Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Rouet (2017)
Title Massive Iatrogenic Outbreak of Human Immunodeficiency Virus Type 1 in Rural Cambodia, 2014-2015.
Citation Clin Infect Dis
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 216
NumPts 216
Subtype CRF01_AE, CRF02_AG

 
  Page 1 of 3    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 216 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
NCHADS001 NCHADS001 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79ED, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS002 NCHADS002 None None   K11X, Q23QP, V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E K22KT 
NCHADS003 NCHADS003 None None   G18D, I31IL, V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E A33AT 
NCHADS004 NCHADS004 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS005 NCHADS005 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS006 NCHADS006 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79ED, K122E, D123S, T165TI, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS007 NCHADS007 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79ED, T107TS, K122E, D123S, T165TI, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS008 NCHADS008 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS009 NCHADS009 None None   E29EK, V35T, T39K, E40EG, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E A33T 
NCHADS011 NCHADS011 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, I135IT, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E A33AT 
NCHADS012 NCHADS012 None None   K30E, V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS013 NCHADS013 None None   M16K, V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, I135IT, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E K13S, A33AT 
NCHADS014 NCHADS014 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, I135IT, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E A33AT 
NCHADS015 NCHADS015 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS016 NCHADS016 None None   E29ED, V35T, T39K, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E K43EV, K46KM 
NCHADS017 NCHADS017 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS018 NCHADS018 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, T165TI, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS019 NCHADS019 None None   V35T, T39K, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E K43EV 
NCHADS020 NCHADS020 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79ED, K122E, D123S, E169ED, K173I, Q174K, D177E, V179IT, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS021 NCHADS021 None None   K20KR, V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79ED, K122E, D123S, E169ED, K173I, Q174K, D177E, V179IT, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS022 NCHADS022 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS023 NCHADS023 None None   K11X, V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79ED, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E V111VM 
NCHADS024 NCHADS024 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200EG, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS026 NCHADS026 None None   E29EK, V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79ED, K122E, D123S, S162SC, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS027 NCHADS027 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS028 NCHADS028 None None   P25A, V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E G18E, Q23K, T27K, I31K 
NCHADS029 NCHADS029 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS031 NCHADS031 None None   G18D, P19Q, V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS032 NCHADS032 None None   G18D, P19Q, V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173R, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E I37IN 
NCHADS033 NCHADS033 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS034 NCHADS034 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS041 NCHADS041 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, D121DE, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS042 NCHADS042 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS043 NCHADS043 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79ED, K122E, D123S, E169ED, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS044 NCHADS044 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, E169ED, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS045 NCHADS045 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79ED, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, E204EK, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS050 NCHADS050 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79ED, D121DE, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS051 NCHADS051 None None   L34I, V35K, T39K, K43E, V60I, K64R, E79ED, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E A33E 
NCHADS052 NCHADS052 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS053 NCHADS053 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS054 NCHADS054 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS055 NCHADS055 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79ED, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS057 NCHADS057 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, A158AS, S162SC, T165TI, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS058 NCHADS058 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, E204K, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS059 NCHADS059 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79ED, K122E, D123S, T165TI, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS060 NCHADS060 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS061 NCHADS061 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, R206RK, Q207A, R211S, K220KN, K238R H221R 
NCHADS062 NCHADS062 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS063 NCHADS063 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79ED, K122E, D123S, K173IR, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS064 NCHADS064 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79ED, K102KR, K122E, D123S, S162SC, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS065 NCHADS065 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79ED, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS066 NCHADS066 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173IT, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS067 NCHADS067 None None   G18X, P19X, K20X, V21X, K22X, Q23X, V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS068 NCHADS068 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79ED, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS069 NCHADS069 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS070 NCHADS070 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS071 NCHADS071 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173IT, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, E233G, K238R, V245E  
NCHADS072 NCHADS072 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS073 NCHADS073 None None   E29K, V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS074 NCHADS074 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS075 NCHADS075 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS076 NCHADS076 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS077 NCHADS077 None None   E6G, V10X, K11X, V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS078 NCHADS078 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, I135IT, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS079 NCHADS079 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, E204K, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS080 NCHADS080 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS081 NCHADS081 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245EK  
NCHADS082 NCHADS082 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS086 NCHADS086 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS087 NCHADS087 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, K122E, D123S, E169D, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS089 NCHADS089 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245N  
NCHADS091 NCHADS091 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS092 NCHADS092 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS093 NCHADS093 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS101 NCHADS101 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79ED, K122E, D123S, T165TI, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS102 NCHADS102 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS104 NCHADS104 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS105 NCHADS105 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS106 NCHADS106 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79ED, K122KE, D123S, I142IT, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS109 NCHADS109 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79ED, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS110 NCHADS110 None None   E29K, V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS113 NCHADS113 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79ED, K122KE, D123S, T165I, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS114 NCHADS114 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, K103KR, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS115 NCHADS115 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79ED, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS117 NCHADS117 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS118 NCHADS118 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS119 NCHADS119 None None   I31T, V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R  
NCHADS120 NCHADS120 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, D237DN, K238R, W239G, V245E  
NCHADS121 NCHADS121 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, K122E, D123S, I135R, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS122 NCHADS122 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E T128TA 
NCHADS123 NCHADS123 None None   V35T, T39K, K43E, E53G, V60I, K64R, K122E, D123S, A158AP, I159IL, S162C, K173I, Q174EK, D177AE, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E Q161QE 
NCHADS124 NCHADS124 None None   K30KE, V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, W88WC, K103R, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS126 NCHADS126 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS127 NCHADS127 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79ED, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS128 NCHADS128 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS129 NCHADS129 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS130 NCHADS130 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, T165TI, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS131 NCHADS131 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, K122E, D123S, E169D, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS132 NCHADS132 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79D, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
NCHADS133 NCHADS133 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, E79ED, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  

Database

Resources

Team