Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Soria (2019)
Title Pretreatment HIV Drug Resistance and Virologic Outcomes to First-Line Antiretroviral Therapy in Peru.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 122
NumPts 122
Subtype B, CRF12_BF, CRF69_01B, CRF17_BF

 
  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 122 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
TR1001_SFK22_23 TR1001_SFK22_23 None None   K49R, I50V, V60I, S68G, I135IV, R211K  
TR1002_SFA63 TR1002_SFA63 None None   K102Q, S162C, T200A, R211K  
TR1003_SFA64_65 TR1003_SFA64_65 None None   T39A, I50V, S68G, K122E, I135R, R211K  
TR1004_SFK24 TR1004_SFK24 None None   K64KR, K102KQ, I135IT, S162C, R211K  
TR1005_SFA69_SFK25 TR1005_SFA69_SFK25 None None  V106VI K64KR, K122KE, I135T, Q174H, R211K, F214FL  
TR1006_SFA70 TR1006_SFA70 None None   V60I, K102Q, K103R, I178M, V179VI, Q207E, R211K  
TR1007_SFA72 TR1007_SFA72 None None   K103R, D123E, I178M, Q207EG, R211K, F214FL  
TR1008_SFA73 TR1008_SFA73 None None   K32R, D177DN, G196E  
TR1009_SFA74_75 TR1009_SFA74_75 None None   V35I, V60I, K122P, I135R, I142IV, F171Y, Q197R, T200E, Q207E, R211RK  
TR1011_SFA78 TR1011_SFA78 None None   K103R, K173N, D177E, I178M, E194D, I195L, G196K, Q197E, T200I, R211K  
TR1012_SFA79 TR1012_SFA79 None None   D123E, I142IT, G196E, T200I, F214L  
TR1013_SFA80 TR1013_SFA80 None None  G190A V35VI, K173E, E194G, T200E, Q207E  
TR1015_SFA81 TR1015_SFA81 None None   E44EK, K104N, D123E, I135T, S162C, R211T  
TR1016_SFA82_83 TR1016_SFA82_83 None None   E28A, V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, K173N, I178M, Q197QE, T200A, Q207K, R211A  
TR1017_SFA84 TR1017_SFA84 None None   V60VI, R125RK, R211K  
TR1018_SFA86_87 TR1018_SFA86_87 None None   K20R, V35I, K122E, D123E, I135T, I202V, F214L  
TR1019_SFA88 TR1019_SFA88 None None   K20R, K102KR, D123E, I135T, T139TI, D177E, I178V, G196E, T200A, Q207QH, R211S, F214L V108VA 
TR1020_SFA89 TR1020_SFA89 None None  K103N K20R, T39A, I135IT, G196R, T200E, R211K  
TR1029_SFA90_91 TR1029_SFA90_91 None None   V60I, D121E, I135V, K166KR, T200I, E203D, F214L  
TR1030_SFA92 TR1030_SFA92 None None   E28K, K32E, V60I, K173T, Q174K, D192N, T200A, R211K K101V 
TR1031_SFA93_94 TR1031_SFA93_94 None None   T39A, I142V, K173Q, D177E, I178M, G196V, T200A, Q207H, R211K  
TR1032_SFA95 TR1032_SFA95 None None   T39A, S68G, D123NS, T165TI, I178L, G196E, R211K  
TR1036_SFA96_97 TR1036_SFA96_97 None None M184MI  G51GR, K82KR, A98S, D123E, I142V, G155GR, P176S, G196E, T200A, Q207N, R211K W88W*, G112GR 
TR1038_SFA98 TR1038_SFA98 None None  K101P, K103N K122E, D123NS, K173N, Q174K, R211K, F214L  
TR1040_SFA99 TR1040_SFA99 None None  V106I V35M, T39TA, E40ED, V60I, K122E, D123DN, D177DE, I202V, E204D, F214L  
TR1043_SFA102_103 TR1043_SFA102_103 None None   R211K  
TR1044_SFA104_105 TR1044_SFA104_105 None None   K103R, I135V, K173E, Q174H, R211K, F214L  
TR1048_SFA113 TR1048_SFA113 None None   K122KE, D123DN, I135R, I178L, V179I, R211K, F214L  
TR1052_SGJ23 TR1052_SGJ23 None None   V35VI, K122KE, I135T, I142V, K173R, I178M, T200E, E204N  
TR1053_SFA114 TR1053_SFA114 None None   S68G, K122E, Q174H, D177E, G196E, Q207A, L210F, R211K  
TR1055_SFK29_30 TR1055_SFK29_30 None None   K32R, V35I, V60I, K102R, K103KR, I135L, V179I, T200I, R211K  
