Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Ceccherini-Silberstein (2004)
Title Identification of the minimal conserved structure of HIV-1 protease in the presence and absence of drug pressure.
Citation AIDS
SelectedGene PR
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 478
NumPts 478
Subtype B, F, C, B + F, CRF12_BF, A, CRF02_AG


  Page 1 of 5    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 478 Clinical PR Isolates

1003-500A 1003-500A PI  M46I, L90M Q58E, G73S L10I, I13V, E34EK, L63P, A71T, V77I, R87RK  
1004A 1004A PI    T12N, R41K, L63P, I64V, I72V  
1005-502A 1005-502A PI  I54A, V82T  L10I, I15V, E35D, M36I, N37E, K55KR, D60E, I62V, L63P, A71V, I85V  
1006A 1006A PI    G16E  
1008-505A 1008-505A PI  L90M  T12S, L19I, K20I, E21EG, E35G, M36I, R41K, L63P, H69K, T74S, V82I, L89M, I93L A22AP 
1012A 1012A PI    T4TP, T12S, I13V, L63P, H69K  
1014-509A 1014-509A PI  M46I, L90M Q58QE, G73S L10LI, K14KR, I15V, G16A, L19LP, K20IMV, I62V, L63P, V77I  
1016A 1016A PI    T12N, I15V, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, Q61E, I62V, L63X, E65D, T74S  
1018-513A 1018-513A PI  D30N  M36I, N37S, I62V, L63P, I93L  
1023-516A 1023-516A PI  D30N  L10LI, R41K, I64V, A71AV  
1027-518A 1027-518A PI  D30N K20T, N88D I15V, E35D, M36I, L63P, H69Q, A71IT, I85V  
1030-519A 1030-519A PI  L90M  E35D, M36I, R41K, R57K, Q61D, I72V, L89M  
1037-522A 1037-522A PI  L90M  G16A, L19V, E35D, M36V, I62V, L63P, H69N  
1038-523A 1038-523A PI  I84V, L90M G73S L10I, D60E, I62V, L63P, A71V, V77I, I93L  
1051-527A 1051-527A PI  G48V, I54V  Q7R, I72IV, V77I  
1062-532A 1062-532A PI    L63T, G68E, A71V, I72T, I93L  
1063-533A 1063-533A PI  M46I, I54V, V82A L24I, G73S L10I, I15V, E35D, M36I, N37D, K55R, L63P, H69K, A71V, I72L  
1064-534A 1064-534A PI    L10I, I13V, Q61H, L63P, I72V, V77I  
106A 106A PI  G48V, I54T, V82A  L10I, L19E, K20R, E35D, M36I, N37D, L63P, A71V, Q92K  
1071-539A 1071-539A PI    E35D, M36I, N37D, L63P, H69K  
1078-543A 1078-543A PI    R41K, D60E  
1082-547A 1082-547A PI  M46L, I54V, I84V L24I, G73V, T74P L10I, I15V, L19LP, K20I, E35N, M36I, R41K, I62V, L63P, I72V, I85V  
1089-551A 1089-551A PI  D30N N88D I15V, E34ED, E35ED, M36I, R41K, R57K, Q61N, L63P, I64L, I93L  
1094-553A 1094-553A PI  L90LM G73GS L10LV, T12TS, I13V, K14KR, L19I, L63P, H69HY, A71AT, I72IM, I93IL Y59YC 
1097-556A 1097-556A PI    L10I, N37D, I62V, L63S, H69N, A71T, I72V, V77I  
1101-558A 1101-558A PI    N37NS, R41RK, I62V, L63AS  
1103-559A 1103-559A PI  L90LM  L10V, I13IV, K14R, Q61E, I62V, L63P  
1114-576A 1114-576A PI  V32I, M46I, I47V, V82A, L90LM K43T L10I, K55KR, L63P, A71T, I72E, V77I, I93L, C95F  
1116-577A 1116-577A PI  V32I, M46ML, V82A, I84IV L33LF I15IV, K20R, M36I, L63P, A71V  
1137-591A 1137-591A PI    L63P  
1138-488A 1138-488A PI  M46L, I84V L33F, F53L, T74P E34Q, N37K, R41K, K55H, I62V, L63P, A71V, I72V, V77I, I93L  
