Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Andreatta (2018)
Title Integrase Inhibitor Resistance Selections Initiated with Drug Resistant HIV-1.
Citation CROI
SelectedGene IN
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Lab
NumIsolates 33
Lab Parent Strain LAI

 

Lab IN Isolates : Susceptibility Data


IsolateINIMajorDRMsINIMinorDRMsMethodDrugFold Res.
E138K E138K  PhenoSense BIC 0.8 
     PhenoSense DTG 0.7 
     PhenoSense EVG 0.9 
     PhenoSense RAL 0.7 
E138K_G140A_Q148R E138K, G140A, Q148R  PhenoSense BIC 18 
     PhenoSense DTG 13 
     PhenoSense EVG >114 
     PhenoSense RAL 105 
E138K_Q148K E138K, Q148K  PhenoSense BIC 4.4 
     PhenoSense DTG 3.2 
     PhenoSense EVG >114 
     PhenoSense RAL >105 
E138K_Q148R E138K, Q148R  PhenoSense BIC 1.6 
     PhenoSense DTG 1.7 
     PhenoSense EVG >114 
     PhenoSense RAL 51 
E157K   PhenoSense BIC 1.0 
    PhenoSense DTG 0.8 
    PhenoSense EVG 0.8 
    PhenoSense RAL 1.3 
E92Q E92Q  PhenoSense BIC 1.1 
     PhenoSense DTG 1.3 
     PhenoSense EVG 24 
     PhenoSense RAL 4.3 
E92Q_G140A E92Q, G140A  PhenoSense BIC 1.4 
     PhenoSense DTG 2.3 
     PhenoSense EVG 54 
     PhenoSense RAL 25 
G140A G140A  PhenoSense BIC 0.6 
     PhenoSense DTG 0.6 
     PhenoSense EVG 2.8 
     PhenoSense RAL 1.2 
G140A_Q148R G140A, Q148R  PhenoSense BIC 2.3 
     PhenoSense DTG 2.8 
     PhenoSense EVG >114 
     PhenoSense RAL 77 
G140E   PhenoSense BIC 1.1 
    PhenoSense DTG 0.9 
    PhenoSense EVG 2.4 
    PhenoSense RAL 1.0 
L234F   PhenoSense BIC 1.2 
    PhenoSense DTG 1.2 
    PhenoSense EVG 1.3 
    PhenoSense RAL 0.6 
L45Q_N115H   PhenoSense BIC 1.5 
    PhenoSense DTG 1.5 
    PhenoSense EVG 23 
    PhenoSense RAL 7.2 
L74M   PhenoSense BIC 0.4 
    PhenoSense DTG 0.5 
    PhenoSense EVG 1.0 
    PhenoSense RAL 1.0 
N155H N155H  PhenoSense BIC 1.2 
     PhenoSense DTG 1.2 
     PhenoSense EVG 30 
     PhenoSense RAL 12 
Q148K Q148K  PhenoSense BIC 0.9 
     PhenoSense DTG 0.7 
     PhenoSense EVG 69 
     PhenoSense RAL 22 
Q148R Q148R  PhenoSense BIC 0.6 
     PhenoSense DTG 0.6 
     PhenoSense EVG 81 
     PhenoSense RAL 27 
Q148R_N155H Q148R, N155H  PhenoSense BIC 2.1 
     PhenoSense DTG 2.2 
     PhenoSense EVG >114 
     PhenoSense RAL 99 
R263K R263K  PhenoSense BIC 1.6 
     PhenoSense DTG 1.5 
     PhenoSense EVG 2.6 
     PhenoSense RAL 1.0 
S147G S147G  PhenoSense BIC 1.1 
     PhenoSense DTG 1.1 
     PhenoSense EVG 3.3 
     PhenoSense RAL 0.7 
S153F  S153F PhenoSense BIC 1.4 
     PhenoSense DTG 1.1 
     PhenoSense EVG 2.2 
     PhenoSense RAL 1.4 
S153Y  S153Y PhenoSense BIC 2.0 
     PhenoSense DTG 1.7 
     PhenoSense EVG 2.4 
     PhenoSense RAL 1.1 
S153Y_L234F  S153Y PhenoSense BIC 2.2 
     PhenoSense DTG 1.9 
     PhenoSense EVG 3.0 
     PhenoSense RAL 0.7 
S24G_N155H_D253E N155H  PhenoSense BIC 1.4 
     PhenoSense DTG 1.5 
     PhenoSense EVG 17 
     PhenoSense RAL 4.6 
T66I T66I  PhenoSense BIC 0.4 
     PhenoSense DTG 0.4 
     PhenoSense EVG 8.6 
     PhenoSense RAL 0.8 
T66I_E138K_Q148K T66I, E138K, Q148K  PhenoSense BIC 54 
     PhenoSense DTG 34 
     PhenoSense EVG >114 
     PhenoSense RAL >105 
T66I_E138K_Q148R T66I, E138K, Q148R  PhenoSense BIC 3.7 
     PhenoSense DTG 3.3 
     PhenoSense EVG >114 
     PhenoSense RAL 103 
T66I_Q148K T66I, Q148K  PhenoSense BIC 2.1 
     PhenoSense DTG 1.0 
     PhenoSense EVG >114 
     PhenoSense RAL >105 
T66I_R263K T66I, R263K  PhenoSense BIC 1.5 
     PhenoSense DTG 1.3 
     PhenoSense EVG 84 
     PhenoSense RAL 0.7 
T66I_S153F T66I S153F PhenoSense BIC 0.6 
      PhenoSense DTG 0.6 
      PhenoSense EVG 30 
      PhenoSense RAL 0.6 
V72A   PhenoSense BIC 0.7 
    PhenoSense DTG 0.7 
    PhenoSense EVG 3.2 
    PhenoSense RAL 0.6 
V72A_N155H N155H  PhenoSense BIC 1.0 
     PhenoSense DTG 1.1 
     PhenoSense EVG 36 
     PhenoSense RAL 8.2 
V72I   PhenoSense BIC 0.5 
    PhenoSense DTG 0.6 
    PhenoSense EVG 1.0 
    PhenoSense RAL 1.1 
V72I_S153Y  S153Y PhenoSense BIC 2.0 
     PhenoSense DTG 1.2 
     PhenoSense EVG 2.1 
     PhenoSense RAL 0.7 

Database

Resources

Team