Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Ceccherini-Silberstein (2004)
Title Identification of the minimal conserved structure of HIV-1 protease in the presence and absence of drug pressure.
Citation AIDS
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 479
NumPts 479
Subtype B, F, C, B + F, CRF12_BF, A, CRF02_AG


  Page 1 of 5    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 479 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
1003-500A 1003-500A RTI RTI M41L, M184V, L210W, T215Y A98AG T7TP, T27X, E28EK, E29EK, S48T, S68SGR, K122P, I135T, I142T, T165X, I167X, I178L, Q197L, R211K, A272P, Q278H, K281KR, I293V, V317A A62AG, R83RT, H96HP, G152GA, S156SP, L168L* 
1004A 1004A RTI RTI M41L, D67N, M184V, L210W, T215Y  K104N, D121H, K122E, I135T, S162A, R211K, D218E, A272P, A288T, I293V, E297V V108VA 
1005-502A 1005-502A RTI RTI M41L, L210W, T215Y  D123E, D177N, Q197E, E204EQ, Q207N, R211K, A272P, T286A, I293V, E297KR  
1006A 1006A RTI RTI M184V, T215C K103N, V108I, K238N K49R, R83K, A158S, T165V, Q197E L149LF 
1008-505A 1008-505A RTI RTI M184V  T27S, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, I135T, K173A, D177E, I178M, G196K, T200A, I202V, E203D, Q207E, V245Q, E248D, D250E, A272P, K277R, T286A, V292I, I293V, Q334N, G335D  
1012A 1012A RTI RTI D67N, K70R, M184V, T215V, K219Q  V118I, D123E, I135T, D177E, I178L, F214L, E224D, A272P, K277R, T286A, E297KR V106G 
1014-509A 1014-509A RTI RTI M41L, D67N, M184V, L210W, T215Y, K219N  E44D, T69TA, V118I, K122E, T139M, I142V, S162C, V179I, I202V, H208Y, R211K, L228H, V245VM, K277R, A288S, I293V, E297A  
1016A 1016A RTI RTI   V35T, D123E, I135T, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, R211K, V245Q, A272P, K277KR, T286A, E291D, V292I, I293V, E297T  
1018-513A 1018-513A RTI RTI M184V  K32KR, K102KQ, K122E, S162C, D177E, I178M, V245E, A272P, K277R, I293V, S322T  
1023-516A 1023-516A RTI RTI M184V  V10VA, I135V, T139TA, T286A  
1027-518A 1027-518A RTI RTI M184V, T215Y  K20R, V60I, R83K, I135L, S162Y, A272P, R284K, T286A, I293V, E297R, D324E K101G 
1030-519A 1030-519A RTI RTI M41L, D67N, K70R, M184V, T215Y, K219EQ  V35T, K49KR, V60I, D123E, E169EK, F171Y, K173T, Q174R, G196E, Q207A, R211KQ, F214FL, A272P, K277R, P294S, E297K, S322T, I329L, Q334H  
1037-522A 1037-522A RTI RTI   D123E, S162Y, R211K, F214L, A272P, R284K, T286A, A288S, I293V, E297R  
1038-523A 1038-523A RTI RTI M41L, D67N, K70R, L74I, M184V, L210W, T215Y, K219Q A98G, K103N, V108VI, Y181C, G190A K20R, V35I, E44D, K122E, S162D, T200E, E203K, Q207E, H208Y, R211K, D218E, L228H, V245E, K277R, S322T, D324E  
1051-527A 1051-527A RTI RTI M41L, D67N, M184V, L210W, T215S, K219W  I135T, G196E, T200I, H208Y, R211K, V245I, I293V, E297A  
1062-532A 1062-532A RTI RTI   V60VI, D123E, K173KE, I178IM, G196E, T200A, Q207H, R211K, A272P, K281R, I293V, P294A, E297R, G333E  