TR1056_SFK31 TR1056_SFK31 None None   V60I, D123E, I135R, I142V, I178L, V179I, T200L, R211K  
TR1057_SFK32_33 TR1057_SFK32_33 None None   V35M, T39A, V60I, S68G, V118I, K122V, I135T, E169D, P176PS, I178L, I195L, T200A, R211K, F214L  
TR1058_SFK34 TR1058_SFK34 None None   K102R, K173KQ, Q174QE, Q197P  
TR1059_SFK35_36 TR1059_SFK35_36 None None   V60I, K103R, K166KR, K173N, Q174R, V179I, G196E, R211RK  
TR1060_SFK37_38 TR1060_SFK37_38 None None   K103R, V118I, K122E, R211G, F214L  
TR1061_SFZ46 TR1061_SFZ46 None None   D123E, D177E, T200E, Q207E  
TR1062_SFO43_44 TR1062_SFO43_44 None None   K122KE, D123DN, S162CY, T200E, R211K  
TR1063_SGJ24 TR1063_SGJ24 None None   E28A, V35I, R83K, D123E, S162SC, Q174K, G196E, T200S  
TR1064_SFZ48 TR1064_SFZ48 None None   P25A, K102KQ, D123E, T200A, E204ED, R211K  
TR1065_SFO48_49 TR1065_SFO48_49 None None  V179D V35K, S68G, D123E, I135T, R211K, F214L  
TR1066_SFO50 TR1066_SFO50 None None   V35T, K104R, D123E, I135T, I142V, T165I, I178V, G196E, I202V, R211K, F214L  
TR1067_SFO51 TR1067_SFO51 None None   V35T, T39A, D121Y, K122E, I135T, S162C, D177E, G196E, T200E, E204N  
TR1068_SGJ25 TR1068_SGJ25 None None   V35T, E36ED, D121Y, K122E, I135T, S162C, D177E, G196E, T200AE, E204N  
TR1069_SFO54 TR1069_SFO54 None None   V35M, I135M, G196E, T200A, Q207E  
TR1070_SGJ26 TR1070_SGJ26 None None  K103KN V35M, T39TA, V60I, R83K, K102Q, K122KE, K166KR, I178M, Q197QK, T200AE, K201KR, E204Q  
TR1071_SFO56_57 TR1071_SFO56_57 None None   W88S, D123E, I142V, T165TI, K173KE, D177E, I178L, T200S, R211S, F214L  
TR1073_SFO59 TR1073_SFO59 None None   E28D, K49R, D123E, I135T, S162C, T200TA, E204D, R211M  
TR1074_SFZ51 TR1074_SFZ51 None None   K20R, K103R, K122KE, D123E, G196K, Q197E, T200E, E204K, R211K, F214L  
TR1075_SFZ52 TR1075_SFZ52 None None   E28A, K32Q, A98S, D177DE, G196E, T200R, R211K  
TR1076_SFZ53 TR1076_SFZ53 None None   K64R, D123DE, I135T, D177E, I178L, T200A, Q207D, R211K, G231V  
TR1077_SFZ54 TR1077_SFZ54 None None  E138A V60I, K102Q, K103R, K104KR, I142V, Q174QR, I178M, G196E, R211G  
TR1078_SGJ27 TR1078_SGJ27 None None  V106VI E28A, K122E, I135IT, T200A, I202V, E204K, R211S, F214L  
TR1079_SGJ28 TR1079_SGJ28 None None   E28A, A98S, I135M, G196E, T200R, R211Q  
TR1080_SFZ57 TR1080_SFZ57 None None   E28A, V35I, A98S, K102KQ, I135T, Q197K, T200E, R211K  
TR1081_SFZ58 TR1081_SFZ58 None None   E28A, D123E, K173Q, D177E, T200I, Q207E, R211K  
TR1082_SFZ59 TR1082_SFZ59 None None   V60I, I135V, I142V, G196E, Q197P, R211K  
TR1083_SFZ60 TR1083_SFZ60 None None   V35I, K64R, K103R, I135L, Q174H, I178V, T200TI, R211K, F214L  
TR1084_SFZ61 TR1084_SFZ61 None None  V179D K20R, K101Q, K104R, D123E, I135K, T165I, R211G, F214L  
TR1085_SFZ62 TR1085_SFZ62 None None   V35I, S68G, K122E, D123N, I135T, I178L, E203D, R211K  
TR1086_SFZ63 TR1086_SFZ63 None None   T200A, Q207E, R211K  
TR1087_SFZ64 TR1087_SFZ64 None None   K20R, T27S, D123E, S162H, E194D, T200E, I202V, E204D, R211K  
TR1088_SFO60_61 TR1088_SFO60_61 None None   E28A, A98S, D177DE, G196E, T200R, Q207QL, R211K  
TR1089_SFO62_63 TR1089_SFO62_63 None None   V60VI, R83RK, K104KR, I135IV, V179VI  
TR1090_SFO64_65 TR1090_SFO64_65 None None   V60I, K104R, I135V, V179I  
