Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Dow (2017)
Title HIV Resistance and Prevention of Mother-to-Child Transmission Regimen in HIV-Infected Infants in Northern Tanzania.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 67
NumPts 67
Subtype A, C, D, B, CRF02_AG

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
13698 13698 None None   E6K, V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, D123N, K173A, D177E, T200I, Q207E, R211N  
13736 13736 None None  E138A V35T, T39A, V60I, K122E, D123S, I135T, I142V, R172K, K173S, Q174K, D177G, V179I, G196E, T200A, I202V, Q207A, R211S, F214L Y183YC 
13742 13742 None None M184V  P4ST, V35S, T39A, K49R, V60I, D121H, K122E, E169D, D177E, I178L, T200I, Q207G, R211K  
13787 13787 None None   V35T, T39N, S48T, R78K, K122E, D123N, I142V, K166R, K173T, D177E, I178L, G190R, I195IV, T200A, Q207E, R211K, W212* G18S 
13796 13796 None None  Y188L K11T, K20R, V21I, V35T, T39R, K43E, V60I, K66R, K122E, D123N, I135T, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178M, V179I, G196E, T200A, Q207A, R211S  
13799 13799 None None   V21I, V35T, K49R, V60I, V90I, D121Y, K122E, I142V, D177E, I178M, T200I, Q207G, R211K  
13802 13802 None None   V35T, K49R, V60I, V90I, K122E, D123S, I135R, A158S, E169D, K173S, Q174K, I178M, T200A, Q207D, R211K  
13870 13870 None None  K103N V35T, T39L, V60I, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, F214L  
13883 13883 None None   K20R, V35T, K49R, V60I, K122P, I135T, Y144F, Q145C, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211K  
14022 14022 None None   P4H, V8I, K11T, V21I, V35T, T39N, G45GE, V60I, W88S, V118I, K122E, D123N, D177E, I178L, T200I, Q207N, R211K, F214L  
14039 14039 None None   V35T, S48T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
14047 14047 None None   V35T, E36X, T39E, S48T, K102Q, K122E, D123G, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207K, R211G  
14100 14100 None None Q151QL  V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, S68T, K82R, K122E, D123N, S162N, K173S, Q174K, D177E, I178L, E194K, T200V, Q207E, R211K, F214L  
14159 14159 None None   V35T, K49R, V60I, V90I, K122E, D123S, I135R, A158S, E169D, K173S, Q174K, I178M, T200A, Q207D, R211K  
14187 14187 None None  Y181C V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, K173T, Q174K, D177E, T200E, I202V, Q207E V8E 
14189 14189 None None   K13KR, V35T, T39A, E40D, V60I, D121H, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, Q207A D192DG 
14207 14207 None None   P9T, V35T, K43E, K49R, V60I, K122E, D123N, I135T, E169D, K173L, Q174K, D177E, I178V, V179I, T200A, Q207A, R211K, F214L  
14213 14213 None None  Y181C V35T, K49R, V60I, K122E, D123S, K173S, Q174K, D177E, G196E, Q197K, Q207A, R211K  
14281 14281 None None  E138A G15GE, V35T, E40D, K43N, V60I, V118I, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174K, D177G, V179I, T200A, I202V, Q207D, R211S, F214L  
14288 14288 None None   K20R, V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, T165I, K173S, Q174K, D177E, V179I, G196E, K201R, Q207A, R211S  
14531 14531 None None  Y181C V35T, E36A, T39E, E40D, K43R, K49R, V60I, W88S, K122E, D123N, I135L, I159V, K173T, D177E, T200A  
14573 14573 None None   V35T, T39A, K43R, S48E, V60I, K122E, D123N, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
14574 14574 None None   V35T, T39A, K43R, S48E, V60I, K122E, D123N, K173S, Q174K, D177E, T200A, E203D, Q207E  
14836 14836 None None  Y181C V21I, E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, K49R, W88S, K122E, D123N, I135L, I159V, K173T, D177E, T200A, Q207E  
14870 14870 None None  Y181C P9A, V35T, V60I, R72X, T165A, R172K, D177E, I178M, G196K, T200I, Q207D, R211K  
14876 14876 None None  Y181C V35T, V60I, K122E, D123S, K173S, Q174K, D177E, I178L, V179I, T200A, Q207A, R211S C38CR 
14878 14878 None None  E138A, Y188L V35T, T39K, S48T, K122E, D123S, R172K, K173V, Q174K, D177G, T200A, Q207E, R211K  
15207 15207 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, D121Y, K122E, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
15213 15213 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, D177E, T200K, E203D, E204D, Q207D, R211K  
15589 15589 None None K219E Y181C V35T, T39A, E44D, V60I, V118I, K122E, I135T, K173S, Q174K, D177E, Q197K, I202V, Q207E, R211S, F214L  
15623 15623 None None  A98G, K103N, Y181C K11N, V35T, T39L, V60I, D121Y, K122E, D123G, K173S, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S  
15672 15672 None None  Y181C V35T, K49R, V60I, K122E, I135T, T165I, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
15724 15724 None None K65E  E28A, V35T, V60I, I135T, S162F, K173S, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207K, R211G D17CY 