1063-533A 1063-533A RTI RTI D67N, K70R, M184V, K219Q  V35M, K43E, K102KE, K166KR, D177E, I178IM, E203EK, A272P, T286TA, V292I, E297K T58P 
1064-534A 1064-534A RTI RTI A62V, M184V  V35I, R83K, K122E, D123E, I135R, R211K, L260LI, A272P, E297K  
106A 106A RTI RTI M41L, D67N, K70R, L74I, M184I, T215F, K219Q Y181C, G190A, H221HY V35L, T39A, V118I, D123E, G196E, R211K, A272P, R284K, E291D, E297R F214M 
1071-539A 1071-539A RTI RTI M184MV  V35T, K49KR, I50V, V60I, R83K, D123E, K166KR, A272P, V276I, K281R, E297K, I329V, Q334E  
1078-543A 1078-543A RTI RTI  K101E, E138A A98S, G196GE, A272P, K277KR, L283LF, I293V, P294T, E297R, K311R  
1082-547A 1082-547A RTI RTI M41L, D67N, T69D, V75A, F116Y, L210W, T215Y, K219R K103N, V179F, Y181C, G190A V35VL, E44D, V111I, V118I, K122E, D123N, S162D, K166R, P170H, T200K, E203V, Q207E, H208F, R211K, K223Q, E224ED, L228H, A272P, L283I, T286A, V292I, I293V, E297R, Q334E K43HQ, K73L, Y146F 
1089-551A 1089-551A RTI RTI M184V  V35T, T39A, V60VI, K122E, D123A, I135T, I142V, D177N, G196E, A272P, K277R, I293V, E297R, E312ED  
1094-553A 1094-553A RTI RTI M41L, M184V  K49R, I50V, R83K, D123E, I135T, K166R, T215X, A272P, K277R, E297K, G335D  
1097-556A 1097-556A RTI RTI M41L, D67N, K70R, M184V, T215Y, K219E K103N K104R, D123E, I135L, R211K, V245E, A272P, K277R, K281R, L283I, I293V, E297K K43N_X 
1101-558A 1101-558A RTI RTI   V35I, R83K, D123E, A272P, K281R, T286P, E297K  
1103-559A 1103-559A RTI RTI M184V  R83K, D123E, I135T, V245E, A272P, K275R, K281KR, R284K, I293V, E297K  
1114-576A 1114-576A RTI RTI M41L, M184V, T215Y  K20R, V35M, T39A, K43KEQ, E44ED, V118VI, K122KR, D123E, I135L, K166R, D177E, V179VI, E203ED, H208HY, L210LS, R211K, A272P, V276VI, R284K, E297K, I329X  
1116-577A 1116-577A RTI RTI M184V K103N, P225PH A98S, K101Q, K104R, D123E, D177N, R211K, A272P, K277R, T286TA, I293V, E297KR  
1137-591A 1137-591A RTI RTI M184V  D123E, V179I, E203K, Q207E, A272P, K281R, A288T, I293V, E297R, L301I  
1138-488A 1138-488A RTI RTI M41L, D67E, T69S_ST, V75M, L210W, T215Y L100I, K103N, E138K K32E, K64R, D123E, D177E, I178M, Q207E, R211K, L228H, L283I, I293V, V317A, Q334QL  
1150-595A 1150-595A RTI RTI M184V  T27TS, K32Q, V35M, V118I, K122E, I135R, I142L, T200A, F214L, T253TS, A272P, R284K, T286A, I293V, E297K, D324E D186H 
1153-598A 1153-598A RTI RTI   A98AS, K102KQ, D123E, I135T, I178L, R211RK, F214L, A272P, T286TA, E297K  
1155-600A 1155-600A RTI RTI M41L, D67N, K70R, T215Y E138A A98S, D123E, T165I, G196E, I202V, A272P, K277R, L283I, R284K, I293V, P294S, E297K, K311R, G333E  
1161-602A 1161-602A RTI RTI   I50IV, R83K, K101R, D123E, K166KR, R211RK, E248ED, A272P, L283LI, R284K, I293V, E297Q  
1170-619A 1170-619A RTI RTI D67N, F116Y, Q151M  T7TA, K11KE, K30KR, K102Q, D123E, N136NT, S162C, E169D, P170L, E194EG, T200TA, R211K, K238KR, A272P, K277R, L283I, I293V, P294A, E297K K13KE, E29EV 
