Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Dow (2017)
Title HIV Resistance and Prevention of Mother-to-Child Transmission Regimen in HIV-Infected Infants in Northern Tanzania.
Citation ARHR
SelectedGene PR
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 67
NumPts 67
Subtype A, C, D, B, CRF02_AG

 

Clinical PR Isolates


SubjectIsolatePIsWksPIMajorPIMinorCommonUnusual
13698 13698 None    T12S, I15V, L19M, M36I, N37K, R41N, H69K, L89M, I93L  
13736 13736 None    K20R, E34K, E35D, M36I, R41K, K45R, R57K, L63A, H69K, L89M  
13742 13742 None    I13V, G16E, R41K, I72R, V75I, V77I  
13787 13787 None    T12S, L19I, M36I, H69K, T74A, L89M, I93L G51R 
13796 13796 None   L33F I13V, E35D, M36I, R41K, R57K, D60E, I62V, H69K, L89M  
13799 13799 None    G16E, E35D, M36I, R41K, R57K, L63Q, I64V, E65D, I72T D25DG 
13802 13802 None    I13V, L33V, E35D, M36I, N37D, L38W, R41K, K45R, R57K, L63P, H69K, L89M G17K 
13870 13870 None    K20R, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, V77I, L89M  
13883 13883 None    I13V, I15V, G16A, E35D, M36I, R41K, R57K, L63Q, H69K, L89M  
14022 14022 None    L10I, I13V, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M  
14039 14039 None    L10I, I13V, E35D, M36I, N37D, R57K, L63A, H69K, L89M  
14047 14047 None    L19I, M36I, N37K, R41N, H69K, I72V, L89M, I93L  
14100 14100 None    T12S, I15V, L19I, K20R, E35D, M36I, N37K, R41N, R57K, L63T, H69K, V82I, I93L  
14159 14159 None    I13V, L33V, E35D, M36I, N37D, L38W, R41K, K45R, R57K, L63P, H69K, L89M G17K 
14187 14187 None    T12A, K14R, I15V, G16E, M36I, N37K, R41N, L63T, I72M, V82I, L89I, I93L H69EK 
14189 14189 None    L10V, K14R, E35D, M36I, N37D, R41K, K45R, R57K, H69K, L89M  
14207 14207 None    I13V, K14R, E35D, M36I, R41K, R57K, L63S, H69K, L89M  
14213 14213 None    I13V, G16E, E35N, M36I, R41K, K45R, R57K, L63T, G68E, H69K, I72T, L89M  
14281 14281 None    L10I, I13V, M36I, K43R, R57K, L63P, H69K, K70Q, L89M  
14288 14288 None    L10I, I13V, G16E, L19S, K20R, E35D, M36I, R41K, R57K, L63H, H69T, L89M  
14531 14531 None    T12S, L19I, K20R, M36I, N37K, R41N, L63P, H69K, L89M, I93L  
14573 14573 None    I13V, I15V, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M  
14574 14574 None    I13V, K14E, I15V, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M  
14836 14836 None    T12S, L19I, K20R, M36I, N37K, R41N, L63P, H69K, L89M, I93L  
14870 14870 None    M36I, R41K, R57K, L63P, H69Y, I72T, V82I  
14876 14876 None    I13V, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, D60E, H69K, L89M  
14878 14878 None    L10I, K14R, L19V, M36I, R41N, L63T, H69Q, L89M, I93L  
15207 15207 None    I15V, N37K, R41N, L63T, H69K, V77I, I93L  
15213 15213 None    L10I, I13V, K14R, L19I, R41K, I64V, C67S, H69Y, V77I  
15589 15589 None    T12S, I15V, L19I, M36I, N37K, R41N, K45R, L63A, H69K, V82I, L89M, I93L  
15623 15623 None    K14R, E35D, M36I, N37E, R41K, R57K, D60E, H69K, L89M  
