Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Wang (2018)
Title High HIV-1 prevalence and viral diversity among entry-exit populations at frontier ports of China, 2012-2016: A cross-sectional molecular epidemiology study.
Citation Infect Genet Evol
SelectedGene PR
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 270
NumPts 270
Subtype CRF01_AE, CRF07_BC, B + C, C, B, A, CRF02_AG, CRF55_01B, CRF08_BC, G, CRF68_01B, G + J, A + B, B + CRF01_AE, H, D, CRF06_cpx

 

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Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 270 Clinical PR Isolates


SubjectIsolatePIsWksPIMajorPIMinorCommonUnusual
HLJCIQ12001 HLJCIQ12001 None    I13V, L19M, E35D, M36I, R41K, I62V, H69K, L89M  
HLJCIQ12002 HLJCIQ12002 None    I13V, K14R, E35D, M36I, N37D, R41K, L63P, H69K, A71V, I72T, V77I, L89M, I93L  
HLJCIQ12003 HLJCIQ12003 None    T12P, L33V, N37Y, I62V, L63S, I64L, H69Q  
HLJCIQ12004 HLJCIQ12004 None    L10I, I13V, N37S, L63S, V77I, L89M  
HLJCIQ12007 HLJCIQ12007 None    L33V, N37Y, I62V, L63S, I64L, H69Q, K70Q  
HLJCIQ13002 HLJCIQ13002 None    I13V, G16E, L23F, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L  
HLJCIQ13003 HLJCIQ13003 None    L10I, E35D, M36I, R41K, I62V, H69K, L89M, F99L  
HLJCIQ13004 HLJCIQ13004 None    T12A, L19I, L63S, V77I, L89M  
HLJCIQ13005 HLJCIQ13005 None   L10F G16E, K20R, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L  
HLJCIQ13006 HLJCIQ13006 None    K14R, G16E, E35D, M36I, R41K, I62V, H69K, L89M, I93L  
HLJCIQ13008 HLJCIQ13008 None    L19M, E35D, M36I, R41K, L63P, H69K, I72V, L89M, I93L  
HLJCIQ13010 HLJCIQ13010 None    L10I, E35D, M36I, R41K, I62V, H69K, K70R, L89M, F99L  
HLJCIQ13011 HLJCIQ13011 None    E35D, N37D, R41K, D60E, I62V, L63P, L89M, I93L  
HLJCIQ13012 HLJCIQ13012 None    E35D, M36I, R41K, I62V, H69K, K70R, L89M  
HLJCIQ13013 HLJCIQ13013 None    I13V, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, V82I, L89M  
HLJCIQ13014 HLJCIQ13014 None    K20R, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M  
HLJCIQ13015 HLJCIQ13015 None    E35D, M36I, R41K, H69K, L89M  
HLJCIQ13016 HLJCIQ13016 None    I15V, E35D, R41K, D60E, L63P, I93L  
HLJCIQ13017 HLJCIQ13017 None    E35D, R41K, D60E, L63P, I64V  
HLJCIQ14001 HLJCIQ14001 None    E35D, M36I, R41K, D60E, Q61E, I62V, H69K, L89M  
HLJCIQ14002 HLJCIQ14002 None    L10I, E35D, M36I, R41K, I62V, H69K, L89M, F99L  
HLJCIQ14003 HLJCIQ14003 None    L10V, I13V, K14R, I15V, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M  
HLJCIQ14004 HLJCIQ14004 None    I13V, Q18E, L19I, M36I, R41K, D60E, L63P, I93L  
HLJCIQ14005 HLJCIQ14005 None    E35D, R41K, D60E, I62V, L63P, V77I, I93L  
HLJCIQ14006 HLJCIQ14006 None    E35D, R41K, D60E, L63P, I72V, V77I, I93L  
HLJCIQ14007 HLJCIQ14007 None    I13V, L19M, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M, I93L  
HLJCIQ14008 HLJCIQ14008 None    L10I, I15V, L63T, I93L  
HLJCIQ14009 HLJCIQ14009 None    T12S, K14R, I15V, L19I, M36I, R41K, L63S, H69K, K70R, I72T, V82I, L89M, I93L  
HLJCIQ14010 HLJCIQ14010 None    G16A, K20R, E35D, M36I, R41K, G68E, H69K, K70R, L89M, I93L  
