Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Kroon (2018)
Title Transmission dynamics among participants initiating antiretroviral therapy upon diagnosis of early acute HIV-1 infection in Thailand.
Citation AIDS
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 438
NumPts 438
Subtype CRF01_AE, B, A, B + CRF01_AE, CRF02_AG, C

 

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Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 438 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
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PT2545858   None None   E6D, K11T, V35T, T39Q, V60I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245N, N265K  
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PT2546042   None None  V179D E6D, V35T, T39K, K43E, V60I, V111I, K122E, D123S, I135T, K173V, Q174K, D177E, I178L, T200I, E203K, Q207A, R211S, F214L, V245Q  
PT2546116   None None   E6D, V21I, K32E, V35T, T39L, V60I, K122E, D123S, I135R, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200I, I202V, Q207A, R211S, K238R V8VL 
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PT2546127   None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, V245E, N265K  
PT2546183   None None   E6D, K11T, V35T, V60I, S68G, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, E194D, G196E, T200E, E204Q, Q207A, R211S, V245E, E248D, S251H, N265K  
PT2546201   None None  V179E E6D, V35T, T39E, E40G, K43E, K102R, K122E, D123S, K166R, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, K238R, V245N, N265K  
PT2546222   None None   E6D, V35T, T39K, K43E, V111I, V118C, K122E, D123G, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245E, N265K  
PT2546267   None None   V35T, T39K, K43E, V111I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E, N265K  
PT2546310   None None  K103N E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, T165I, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211K, V245Q  
PT2546352   None None   E6D, K11T, P14A, K22R, V35T, T39K, K43E, S68G, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E, N265K  
PT2546401   None None   E6D, V35T, T39K, K104R, K122E, D123N, I135T, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207A, V245E, N265K  
PT2546453   None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I142V, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
PT2546523   None None   E6D, K20R, V21I, V35T, T39K, V60I, K122E, D123N, K173A, Q174K, D177E, T200K, I202V, Q207A, R211S, K238R  
PT2546553   None None   V35T, T39K, K43E, V60I, S68G, K122E, D123S, S134SR, I135T, I159V, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R T84TP, N137IT 
PT2546625   None None   V60I, K122E, D123S, I135T, R211K, K238R  
PT2546635   None None   E6D, V21I, K32E, V35T, T39L, V60I, D123S, I135R, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200I, I202V, Q207A, R211S, V245E, N265K  
PT2546745   None None K65R, V75I, Y115F, F116Y G190Q E6D, V35T, T39K, V60I, S68G, V118I, K122E, D123S, I135T, T139TA, K173V, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, F214FL, K238R K46M 
PT2546803   None None   K11N, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135IK, I142V, R143RK, R172K, K173KI, Q174K, D177EK, Q207D, R211S, K238R V111VG, I178IK 
PT2546820   None None   K13N, P14Q, G15E, V35T, T39K, K122E, D123S, I135T, T165I, K173V, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, I244V, V245K, N265K  
PT2547045   None None K219E  E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179I, Q207T, R211S, D218E, K238R, V245E  
PT2547080   None None   V35T, T39K, K43E, K49R, V60I, K122E, D123S, K166R, Q174G, D177E, I178M, Q207N, R211K, K238R, V245E  
PT2547119   None None   V35T, T39K, K43A, K122E, D123S, S162C, K173A, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, E224D, V245E  
PT2547164   None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, E204Q, Q207A, R211S, K223R, K238R, V245E, N265K  
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PT2549437   None None   E6D, V21VI, E29EK, V35T, T39N, V60I, D121Y, K122E, I142V, K173T, Q174R, D177E, I178M, G196E, Q207D, R211S, V245E  
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PT2549724   None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245K, N265K  
PT2549854   None None   V35T, T39K, K43E, V111I, V118C, K122E, D123G, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245E, N265K  
PT2549883   None None   E6D, E28A, V35T, T39E, K64R, D86E, K122E, D123S, S134SR, I135T, I142T, K173T, Q174R, D177E, V179T, T200A, I202V, Q207N, L210S, R211S, V245E, N265K I132IK 
PT2549958   None None   E6D, K11T, K20R, V35T, E36A, T39K, K43E, V60I, K103R, K122E, D123S, Q174R, V179I, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E