R, G86R 
MX-HIV-296 MX-HIV-296 None    I13V, M36I, N37D, R41RK, R57K, L63A, A71V, I93L  
MX-HIV-313 MX-HIV-313 None    R41K, I62V, L63AP, I64IL, V77I, I93L  
MX-HIV-324 MX-HIV-324 None    T12P, I13V, R41K, L63P, V77I, I93L  
MX-HIV-327 MX-HIV-327 None    I15V, N37T, P39S, I62V, L63P, I72V  
MX-HIV-350 MX-HIV-350PR None    T12A, K14R, E35D, N37D, R41K, D60E, L63P, I93L  
MX-HIV-352 MX-HIV-352 None    I13V, I15V, E35D, I64V, V77I  
MX-HIV-354 MX-HIV-354 None    I13V, I62V, L63P, V77I, T91V, I93L  
MX-HIV-355 MX-HIV-355 None    I15V, E35D, N37E, V77I, I93L  
MX-HIV-370 MX-HIV-370 None    L10I, T12P, K14R, E35D, N37E, R57K, D60E, L63P, C67S, I93L  
MX-HIV-376 MX-HIV-376 None    T12TA, E35D, R41K, L63S, K70R, A71V, I93L  
MX-HIV-381 MX-HIV-381 None    T12S, L19I, G48R, I62V, L63N, A71T, V77I, I93L  
MX-HIV-384 MX-HIV-384 None    T12P, L19I, E35D, N37Q, R41K, K45R, L63P, E65D, I93L K70S 
MX-HIV-385 MX-HIV-385 None    L19T, T91V, I93L  
MX-HIV-390 MX-HIV-390 None    L19I, R41K, R57K, L63P, V77I, I93L  
MX-HIV-395 MX-HIV-395 None    I13V, I15V, E35D, I64V, V77I  
MX-HIV-398 MX-HIV-398 None    L10I, L63H, K70T, I93L  
MX-HIV-399 MX-HIV-399 None    E35D, M36I, R41K, L63P, K70R, I93L  
MX-HIV-401 MX-HIV-401 None    I15V, E35ED, N37S, R41K, L63V, K70R, V77VI  
MX-HIV-433 MX-HIV-433 None    R8RQ, L10I, L63H, K70T, I93L  
MX-HIV-439 MX-HIV-439 None    L19V, R41K, R57K, L63A, A71T, I72V, V77I, I93L  
MX-HIV-450 MX-HIV-450 None    I13V, M36I, R41K, K45KR, I62V, L63S, T91V, I93L  
MX-HIV-459 MX-HIV-459 None    I13V, N37T, R41RK, I62T, L63P, I64M, A71V, I93L  
MX-HIV-460 MX-HIV-460 None    L10I, I13V, L19I, K20I, M36I, N37D, R41K, H69K, K70R, I72M, V82I, L89M, F99L  
MX-HIV-463 MX-HIV-463 None  M46L  T4P, I15V, M36I, L63P, K70KR, V75VI, I93L  
MX-HIV-464 MX-HIV-464 None    T12TK, L19I, V77VI, T91V, I93L  
MX-HIV-469 MX-HIV-469 None    E35D, M36L, R41K, L63P, H69Y, I72T  
MX-HIV-470 MX-HIV-470 None    T12A, I13V, E35D, K45R, R57K, L63S, I64V, A71V, V77I, I93L  
MX-HIV-473 MX-HIV-473 None    K14R, R41K, L63T, H69Y, I72T, V77I  
MX-HIV-474 MX-HIV-474 None    T12I, N37DE, R57K, I62V, L63P, I64L, V77I, I93L  
MX-HIV-476 MX-HIV-476 None    I13V, L19T, K20R, M36I, I62V, L63P, I72V  
MX-HIV-494 MX-HIV-494 None    L19V, R57K, L63A, A71T, I72M, V77I, I93L  
MX-HIV-527 MX-HIV-527 None    T12TA, N37S, K45R, R57K, L63P, I72EV, V77I, I93L  
MX-HIV-540 MX-HIV-540 None    L10I, T12TA, I13V, E35D, M36I, N37D, R57K, L63T, I64V, E65D, I72T  
MX-HIV-542 MX-HIV-542 None    T12N, E35D, N37S, R41K, R57K, L63P, A71T, V77I  
MX-HIV-545 MX-HIV-545 None    L10I, G16E, L63H, K70T, I93L  
MX-HIV-546 MX-HIV-546 None    M36L, I62V, L63P, H69X  
MX-HIV-553 MX-HIV-553 None    I13V, K14R, I15V, L19I, N37D, L63P  
MX-HIV-554 MX-HIV-554 None    N37S, I62V, L63T, I64V, H69Y, I72V