Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Ueda (2018)
Title Genetic Diversity and Drug Resistance of HIV-1 Circulating in North Sulawesi, Indonesia.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 37
NumPts 37
Subtype CRF01_AE, B, A, B + C

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
MN10 MN10 NRTI NNRTI   E6D, V35T, E36D, T39K, K43E, T107S, K122E, D123S, I142V, K173M, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245E  
MN11 MN11 NRTI NNRTI   E6D, K11T, V35T, E36D, T39K, K43E, G112A, K122E, D123N, Q174K, D177E, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
MN12 MN12 NRTI NNRTI   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, D123N, I135T, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E, S251N  
MN13 MN13 NRTI NNRTI   E6D, K11T, V35T, E36D, T39K, K43E, V111I, K122E, D123N, K173M, Q174K, D177E, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
MN14 MN14 NRTI NNRTI   E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, K122E, D123N, I142V, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, I202V, Q207A, R211S, K238R, V245K  
MN15 MN15 NRTI NNRTI   E6D, K11S, K32I, V35T, T39K, K64R, T107S, K122E, D123S, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211T, V245K  
MN17 MN17 NRTI NNRTI   K20R, T39A, V111I, K122E, I135V, S162C, T200I, R211K  
MN18 MN18 NRTI NNRTI   E6D, V35T, T39K, K43E, V60I, S68G, I135T, T165I, K173V, Q174K, D177E, V179T, T200A, Q207A, R211S, V245E  
MN20 MN20 NRTI NNRTI   E6D, K11T, V35T, T39K, R83K, K122E, D123K, I142V, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245K  
MN21 MN21 NRTI NNRTI M184V K103N V35T, T39N, V60I, R83K, K102R, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200R, Q207A, R211S, K238R, V245E  
MN24 MN24 NRTI NNRTI M184V K103N E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, K43E, K49R, A98S, D123N, I135L, K166N, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
MN25 MN25 NRTI NNRTI   V35T, K122E, D123S, I135R, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211K, K238R, V245E  
MN28 MN28 NRTI NNRTI   E6D, K11A, V35T, T39N, K122E, D123N, T165I, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, V245K  
MN33 MN33 NRTI NNRTI   E6D, K11T, V35T, E36D, T39K, K43E, V111I, K122E, D123S, I135V, T139A, I142V, K173T, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245E  
MN34 MN34 NRTI NNRTI   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, D121H, K122E, D123N, I135T, S162C, K173A, Q174K, Q207A, R211K, K238R, V245E  
MN36 MN36 NRTI NNRTI   E6D, V35T, K49R, K122E, D123N, I135L, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, E203D, Q207D, R211K, V245E  
MN37 MN37 NRTI NNRTI   E6D, V35T, T39E, V60I, K64R, T107S, K122E, D123S, I135R, R172K, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211K, V245K  
MN38 MN38 NRTI NNRTI   E6D, K11T, K20R, V21I, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123N, I142V, K173I, Q174K, D177E, I178M, I202V, Q207A, R211S, V245E T128I 
MN39 MN39 NRTI NNRTI   E6D, K11T, V35T, T39E, R83K, K122E, D123S, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245K  
MN41 MN41 NRTI NNRTI   E6D, K11T, V35T, T39E, R83K, D123N, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, V245K  
MN43 MN43 NRTI NNRTI A62V, K65R, D67H, V75I, F77L, F116Y, Q151M, M184V, K219E K103N, L234I E6D, K11T, I31L, V35T, T39K, S68G, T69N, D76N, V90I, A98S, K122E, D123N, K173M, Q174K, D177E, V189I, G196E, T200I, I202V, Q207A, R211S, L228H, V245E  
MN44 MN44 NRTI NNRTI M184V, T215F Y181C, G190A E6D, K11T, V21I, K32E, V35T, T39K, K49R, R83K, D123S, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245K  
MN45 MN45 NRTI NNRTI   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, T165I, R172K, K173V, Q174K, D177E, I178L, Q207A, R211N, K238R, V245E  
MN47 MN47 NRTI NNRTI   E6D, K11T, V35T, T39K, V118I, D121H, K122D, D123S, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245K  
MN48 MN48 NRTI NNRTI L74V  E6D, V8I, E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, Q207K, R211G, V245Q, E248V, K249Q  
MN50 MN50 NRTI NNRTI   E6D, K11T, V35T, T39E, R83K, K122E, D123S, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
MN53 MN53 NRTI NNRTI   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E L12V 
MN55 MN55 NRTI NNRTI   E6D, K11T, V35T, T39K, K43A, R83K, K122E, D123S, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211K, K238R, V245E  
MN56 MN56 NRTI NNRTI   E6D, V35T, T39K, K43A, V60I, K102R, K104R, K122E, D123N, I135V, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, I202V, Q207N, R211S, V245E  
MN58 MN58 NRTI NNRTI M41L, A62V, M184V, L210W, T215Y K103N, P225H I2T, E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, A98S, K122E, D123N, I135T, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, L228R, K238R, V245E  
MN59 MN59 NRTI NNRTI   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, R172K, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245E  
MN60 MN60 NRTI NNRTI  K103N I5M, E6K, E169D, Q174K, R211K, V245A  
MN61 MN61 NRTI NNRTI   E6D, K11T, V35T, S68G, K122E, D123S, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207E, K238R, V245E  
MN63 MN63 NRTI NNRTI   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V60I, V111I, K122E, D123N, I135T, K173L, Q174K, D177E, I202V, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
MN7 MN7 NRTI NNRTI   E6D, K11T, V35T, T39K, S68G, K122E, D123S, I135V, K166R, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245K  
MN8 MN8 NRTI NNRTI   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, A98S, K122E, D123N, I135T, K166R, K173I, Q174K, T200I, Q207A, R211S, K238R, I244V, V245Q  
MN9 MN9 NRTI NNRTI M184V K103N E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, K43E, A98S, K122E, D123N, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  

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