HLJCIQ14011 HLJCIQ14011 None    I13V, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, K70R, V82I, L89M  
HLJCIQ14012 HLJCIQ14012 None    T12S, I15V, L19Q, N37S, I62V, L63P, V77I, I93L  
HLJCIQ14013 HLJCIQ14013 None    I13V, E35D, M36I, R41K, D60E, Q61E, I62V, H69K, K70R, L89M  
HLJCIQ14014 HLJCIQ14014 None    I13V, L19M, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M  
HLJCIQ14015 HLJCIQ14015 None    K20R, E35D, M36I, R41K, C67S, H69K, L89M, I93L  
HLJCIQ15001 HLJCIQ15001 None    E35D, R41K, D60E, L63P, I93L H69L 
HLJCIQ15002 HLJCIQ15002 None    E35D, M36I, R41K, H69K, K70R, L89M  
HLJCIQ15003 HLJCIQ15003 None   Q58E E35D, M36I, R41K, D60E, L63P, I93L  
HLJCIQ15004 HLJCIQ15004 None    I13V, E35D, R41K, D60E, L63P, I64V, I93L  
HLJCIQ15005 HLJCIQ15005 None  M46I  L19M, M36I, P39S, R41K, L63P, H69K, L89M, I93L  
HLJCIQ15006 HLJCIQ15006 None    L10V, E35D, M36I, R41K, Q61E, H69K, L89M  
HLJCIQ15007 HLJCIQ15007 None    I13V, L19M, E35D, M36I, R41K, K45R, R57K, H69K, L89M  
HLJCIQ15008 HLJCIQ15008 None    I13V, E35D, M36I, R41K, L63S, H69K, L89M  
HLJCIQ15009 HLJCIQ15009 None    T12S, I15V, L19I, M36I, R41K, L63P, H69K, I93L  
HLJCIQ15011 HLJCIQ15011 None    I13V, I15V, E35D, M36I, R41K, R57K, C67Y, H69K, L89M  
HLJCIQ15012 HLJCIQ15012 None    I13V, G16E, L19V, K20R, E35D, M36I, R41K, R57K, L63G, H69K, K70R, L89M, I93L  
HLJCIQ15014 HLJCIQ15014 None    E35D, L63P, I93L  
HLJCIQ15015 HLJCIQ15015 None    I15V, L19M, E35D, M36I, R41K, H69K, V82I, L89I, I93L  
HLJCIQ15018 HLJCIQ15018 None    K20R, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L  
HLJCIQ15020 HLJCIQ15020 None    I13V, I15V, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M  
HLJCIQ16001 HLJCIQ16001 None    G16E, K20R, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, I93L  
HLJCIQ16004 HLJCIQ16004 None    E35D, M36I, R41K, H69K, V82I, L89M, I93L  
HLJCIQ16005 HLJCIQ16005 None    I13V, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, K70R, V82I, L89M  
HLJCIQ16006 HLJCIQ16006 None    R41K, D60E, Q61E, L63S, A71V, V77I, I93L  
HLJCIQ16007 HLJCIQ16007 None    E35D, M36I, R41K, R57K, L63P, A71T, I72V, I93L  
HLJCIQ16008 HLJCIQ16008 None    I13V, L19M, E35D, M36I, R41K, R57K, C67Y, H69K, K70R, L89M  
HLJCIQ16009 HLJCIQ16009 None    G16A, L19I, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, V77I, L89M, I93L  
JLCIQ16002 JLCIQ16002 None    I13V, K20I, E35D, M36I, R41K, H69K, V82I, L89M  
JSCIQ12001 JSCIQ12001 None    G16E, E35D, M36I, R41K, D60E, H69K, L89M, I93L  
JSCIQ12002 JSCIQ12002 None    I13V, K14R, K20I, L33I, E34T, P39S, R41K, L63P, H69K, L89M  
JSCIQ12003 JSCIQ12003 None   Q58E T12S, I15V, L19I, M36I, R41K, D60E, L63P, H69K, I93L  
JSCIQ12004 JSCIQ12004 None   L10F I13V, K14R, E35D, M36I, R41K, L63V, H69K, K70R, L89M  
JSCIQ12007 JSCIQ12007 None    I15V, E35D, L63T, A71T, I72V, V77I, I93L  
JSCIQ12008 JSCIQ12008 None    I13V, I15V, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M  
JSCIQ12010 JSCIQ12010 None    I15V, L19I, M36L, N37S, D60E, Q61E, L63T, H69K, V82I, L89M, I93L  