1150-595A 1150-595A PI  V82VA  L10V, I13V, I15V, M36MI, L63P  
1153-598A 1153-598A PI    L10I, I15V, M36I, N37T, I62V, L63S, C67D, H69K  
1155-600A 1155-600A PI  V32I, M46I, V82A  L63A, A71V, I72IV  
1161-602A 1161-602A PI    T12S, L63PS, H69HQ  
1170-619A 1170-619A PI  V32I, M46I, I47V, V82A  M36L, N37S, I62V, L63P, I64V, I93L  
1171-607A 1171-607A PI  V32I, M46I, I47IV, V82A, L90M L10F, K43T, F53FL G16E, R41RK, L63P, A71V, I93L  
1176-608A 1176-608A PI  M46I, N88S, L90LM L10LF I3V, N37D, D60E, Q61D, I62IV, L63P, H69K, T74TA, V77I, I93L  
1187-620A 1187-620A PI  D30N, M46L L10F, N88D N37K, K45R, K55N, L63P  
1191-612A 1191-612A PI  V32I, M46I, I47V, I54L, V82A, L90M L33F, G73S I15V, Q18E, K20R, E35D, M36I, I62V, L63P, A71V, I72V  
1205-120A 1205-120A PI  I54V, V82A, L90M L33F, Q58QE I13V, A71AV, V77I  
1206-121A 1206-121A PI  M46I, I84V, L90M G73T L10I, K20X, R41K, I62V, L63P, I72L, P79H  
1213-137A 1213-137A PI    R41K, I62V, L63S  
1215-139A 1215-139A PI    I15V, M36I, N37S, I62V, L63P, H69Q  
1216-140A 1216-140A PI  V32I, M46L, V82A, L90M L10FI I13V, K20R, E35D, M36I, N37D, I62V, L63P, I64IV, E65D, A71V, I72V  
1222-626A 1222-626A PI  L90M G73S L10LI, I13V, I15V, K20KM, I62V, L63P, A71T  
1229-630A 1229-630A PI    W6WC, I64V  
1252-637A 1252-637A PI  G48V, I54V, V82T, I84V, L90M K43T L10IV, I15IV, L19I, K20R, M36I, N37ND, L63P, A71V, I72IV, I93L  
1253-638A 1253-638A PI  L90M  I13V, K20IV, K43KR, L63P, A71V, I72IV, T74S, V77I  
1257-639A 1257-639A PI    E35D, M36I, N37D, I64V  
1262-485A 1262-485A PI  D30N N88D L10I, I13V, Q61QH, I62V, L63P, H69HN, A71T, I72V, V77I  
1276-646A 1276-646A PI    E35D, M36I, I64V, H69K  
1277-649A 1277-649A PI    N37T, R41K, I62V, I64V, T74A  
1280-652A 1280-652A PI    I13V, K20M, M36I, I64V  
1283-650A 1283-650A PI  M46I, G48V, I54T, V82A  L10I, I62V, L63P, A71I, I93L  
1287-658A 1287-658A PI  L90M  I15V, L63P, H69N, A71T  
1299-662A 1299-662A PI  V32I, M46I, V82A, L90M  T12N, L19Q, K20R, M36I, I62V, L63P, C67F, H69K, A71V  
1303-925A 1303-925A PI  G48V, I54V, V82A L24I, L33F, K43T L10Y, I15IV, K20M, E35ED, M36I, I62V, L63P, A71T, I72E, T91A  
1305-665A 1305-665A PI    L10LV, T12I, I15V, G16GE, N37D, I62V, L63H, H69N, I72V, V77VI  
1306-666A 1306-666A PI  V32I, M46L, V82A, L90M  E35D, L63P, A71V, L89LI V75VA 
1308-563A 1308-563A PI    G16E, E35ED, M36I, L63C, H69K  
1312-668A 1312-668A PI  D30N N88D I13V, I15IV, L19V, K45KR, A71AV  
1315-564A 1315-564A PI  L90M L10F, N88D I13V, K14R, K20R, L33I, M36I, N37D, I62V, L63P, A71T  
1320-568A 1320-568A PI  M46I, I84V  L10I, R41K, L63P, V77I, L89M, Q92QR, I93L  
1321-670A 1321-670A PI  M46ML  K14R, R41K, L63P, V77I, Q92QR, I93L V82VD 
1331-673A 1331-673A PI  V32I, M46I, I47A  I13V, G16E, K20I, E35D, M36I, I64V, I72V  
1334-675A 1334-675A PI  M46MI, N88S  L19Q, L63P  