1171-607A 1171-607A RTI RTI M41L, D67N, L74V, M184MV, L210W, T215Y Y181C V35T, K49R, V118I, K122E, D123DE, I135T, S162D, I178L, V179VI, T200E, K201T, I202V, E204K, A272P, K275Q, V276T, K277R, L283I, I293V, E297A, E300Q  
1176-608A 1176-608A RTI RTI M41L, L74LV, L210W, T215Y K101E, Y181C, G190A T39A, E44D, V118I, D123E, D177E, Q197K, R211K, L228H, Q242H, V245K, I257L, A272P, I293V, E297K, S322T, Q334E  
1187-620A 1187-620A RTI RTI A62V, V75I, F77L, F116Y, Q151M, M184V  V35I, S68G, I135T, V245K, I293V, P294Q  
1191-612A 1191-612A RTI RTI M41L, D67N, L74V, L210W, T215Y, K219R A98G, V108I, Y181C V35M, K43Q, E44D, K101Q, V118I, K122E, N136T, I178M, V189I, T200E, E203K, H208Y, R211K, K223T, L228H, Q242H, V245M, K277R, Q278E, L283I, E297R, D324E  
1205-120A 1205-120A RTI RTI M41L, L210W, T215Y  E44D, S68G, D123E, I135T, P176Q, G196E, R211K, L228H, V245E, K277R, I293V, P294S, V317A  
1206-121A 1206-121A RTI RTI M41ML, D67N, M184V, L210W, T215Y  E6K, E44D, S68G, V118VI, K122E, A158S, I178M, V179VG, G196E, Q207K, R211T, K219D, A272P, E297K  
1213-137A 1213-137A RTI RTI   K122E, D123E, I135T, S162C, G196E, R211K, A272P, K281KR, I293IV, E297K  
1215-139A 1215-139A RTI RTI K70R, M184V  K20R, V21I, V60I, K64KR, T69X, D123E, V245KQ, A272P, K281R, E297K  
1216-140A 1216-140A RTI RTI M41L, D67N, L210W, T215Y  K43KE, V118I, D121Y, K122E, I135T, S162C, Q174K, D177E, G196E, A272P, K277R, V292I, E297A  
1222-626A 1222-626A RTI RTI M41L, L210W, T215Y  K43KE, V118VI, K122E, I293V, E297Q  
1229-630A 1229-630A RTI RTI   K49R, R83RK, D123DE, E169D, I178IM, G196E, A272P, K281R, T286TA, E297K  
1252-637A 1252-637A RTI RTI A62V, V75I, F77L, Y115F, F116Y, Q151M, M184V K103S, V108I, G190A E6D, T58N, K64R, S68G, K70X, K101Q, D123E, I135T, S162D, S163SG, K166Q, D177E, T200IM, V245M, A272P, K277R, L283LI, I293V, P294A  
1253-638A 1253-638A RTI RTI M41L, M184V, T215Y  T39TA, K101KQ, K122KE, D123E, I142V, K166R, G196E, A272P, T286A, I293V, E297T, D324E  
1257-639A 1257-639A RTI RTI   V60I, R83K, T107TP, D123E, T200I, R211K, A272P, E297K, A327V  
1262-485A 1262-485A RTI RTI M41L, M184V, T215Y  K101R, K122E, D123E, I135T, S162C, A272P, K277R, T286A, E297K, D324E  
1276-646A 1276-646A RTI RTI   K122KE, D123E, S162C, T200AE, R211K, K238KR, V245E, A272P, K281R, T286A, E297K, I326V  
1277-649A 1277-649A RTI RTI M184V  V35L, R83K, I135T, G196E, R211K, V245E, K277R, T286A, E297R, I329V, Q334L  
1280-652A 1280-652A RTI RTI M184V  V35I, V60I, R83K, D123E, G196E, Q197K, A272P, K281R, I293V  
1283-650A 1283-650A RTI RTI M41L, D67N, T69D, K70R, L74LI, M184V, T215F, K219Q K103KN, Y181IS K101KQ, K102KR, K122E, S162D, V179I, D218E, L228H, V245E, S251N, K277R, T286A, E297R  
1287-658A 1287-658A RTI RTI M184V  K101R, D123E, I135R, D177E, A272P, T286A, E297R, R307RK  