JSCIQ12012 JSCIQ12012 None    L19I, E35D, M36I, R41K, L63I, H69K, V82I, L89M  
JSCIQ12014 JSCIQ12014 None    I13V, I15V, K20R, M36I, N37D, P39T, R41K, H69K, L89M  
JSCIQ12015 JSCIQ12015 None    I15V, K43I  
JSCIQ12016 JSCIQ12016 None    T12S, I15V, L19V, M36I, N37S, R41K, L63T, H69K, T74A, L89M, I93L  
JSCIQ12017 JSCIQ12017 None    I13V, L19M, E35D, M36I, R41K, H69K, V82I, L89M  
JSCIQ12018 JSCIQ12018 None    G16A, K20R, E35D, M36I, R41K, H69K, K70R, L89M, I93L  
JSCIQ12019 JSCIQ12019 None    T12S, L63P, A71T, I72E, V77I  
JSCIQ12020 JSCIQ12020 None    T12S, K14I, I15V, L19V, M36I, R41K, L63V, H69K, L89M, I93L  
JSCIQ12022 JSCIQ12022 None    I15V, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L  
JSCIQ12023 JSCIQ12023 None    I13V, E35D, M36I, R41K, I66V, H69K, K70R, L89M, I93L  
JSCIQ12024 JSCIQ12024 None    I13V, K14E, K20V, M36I, N37G, R41K, H69K, K70R, L89M  
JSCIQ12025 JSCIQ12025 None    E35D, M36I, R41K, H69K, L89M  
JSCIQ12026 JSCIQ12026 None    K20R, E35D, M36I, R41K, L63T, H69K, K70R, V82I, L89M, I93L  
JSCIQ12027 JSCIQ12027 None    G16E, E35D, M36I, R41K, D60E, H69K, L89M, I93L  
JSCIQ12028 JSCIQ12028 None    T12S, I15V, L19I, E35D, M36I, R41K, H69K, T74S, L89M, I93L  
JSCIQ13002 JSCIQ13002 None    E35D, R41K, D60E, Q61E, L63P, A71V, I72M, V77I, V82I, I93L  
JSCIQ13004 JSCIQ13004 None    K20R, E35D, M36I, R41K, L63S, H69K, K70R, L89M, I93L  
JSCIQ13005 JSCIQ13005 None    L33I, E35D, R41K, D60E, L63P, I93L  
JSCIQ13007 JSCIQ13007 None    Q7R, I13V, K14R, G16R, K20I, E35Q, M36I, N37D, R41K, R57K, I62V, L63P, C67E, H69K, V82I, L89M  
JSCIQ13008 JSCIQ13008 None    L10I, I13V, K14R, K20I, E35D, M36I, R41K, L63S, H69K, K70R, V82I, L89M  
JSCIQ13009 JSCIQ13009 None    T12S, I15V, L19I, E35D, M36I, R41K, H69K, T74A, L89M, I93L  
JSCIQ13010 JSCIQ13010 None    T12S, I15V, L19V, M36I, Q61E, L63P, H69K, I93L  
JSCIQ13011 JSCIQ13011 None    I13V, E35D, R41K, D60E, L63P  
JSCIQ13012 JSCIQ13012 None   L33F I13V, L19V, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M, I93V  
JSCIQ13013 JSCIQ13013 None    E35D, M36I, R41K, D60E, I62V, L63P  
JSCIQ13014 JSCIQ13014 None    E35D, R41K, D60E, L63P, V77I, I93L  
JSCIQ13020 JSCIQ13020 None    T12S, E35D, R41K, D60E, L63T, I64M, A71V, I93L  
JSCIQ13021 JSCIQ13021 None    L10I, I13V, E35D, M36I, R41K, L63T, E65D, H69K, I72V, L89M  
JSCIQ13022 JSCIQ13022 None    K20R, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L  
JSCIQ13023 JSCIQ13023 None    T12E, I13V, K14E, K20I, E35N, M36I, N37D, R41K, K43R, H69K, K70R, L89M, I93L G17K 
JSCIQ13024 JSCIQ13024 None    T12S, I15V, L19I, E35D, M36I, R41K, D60E, Q61E, I62V, H69K, A71T, I93L  
JSCIQ13025 JSCIQ13025 None    Q7H, V11I, T12K, I13V, L19I, K20I, M36I, N37D, R41K, L63H, H69K, L89M  
JSCIQ13026 JSCIQ13026 None    I13V, L19P, K20I, M36L, N37S, H69K, L89I  
JSCIQ13027 JSCIQ13027 None    T12K, K14E, L19P, K20I, M36I, R41K, H69K, L89M  
JSCIQ13029 JSCIQ13029 None    I13V, K14R, K20I, E35D, M36I, R41K, H69K, V82I, L89M  
JSCIQ13030 JSCIQ13030 None    I13V, K20R, M36I, R41K, H69K, T74S, L89M, I93L