15672 15672 None    I13V, E35D, M36I, N37D, K45R, R57K, L63P, H69K, L89M  
15724 15724 None    Q7D, L10I, I13V, I15V, G16E, E35D, M36I, R41K, R57K, L63G, H69K, I72V, L89M D30G 
15779 15779 None    I13V, E35D, M36I, R41K, R57K, L63Q, H69K, L89M  
15800 15800 None    T12S, I15V, L19V, M36I, H69K, T74S, L89M, I93L  
15819 15819 None    L10V, I13V, I15V, L33V, E35D, M36I, R41K, R57K, L63V, G68E, H69K, L89M  
15872 15872 None    K20R, E21G, E35D, M36I, N37E, R41K, R57K, D60E, Q61E, I62V, C67*, H69K, L89M  
16020 16020 None   N88ND I15V, L19I, M36I, R41K, D60E, L63S, H69K, L89M, I93L G27R, G51R 
16102 16102 None    T12A, I13V, K14R, E35D, M36I, R41K, R57K, D60E, I62V, L63P, H69K, L89M  
16124 16124 None    T12S, L19I, M36I, R41K, L63P, H69K, T74S, L89M, I93L  
16127 16127 None    T12S, L19I, M36I, R41K, H69K, T74S, L89M, I93L Q92Q* 
16291 16291 None    L10I, I13V, L33V, M36I, N37S, R41K, I64V, K70R, I72E  
16373 16373 None    I13V, E34D, E35D, M36I, L38V, R41K, K45R, R57K, L63P, H69K, L89M R87G 
16461 16461 None    I13V, K14R, E35D, M36I, R41K, R57K, L63P, H69K, L89M  
16531 16531 None    T12S, K14R, I15V, L19I, E35D, M36I, R41K, L63T, H69K, L89M, I93L  
16587 16587 None    I13V, L19T, E35D, M36I, R41K, K45R, R57K, L63S, H69K, L89M  
16612 16612 None    T12S, I13V, I15V, G16E, L19I, K20R, M36I, N37K, R41K, D60E, I62V, L63V, H69K, T74S, L89M, I93L  
16659 16659 None    T12S, I13V, I15V, G16E, L19I, M36I, L63A, G68E, H69K, G78R, I93L G51R, G86R, G94R 
16762 16762 None    I15V, L19I, E35D, M36I, R41K, W42*, G49E, L63T, H69K, I93L G86R, R87G 
16901 16901 None    R41K, Q61N, L63C, V75I  
16946 16946 None    I13V, K14KE, K20R, M36I, R41N, I64V, H69K  
16963 16963 None    T12S, I13V, I15V, G16E, L19I, K20R, M36I, L63A, H69K, I93L  
17038 17038 None    E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M  
17139 17139 None   Q58E I13V, E21EG, A22AV, M36I, R41K, R57K, I62V, L63P D60A 
17214 17214 None    I13V, M36I, R41K, I62V, L63N, I64V, H69Y, I72V  
17341 17341 None    L19I, M36I, R41K, H69Y  
17561 17561 None    L10V, I13V, G16E, K20R, E35D, M36I, P39S, R41K, R57K, I62V, L63H, H69K, K70R, L89M  
17575 17575 None    L10M, I13V, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, H69K, L89M, I93V  
17648 17648 None    I13A, K20I, M36I, R41K, L63A, H69K, K70R, L89I  
17793 17793 None    E35D, M36I, R41K, R57K, L63S, I64IV, H69K, I72V, L89M  
18499 18499 None    I13V, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, L63P, I64M, H69K, K70R, L89M  
18578 18578 None    L19Q, M36I, R41K, L63P, I64V, E65D  
18874 18874 None    K14R, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, H69K, L89M  
19023 19023 None    V11I, T12S, I15V, L19V, M36I, R41K, D60E, H69K, L89M, I93L  
19034 19034 None    I13V, E35D, M36I, R41K, R57K, D60E, H69K, K70R, L89M  
19140 19140 None    T12TA, I13V, I15V, M36I, R41K, I64V  
19366 19366 None    L19T, K20R, E35D, M36I, R41K, L63S, H69K, L89M, I93L I13IT 

Database

Resources

Team