1299-662A 1299-662A RTI RTI M184V  T27S, E28A, S48T, A98S, K122E, D123E, S134SG, I135T, G196GE, F214FL, K249L, A272P, K281R, V292I, I293V, P294T, T296S, E297R  
1303-925A 1303-925A RTI RTI M41L, D67N, L210W, T215Y  P4S, T39A, D123E, I142V, K166R, D177E, A272P, I293V  
1305-665A 1305-665A RTI RTI M184V  V90VI, D123E, K166KR, I180V, R211K, A272P, K277R, I293V, T296S, E297R  
1306-666A 1306-666A RTI RTI D67NT, K70R, M184V, K219E  K11KN, T27TP, I47IF, K49R, E53D, F77FS, K122E, S162N, Q207N, F214L, I293V, P294Q, S322T T84PS, T131TA 
1308-563A 1308-563A RTI RTI K70R, M184V, K219KQ  V35T, T69S, D123E, I135T, G196E, F214L, A272P, K281KR, T286A, E297K  
1312-668A 1312-668A RTI RTI K70R, M184V K103N V60VI, T69N, K101R, D121Y, K122E, I135T, I142V, S162C, T200A, F214L, A272P, K277R, I293V  
1315-564A 1315-564A RTI RTI M184V  S68G, I135T, G196K, Q197K, S251I, T286A, E297T, D324E, I329L K277KM, I326EV 
1320-568A 1320-568A RTI RTI M41L, M184V, L210W K103N K43E, K49R, R211K, K277R, I293V, E297A, E312Q, Q334H T216H, P217Q 
1321-670A 1321-670A RTI RTI M184V  V21I, V35I, D123E, I135T, S162C, Q207E, V245E, A272P, K281R, I293IV, P294PS, E297K, A304AE, Q334L  
1331-673A 1331-673A RTI RTI M41L, D67N, M184V, L210W, T215Y, K219N  E44D, K122E, S162C, I202V, Q207K, R211K, A272P, K277R, Q278H, T286A, P294S, S322T  
1334-675A 1334-675A RTI RTI M184V  R83K, D123E, I135L, K166KR, I180V, A272P, K281R, T286P, E297K  
133A 133A RTI RTI M41L, M184V, T215F K103N, E138EQ K49E, K102Q, D123E, I135T, I142K, G196E, R211K, A272P, Q278QH, T286P, I293V, E297K K73K_R 
1348-684A 1348-684A RTI RTI M41L, D67N, K70R, T215F, K219E Y181C D123E, I135V, S162C, I178M, V179VI, D218E, L228R, E248D, A272P, K281R, V292I  
1349-685A 1349-685A RTI RTI   K11Q, V35VI, K66KR, D121H, K122E, D123S, I135T, S162C, V245E, V276T, K277R  
1354-688A 1354-688A RTI RTI M184V K101P, K103N M16MV, V35PT, S48T, V60I, K122E, I135V, V179I, T200A, F214L, A272P, K277R, I293V, P294T, E297KR, P321PS, I329V  
1355-492A 1355-492A RTI RTI D67N, K70R, T215Y, K219Q  K49R, I135K, D177E, I202V, Q207R, R211K, Q278H, V292I, I293V, K311R  
1368-122A 1368-122A RTI RTI M41L, D67N, T69D, L210W, T215Y G190GA V35IM, K43KQ, E44D, K101X, V118VI, D123E, K166R, D177E, T200TI, R211K, E248ED, A272P, K277R, R284RK, E297K I270IL 
1370-694A 1370-694A RTI RTI M41ML, A62AV, M184V, T215Y  D121H, K122E, I135T, I142IT, Q174K, D177E, V245K, A272P, V292I, I293V, E297T, G333E, Q334HY H198D 
1371-695A 1371-695A RTI RTI   K20R, V179I, R211K, E297K, L301I, I326V, Q334L K275KN 
1378-474A 1378-474A RTI RTI M41L, M184V, T215Y  K122E, I135T, Q197H, R211K, T286A, E291D, P294T  
1379-487A 1379-487A RTI RTI M184V, L210W, T215Y E138A K20R, R83K, D123E, I142V, Y144YF, Q174K, G196E, R211K, A272P, K281R, T286A, P294T, E297R, R307RS  
1382-486A 1382-486A RTI RTI D67N, K70S, M184V, T215Y  T69S, K102KR, I135T, I142V, G196E, I202V, A272P, K275R, Q278N, I293IV L310L_P 