TR1091_SFZ65 TR1091_SFZ65 None None  V179D V21I, V35I, G45GE, V60I, D123E, I142V, Q197P, T200NS, R211K  
TR1092_SFZ66 TR1092_SFZ66 None None   T27S, V35I, E44D, S68G, S105SA, D123N, I178IM K122S 
TR1093_SFZ67 TR1093_SFZ67 None None   K20R, K32T, V35VI, D121H, K122E, I178L, V179I, T200E, E204N, R211K  
TR1094_SFZ68 TR1094_SFZ68 None None  V179D K102R, D123N, I135T, D177E, T200E, R211K  
TR1095_SFZ69 TR1095_SFZ69 None None   D123DE, G196E, Q197K, E203K, Q207D, R211K  
TR1096_SFZ70 TR1096_SFZ70 None None  K103N, E138G, P225PH K20R, K102Q, K122Q, D123E, I135L, T200E  
TR1097_SFZ71 TR1097_SFZ71 None None   P19Q, V35L, K103R, K122E, D123DE, I178M, V179VI, Q207E  
TR1098_SFZ72 TR1098_SFZ72 None None   V35IT, K122Q, I142IV, K166KR, K173Q, I178IL, G196A, Q197P, T200A, R211K  
TR1099_SFZ73 TR1099_SFZ73 None None  K103N I135R, K173E, Q174QK, T200E, E204EK, Q207X  
TR1100_SFZ74 TR1100_SFZ74 None None  K103N K102R, I135R, K173E, D177DN, T200E, Q207K  
TR1101_SFZ75 TR1101_SFZ75 None None   V60I, K103R, D123E, I135T, I142V, K173E, G196E, I202IV, E203EG, E204K, R211S, F214L  
TR1102_SFZ76 TR1102_SFZ76 None None  K103N T27S, V35I, V60VI, K102KR, K173E, Q174K, T200E, Q207E  
TR1103_SGH31 TR1103_SGH31 None None   V35M, T39S, S68G, D123E, I135T, I142V, G196R, T200E  
TR1105_SGH32 TR1105_SGH32 None None  V106VI V35I, K122E, D123E, I142V, E169D, R211K, F214L  
TR1106_SGH33 TR1106_SGH33 None None  V179D, Y188YC, G190GA K103KR, D123E, I135V, S162C, T200A, R211K  
TR1108_SGH35 TR1108_SGH35 None None   K102Q, K103R, I178M, V179I, T200A, Q207K, R211K  
TR1109_SGH36 TR1109_SGH36 None None  V179D D123N, G196E, R211A, F214L  
TR1110_SFO66 TR1110_SFO66 None None   A98S, K104R, A158S, T200D, P236L  
TR1111_SGH37 TR1111_SGH37 None None   V60I, K102Q, K103R, K122E, I178M, V179I, V189I, T200A, E204D, Q207E, R211K  
TR1112_SGH38 TR1112_SGH38 None None   D121H, K122E, I135R, I178M, R211K  
TR1113_SGH39 TR1113_SGH39 None None   A98S, K122X, I135V, I178L, T200E  
TR1114_SGH40 TR1114_SGH40 None None   V118I, D123E, I135T, K166R, K173I, D177E, I178V, I202IV, F214L  
TR1115_SGH41 TR1115_SGH41 None None   V35E, T39A, D121H, K122E, I135R, I142V, P176PS, I178M, T200A  
TR1116_SFO68_69 TR1116_SFO68_69 None None  Y181YC V35T, T39M, D123E, I135T  
TR1119_SGH44 TR1119_SGH44 None None   I178IM, G196E, R211K  
TR1120_SGH45 TR1120_SGH45 None None F77FL  K103R, D123S, I178IM D76DE 
TR1121_SGH46 TR1121_SGH46 None None   V35VI, R83K, K102Q, K103R, D123E, T165I, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K  
TR1122_SGH47 TR1122_SGH47 None None   I135T, S162A, K173Q, D177E, I178M, Q207E  
TR1123_SGH48 TR1123_SGH48 None None   D123E, I135T, I142L, G196E, T200V, R211K, F214L  
TR1124_SGH49 TR1124_SGH49 None None   I50V, V60I, K104R, D123E, I135V, I142V, I178M, G196E, R211G  
TR1125_SGH50 TR1125_SGH50 None None  V179DE V35I, K102R, T200E, E204D  
TR1128_SFO70 TR1128_SFO70 None None   S48T, K102KR, K104R, T165I, E169D, G196E, T200A, I202V, R211G  
TR1129_SFO71_72 TR1129_SFO71_72 None None   S48ST, W88WS, K104KR, D123DE, I142IMV, T165TI, E169ED, K173KE, D177DE, I178IL, G196GE, T200S, I202IV, R211RS, F214L  
TR1130_SFO73_74 TR1130_SFO73_74 None None  E138A V35I, S48E, T139I, K173R, Q174E, I202V, F214L  
TR1132_SGH51 TR1132_SGH51 None None   K22R, V60VI, K104R, T200A  

Database

Resources

Team