133A 133A PI    R57RK, I62IV, L63P, H69N, A71AT, V77I  
1348-684A 1348-684A PI  M46I, I54V, V82A L24I L10I, L19I, R41K, K55R, D60E, L63P, I64V, T74TS  
1349-685A 1349-685A PI    T12Q, L19I, N37S, I72V  
1354-688A 1354-688A PI  L90M G73C L10V, I15V, G16E, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, Q61N, I72R, I93L  
1355-492A 1355-492A PI  L90M L10LF, K20KT, G73S, N83D I13V, K14R, M36ML, R41K, I62V, L63P, A71V, V77VI, I93L R57E, Q58S 
1368-122A 1368-122A PI  G48GV, I54IV, L90LM K43KT L10LI, L63AP, H69HR, V77VI, I93IL, C95CF  
1370-694A 1370-694A PI  M46L, V82A  L10I, I15V, K20R, M36I, I62V, I93L  
1371-695A 1371-695A PI    L10I, I13V, E35D, M36I, N37D, R57K, I62V, L63T, A71T, I72T, I93L  
1378-474A 1378-474A PI  D30N, M46I N88D I13V, K14R, L19I, E35D, N37D, L63P, V77I, I93L  
1379-487A 1379-487A PI  I54V, L90M  L10I, I62V, L63P, C67E, H69KR, A71V, V77I V82G 
1382-486A 1382-486A PI  M46I, I54V, V82L L24I L63P, H69Q, A71X, V77I  
1383-490A 1383-490A PI  D30N N88D T12S, I15V, G16A, L19T, K20I, L63P, H69N, A71V, V77I  
1386-479A 1386-479A PI  M46I, L90LM  K20I, L63P, A71AT, V77VI, I93IL  
1389-482A 1389-482A PI  L90M G73S L10IV, L63P, A71V, I72IT, V77I, I93L  
138A 138A PI    L10I, N37C, I62V, L63P, H69N, V77VI, V82VI  
1392-467A 1392-467A PI  L90M K20T L10V, I13V, K14KR, I15IV, Q18QH, E35D, M36MI, R41K, D60E, I62IV, L63PS, I64IV, A71X, I72IT, V77VI, Q92R  
1395-494A 1395-494A PI    M36L, L63T, A71V, T74A, V77I, I93L  
1396-470A 1396-470A PI  M46I, L90M  L10I, I62V, L63P, I64L, I72V, V77I, Q92K, I93L  
1409-709A 1409-709A PI  D30N  I13V, K14R, K20KR, E35D, M36I, R41K, Q61E, L63P, I64L, A71IV, I93L  
1415-713A 1415-713A PI    K14R, N37D, L63P, C67H, H69K  
1424-717A 1424-717A PI  L90M G73GS L10LI, E35D, M36V, N37E, D60E, I62IV, L63P, H69K, A71AV, I85IV, I93IM  
1433-721A 1433-721A PI  L90M K20T I13IV, I15IV, E35D, M36I, F53I, I62V, L63P, H69N, A71V, I72V, I93IL  
1447-730A 1447-730A PI    I15V, R41K, K43R, R57K, L63X, E65ED, A71V, I93L  
1452-735A 1452-735A PI  M46I K20T L10LI, I13V, L19Q, E35D, I64V, E65D, T74S, I93L  
1453-736A 1453-736A PI  D30N N88D I13V, K14KR, N37A, L63P, H69K, A71V, V77I  
1455-738A 1455-738A PI  M46L, I54V, V82A L24I, L33F, G73S L10I, E35ED, M36L, K55R, I62V, L63P, I66F, A71V, I72M, V77VI  
1456-739A 1456-739A PI  V32I, M46I, I47V, V82A, L90LIM K43KT, G73GS L10I, K55KR, L63P, H69T, A71AV, V77I, I85IV, I93IL  
1458-741A 1458-741A PI  L90M  L10V, I13V, L19Q, E34D, M36I, K45R, D60E, I62IV, L63P, I64V, H69HQ, K70E  
1462-743A 1462-743A PI  D30N N88D L10I, E34ED, E35EDG, M36I, R41K, L63P, I64V, K70R, T74S, I93L  
146A 146A PI  M46I, N88T G73T K20I, L63LP, H69K  
1470-748 1470-748 PI    N37D, L63P, I64L, V77I, I93L  
1474-750A 1474-750A PI  V32I, M46MI, L90M K43T L10V, I13V, I15IV, K20R, E35D, M36I, N37S, L63P, I66F, A71V  
761 761 PI    N37D, I64V