15779 15779 None None  Y181C V35T, T39M, K122E, D123S, I135T, K166R, K173A, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F214L  
15800 15800 None None  V106A V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, S162X, K173T, Q174K, I178L, T200A, Q207E Q161S 
15819 15819 None None   E29K, V35T, E40D, V60I, K122E, D123S, I135T, I142V, K166R, K173L, Q174R, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S  
15872 15872 None None D67DG E138K, G190A V35T, T39A, V60I, K64R, D121Y, K122E, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, H208Y, R211K, F214L F160L 
16020 16020 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, F77S, W88*, K122E, I135R, G155R, K173A, Q207E, R211K G18R 
16102 16102 None None  K103N K22R, V35T, T39A, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, I142V, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K  
16124 16124 None None  E138A K11E, V35T, E36A, T39E, S48T, E53D, V60I, D121H, K122E, D123S, I135V, I142V, K173A, Q174K, D177E, I178V, Q197K, T200A, Q207A, R211K  
16127 16127 None None  E138A K11E, V35T, E36A, T39E, S48T, E53D, V60I, D121H, K122E, D123S, I135V, I142V, R172K, K173A, Q174K, D177E, I178V, Q197K, T200A, Q207A, R211K  
16291 16291 None None   V35T, E36D, E40D, V60I, D121H, K122E, D177E, T200I, Q207E, R211K P133PS 
16373 16373 None None  E138G M16T, K20R, V21I, V35T, K49R, I50V, V60I, K122E, D123S, I135T, S163T, T165I, K173S, Q174K, D177E, V179S, T200A, Q207A, R211S V189E 
16461 16461 None None  K103N V35T, K49R, V60I, K122E, D123S, I135T, Q151QR, E169D, K173S, Q174K, D177E, V179I, G196E, T200A, Q207A  
16531 16531 None None   K11R, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, K173T, Q174K, T200A, R211K  
16587 16587 None None K70R, K219E Y181C P4H, K20R, V35T, T39I, V60I, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, I178V, V179I, T200A, I202V, E204D, Q207A, R211S, F214L  
16612 16612 None None   V35T, T39A, S48T, V60I, K122E, D123S, I135M, S162X, K166R, T200A, Q207E D110G, Q161R 
16659 16659 None None M41L, D67N, K70R, M184V, T215Y Y188L P4H, M16I, T27S, V35T, T39E, G45R, G51R, E53K, V60I, W88*, G112E, K122E, D123N, I135R, W153*, G155R, S162C, K173A, D177E, G190R, G196K, T200A, Q207E, W212* G141K, G152R 
16762 16762 None None  Y181C V35T, E36A, T39D, S48T, G51R, W88*, K122E, D123G, W153*, K173T, D177E, G196R, T200A, Q207V, R211K, W212*  
16901 16901 None None  K103S E28G, V35R, E44D, V60I, K102Q, K122E, D177E, I178M, V179VI, D192N, T200I, I202V, Q207E, R211K  
16946 16946 None None   V8I, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123N, I135L, P170L, K173N, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207D  
16963 16963 None None M41L, D67N, K70R, M184V, T215Y, K219E Y188L P4H, T27S, V35T, T39E, V60I, K122E, D123N, I135R, S162C, K173A, D177E, T200A, Q207E P97T 
17038 17038 None None   V35T, E36D, V60I, S105A, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211N  
17139 17139 None None   V35T, E44D, S117SP, K122E, D123S, I142V, D177E, Q207E, R211K  
17214 17214 None None   E28A, V35T, V60I, K104R, D121C, K122E, K173S, Q174K, D177E, V179I, I195IT, T200A, I202V, Q207A, R211S  
17341 17341 None None M184V K101E, G190A P4T, V35T, K122E, D123N, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L R199RI 
17561 17561 None None   V21I, V35T, E36D, T39R, S48E, V60I, V90I, K122E, D123N, T165I, K173S, T200A, I202V, Q207G, R211K  
17575 17575 None None T215S  K11E, E28K, V35T, T39L, I50V, V60I, D121H, K122E, D123G, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, F214L H208HR 
17648 17648 None None K219N V179E, Y181C, Y188H E6D, V35T, E36D, K102Q, K104R, K122E, S162A, K166KN, K173V, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
17793 17793 None None   E28K, K32E, V35T, T39A, K122E, D123S, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, F214L  
18499 18499 None None   V35T, T39R, S48E, K49R, V60I, D121Y, K122E, D123E, I135T, K173L, Q174K, V179I, Q207A, R211S M184MR 
18578 18578 None None   E6D, V35T, T39A, S48T, V60I, K122E, D123S, K166R, Q174L, D177E, T200K, Q207A, R211K  
18874 18874 None None   V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174K, G196E, Q207A, R211S Q161L 
19023 19023 None None   E6K, V35T, E36A, T39D, S48T, F116FS, K122E, K173A, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K  
19034 19034 None None   K20R, V35T, T39K, K43E, K122E, D123G, I135R, K173S, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S, F214L  
19140 19140 None None  Y181C T27TS, L34LF, V35T, I50IT, V60I, D121Y, K122E, D177E, G196R, T200I, Q207E, R211K  
19366 19366 None None   P4S, P14L, V35T, E36A, T39D, S48T, K104R, K122E, D123N, K173V, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  

Database

Resources

Team