1383-490A 1383-490A RTI RTI M184V  V60I, R83K, D123E, I135T, R211K, K238R, A272P, A288S, E297K, V317A  
1386-479A 1386-479A RTI RTI M41L, M184V, T215Y E138A K102KQ, I135V, I142V, S162T, K173E, D177N, V245EK, A272P, K277R, Q278H  
1389-482A 1389-482A RTI RTI  L100I, K103N, E138Q V21I, D123E, I178M, G196E, R211G, L228R, A272P, K277R, I293V, P294T, E297K, K311R  
138A 138A RTI RTI M184V, T215Y Y188L D123E, V179I, R211K, A272P, T286A, E297R  
1392-467A 1392-467A RTI RTI D67NT, K70R, T215Y, K219Q L100LV K22KN, T27TP, T39TP, D123E, I135T, N136NT, Y146YS, D177E, I195IM, R211Q, T286A, A288S, T296S, E297K, K311R W71WG, K73KN, F77FC, V118VG 
1395-494A 1395-494A RTI RTI M41L, T215Y  V60I, I135V, R211K, D250DE, T286A  
1396-470A 1396-470A RTI RTI D67N, K70R, T215FV, K219Q  E6D, K20R, V35M, D123E, K166KR, D177E, G196E, Q197K, I202V, H208Y, A272P, K277R, T286A, P294A, E297K  
1409-709A 1409-709A RTI RTI D67N, K70R, K219KQ  E28A, K122E, D123E, I135T, R211K, V245X, K249Q, E297K, I329V, Q334E  
1415-713A 1415-713A RTI RTI M184V  V35I, R83K, D123E, D177E, R211K, A272P, K281R, E297K  
1424-717A 1424-717A RTI RTI M184V  K13KR, K122A, I135IM, D177E, L210F, A272P, K277R, T286P, E297R, G333E E89EG 
1433-721A 1433-721A RTI RTI M41L, M184V, T215Y  V35M, R83K, D121Y, K122E, I135T, D177E, Q207K, R211A, A272P, R284K, T286A, E297R, K311R, I329L  
1447-730A 1447-730A RTI RTI M184V  K102KR, D123E, I142V, I180V, R211RS, A272P, T286A, E297R  
1452-735A 1452-735A RTI RTI M41L, D67N, M184V, T215Y  K49R, A98S, I178M, R211K, I293V, K311KR, Q334E  
1453-736A 1453-736A RTI RTI M184V  V35I, T39S, D121Y, K122E, I135T, D177E, Q207A, R211RK, V245S, K249Q, R284K, I293V, P294A, T296S, E297K  
1455-738A 1455-738A RTI RTI D67N, K70R, M184V, K219Q  F214L, T286A, D320DG, Q334C, G335S  
1456-739A 1456-739A RTI RTI D67N, K70R, M184V, T215F, K219Q K103KN P1PL, T69N, V90I, K122E, D123E, I135V, I142Q, S162Y, D177E, I195L, G196K, A272P, K277R, K281R, T286P, P294A, E297K S156SL 
1458-741A 1458-741A RTI RTI M184V K101KE V118I, D123E, F214L, A272P, E297R  
1462-743A 1462-743A RTI RTI M41L, D67N, L210W, T215Y  K43N, V60VI, R72RG, A98AS, K101KR, V118I, K122KE, I135L, K166R, D177N, V179I, Q197H, T200A, I202IL, R211K, A272P, K277R, I293IV, E297K, Q330QP  
146A 146A RTI RTI D67N, K70R, M184MV V106VA K32R, V35T, S48E, V60I, K101R, T107TP, D121DY, D123E, T139Q, A158AS, R172RK, A272P, K277R, T286A, P294T, E297K Y146YF 
1470-748 1470-748 RTI RTI   D123E, S162C, D177E, R211K, V245R, A272P, K277R, T286A, E297HQ, D324E, I329L, G333E  
1474-750A 1474-750A RTI RTI M41L, D67N, M184V, T215Y, K219Q  V35R, T39A, K43E, V60I, V118I, K122E, D123G, I135T, D177E, E203D, R211RK, E224D, P226S, A272P, K281R, T286A, E297A, V317A  
761 761 RTI RTI M184V, L210W, T215Y Y181C, G190GA E44ED, D123E, G196E, R211RKQ, A272P, K275R, T286TA, I293IV, E297K, G335D